蛋白质PDB文件说明

1、字符集合 只曼一些非控制型宇符，敷空格和结束符，出现在PDB文件记录中。也就是： “bcdufghijldmn()pqrstuvwxyzABCDEFGHIJKLMN()PQRSTUVWXYZ 1234567890 入 COMPND 2 MOLECULE： GLUTATHIONE SYNTHETASE; COMPND 3 CHAIN: NULL; COMPNP 4 SYNONYM: GAMMA-L-GLUTANrirL-L-CYSTEINE:GLYCINE UGASE COMPND 5 (APP-FORM1NG); COMPND 6 EC： 63.2.3; COMPND 7 ENGINEERED

2、: YES COMPNP MOLJD: 1; COMPND 2 MOLECULE： S-APENOSYLMETH1ONINE SWTHETASE; COMPND 3 CHAIN: A, B; COMPND 4 SYNONYM: MAT. ATP：L-METHIONINE S-ADENOSYLTRANSFERASE; COMPNP 5 EC： 2.5.6; COMPNP 6 ENG1NEEREP: YES; COMPND 7 BI()LOGICAL_UNIT: TETRAMER; COMPND 8 ()THER_DETA】LS: TETRAGONAL MODIFICATION 数据类型 该部分该

3、部分主雯用来描述试验和记录中该大分于的一些基本信息，有 以下几种记录： HEAP ERX)BSLTE,T1TTTLE,CA VE AT,COMPND,SOURCE,KEYWDS, EXPDTA, ACTHOREVDATSPRSPEJRNL和REMARK部分。以下来具体说明一下各个记录。 记录类塑 按照在记录中出现的频率区分： SINGLE 一个X件中只出现一次按宇母顺序列出如下： 记录类塑说明 CRYST1晶胞参数 END结束 HEAD ER分于类，公布日期,IP号 MASTER版权拥有者 ORIGXn宜角一PPB坐标 SCALEn直角部分结晶学坐标 如杲这些记录在一个记录中重复出现是错误的。

4、 SINGLE CONTINUED 在记录中概念性的只出现一次,但信息内容可能超过了可利用列的数目閃次这些记录在后来的排列中会继续按宇母顺序列出如下: 记录类型说明 AUTHOR结构测定者 CAVEAT可能的错谋提示 COMPNP化合物名称 EXPDTA测定结构所用的试验方法 KEYWDS 关键词 OBSLTE注明该id号巳改为新号 SOURCE化合物来源 SPRSPE巳撤消或更改的相关记录 TITLE说明试验方法类型 MULTIPLE 大部分记录类型多次出现,经常出现在这些组中，组中的信息理论上并没有连接,但巳呈现为列表的组成部分这种记录类型中的许多习惯连载可能不 仅仅制定记录还和其他记录相

5、联按宇母顺序列出如下： 记录类型说明 ANISOU温度因子 ATOM标准基因的原亍坐标 CISPEP顺势残.基 CQNECT有关记录 DBREF其他序列库的有关记录 HELIX螺旋 HET非标准残基 H ETSYM 非标准残杀的同义宇 HYDBND 氢键 LINK残越间化学键 MODRES对标准残基的修饰 MTRINn显示非晶相对称 REVDAT修订日期氏相关內容 SEQAPVPPB与其它记录的出入 SEQRES残基序列 SHEET片层 S1GATM 标准差 S1GU1J温厦閃于 SITE特性位点 SLTBRG盐桥 SSBONP 二硫键 turn转折 TVECT转换閃子 Multiple Co

6、ntinued 在记录中概念性的出现多次，但信息内容可能超过了可利用列的數目闵次这些记录在后来的排列中会继续按宇母顺序列出如下： 记录类型说明 FORMUL非标准残埜化学式 HETATO非标准集团原子坐标 H ETNAM 非标准残基的化学名称 Grouping 有三种记录类型用来聚合其他记录.按宇母顺序列出如下： 记录类型说明 ENPMDL亚基结束 MODEL多亚基时，示亚基号 TER链末端 MODEL/ENDMPL 记录包围着 ATOM, HETATO, SIGATNI, AN1SOU, SIGUIJ,和 TER 记录.TER 记录预示链的耒端. Other 其他记录类型有详细的内部结构按宇

