第十一章-动物基因组学基础.ppt

第11章动物基因组学基础,内容,动物遗传标记基因图谱基因定位方法动物基因组学,第一节动物遗传标记,遗传标记能够用以区别生物个体或群体及其特定基因型、并能够稳定遗传的物质标志。形态学标记（morphologicalmarker）能够用肉眼识别和观察、明显显示遗传多样性的外观性状。毛色、角形、冠形、耳形、体型、外貌细胞遗传标记（cytologicalgeneticmarker）染色体核型、带型和数量特征的变异等反映了染色体在结构和数量上的遗传多态性,动物遗传标记的发展,免疫遗传标记（immunogeneticalmarker）以动物的免疫学特征为标记，红白细胞抗原，Swineleucocyteantigen,SLA生化遗传标记(biochemicalgeneticmarker)在同一动物个体中具有相同功能的蛋白质存在两种以上的变异体；蛋白质多态性分子遗传标记（Moleculargeneticmarker）,分子遗传标记,1、限制性片段长度多态性标记（RFLP）2、串联重复序列标记（TRS）（1）小卫星：（MinisatelliteDNA）（2）微卫星：（MicrosatelliteDNA,MS）3、随机扩增多态性DNA标记（RAPD）4、线粒体DNA标记（mtDNA）5、扩增片段长度多态性标记（AFLP）6、单核苷酸多态性标记（SNP）,遗传标记在动物遗传育种中的应用,1、动物种质资源的遗传评估、保护和利用2、个体及亲缘关系的鉴定3、基因定位与遗传图谱的构建4、标记辅助选择（MAS）5、杂种优势预测6、遗传监测7、抗病育种,第二节基因图谱,基因图谱的概念连锁图谱的构建物理图谱,基因图谱,基因位点在染色体上的线性排列顺序及它们之间的相对距离物理图谱（physicalmap）、遗传图谱（geneticmap）、表达图谱（expressionmap）、转录图谱（translationmap）物理图谱用细胞和分子遗传学原位杂交的方法和体细胞杂交的方法建立的；基因位点间的距离用碱基对或千碱基对表示。遗传图谱通过连锁分析的方法建立的，也称为连锁图谱（linkagemap）基因位点间的距离用厘摩（cM）表示。,连锁图谱的构建,参考家系（referencefamily）用于构建连锁图谱的动物群体，也称为作图群体构建方法：高繁殖力动物：回交，F2代杂种互交低繁殖力动物：系谱清楚的半同胞家系分析方法双回交的2检验两基因位点F2群体的2检验直接分析法多位点连锁分析,物理图谱,将基因或遗传标记定位在某一染色体或染色体的某一特定区域上。构建方法分离染色体体细胞杂交,基因定位（genelocation）是用一定的方法将基因确定到染色体的实际位置。这是现代遗传学的重要研究内容之一。将不同的基因确定于染色体的具体位置之后，即可绘制出基因图（genemap）。,第三节基因定位方法,质量性状的基因定位方法,家系分析法（pedigreeanalysis）对性染色体连锁的基因十分有效遗传重组值定位法两点测交法三点测交法细胞学定位与体细胞定位物理学定位,数量性状的基因定位,主效基因（Majorgene）某一基因位点的等位基因对某一数量性状的效应具有足够大的效应。检测：多峰分布有选择的回交非正态分布综合分离分析,数量性状的基因定位,候选基因法（candidategeneapproach）,第四节动物基因组学,Genomics:以基因组分析为手段，研究基因组的结构组成、时序表达模式和功能，提供有关物种及细胞功能的进化信息。人类基因组计划动物基因组计划,动物基因组学及人类基因组计划,1985年率先提出的，旨在阐明人类基因组30亿个碱基对的序列，发现所有人类基因并搞清其在染色体上的位置，破译人类全部遗传信息，使人类第一次在分子水平上全面地认识自我。1990年正式启动，这一价值30亿美元的计划的目标是，为30亿个碱基对构成的人类基因组精确测序，从而最终弄清楚每种基因制造的蛋白质及其作用。2000年6月26日是人类历史上值得纪念的一天。来自科技部和中国科学院的消息说，人类基因组的工作草图已经绘制完毕并于今天向全世界公布。,动物基因组学在家畜育种中的应用,