肿瘤基因检测与个体化用药

肿瘤基因检测与个体化用药,精准医学研究所洛阳中科信息产业研究院,肿瘤防治形势-严峻,2,2012中国肿瘤登记年报,我国每年新发肿瘤病例约为：,肿瘤三大治疗手段,3,约90%肿瘤患者在治疗过程中会用到抗肿瘤药物,抗肿瘤药物使用原则,卫计委抗肿瘤药物临床应用指导原则,不同肿瘤药物疗效比较,5,Medical College of Wisconsin #099 Chemotherapy: Response and Survival Data, Author(s): David E Weissman, Charles F von Gunten, April 2009.,药物不良反应严重,占据全球主要死亡原因第4-6位我国因药物不良反应住院人数250万/年因药物不良反应死亡人数约20万/年,6,循证医学模式下的抗肿瘤用药,以群体医疗数据为依据，其实存在个体差异；治疗方案的选择依据的是肿瘤的解剖学部位，应着重考虑同一肿瘤的基因差异；,7,临床中使用的个体差异检测手段,8,传统基因检测方法的临床局限性,第一代测序检测不到低频突变，假阴性率高一次只能测一个基因所需样本量大，穿刺样本耗尽，患者失去其它基因检测和个体化治疗的机会,9,第二代测序,10,美国第二代测序临床应用-举例,11,临床病历资料女性， 58岁，病理诊断为转移性胸腺癌；胸腔和肝内病灶增大迅速,基因检测结果KIT基因突变（在此种肿瘤非常罕见）,临床治疗KIT蛋白激酶抑制剂伊马替尼，一天一次，连续1月RECIST标准疗效评价，SD（疾病稳定）,伊马替尼治疗前,伊马替尼治疗1个月,12,产品简介,13,通过第二代测序检测患者肿瘤组织和正常组织的88个基因，找出体细胞突变和某些多态性位点，结合患者的其他临床信息，借助晶云的药物基因组知识库和大数据算法，为医生提供最优的用药方案参考。,为什么是88个基因,药物基因组数据库、文献挖掘国内外靶向药伴随诊断的基因化疗药代谢有关基因化疗药有效性的标记基因国内药物临床试验入选标准中提到的基因文献中报道的可能耐药基因,14,自主研发的药物基因组知识库,基于PharmGKB、SNPedia数据库，加上文献挖掘，收录对药物在人体内吸收、代谢、疗效及不良反应产生影响的基因变异国内外药物临床试验数据库,15,个性化用药分析报告,16,临床分析报告中的三大内容,推荐合适的靶向药、化疗药提醒靶向药原发性耐药推荐患者参加国内外药物临床试验,17,推荐合适的靶向药,18,EGFR-TKI药物与EGFR基因敏感性突变,埃克替尼的适应症本品单药适用于治疗表皮生长因子受体（EGFR）基因敏感突变的局部晚期或转移性非小细胞肺癌（NSCLC）患者的一线治疗不推荐本品用于EGFR野生型非小细胞肺癌患者埃克替尼的用药问题10% EGFR基因敏感突变的患者原发性耐药,19,靶向药原发性耐药提醒,EGFR-TKI药物原发性耐药的机制EGFR T790MALK基因重排RAS基因突变BRAF基因突变PTEN基因突变,20,推荐合适的化疗药,21,ERCC1, CDA多态性与铂类药物使用,22,推荐患者参加国内外药物临床试验,23,服务流程,24,25,感谢,26,27,肿瘤组织样本要求,28,一、石蜡组织标本手术样本（大样本）：切片25张以上（防脱玻片），厚度5m，肿瘤细胞占比50%，坏死组织区域10%；穿刺样本（小样本）：切片35张以上（防脱玻片），厚度5m，肿瘤细胞占比50%，坏死组织区域10%。切片时注意对切片机及台面进行消毒处理，不同样本更换新刀片，防止交叉污染。切片时摊片即可，无需烤片处理，切片编号规范清晰。为保证石蜡标本DNA提取的成功率，请尽可能送检1年以内的蜡块或6个周以内的石蜡切片。标本存放于塑料玻片盒中，4-8保存、运输。,肿瘤组织样本要求,29,二、新鲜组织标本手术样本（大样本）：肿瘤组织50mg，肿瘤细胞占比50%，坏死组织区域10%；穿刺样本（小样本）：穿刺1针以上，肿瘤细胞占比50%，坏死组织区域10%。收到组织后立即用至少5倍体积的10%中性福尔马林固定液固定，置于贴好标签的标本瓶中，于4-8条件下72h内送达实验室（穿刺样本尽量48h内送达）。,肿瘤组织样本要求,30,三、胸水胸水细胞沉渣：胸水沉渣3000rpm离心5min，将沉渣所得细胞转入1.5mlEP管中，封口膜封管口，管盖和管壁标记姓名编号，4-8条件下保存、运输。胸水细胞沉渣石蜡切片：将胸水细胞沉渣制作成石蜡包埋蜡块，4-8条件下送检蜡块或按照石蜡组织样本要求切片后送检。,产品升级,临床应用推荐合适的靶向药、化疗药靶向药抗药性预测推荐患者可参与的药物临床试验依据本产品使用者的反馈，推荐标准治疗方案科学研究发现驱动基因发现预后基因,31,32,精准医学的核心内涵是三个集成：1.基因蛋白与代谢组学的集成；2.临