测序技术能替代微生物检验技术PPT课件PPT课件.ppt

NGS能取代微生物学传统技术 无锡市第二人民医院检验科 传统微生物检测技术病原检出阳性率低 培养时间长 病原颗粒 抗原 抗体 代谢产物 涂片培养 免疫学 质谱生化 鉴定疑难感染病原 经典案例 14岁联合免疫缺陷综合征男孩8个月2013年旅行后脑膜炎住院6周内 38项感染病原检测5种抗生素经验治疗48小时脑脊液高通量测序钩端螺旋体475条序列 更换青霉素32天痊愈出院 鉴定疑难感染病原 经典案例 鉴定疑难感染病原 经典案例 中国 上海华山医院感染科 战狼3 输入性非洲锥虫病 中国感染与疾控团队的72小时救援 鉴定疑难感染病原 经典案例 中国 上海华山医院鉴定新发病原体 猪疱疹病毒跨物种传播 2017年6月 江西女性患者 反复发热 头痛两周 视力下降 病情恶化 转诊到上海华山医院 全面检查均未明确病原体 手术眼玻璃体液送至宏基因组测序平台 36小时传来报告 测出4832条猪疱疹病毒序列 确诊病原体 由抗生素转为抗病毒治疗 一周后患者体温正常 视力稳定 出院后定期随访 最终治愈 经过调查 该患者来自江西某养殖场 曾被污水泼溅入双眼 上海专家远赴江西采取样本检测 明确了病毒跨种传播路径 该研究发表于美国疾控中心主办的权威杂志 该案例引起中国国家疾控系统的高层重视 推动了新发感染精准诊治的政策落地 鉴定疑难感染病原 经典案例 中国 北京协和医院鉴定新发病原体 猪疱疹病毒跨物种传播 鉴定疑难感染病原 经典案例 中国 上海中山医院 中山探索系列 快速鉴定新发病原体重大传染病 传染病暴发的溯源重大传染病 西非肆掠的埃博拉病毒的遗传多样性和传播途径的分析 GenomicsurveillanceelucidatesEbolavirusoriginandtransmissionduringthe2014outbreak 2014年2月从几内亚开始 3月到利比里亚 5月塞拉利昂 7月末到尼日利亚病例指数增长Newgenomictechnologiescanprovidenear real timeinsightsintothepathogen sorigin transmissiondynamics andevolution 如何进入并在人群中传播 变异情况 是否有来自自然宿主的新毒株 来自血流 肺部 CNS 脓肿等不同感染部位和不同的标本类型 来自血流 肺部 CNS 脓肿等不同感染部位和不同的标本类型 mNGS用于ICU脓毒症患者的病原学诊断 血液 mNGS用于肺部感染患者的病原学诊断 肺组织 mNGS用于中枢神经系统感染患者的病原学诊断 脑脊液 mNGS在检测不同来源脓肿标本方面的技术优势 脓肿标本 mNGS用于骨关节感染患者的病原学诊断 骨关节液 检测出细菌 病毒 真菌 寄生虫等不同的病原体 检测出细菌 病毒 真菌 寄生虫等不同的病原体 mNGS用于诊断罕见肺外肝结核 结核杆菌 mNGS用于诊断新发传染病 猪疱疹病毒 mNGS用于诊断真菌感染 耶氏肺孢子菌 mNGS用于诊断实质外脑囊虫病 脑囊虫 受惠于儿童 青年 老人 免疫缺陷等不同的人群 受惠于儿童 青年 老人 免疫缺陷等不同的人群 mNGS用于儿童肺炎病原学探查罕见肺外肝结核 儿童 mNGS用于检出罕见鼻病毒和博卡病毒混合感染 青年女性 mNGS用于免疫缺陷人群病原学诊断队列研究 免疫缺陷患者 mNGS用于老年人关节感染病原诊断 老年人 Nature NEJM Cell CID JCM等超高水平的文章层出不穷 Nature NEJM Cell CID JCM等超高水平的文章层出不穷 mNGS测序将变革临床病原检测中国科学家Cell重要评述文章 mNGS成为病毒分类新方法技术变革带来急性和慢性肺部感染管理新机遇新诊断工具mNGS用于临床的机遇及挑战mNGS临床应用离现实更近一步 测序技术 NGS nextgenerationsequencing 又称高通量测序技术