第七章 细菌的分类与命名.ppt

第七章,细菌的分类与命名,第一节细菌的分类,一、细菌的分类地位细菌归属于原核生物界(Procaryotae)原核生物分两大类：细菌古细菌,细菌（Bacteria）又称真细菌（Eubacteria），包括细菌、放线菌、螺旋体、霉形体、立克次氏体、衣原体等，此外还涉及蓝细菌、紫色光合细菌等。,古细菌（Archaea）是16SrRNA寡核苷酸序列以及其他一些细胞组分在分子水平上与真核细胞和原核细胞的组分都有所不同的一类细菌，包括产甲烷菌、极端嗜盐菌、高度嗜热菌等。在兽医微生物学中，古细菌不占重要位置。,二、细菌分类的等级单元与其他生物相同，按界、门、纲、目、科、属、种、型排列。如两个等级之间中间类型过多，则加相应的亚类，如亚门、亚科、亚种等。,最重要和最基本的分类单元在微生物分类中种是最重要和最基本的分类单元，相似的种划归到一起构成属，相似属构成科，依此类推，最高的分类单元为界。目前科和科以上的划分在细菌学中还不太完善，而且随着研究的深入，科、属的划分还会发生变动。,三、种和种以下分类单位及含义1、种（species）种是细菌分类的基本单位。凡是生物学性状高度相似，在遗传性上属于同源（同源性大于97%）的一类细菌，可划归入一个种。同种细菌主要性状应该相同，但某些性状仍可有一定的差异，根据这些差异进一步划分，则形成亚种及型等。,2、亚种(Subspecies)同种细菌内，根据某一性状的不同可划分成亚种。这一性状通常是变异的且是稳定的。如：马链球菌马亚种金黄色葡萄球菌厌氧亚种,3、型（type）与亚型（subtype）同种细菌某一性状有差异，但这种差异不象亚种那样显著时，则划分为型。型常被用于亚种以下的细分，划分型仅从某一性状上来分。如：根据抗原性抗原型（血清型）噬菌体裂解噬菌体型生化反应生化型生物学特性生物型同型细菌按其微细差异进一步划分，则划分为不同的亚型，亚型不属于细菌正式的分类单元。,4、菌株（strain）又称品系，为同种细菌不同来源的纯培养物。同种细菌可有多个菌株，菌株的主要性状应相同，次要性状可稍有差异。具有该种细菌典型特征的菌株，为该菌的标准菌株（典型菌株或代表菌株），可供细菌鉴定及科研中作参考菌株。菌株的命名没有一定的规定，通常用地名或动物名的缩写加编号作菌株名。,5、群或组(group)不是正式的分类单元，在任何一级都可借用。在自然界常可发现某些细菌的特征是介于两种细菌之间，彼此不易严格区分，我们就把这两种细菌和介于他们之间的种类，划归为一个群。如大肠菌群。,四、细菌分类鉴定的标准长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是其表型特征，即形态、染色、培养、细胞壁结构、生理生化及抗原性的特征。这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的作用，尤其在临床微生物学实践中，至今仍有应用价值。,目前分类主要的依据主要是根据种系发生关系，即分析其基因的同源性，从而确定分类地位。方法主要采用三种：测定DNA分子中碱基(G+C)mol%核酸分子杂交16SrRNA寡核苷酸编目,五、细菌的分类体系伯吉氏系统细菌学手册（BergeysManualofSystematicBacterology），由美国细菌学家Holt主编，共四卷：第1卷一般医学和工业方面重要的G-细菌（1984年）第2卷放线菌以外的G细菌（1986年）第3卷古细菌、蓝细菌及其他G细菌（1989年）第4卷放线菌（1989年）从2001年开始发行第2版，共分5卷，计划在数年内出齐，内容将反映分子水平的细菌分类。,该书的姐妹篇是“伯吉氏细菌鉴定手册”（BergeysManualofDeterminativeBacterology），简要的描述了各个属的性状及属内各种的简明比较。自1923年出版第一版以来，经多次修订，于1984年出到了第九版。并改名为“伯吉氏系统细菌学手册”。,有关分类位置发生变化和分离鉴定新细菌的论文，都应在“国际系统与进行微生物学杂志”（IJSEM）原名“国际系统细菌学杂志”（IJSB）发表，如在其他杂志发表，必须提交论文副本给该杂志公布，两年后无异议，所提出的新细菌名称才能生效。,第二节细菌的命名,细菌的命名依据国际细菌命名法规采用“双名法”命名。即用“属名”加“种名”来表示一个生物的学名。书写时“属名”在前，用拉丁文或拉丁化的名词表示，且第一个字母大写；“种名”在后，用拉丁文或拉丁化的形容词或名词