医学数据库及文献检索技巧-陈泽鑫

医学数据库及文献检索技巧,浙江大学医学院附属第二医院科教部临床流行病与生物统计室陈泽鑫（660630）303353479,概述,为什么要做文献检索检索策略和方法常见数据库的检索操作,为何要进行文献检索,教材的内容相对滞后于学科本身发展的实际水平获取研究课题最新研究成果和研究概况文献中的新观点、新创造、新方法能够启迪思维、激发学习和研究兴趣可以做一些综述研究，比如meta分析概况：新、全、可以用来发表综述类文章,文献-巨人的肩膀,研究选题：启迪思维、避免不必要重复研究方案：课题的发展历史、现状、动向前人成功的经验、失败的教训、最大限度地利用别人的成果，在此基础上开展新的探索研究技术：查阅最新最有效的研究技术成果鉴定：判定成果的先进性、科学性和实用性体现论文的创新性和科学性,文献检索的方法,直接法：指直接利用检索系统（工具）检索文献信息的方法追溯法：利用文献后面所列的参考文献，逐一追查原文（被引用文献），然后再从这些原文后所列的参考文献目录逐一扩大文献信息范围，一环扣一环地追查下去的方法循环法：综合使用上述两种方法,文献检索的策略,检索策略，就是在分析课题内容具有哪些概念单元的基础上，确定检索系统、检索文档、检索途径和检索词，并科学安排各检索词之间的位置关系和逻辑关系以及查找步骤等。检索策略考虑得是否周全，直接影响文献的查全率和查准率。,制定检索策略的步骤,明确查找目的与要求,确定检索途径和方法（自由词检索、主题词检索、著者检索、题目检索、刊名检索）,建立检索命题（主题词及逻辑关系）,选择合适数据库,根据文献线索，查阅原始文献,明确查找目的与要求,首先要对检索课题进行认真细致的分析，明确检索目标，弄清课题概念的内涵和外延，以及可能涉及的学科领域和范畴，以便使检索标识正确切题,选择合适数据库,国内中国知网（CNKI）检索平台（首推）万方数据库维普期刊国际Pubmed/MedlineWebofScience/WebofknowledgeEmbaseWILEYCochrane数据库（循证医学数据库）QVID全文数据库,中国知网,同方知网（北京）技术有限公司是清华同方股份有限公司全资境外子公司，拥有130多名科学家和数千IT技术人员组成的知识传播工程技术研究院。前身为中国学术期刊（光盘版）电子杂志社，由中国国家新闻出版总署和国家教育部主管、清华大学主办的专业互联网与电子出版机构。,万方数据库,由国家法定学位论文收藏机构中国科技信息研究所提供资源，本数据库收录了自1977年以来我国自然科学领域博士、博士后及硕士研究生论文，其中文摘已达38万篇，首次推出最近3年的论文全文10多万篇，并年增全文3万篇作为国家“九五”重点科技攻关项目，目前已集纳了理工、农、医、人文等五大类的70多个类目的2500多种科技类核心期刊，实现全文上网。,维普期刊,维普资讯公司推出的中文科技期刊数据库(全文版)（简称中刊库）是一个功能强大的中文科技期刊检索系统。海量数据：数据库收录了1989年至今的8000余种中文科技期刊刊载的830余万篇文献，并以每年150万篇的速度递增。覆盖范围：涵盖自然科学、工程技术、农业、医药卫生、经济管理、教育科学和图书情报等学科。分类体系：按照中国图书馆分类法进行分类，所有分为：自然科学、工程技术、农业、医药卫生、经济管理、教育科学和图书情报这7个专辑。,文献收录比较,Pubmed,Medline是美国国立医学图书馆（theNationalLibraryofMedicine,NLM）研制开发的国际上最具权威性的综合性生物医学文献书目数据库。收录范围：全世界70多个国家和地区1966年以来的4600余种生物医学期刊，目前文摘条目1300余万篇，年报道量40万条，英文刊物占90%、3/4有英文摘要，每周更新。内容：医学、药学、牙医学、护理学、预防医学、卫生管理、兽医学等专业。PubMed是其提供Internet免费检索的WEB数据库。,Webofscience,ThomsonReuters公司出版，科学引文索引（SCI）的网络版230多个学科领域,9000种核心期刊,数据最早追溯到1898年,Cover-to-Cover收录期刊每一期每一篇文献。收录除漫画与广告外的所有内容.三大引文索引ScienceCitationIndexExpanded(科学引文索引，SCIE）8200种核心期刊，可回溯到1900年SocialScienceCitationIndex(社会科学引文索引，SSCI）2600种核心期刊，可回溯到1900年Arts&HumanitiesCitationIndex(艺术与人文索引A&HCI）1400种核心期刊，可回溯到1975年,Embase,收录3800多种医学、药学专业期刊；涵盖了大量的欧洲和亚洲医学期刊；专有药物检索（DrugSearch）:支持药物名称检索，并提供药物联接，其中包括17个核心的药物联接和47个药物管理联接,WILEYCochrane数据库,Cochrane图书馆是以光盘（CD-ROM）和软盘形式发表的一种电子出版物（每年4期），是临床医学各专业防治方法的系统评价（SystematicReview或Meta-分析）和临床对照试验的资料库，是国际Cochrane协作网的产品，由英国牛津UpdateSoftware公司出版。