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文档简介

.,1,如何分析基因序列中的启动子、外显子和内含子,生命科学学院,.,2,启动子：RNA聚合酶特异性和结合的DNA序列。启动子是基因的一个组成部分，控制基因表达的起始时间和表达的程度。外显子：断裂基因中的编码序列。外显子是真核生物基因的一部分，它在剪接后仍会被保存下来，并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。内含子：断裂基因的非编码区，可被转录，但在mRNA加工过程中被剪切掉，故成熟mRNA上无内含子编码序列。,.,3,怎样利用互联网中的网站或软件分析该序列中的外显子、内含子和启动子呢？,现有人基因组中的一段序列GGTATGGGGCCAAGAGATATATCTT.,.,4,一、根据一段碱基序列找到其对应的基因名或其序列号,.,5,任选浏览器搜索“NCBI”找到后点击进入，出现如上界面点击“BLAST”（BasicLocalAlignmentSearchTool,BLAST）,.,6,当出现如上界面时，点击“nucleotideblast”,.,7,打开页面后，在检索框中输入需要查找的序列，如图所示,.,8,根据索要查询的基因来源，选定需要查询的基因（人类基因）点击“BLAST”打开,.,9,出现页面后向下滑动直至出现图1寻找Ident(一致性）最高的一项点击进入,.,10,点击进入后见所查序列名称以及序列号据此进行操作,.,11,二、已知基因的基因名或序列号找到其启动子、外显子和内含子,.,12,1、输入网址进入UCSC网站,.,13,2、点击GenomeBrowser,.,14,3、点击进入后可看到以下页面,（1）选择是何种生物的基因（如人类，老鼠等）,（2）输入你所需要查询的基因名称,输入完毕，点击SUBMIT,.,15,4、可看到以下页面,（1）将EnsemblGenes设置为dense（显示）,（2）点击refresh,.,16,5、可看到以下页面,找到EnsemblGenes点击所对应的序列图形,.,17,6、可看到以下页面,继续点击所对应的序列图形,.,18,7、可看到以下页面,选择GenomicSequence,.,19,8、可看到以下页面,（2）选择表现形式（如外显子大写，其余都小写）,（1）根据需要选择所要展现的内容（如外显子、内含子）,（3）点击submit,.,20,9、可看到以下页面,此为HBB基因的全部序列,第一段大写部分为第一个外显子。第一个外显子前面的所有小写部分为该序列的启动子。大写部分之间夹杂的小写部分为该序列的内含子。,.,21,三、检验所得序列是目的序列,.,22,1、验证,利用word输入我们所得到序列的第一个外显子的部分序列进行验证，看是否与原题序
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