第三章 载体与宿主的选择

第三章基因工程载体及宿主,第一节用于基因克隆的载体,质粒（plasmid）,噬菌体或病毒DNA,考斯质粒（cosmid）与噬菌粒,人造染色体载体,载体的功能及特征,真核细胞的克隆载体,1载体的功能及特征,载体的功能,运送外源基因高效转入受体细胞,为外源基因提供复制能力或整合能力,为外源基因的扩增或表达提供必要的条件,载体应具备的条件,具有针对受体细胞的亲缘性或亲和性（可转移性）,具有合适的筛选标记,具有较高的外源DNA的载装能力,具有多种单一的核酸内切酶识别切割位点,具有与特定受体细胞相适应的复制位点或整合位点,2质粒,2.1质粒的定义,质粒（Plasmid）：细菌细胞内一种自我复制的环状双链DNA分子，能稳定地独立存在于染色体外，并传递到子代，一般不整合到宿主染色体上。现在常用的质粒大多数是经过改造或人工构建的，常含抗生素抗性基因，是重组DNA技术中重要的工具。,大肠杆菌的质粒主要有F质粒（大肠杆菌致育因子）、Col质粒（大肠杆菌素因子）、R质粒（抗药性因子）、降解质粒等。隐蔽性质粒多表型质粒,2.2质粒的基本特征,质粒是生物细胞内固有的、能独立于寄主染色体而自主复制、并被稳定遗传的一类核酸分子。,质粒广泛存在于细菌细胞中，在霉菌、蓝藻、酵母和一些动植物细胞中也发现了质粒。,绝大多数的质粒是DNA型的，少量线型或RNA质粒。,绝大多数的天然DNA质粒具有共价、封闭、环状的分子结构，即cccDNA（covalentlyclosedcircularDNA）,质粒DNA的分子量范围：1-300kb,2.2.1质粒的自主复制性,质粒能利用寄主细胞的DNA复制系统进行自主复制,质粒DNA上的复制子结构决定了质粒与寄主的对应关系,根据在每个细胞中的分子数（拷贝数）多寡，质粒可分为两大复制类型：,严紧型复制控制的质粒1-3拷贝（stringentplasmid）,松弛型复制控制的质粒10-60拷贝（relaxedplasmid）,不同类型质粒其本质是是否受宿主细胞不稳定的复制起始蛋白控制。,即使是同一质粒，其拷贝数在不同的寄主细胞间和不同的生长环境也可能有很大的变化。,目前公认的用于阐释质粒DNA复制控制机理的分子模型有两种：其一是自体阻遏蛋白质模型（autorepressormodel），其二是抑制蛋白质稀释模型（inhibitordilutionmodel）。前者的核心内容是，阻遏蛋白质的合成受负反馈（negativefeedback）机理调节，而且其浓度是恒定的。后者的关键论点是，阻遏蛋白质是组成型合成，其浓度同质粒的拷贝数成正比。,（1）抑制蛋白质稀释模型它认为质粒DNA的复制，是受一种由质粒DNA编码的抑制蛋白质Cop调控的。细胞中Cop蛋白质的浓度是同质粒分子的拷贝数成正比，它抑制质粒DNA复制活性的作用方式有两种途径：一种是通过同质粒DNA的复制起点（oir）结合，直接地抑制质粒DNA的复制；另一种是通过阻断起始蛋白质Rep的合成，间接地抑制质粒DNA的合成。,（2）自体阻遏蛋白质模型在抑制蛋白质稀释模型提出若干年之后，L.Sompayrac和O.Maaloe也提出了另外一种解释质粒DNA复制机理的自体阻遏蛋白质模型。这个模型对质粒DNA复制控制机理有两种解释：1.质粒DNA的复制是由一种叫做起始蛋白质Rep引发的。Rep蛋白质编码基因rep和自体阻遏蛋白质编码基因atr是属于同一个操纵子，它们共转录成同一个mRNA分子。自体阻遏蛋白质通过同启劝子-操纵基因区（P/O）的结合作用，调节质粒DNA的转录作用，以维持细胞中Arr和Rep蛋白质处于恒定的水平。而后，由Atr蛋白质调节产生的Rep蛋白质，则是通过同复制起点（ori）的结合，来引发质粒DNA的复制图（a）。