循证医学数据库，是目前最全面的系统评价资料库,Webofscience和Pubmed比较,Pubmed主要聚焦医学和生物医学，Webofscicence覆盖多学科，而且可以查期刊的影响因子Webofscicence可以提供引文分析数据（引用情况）Webofscicence可以追溯更古老的文献Pubmed每天更新，Webofscicence每周更新期刊数：Pubmed：约6000，Webofscicence：约8700（每年会有变动）目前Webofscicence可以通过过WebFeat提供的跨库联合检索功能，检索数据不在ISIWebofKnowledge平台上，其中就包括Pbumed数据库,功能强大，定位准确的Google/googlescholar很遗憾，国内没法用,利用Google/googlescholar直接定位几篇可能与自己需要研究目的相关的文献（有时不一定是科研文章，但是也可参考借鉴）,翻墙/VPN,找到合适的主题词，近义词，不同拼写方式等,确定检索途径和方法,比较常见的检索途径有自由词检索、主题词检索、著者检索、题目检索、刊名检索等主题词检索和自由词检索是最常用的检索途径主题词是一种规范化的检索语言，同一主题的文献，不受文献中使用何种名称，不同词形，拼写、单复数等的限制，都会被标引到同一个规范最成熟典型的主题词表当属美国国立医学图书馆医学主题词表简称MeSH,确定检索命词,使用国际疾病分类代码（ICD）、国际系统医学术语集（SNOMED）、一体化医学语言系统(UMLS)列出同义词和相关语列出英美可能的术语或者不同拼法rubbingalcohol/surgicalspiritcancer/tumor/tumour/tumeur/neoplasms/carcinoma注意不同的单词结尾prognosis/prognostic列出可能的缩写词myocardialinfarction/MI,如何找到准确的英文术语？,参考mesh词库当中的词语借助翻译软件先查找中文文献，选择有英文翻译的文章，其中可能就有你需要的准确翻译借助google验证查到的术语的准确性,机械通气的可能用词,建立检索术语,布尔逻辑符：AND,OR,NOT截词符:主题词的一部分进行检索，pubmed中使用*如前文的prognosis/prognostic，可选择prognos*PICO原则：明确问题四原则Patient：研究对象Intervention：干预措施Comparison：比较的措施Outcome：关心的结果当检索到文献较少时，也可以考虑去除某一个方面内容重新检索做相关性或者预测性研究时，一般关注I和O就可以了,逻辑符的使用,AANDB:返回A和B数据集中相交的部分AORB：返回A和B数据集所有的部分ANOTB：满足A但去除B后剩下的部分AWithB:A,B相邻，但是顺序不能颠倒ANearB:A,B相邻，但是顺序可以颠倒AInB:限定检索词A一定要出现在B中限定时间限定语言限定国家等,修正检索结果,文献检索过程是一个不断完善和学习的过程，根据实际需要可以针对相应的检索策略，检索更为专指或者扩大检索范围,常见数据库的检索操作,如何快速找到数据库入口浙江大学图书馆数据库导航登入：RVPN下载客户端，账号密码登入即可,要求：确认胃管位置的方法的相关文献（中文）,数据库：中国知网检索途径：自由词或主题词检索词（不同称呼、表述方法、近义词等）：胃管/鼻胃管位置/部位方法/操作确定主题词几检索术语：（胃管或鼻胃管）并且（位置或部位）并且（方法或操作）,该页面称为总库平台页面、提供单库入口及跨库检索功能,导航区,检索区,数据库列表区，提供各个数据库入口。点击单库列表即进入某一库中检索,按要求填入检索词及检索条件,如果有需要，此处可以填写相关发表时间等限制条件,选择学科缩小范围提高精度,选择文献年份及排列顺序，快速找到需要的文献,文献综述对于快速全面的掌握研究概况非常重要,点击标题进入文章详细页面,选择下载全文的格式,密码：zjdxtsg(浙江大学图书馆拼音首字母),用户名：sh0283,要求：癌症患者临终关怀相关文献（外文）,数据库：Pubmed检索途径：自由词或主题词检索词（不同称呼、表述方法、近义词等）：肿瘤：Mesh主题词：Neoplasms临终关怀：Mesh主题词：HospiceCare确定主题词几检索术语：HospiceCareMeshAND“Neoplasms”Mesh,输入检索词,选择MeSH主题词库,勾选合适并且正确的主题词,选择合适逻辑词，并添加到搜索词板,相同步骤，操作添加“临终关怀”的检索词,最后点击“searchPubMed”,选择不同排序方法,选择你需要的文献类型,选择发表时间,选择试验对象,保存文献概要信息,勾选你需要的文献,选择保存到你需要保存的地方,文章信息及全文,获取全文的链接,文献基本信息,摘要信息,自由词检索方法,确定检索词：癌症：Cancer/cancers、tumor/tumors、tumeur/tumeurs、carcinoma/carcinomasneoplasm/neoplasms临终关怀：hospicecare、palliativecare、terminalcare确定检索术语：(Cancer*ORtumor*ORtumeur*ORcarcinoma*ORneoplasm*)AND(hospicecareORpalliativecareORterminalcare)是不是很繁琐？Mesh主题词化繁为简,选择高级检索方式,按要求依次填入检索词,为了检索的提高精确度，并缩小范围，一般选择Title/Abstract,选择逻