7、母顺序列出如下： 记录类型说明 JRNL发表坐标集的文蔽 REMARK注解 记录的表示 PDB数据库中的數据都应按照一定的规定来出现，强制记录类型必须出现在所有的记录中，当强制数据没有提供，记录名必须出现在记录中并以 NULL表示当此条件存在时选择项丧就交成强制记录类型。以下表格曼对这两种类型的具体划分和描述： 记录类型 说明1 变为强制的条件 HEADER 强制1 OBSLTE 可选1 个别记录中强制 TITLE 强制 CAVEAT 可选 该记录中有错误 COMPND 强制 SOURCE 强制 KEYWDS 强制1 EXPDA 强制 1 AUTHOR 强制1 REVDAT 强制 SPRSDE

8、 可选1 在被替代的记录中 JRNL 可选 出版物描述了该试验 REMARK 1 可选 出版物描述了该试验 REMARK 2 强制 REMARK 3 强制1 REMARK N 可选1 一泄条件下强制，如记录在备注描述 DBREF 可选 每个缩氨酸链的长度大于十个残基并 且核酸记录存在于核算蛋白库中（NDB） SEQADV 可选 有序列冲突 SEQRES 可选 ATOM记录存在 MODRES 可选 有修饰存在 HET 可选 1 有不标准的残基除了水分子 HETNAM 可选1 有不标准的残基除了水分子 HETSYN 可选 FORMUL 可选 有不标准的残基或水 HELIX 可选 SHEET 可选

9、TURN 可选 SSBOND 可选 有二硫键存在 LINK 可选 HYDBND 可选 SLTBRG 可选 CISPEP 可选 SITE 可选1 CRYST1 强制 ORIGX1 0RIGX2 ORIGX3 强制1 SCALE1 SCALE2 SCALE3 强制1 MTRIX1 MTRIX2 MTRIX3 可选 完全不对称单元 非晶相对称 TVECT 可选1 MODEL 可选 记录中多于一个MODEL ATOM 可选1 有标准的残基存在 SIGATM 可选1 ANISOU 可选 SIGUIJ 可选 TER 可选 有ATOM记录存在 ENDMDL 可选 有MODEL存在 CONNECT 可选 不标

10、准的团存在 MASTER - 强制 END 强制 精品 记录部分的划分 Title 大槪描述 HEADER, OBSLTE, TITLE, CAVEAT, COMPND, SOURCE, KEYWDS, EXPDTA, AUTHOR, REVDAT, SPRSDE, JRNL Remark 参考书目，最大分辨率,注解等 REMARKS 1, 2, 3 and others Primary structure 一级结构氨基酸或核昔酸序列和PDB序列与 英他序列库的有关记录 DBREF, SEQADV, SEQRES, MODRES Heterogen 不标准组的描述 HET, HETNAM, H

11、ETSYN, FORMUL Secondary structure 二级结构 HELIX, SHEET, TURN Connectivity annotation 化学元素连接 SSBOND, LINK, HYDBND, SLTBRG, CISPEP Miscellaneous feature 大分子的特征 SITE Crystallographic 晶体细胞描述 CRYST1 Coordinate transformation 坐标描述 ORIGXn, SCALEn, MTRIXn, TVECT Coordinate 原子坐标数据 MODEL, ATOM, SIGATM, ANISOU, S

12、IGUIJ, TER, HETATM, ENDMDL Connectivity 化学键连接| CONECT Bookkeeping 槪要信息和结束标志 MASTER, END 对数据类型的说明 数据类型 Achar Atom Character Continuation 描述 一个英文字母(A-Z, a-z) 原子名 ASCII码和空格 如果一行描述不完用此表示序列号，占两个字符右对齐，第一个用空格 Date 占九个字符dd-mmm-yy, DD表日期，右对齐不足左补零;MMM表月份用常用的三个英文字母表示;YY表20世纪的一 年，他们都必须是有效日期 IDcode 占四个字符，第一个是阿拉伯

13、数字(0-9),余下的三个由希腊数字组成，字母必须是大写的。若第一个是阿拉伯数 字零则对此蛋白质的描述中没有坐标数据 Integer Token List Lstring LString(n) Real (n, m) Record name Residue name Slist Specification Specification list String String (n) SymOP 右对齐，不足的用空格填充的整型数据 由一组没有空格的字符组成，结尾部分紧跟着冒号和空格 一个由逗号分开的字符串 字符串，任何空格都有意义必须保存 有N个字符的Lstring 实型 记录的名字，由六个字符组成