2.Rep蛋白质是一种具有双重功能的蛋白质。它既具有自体阻遏蛋白质的功能，可同P/O区结合而抑制转录作用；同时又具有起始蛋白质的功能，能对复制起点（ori）发生作用，引发质粒DNA进行复制图（b）,2.2.2质粒的不相容性,任何两种含有相似复制子结构的不同质粒，不能同时存在于一个细胞中，这种现象称为质粒的不相容性，不相容性的质粒组成不相容性群。,以大肠杆菌的质粒为例：,ColE1、pMB1拥有相似的复制子结构，彼此不相容,pSC101、F、RP4拥有相似的复制子结构，彼此不相容,p15A及其衍生质粒拥有相似的复制子结构，彼此不相容,质粒的不相容性：分子机制,两种含有相似复制子结构的不同质粒，在复制时受到同一种拷贝数控制系统的干扰，致使两种质粒的最终拷贝数不同，其中拷贝数多的质粒在以后的细胞分裂周期中更具优势。,两种含有不同复制子结构的不同质粒，在复制时各受自己的拷贝数控制系统的调节，致使两种质粒的最终拷贝数恒定，因此在经过若干复制周期和细胞分裂周期后仍能共处于同一细胞内。,2.2.3质粒的可转移性,革兰氏阴性菌的质粒可分成两大类：,接合型质粒能在天然条件下自发地从一个细胞转移到另一个细胞（接合作用），如F、Col、R质粒等,非接合型质粒不能在天然条件下独立地发生接合作用如Col、R的其它成员,值得注意的是，某些非接合型质粒（ColE1）在接合型质粒的存在和协助下，也能发生DNA转移，这个过程由bom和mob基因决定.,在一般情况下，质粒的接合转移能力与分子大小及复制型间有一定的相关性。现归纳如下：,2.2.4携带特殊的遗传标记,野生型的质粒DNA上往往携带一个或多个遗传标记基因，这使得寄主生物产生正常生长非必需的附加性状，包括：,物质抗性抗生素、重金属离子、毒性阴离子、有机物,物质合成抗生素、细菌毒素、有机碱,这些标记基因对DNA重组分子的筛选具有重要意义,2.3质粒DNA的分离纯化,实验室一般使用下列三种方法制备质粒DNA：,氯化铯密度梯度离心法,质粒DNA纯度高、周期长、设备要求高、溴乙锭污染,碱溶法,质粒DNA纯度底、快速、操作简便,沸水浴法,质粒DNA纯度、操作周期介于氯化铯法和碱溶法之间,氯化铯密度梯度离心法：,用含有EDTA的缓冲液悬浮菌体,加溶菌酶裂解细菌细胞壁,加CsCl和溴乙锭,超速离心过夜,在紫外灯下吸取cccDNA,稀释沉淀cccDNA,proteins,ocDNA,L-DNA,cccDNA,RNAs,碱溶法：,用含有EDTA的缓冲液悬浮菌体,加溶菌酶裂解细菌细胞壁,加NaOH和SDS的混合溶液，去膜释放内含物,加高浓度的醋酸钾溶液，沉淀染色体，去除染,色体DNA及大部分蛋白质,离心取上清液，用苯酚-氯仿萃取，去除痕量的蛋白质,乙醇或异丙醇沉淀水相质粒DNA,用无DNase的RNase去除残余的RNA,cccDNA,L-DNA,ocDNA,D-DNA,T-DNA,碱变性法质粒提取的原理：根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA片断之间，在拓扑学上的差异而发展出来的。在pH值12.012.5范围内时，线性的DNA会被变性而共价闭合环状质粒DNA却不会被变性。通过冷却或恢复中性pH值使之复性，线性染色体形成网状结构，而cccDNA可以准确迅速复性，通过离心去除线性染色体，获得含有cccDNA的上清液，最后用乙醇沉淀，获得质粒DNA。,沸水浴法：,用含有EDTA和TritonX-100的缓冲液悬浮菌体,加溶菌酶裂解细菌细胞壁,沸水浴40秒钟,离心，用无菌牙签挑去沉淀物,乙醇或异丙醇沉淀质粒DNA,2.4质粒的构建,天然存在的野生型质粒由于分子量大、拷贝数低、单一酶切位点少、遗传标记不理想等缺陷，不能满足克隆载体的要求，因此往往需要以多种野生型质粒为基础进行人工构建。