基于结构的虚拟筛选及Maestro的使用教程_第1页
基于结构的虚拟筛选及Maestro的使用教程_第2页
基于结构的虚拟筛选及Maestro的使用教程_第3页
基于结构的虚拟筛选及Maestro的使用教程_第4页
基于结构的虚拟筛选及Maestro的使用教程_第5页
已阅读5页,还剩9页未读 继续免费阅读

下载本文档

版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领

文档简介

基于结构的虚拟筛选与Maestro的使用,朱孔凯2015-7-22,药物发现面临的挑战,化学空间,1020类药化合物,生物空间,104105蛋白,药物发现,先导化合物,药靶,正确的小分子+正确的药靶,高通量筛选VS虚拟筛选,优点:可进行大规模(上百万分子)筛选。缺点:费钱;有些体系不适合;命中率低。,晶体结构,已知,未知,基于配体的方法,基于结构的方法,分子对接,已有活性化合物,相似性搜索,药效团模型,机器学习,没有活性化合物,常用的分子对接程序有DOCK,AutoDOCK,Glide,Gold等。,Maestro,登陆:(Putty、Xshell),Maestroisthegraphicaluserinterface(GUI)forallSchrdingersoftware.,Prime-蛋白质结构预测;Glide-配体-受体分子对接;Liaison-预测结合与亲和力;Qsite-研究蛋白质活性区域内的反应机制(QM/MM);Phase-作基于配体的药效建模;QikProp-用于候选药物的ADME性状预测;LigPrep-用于小分子配体的准备;Epik-对生物环境中的配体质子化状态做精确枚举;Jaguar-高性能初始量子力学组件;MacroModel-应用于材料及生命科学等的化学研究;Strike-用于检查组织性能关系的化学方法统计程序;,分子对接(Glide),分析对接结果,ApplicationsG

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

评论

0/150

提交评论