生物统计学概述PPT课件

1,生物统计学概述,南京医科大学魏永越weiyongyue,2,提纲,学科简介生物统计学(基础篇)临床试验中的生物统计学生物统计学(高级篇),3,一学科历史简介,4,概率论起源,起源于赌博的一门学科,1400栖凤枝稍尚软弱化龙形状已依稀,1700江山代有人才出各领风骚数百年,1900忽如一夜春风来千树万树梨花开,徐传胜.概率论简史.数学通报.2004,10:36-38.陈希儒.数理统计学简史.,5,概率论起源,栖凤枝稍尚软弱化龙形状已依稀,两个赌徒相约若干局,谁先赢了3局则赢.若一人赢2局,另一人赢1局,赌博中止,问赌本应怎么分？,1494，Pacioli：按2：1进行分配,1654，Pascalxi1,xi2,xik)为在地理位置(ui,vi)处的因变量y和自变量观测值k(ui,vi)为观测点(ui,vi)处的未知参数，它是(ui,vi)的未知函数。i为独立同分布的随机误差，通常假定其服从N(0,2)。,.,72,GWR模型中的参数在每个回归点(空间中的某个部分区域)是不同的，就不能用最小二乘方法(OLS)估计参数，而采用加权最小二乘法(WLS)方法。回归点i的参数估计向量表示如下：,权重矩阵：1.专业角度；2.核函数,73,.,74,75,传染病研究中的统计学,传染病的发病预测,江苏省19802000年伤寒副伤寒发病人数乘积季节模型预测结果,76,全基因组研究中的生物统计学,高维数据1,000个样本，1,000,000个SNP位点较之前几年，试验检测费用已大幅下降，但仍然较高高维灾难数据管理的挑战(横向-纵向)试验设计方法的挑战(多阶段设计)经费有限的情况下，考虑更多的位点位点数目有限的情况下，使得费用最低统计分析方法的挑战降维策略算法设计的挑战,77,药物不良反应预警中的统计学,随着药品不良反应自愿报告系统(spontaneousreportingsystem,SRS)日益规范，SRS数据库容量迅速膨胀，基于海量数据的SRS信号监测技术越来越收到人们的重视，数据挖掘技术已逐步运用到药物警戒领域1。数据特点：仅有分子，没有分母，无法计算发生率,78,频数法报告比数比法(reportingoddsratio,ROR)报告率比例法(proportionalreportingratio,PRR)序贯检验（SPRT）贝叶斯法贝叶斯置信传播神经网络（BCPNN）经验贝叶斯伽玛泊松缩减（MGPS）综合法,79,80,计算统计(ComputationalStat),JacknifeBootstrapPermutationMonteCarloStatisticalSimulation,81,Thanks！Welcomediscussiontofindpointsincommonforcooperation!,82,新药临床试验中的统计学规范研究,导师：陈峰教授于浩教授学生：魏永越,83,临床试验中的统计学,84,研究内容,85,（一）中心化随机分组及在线系统实现报告人：赵杨,86,研究背景,从管理角度研究中心较多，各中心入组速度差别较大试验晚期中心间药物调配从方法角度区组随机分组可以保证某些重要的分层因素在组间的均衡性，但仍然有出现不均衡的机会能考虑分层因素的随机方法在传统随机分组模式下，操作流程复杂，手工操作的可行性低,87,中心化随机分组,受试者等待入组,随机分组中心或分组系统,发送相关信息,采用既定的方法进行随机分组,告知随机分组结果患者随机编号01001药物编号28,中心化区组随机最小随机分层随机,88,设计框架,由于各中心竞争入组，事先无法确定各中心的样本量。因此，药物分配存在一定的困难。如何在盲法及多中心竞争入组的需求下实现各中心药物预分配，是中心化随机实施过程中的一个难点。,89,研究者随机分组的业务流程,90,随机分组流程示例,1号中心有受试者等待入组,随机分组系统,91,随机分组流程示例,1号中心有受试者等待入组,随机分组系统,随机分组进入B组,药物随机表,随机编号01001药物编号5,药物分配单位可以是研究中心，或多个研究中心组成的大区。通过系统中的药物管理平台，可以实现药物预分配、补充分配及药物回收。