,目前实验室使用的大肠杆菌质粒大多是由少数几个野生型质粒构建的：,pSC1018.8kb拷贝数5四环素抗性标记基因Tcr,ColE16.5kb拷贝数20-30大肠杆菌内毒素标记基因E1,RSF2124ColE1衍生质粒氨苄青霉素抗性标记基因Apr,载体改造和构建的原则去掉不必要的DNA区段。减少限制酶的识别位点，一种酶只保留一个。（单一的限制性酶切位点）。加入易于捡出的选择性标记基因。对质粒进行安全性改造，要求质粒不能随便转移。改造或增加基因表达的调控序列。,2.5质粒的分类,人工构建的质粒根据其功能和用途可分成如下几类：,高拷贝质粒突变拷贝数控制基因拷贝数1000-3000扩增基因,低拷贝质粒来自pSC101拷贝数小于10表达某些毒性基因,温敏质粒在不同温度下表现出拷贝数、整合等不同性质,测序质粒含有测序通用引物互补序列和多酶接头polylinker,整合质粒装有整合促进基因及位点便于外源基因的整合,穿梭质粒装有针对两种不同受体的复制子便于基因克隆,表达质粒装有强化外源基因表达的转录、翻译、纯化的元件,探针质粒装有报告基因便于启动子等元件的克隆筛选,2.6重要的大肠杆菌质粒载体,松弛型复制,2.6.1pBR322质粒载体,氯霉素可扩增,拷贝数50-100/cell,用于基因克隆,P49-53,pSC101,pSE2124,pMB1,重要的大肠杆菌质粒载体,2.6.2pUC18/19,拷贝数2000-3000/cell,用于基因克隆和测序,装有多克隆位点（MCS）,正选择颜色标记lacZ,P53-54,重要的大肠杆菌质粒载体,pUC18/19：正选择标记lacZ的显色原理,pUC18/19,Plac,lacZ,MCS,b-半乳糖苷酶的a-肽段,a,b,5-溴-4-氯-3-吲哚基-b-D-半乳糖苷,X-gal,IPTG（异丙基硫代半乳糖苷，与乳糖结构类似但不能被-半乳糖苷酶降解）,重要的大肠杆菌质粒载体,2.6.3pGEM-3Z,多拷贝,装有两个噬菌体的强启动子,装有多克隆位点（MCS）,正选择颜色标记lacZ,用于外源基因的高效表达,注意：T7和SP6启动子特异性地由噬菌体DNA编码的RNA聚合,2743bp,MCS,lacZ,PT7,ori,Apr,pGEM-3Z,PSP6,酶所识别，因此相应的受体菌必须表达噬菌体RNA聚合酶，如：,E.coliBL21（DE3）等,P55-56,穿梭质粒载体：人工构建的具有2种不同复制起点和选择标记，在2种寄主内都能存活和复制，并可携带外源基因往返穿梭的质粒载体,大肠杆菌-枯草杆菌穿梭质粒载体如pBE2,大肠杆菌-酿酒酵母穿梭质粒载体如pPIC9K,大肠杆菌-动物细胞穿梭质粒载体如pMT2,p56,2.6.4穿梭质粒载体,大肠杆菌-植物细胞穿梭质粒载体如Ti质粒,3噬菌体或病毒DNA,噬菌体或病毒是一类非细胞微生物，能高效率高特异性地侵染宿主细胞，然后或自主复制繁殖，或整合入宿主基因组中潜伏起来，而且在一定的条件下上述两种状态还会相互转化。,噬菌体或病毒的上述特性使得它们的DNA能被开发成为基因工程的有用载体，因为：,高效率的感染性能使外源基因高效导入受体细胞,自主复制繁殖性能使外源基因在受体细胞中高效扩增,3.1大肠杆菌的l噬菌体,3.1.1l噬菌体的生物学特性：生物结构,l噬菌体是大肠杆菌的温和型噬菌体,l噬菌体由外壳包装蛋白和l-DNA组成,l-DNA全长48502个核苷酸,l-DNA上至少有61个基因,l噬菌体生物学特性：生物结构,5TCCAGCGGCGGGG,3,3,CCCGCCGCTGGA5,COS,COS,cos,头部合成基因,尾