14、，左对齐，不足的用空格补充 右对齐格式标准氨基酸或核昔酸中的一个，后有列表不标准组分在HET中详细说明 由一些内容组成的字符串，有分号分开 由一些token记录组成的字符串，由冒号分开 由Specifications组成的序列，由分号分开 由字符组成的序列，可能有些空格，但应该详细说明 由N个字符组成String 由4-6个数字组成的整数，右对齐格式详细资料在Appendix 1 残泰名宇 在PPB格式中出现的标准残基的名宇: 残基类型 氨基酸 核酸 其他 残基名字 ALA, ARG, ASN, ASP, CYS, GLN, GLU, GLY, HIS, ILE, LEU, LYS A, C,

15、 G, T, U, I, +A, +C, +G, +T, +U, +1 UNK(unknown) Appendix 4中有更多关于标准残基名和缩写的信息,Appendix 5中有他们的化学式和分子量. 标题部分 HEADER份子类，公布日期、ID号） 综述 该记录包合三个方而的内容：罢白质的种类，被该数据库接收的日期和唯一区分该罢白质的id CODE. 记录格式 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1 - 6 Record name ” HEADER” 11 - 50 String(40) classification 该餐白质的分类 51 - 59 Dale depDate 被數据库接收的日期

16、 63 一 66 IDeode idCodc 唯一标识某个餐白 细节 改分类丧示悬左对齐的，并且由于分给宇符位的限制，有时分类名太长，要用简写衰示。在KEYWDS记录中存着改分类的全称。 示例 1234567 1234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 HEADER MUSCLE PROTEIN02-JUN-93 1MYS HEADER HYDROLASE (CARBOXYLIC ESTER)08-APR-93 2PH1 HEADER COMPLEX (LECT1N/TRANSFERIUN)07-

17、JAN-94 1LGB OBSLTE （注明此ED号巳改为新号） 综述 该记录出现在巳经被收回的罢白质的描述中，可以作为一个标志。任何新的记录都能代替别回收的记录这个版本允许多个新纪录代替现有记录. 记录格式 列 數据类型 宇段名称 定义描述 1 - 6 Record name OBSLTE， 9-10 Continuation continuation 允许多畫记录串联表示不同行的顺序号 12 - 20 Date repDate 被替代的日期 22 - 25 IDeode idCodc 该记录的id code 32 - 35 IDeode rldCodc 替换的id code 37 - 40

18、 IDeode rldCodc 替换的id code 42 - 45 IDeode rldCodc 替换的id code 47-50 IDeode rldCodc 替换的id code 52-55 IDeode rldCodc 替换的id code 57 - 60 IDeode rldCodc 替换的id code 62 - 65 IDeode rldCodc 替换的id code 67 一 70 IDeode rldCodc 替换的id code 细节 只有第一个提交记录的人才有权利收回改蛋白质，所有回收的记录都有硏究用途. 示例 1234567 1234567890123456789012

19、3456789()1234567890123456789012345678901234567890 OBSLTE 31-JAN-941MBP 2MBP TITLE（说明实脸方法类型） 综述 该记录描述试验的题目或者对它的一些分析。该记录唯一区分一个罢白质。 记录格式 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1-6 Record name ”TITLE M 9-10 Continuation 顺序 允许多重记录串联裘示不同行的顺序号 11 -70 String 标题 试验題目 细节 1. 描述记录內容和区别相似记录得程序或条件,使录入者有机会著重强调做这些特殊试脸得根本目的. 2. TITLE可能包括

20、得一些项目：实验类型 -对突炎的描述 -记录中只给出a-碳原于. 示例 1234567 12345678901234567890123456789()1234567890123456789012345678901234567890 TITLERH1ZOPUSPEPSIN COMPLEED WITH REDUCED PEPT1PE INHIBITOR T1TLEBETA-GLUCOSYLTILAXSFERASE, ALPHA CARBON COORDINATES ONLY CAVEAT（可能的错误提示） 综述 警告在蛋白质记录中中出现的错误。 记录格式 列 數据类型 宇段名称 定义描述 1-6

