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文档简介

外文医学数据库,PubMed,PubMed一、PubMed数据库简介二、PubMed数据范围三、PubMed主页四、PubMed检索方法五、检索结果的处理,PubMed是美国NLM所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的一个以Web方式向用户提供服务的生物医学文献检索系统,是目前世界上查找医学文献利用率最高的网上免费数据库,一、PubMed数据库简介,二、PubMed的数据范围,出版商提供的书目信息,PreMedline,OLDMEDLINE(1950-1965),MEDLINE,MEDLINE数据库简介,收录范围:来源于美国和世界上70多个国家和地区、50种语言的7395种(截止到现在)权威生物医学及相关学科期刊,内容涉及生物医学各个领域;85%以上原文为英语,80%记录有文摘,5%免费全文。目前记录已达约2200万条,约40万篇/年。回溯时间:1966年至今。记录中有indexedforMEDLIEN标记,学科范围:基础生命科学临床生命科学生物科学解剖学组织学化学与药物心理学社会医学农业医技设备学医技工业学医学信息学使用词表:MeSH(医学主题词表),PreMEDLINE,是一种由正在加工处理中的文献记录组成的数据库,这些新记录还未被或正在标引,暂时存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新,经过标引(增加主题词、文献类型、数据库存取号等字段)以后转入Medline,一旦记录被转入到Medline数据库,就被从PreMEDLINE数据库中删除。记录中有PubMed-inprocess的标记。,Pre-Medline最新信息,Medline,NewData,Collect,PubMed,Process,PubMed,一周以后,出版商提供的书目信息(Publisher-SuppliedCitation)出版商直接向PubMed提供的非Medline收录的电子刊物,记录标有Recordassuppliedbypublishers标记。(如:Science或Nature中的地质学文献等)。,标记不同,出自分库亦不同,Nucleotide:DNA序列数据库Protein:蛋白质序列数据库Genome:基因组序列数据库Structure:分子结构模型数据库OMIM:人类孟德尔遗传学在线数据库PMC:PubMed中心,免费全文期刊检索,与NCBI其它数据库的链接,3.特点获取生物医学权威期刊最多世界上70多个国家的7395种权威期刊多种检索方法,多条检索途径时效性极强(每周更新)回溯年代久远(1950年至今)利用MeSH作为转换词表,标引质量高部分文献可以免费获取全文检全率、检准率高,PubMed简介,三、PubMed主页,免费进入PubMed途径:/PubMed/sites/entrez,主页结构,四、PubMed的检索途径和方法基本检索高级检索主题检索期刊检索专用检索,(一)基本检索,PUBMED提供了词汇自动转换功能:MeSH转换表期刊转换表短语表作者姓名索引逻辑运算符检索,检索运算符,(1)逻辑运算符:OR、AND、NOT运算顺序:ORANDNOT,可用()改变检索词的处理顺序。(2)截词符:*。eg:cell*:cell、cells、celliferous、cellophane和cellular等词的文献。(3)利用字段标识符进行限定检索:检索式格式:检索词A字段标识B,检索在字段中含有检索词A的文献。如:hepatitisTI,smithAU,cellTA。(4)“”,将短语做为不可分割的整体进行检索。如:“OXYGENFREERADICALS”注意:AND必须大写、和“”必须为英文或中文半角。,Pubmed简单检索实例例一查找有关“肝癌和肝炎的关系”的文献,英文“livercancer”和“hepatitis”,检索结果显示,题录格式内容(几个字段?),作者限定字段检索,例二查找作者Hemilah著作的文献,在西文文献里,著者的署名一般名在前姓在后,例:著者“HenryHemila”应转换成“Hemilah”,后加著者字段限定来检索,注意:姓在前,名在后姓全称,名缩写,四、PubMed的检索途径和方法基本检索高级检索主题检索期刊检索专用检索,检索框,检索史,限定检索,30个字段,Limits(限定)PublicationTypes:有7种类型Languages:提供常用的7种语种Ages:共有13个年龄段Gender:男性、女性HumanorAnimalSubsets(子集):11个主要子集Dates:可检索1965年至今的文献,限定检索,索引检索,PubMed高级检索实例例:查找关于“锌对于2岁婴儿(即出生至23个月)成长的作用”(要求时间20002008)的英文文献步骤一,确定关键词ZincInfantGrowth,把它们输入检索框。,步骤二,限定时间。点击。在其中的PublicationDate的输入框内输入FROM2000TO2008.步骤三,限定语种。在Languages下拉菜单内选择English。,四、PubMed的检索途径和方法基本检索高级检索主题检索期刊检索专用检索,主题检索,MeSHDatabase:例1:从主题途径查找FK506副作用例2:从主题途径查找肾移植的文献例3:从主题途径查找阿司匹林治疗高血压的文献,检索流程第一步:主题分析英文转换FK506adverseeffectskidneytransplantation点击MeSHDatabaseMesh界面输入检索词Go,第二步:选定该主题词主题词轮排表点击该主题词主题词细节屏,主题词轮排,提示相关词,主题词轮排表,第三步:主题词细节屏(主题词词义注释、副主题词、加权或不扩展、入口词、曾用词、树状结构)选择合适的副主题词选择加权或不扩展sendto,主题词细节屏,主题词词义注释,主题词细节屏,副主题词选择,主题词词义注释,加权检索,不扩展检索,曾用词,药理作用,树状结构,曾用词,入口词,树状结构,药理作用,选择发送方式SearchBoxwithANDSearchBoxwithORSearchBoxwithNOT,第四步:searchbox点击searchPubMed检索结果,searchbox,题录格式界面,例:检索利用阿司匹林治疗高血压的文献。分析:本课题包含两个主题词,即阿司匹林(aspirin)和高血压(hypertension),阿司匹林(aspirin)组配副主题词治疗应用(theraputicuse),高血压应组配副主题词药物疗法(drugtherapy),两条检索式之间用and联接。,Pubmed主题词检索的功能:(1)理解词义和收入词表的时间(2)限定副主题词,提高查准率。(3)加权检索,提高查准率。(4)了解树形结构,扩展检索,提高查全率(5)了解同义词,提高查全率。,四、PubMed的检索途径和方法基本检索高级检索主题检索期刊检索专用检索,JournalDatabase(期刊数据库)可输入刊名全称、缩写或国际标准期刊号(ISSN)检索特定期刊的编目信息;,检索:PubMed中收录关于高血压(hypertension)的期刊有哪些?,引文匹配器,引文匹配器(SingleCitationMatcher)nursing,2008,38(12):61,PubMed一、PubMed数据库简介二、PubMed数据范围三、PubMed主页四、PubMed检索方法五、检索结果的处理,四、检索结果处理,1、检索结果的显示与标记2、检索结果的保存及定购,检索结果显示默认为题录格式每页显示20条记录,结果显示格式,每页显示记录数,结果排序方式,纯文本方式显示,纯文本显示记录,文摘显示格式,MEDLINE格式,可链接到SpringerLink数据库获取全文,但是是收费的,可链接到PubMed中心获取免费全文,

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