部合成基因,溶菌控制基因,晚期控制基因,DNA合成控制基因,阻遏基因,早期控制基因,阻遏基因,重组基因,删除与整合基因,l-DNA,l噬菌体生物学特性：感染周期,E.coli,吸附,LamB受体,注入,复制,包装,裂解,l噬菌体生物学特性：感染周期,体内包装,100个左右的拷贝,包装范围为原DNA的75-105%,即36-51kb,D,A,l噬菌体生物学特性：溶原状态,l噬菌体感染大肠杆菌后，除能裂解细胞外，也可能将其DNA直接整合到宿主细胞的染色体DNA上，并不产生子代噬菌体颗粒，这种情况为溶原状态。整合主要由l-DNA上的cI和int两基因的产物所激活，而这两个基因的开放与关闭又取决于宿主细胞本身的性质。人们可以根据需要改变l-DNA或宿主细胞的性质，使噬菌体或处于溶菌状态，或处于溶原状态DNA重组技术一般需要l噬菌体进入溶菌状态,3.1.2l-DNA载体的构建：,野生型l-DNA包装的上限为51kb，本身长度为48.5kb，只有当插入的外源DNA片段不大于2.5kb时，才能被包装成有感染力的噬菌体颗粒。因此缩短野生型l-DNA的长度，可以提高装载量。其实野生型l-DNA上约有40-50%的片段是复制和裂解所非必需的。根据切除的多少，可将l-DNA分成两大类载体：,插入型载体,取代型载体,DNA大小是野生噬菌体的75-105%(37-51kb)，才能被包装成噬菌体,（1）缩短长度,l-DNA载体的构建：缩短长度插入型载体,体外包装,插入位点,体外包装,插入片段,载体长度37kb,插入片段大小：,0-14kb,（5137）,l-DNA载体的构建：缩短长度取代型载体,体外包装,体外包装,插入片段,最小装载长度10kb,（3651）,载体长度26kb,插入片段,最大装载长度25kb,（2）删除重复的酶切位点,野生型的l-DNA链上有5个EcoRI位点和7个HindIII位点，不利于重组操作，必须删除至1-2个,同时，为了便于各种来源的DNA片段的克隆，还需要增加一些单一的酶切位点,除了简单的切割外，还需要采用定点突变技术去除或增添酶位点,（3）加装选择标记,与质粒不同，野生型l-DNA上缺少合适的选择标记，因此加装选择标记是l-DNA克隆载体构建的重要内容,l-DNA克隆载体上的选择标记主要有下列两类：,免疫功能类标记,颜色反应类标记,加装选择标记imm434,imm434基因编码一种阻止l-噬菌体进入溶菌循环的阻遏物。含有完整标记基因的l-载体进入受体细胞后，建立溶原状态，细菌生长缓慢，形成浑浊斑；,当外源DNA插入到标记基因中，基因灭活，l-重组分子便进入溶菌循环，形成透明斑,加装选择标记lacZ,lacZ基因编码b-半乳糖苷酶，能催化无色的X-gal生成蓝色化合物。当外源基因插入到lacZ基因中，基因灭活，不能合成蓝色化合物；而空载体l-DNA则产生蓝色透明斑,构建琥珀密码子的突变体,琥珀型突变（sup)是指由CAG（Gln）向UAG（stop）的突变。大肠杆菌的某些菌株含有特异性的校正基因，其编码产物校正tRNA能专一性地纠正这一突变。将野生型l-DNA上D和E两个头部包装蛋白的基因中的CAG密码子突变成UAG。当这种l-DNA进入一般的大肠杆菌菌株后，不能合成有活性的头部蛋白，也就不能被包装和裂解细菌，这样就可以阻止有害重组体的生物污染及扩散，而基因工程实验中使用的受体则是具有琥珀型突变体校正功能的菌株,3.1.3l-DNA载体的主要类型：,插入灭活型载体,Charon2、Charon6、lgt11,取代型载体,lEMBL4、lgtlc、lNM762、Charon40,正选择型载体,lEMBL1、lL47、l1059,野生型的l噬菌体不能在P2噬菌体溶源性的细菌中繁殖（Spi+），这种生长抑制表型受l-DNA上的red和gam两个基因控制。