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从CCLE中查找AML细胞系的基因表达量 从CCLE中查找基因表达量 1 到broadinstitute的一个子页去下载安装GENE E http www broadinstitute org cancer software GENE E download html由于该软件是java编写的 需要java的一个预安装环境 从CCLE中查找基因表达量 2 进入CCLE 选择browse cellline 之后选择Histsubtype1 选择所要查找的细胞系 AML 从CCLE中查找基因表达量 3 选择downloadselectedannotations这个下载好的celllineannotation csv文件将在后面使用到 从CCLE中查找基因表达量 4 在搜索栏填写所要查找的基因名如meis1 从CCLE中查找基因表达量 5 点击meis1 进入detailpage 从CCLE中查找基因表达量 5 点击download 下载基因表达量的文件 文件后缀名是 gct 从CCLE中查找基因表达量 6 用GENE E打开下载好的基因表达量的文件 里面有所有细胞系的meis1表达量的比对值 表达量的值来自于芯片 从CCLE中查找基因表达量 7 点击file annotatecolumns 选择第一次下载的celllineannotation csv 出现注解 从CCLE中查找基因表达量 8 双击histsubtype1 就能够对筛选的细胞系进行由左到右的从高到低的表达量的排列 从CCLE中查找基
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