,92,临床研究随机分组系统界面,不同用户登陆后，所见菜单项目会有所不同,93,（二）在线数据采集及管理中的关键技术报告人：赵杨,94,传统数据流程,修正错误,修正错误,数据需要经过多个环节，一般是项目结束后开始数据录入，间隔时间较久，数据回顾较为困难,申办方检查实验进度，稽查研究质量较为不便,如何快速获得准确的临床试验数据，是提高新药临床研究效率及结果可靠性的关键,95,基于网络的电子化数据流程,WAP,WEB,监查员,统计学家,申办厂商,管理机构,项目管理员,3R:实时采集数据实时核查数据实时导出数据,96,数据采集模块,每个数据都会经过有效值校验及逻辑检查须双份录入的研究项目，须实时双份比对规范化合并用药名称与WHO药物词典数据库或MIMS对接规范化不良事件名称与MedDRA或WHOART数据库对接多途径数据采集基于WEB进行数据上传基于WAP智能手机进行初步数据采集，然后上网确认,97,核查模块,管理员可根据研究方案，商定研究项目所需逻辑核查条目，并将其逐条配置入系统中监查员可对数据进行实时核查，对有疑问的数据，向研究者发送系统内疑问消息及Email提示，亦可生成疑问表供下载锁库前，必须检查每条疑问都有回复或修正,98,数据交换模块,数据导入以既定的格式填写试验数据后上传数据导出导出试验数据及数据定义信息（ASCII/SAS/ODMXML/）生成PDF格式的CRF文档导出项目配置信息生成项目信息文件夹供提交管理部门,数据定义：yy/mm/dd,99,数据安全,安全性数字签名口令多重加密网络加密传输(SSL协议)稳定性数据切割及分布式存储数据服务器位于局域网内,100,101,（三）盲态核查规范与思路报告人：魏永越,102,盲态逻辑核查设计思路,逻辑核查列表,核查报告疑问表,系统将繁琐的核查程序封装在“黑匣子”中,103,初始系统,配置参数,逻辑核查,生成报表,REC文件,备用模板,盲态逻辑核查设计框架,STEP1：1.初始化程序2.导出变量集3.生成模板,STEP3：1.动态解析配置文件2.累加检查结果到数据集,STEP4：1.生成逻辑核查报告2.导出每位受试者疑问表,STEP2：1.配置逻辑核查表达式2.配置各中心参考值范围,初始系统,配置参数,逻辑核查,生成报表,104,STEP1.1系统初始化（格式化文件夹）,初始系统,105,STEP1.2系统初始化（生成配置文件）,106,STEP2配置项目参数（逻辑表达式）,IsMissingCheckReferenceCheckLabMissingCheckLabCMCheckLabCMChange,配置参数,107,STEP3动态解析配置文件,导入配置文件,逐条解析逻辑检查表达式，进行逻辑核查,生成检查结果库,逻辑核查,108,STEP4生成核查报告及疑问表,核查报告,疑问表,生成报表,109,（四）统计报告输出的RTF编码技术报告人：魏永越,110,常见报告输出技术,常用报告输出技术PROCReport+ODS(OutputDeliverySystem)SAS动态数据交换技术（DDE）DATASTEP中构造字符表格并将其输出至TXT文件动态报表输出技术可明显提高效率、减少错误、统一风格，一直是SAS应用中的热点问题,111,ODS输出原理剖析,*.RTF,Data,ODS,PROCTemplate;definestylepenguin;styleheader/protectspecialchars=offfont_face=黑体just=centerfont_weight=Boldfont_size=11pt;styleTable/cellspacing=1ptcellpadding=2frame=hsidesrules=groups;end;RUN;QUIT;,pardplaintrowdirow1irowband-1ts15trgaph15trleft-108trhdrtrkeeptrbrdrtbrdrnonetrbrdrlbrdrnonetrbrdrbbrdrnonebrdrw20trbrdrrbrdrnonetrbrdrhbrdrnonebrdrw20trbrdrvbrdrnonetrftsWidth0trautofit1trpaddb15trpaddl15trpaddt15trpaddr15trpaddfl3trpaddft3trpaddfb3,112,RTF文档结构,根据匹配原则断句找规律,113,设计框架,报告文档,页眉页脚,文档属性,文字段落,表格,114,RTF操作底层接口,基本宏%StrToInternalCode(tcStr=);宋体=badacce5业务宏段落：%AddParagraph();%AddParagraphText();表格：%AddTable();%AddRow();%AddCell();%AddCellText();文档：%AddDoc();%AddEmptyPar;%AddSecti