若将外源DNA取代red和gam，重组噬菌体便拥有Spi-表型，能在P2噬菌体溶源性的大肠杆菌受体菌中繁殖，并形成透明斑,3.1.4l-DNA重组分子的体外包装,l-DNA重组分子需在体外人工包装成有感染力的噬菌体重组颗粒，方可高效导入受体细胞用于体外包装的蛋白质可直接从感染了l噬菌体的大肠杆菌中提取，现已商品化。这些包装蛋白通常分为相互互补的两部分：一部分缺少E组份，另一部分则缺少D组份。包装时，当且仅当这两部分包装蛋白与重组l-DNA分子混合后，包装才能有效进行，任何一种蛋白包装液被重组l-DNA污染后，均不能被包装成有感染力的噬菌体颗粒，这也是基于安全而设计的,3.1.5l-DNA及其重组分子的分离纯化,将大肠杆菌在含有麦芽糖的培养基中培养至对数生长期,加入l噬菌体或重组l噬菌体的悬浮液，37培养1小时,用新鲜培养基稀释，继续培养4-12小时。这时噬菌体颗粒,密度已达1013-1014/L，大肠杆菌细胞已完全裂解,超速离心，沉淀噬菌体,苯酚抽提，释放l-DNA,乙醇或异丙醇沉淀l-DNA,3.1.6l-DNA作为载体的优点,l-DNA可在体外包装成噬菌体颗粒，能高效转染大肠杆菌,l-DNA载体的装载能力为25kb，远远大于质粒的装载量,重组l-DNA分子的筛选较为方便,重组l-DNA分子的提取较为简便,l-DNA载体适合克隆和扩增外源DNA片段，但不适合表达,外源基因,3.2大肠杆菌的M13单链噬菌体DNA,M13噬菌体的生物学特性：生物结构,M13噬菌体的外型呈丝状,M13噬菌体由外壳包装蛋白和正链DNA组成,M13DNA全长6407个核苷酸,M13DNA上至少有10个基因,2700个外壳蛋白分子,M13噬菌体不裂解宿主细胞，但抑制其生长,大肠杆菌的M13单链噬菌体DNA,M13噬菌体的生物学特性：感染周期,（+）DNA,RFDNA,RFDNA,RFDNA,-DNA,II,V,大肠杆菌的M13单链噬菌体DNA,M13DNA载体的构建：,IIIVIIIVIIXVVIIIXVIII,野生型M13RF-DNA,IIIVIIIVIIXVVIIIXVIII,M13mp系列载体,lacZ,polylinker,大肠杆菌的M13单链噬菌体DNA,M13DNA载体的特点：,使克隆的DNA片段以特定单链的形式输出受体细胞外,这在DNA定向突变中非常有用,M13重组分子筛选简便,被M13噬菌体感染的受体细胞生长缓慢，形成混,浊斑，易于辨认挑选。而且重组分子越大，混浊,斑的混浊度亦越大,但M13-DNA载体的最大缺陷是装载量小，只有1.5kb,与动植物受体细胞相适应的载体一般选择相应动植物的病毒基因组DNA。,动植物病毒种类繁多，每一种动植物都有多种特异性的病毒。按照基因组的结构，可将动植物病毒分成四大类：,单链DNA病毒,双链DNA病毒,单链RNA病毒,双链RNA病毒,RNA病毒在自我复制时大多存在相应的DNA中间反应物，这些中间体可作为载体进行常规的DNA重组。,4考斯质粒与噬菌粒,l-DNA载体和M13-DNA载体的装载量最大分别为25kb和1.5kb，但在很多情况下，往往需要克隆更大的外源DNA片段，考斯质粒和噬菌粒载体的构建就是为了进一步提高噬菌体DNA的装载量。,在包装上限固定的条件下，大幅度缩短噬菌体DNA的长度，就能同步增加载体的装载能力。将噬菌体DNA与包装有关的序列与质粒组装在一起，既能最大限度地缩短载体的长度，同时又能保证重组DNA分子在体外仍被包装成有感染力的颗粒，这便是构建考斯质粒和噬菌粒载体的思路。当然，由于考斯质粒和噬菌粒不再携带包装蛋白基因，因此重组DNA分子在细胞内不能形成噬菌体颗粒。,4.1考斯质粒（cosmid）,考斯质粒载体的构建：,考斯质粒是一类人工构建的含有l-DNAcos序列和质粒复制子的特殊类型的载体,1978年Collins和Hohn发明构建,pHC79,6400bp,Tcr,lfragment,cos,ori,Apr,PstI,BamHI,SalI,cossite-carryingplasmid,1.8kb的l-DNA片段+pBR322片段,装载范围为31-45kb,考斯质粒（cosmid）,考斯质粒载体的特点：,能像l-DNA那样进行体外包装，并高效转染受体细胞,装载量大（45kb）且克隆片段具有一定的大小范围,能像质粒那样在受体细胞中自主复制,重组操作简便，筛选容易,不能体内包装，不裂解受体细胞,4.2噬菌粒（phagemidorphasmid）,噬菌粒载体的特点：,噬菌粒是一类人工构建的含有单链噬菌体包装序列、复制子以及质粒复制子、克隆位点、标记基因的特殊类型的载体,能像M13-DNA那样体外包装，并高效转染受体细胞,装载量比常规的M13mp系列要大很多（10kb）,能像质粒那样在受体细胞中自主复制,重组操作简便，筛选容易,通过克隆双链DNA能获得同等长度的单一单链DNA,噬菌粒（phagemidorphasmid）,重要的噬菌粒载体：pUC118/119,pUC118pUC18+M13间隔区IG,pUC119pUC19+M13间隔区IG,500个拷贝,3200bp,MCS,lacZ,lacI,ori,Apr,M13-IG,pUC118/119,表示M13辅助噬菌体DNA,噬菌粒（phagemidorphasmid）,重要的噬菌粒载体：pBluescript体外转录载体,pBluescript=pUC+f1-ori+PT3+PT7,2958bp,MCS,lacZ,PT7,ori,Apr,f1-ori,pBluescript,PT3,噬菌体启动子PT3和PT7强化外源基因的转录,提取出来的单链DNA重组分子在噬菌体RNA聚合酶的存在下，又可实现外源基因的体外转录,5人造染色体载体,人类、动物、植物的全基因组序列分析往往需要克隆数百甚至上千kb的DNA片段，此时考斯质粒和噬菌粒载体的装载量也远远不能满足需要。,将细菌接合因子或酵母菌染色体上的复制区、分配区、稳定区与质粒组装在一起，即可构成染色体载体。当大片段的外源DNA克隆在这些染色体载体上后，便形成重组人造染色体，它能像天然染色体那样，在受体细胞中稳定的复制并遗传。,目前常用的人造染色体载体包括：,细菌人造染色体（BAC）,酵母人造染色体（YAC）,5.1细菌人造染色体（BacterialArtificialChromosomesBAC）,细菌人造染色体通常是在大肠杆菌性因子F质粒的基础上构建的，其装载量范围在50-300kb之间,各种类型的pBACs在大肠杆菌受体菌只能维持单一拷贝pBACs主要适用于：,克隆大型基因簇（genecluster）结构,构建动植物基因文库,oriS,repE-Fforplasmidreplicationandregulationofcopynumber.parAandparBforpartitioningFplasmidDNAtodaughtercellsduringdivisionandensuresstablemaintenanceoftheBAC.Aselectablemarkersforantibioticresistance,someBACsalsohavelacZatthecloningsiteforblue/whiteselection.T7&Sp6phagepromotersfortranscriptionofinsertedgenes.,5.2酵母人造染色体（YeastArtificialChromosomesYAC）,YAC载体应含有下列元件：,酵母染色体的端粒序列,酵母人造染色体的构建：,pYAC4,CEN4,EcoRI,URA3,TEL,BamHI,TEL,ori,Apr,TRP1,ARS1,酵母染色体的复制子,酵母染色体的着丝粒序列,酵母系统的选择标记,大肠杆菌的复制子,大肠杆菌的选择标记,YAC载体的装载量为350-400kb,酵母人造染色体（YeastArtificialChromosomesYAC）,酵母人造染色体的使用：,EcoRI,EcoRI,EcoRI,BamHI,连接,转化酵母菌,重组酵母染色体,6真核细胞的克隆载体,6.1酵母细胞中基因克隆常用载体共同特点（1）能在大肠杆菌中克隆，并且具有较高的拷贝数。这样可使外源基因转化到酵母细胞之前先在大肠杆菌中扩增；（2）含有在酵母中便于选择的遗传标记。有些还携带用于大肠杆菌的抗菌素抗性标记；（3）含有合适的限制酶切位点，以便外源基因的插入。共有三种类型的载体1.整合型载体（YIP）2.复制型载体（YRP）3.附加体型载体（YEP）,YIP型载体是由大肠杆菌质粒和酵母的DNA片段构成的。如Pyeleu10是由ColEI质粒和酵母DNA提供的亮氨酸基因（Leu2+）片段构成，在细菌中复制、扩增，进入酵母后可整合表达。YIP型载体的特点是转化率低(只有1-10转化子/微克DNA)，但转化子遗传性稳定稳定，多用于遗传分析工作。,YRP型载体是带有选择标记和复制子的酵母的DNA片段插入到大肠杆菌质粒中构成的。因为它同时含有大肠杆菌和酵母的自主复制基因，所以能在两种细胞中存在和复制。可以在两种截然不同的生物细胞中复制的载体称为穿梭载体（ShuttleVector）.穿梭载体在基因工程中广泛使用。YRP型载体转化率高，拷贝也高，但不稳定，易丢失,YEP型载体一般由大肠杆菌质粒、2m质粒以及酵母染色体的选择标记构成。2m质粒含有自主复制起始区（Ori）和STB区,STB序列能够使质粒在供体细胞中维持稳定。利用2m质粒，人们已经构建出许多YEP型载体。YEP型载体对酵母具有很高的转化活性，一般为103-105转化子/微克DNA。比YRP型载体更稳定，拷贝数也高（25-100个/细胞），是基因克隆中的常用载体。,6.2植物基因克隆的载体Ti质粒,Ti质粒存在于能够引起植物形成冠瘿瘤的土壤农杆菌中。这种肿瘤的形成是由Ti质粒决定的，故称为诱导肿瘤的质粒（Tumorinducingplasmid），简称Ti质粒。,T-DNA的染色体整合机制,农杆菌介导法,共整合转化程序,二元整合转化程序,6.3动物细胞基因克隆的载体:SV40病毒载体,SV40病毒（猿猴空泡病毒40）呈小型20面体，环状DNA，外壳蛋白由VP1、VP2、VP3构成。受纳细胞（permissivecell）：能使细胞裂解释放感染性病毒颗粒，并使寄主细胞裂解，如猿猴细胞。非受纳细胞（nonpermissivecell）：不产生感染性病毒颗粒，但能整合到细胞染色体中产生癌变，如小鼠或仓鼠的细胞。SV40病毒载体1.取代型重组病毒载体2.重组的病毒-质粒载体,取代型的重组病毒载体（recombinantVirusVector）,其特点是外源DNA直接插入在缺陷型的病毒基因组上。插入的外源DNA片段在大小同被取代的病毒基因组区段是等同的，这样形成的重组体DNA能够在哺乳动物的受纳细胞中增殖，并被包装成病毒颗粒。但为了补充被取代的病毒基因组DNA的功能，必须使用一种与之互补的辅助病毒。晚期区段取代载体早期区段取代载体,重组的病毒-质粒载体只取病毒基因组中维持在辅乳动物中进行复制的有关序列，使它与一个细菌质