21、Record name ” CAVEAT 9-10 Continuation continuation 允许多重记录串联表示不同行的顺序号 12- 15 IDeode idCodc 买白质的ID code 20-70 Siring comment 營告的原闵 细审 1. PDB在还来回收的错误记录中加此记录，用的比较保守只在外部评论后用. 2. PDB不能核实转化回晶胞时注意此记录，此时分子结构依然正确. 示例 1234567 1234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 CAVEAT 1ABC T

22、HE CRYSTAL TRANSFORMATION IS IN ERROR BUT IS CAVEAT 2 1 ABC UNCORRECTABLE AT THIS TIME COMPND（化合物分子组成） 综述 描逑餐白质的组成 记录格式 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1 -6 Record name ” COMPNIT 9-10 Conrinuation continuation 允许多重记录串联丧示不同行的顺序号 11 -70 Specification list compound 对分于成分的描述 细节 对罢白质组成的描述又细分为如下: 记号 MOLJD MOLECCL E CHAI

23、N FRAGMENT SYNONYM EC E NG1NEER ED MUTATION B】()L()G1CAL_UN】T ()THER_D ETAILS 确切涵义描述 每一成分的數目 分于名 逗号分开琏标识符，若空白用NULL”表示 对结构域或具体部分的详细描述 MOLECULE同义部分，逗号分开 珞学委员会相关号码，不止一个时用逗号分开 分于通过重组产生或纯化学合成 自野生型突变的描述 完整功能单元描述 増加的注释 对MUTATION以下举例说明惯用的几种突萸类型: 突萸类型 描述 形式 简单替代 極入突变 缺失突变 Asn 替代 His 57 只在C链中Asn替代His 57 His a

24、nd Pro 插入 Lys 48 前 A链和C链的Arg 141缺失,B链 中的不缺失 His 23 到 ARG 26 缺失 DEL(23-26) 只B链的His 23C和Arg26缺失 COMPND COMPNP COMPND COMPND COMPND COMPND COMPNP COMPND MOLJP: 1; 2 MOLECULE: HEMOGLOBIN; 3 CHAIN: A, B, C, D; 4E NG1NEERED: YES; 5 MUTATION: CHAIN B, P, VIA; 6 BK)L()GICAL_UNIT: HE MOGLOBIN EXISTS AS AN A1

25、B1/A2B2 7 TETRAIMER； 8 OTHER.P ETAILS: DE OXY FORM COMPND COMPND COMPND COMPND COMPND COMPNP COMPNP COMPND COMPND COMPND COMPNP COMPNP MOLJD: 1; 2 MOLECULE: COWPEA CHLOROTIC MOTTLE VIRUS; 3 CHAIN: A, B, C; 4 SYNONYM: CCMV; 5 MOLJP: 2; 6 MOLECULE: RNA (5,-(*AP*UP*AP*U)-3t); 7 CHAIN: D, F; 8 ENGINEERE

26、D: YES; 9 MOLJP: 3; 10MOLECULE: RNA (5,-(*AP*U)-3t); 11 CHAIN: E; 12 ENGINEERED:YES H57N Chain C, H57AN INS(HP-K48) Chain A, C, PEL(R141) DE L(23-26) ChMn B、DEL(H23QR26) 如有多于十种突燹一所有突变在SEQAPV记录中列出 -一些突变可能在COMPND的MUTAT3ON中列出来强调录入者认为最畫要的部分. 示例 1 12345678901234567890123456789()12345678901234567890123456

27、78901234567890 COMPND MOLJD: 1; COMPND 2 MOLECULE: HEVAMINE A; COMPND 3 CHAIN: NULL; COMPND 4 EC： 3.2.14, 7； COMPND 5 OTHER.PETAILS: PLANT END()CH1T1NASE/LYS()ZYME SOURCE（化合物耒源） 综述 确切涵义描述 分于数目 化学合成来源 分于结构域或片段的详细描述 生物体的系统命名 生物体的习惯金名 标识链 标识参数 实验细胞链 American Type Culture Collection 号 码 有待殊功能的组织

28、一般功能和结构的组织细胞 标识特殊的细胞类型 细胞组织结构 标识分泌物如唾液，尿液，毒液等 标识细胞位虽 识别包 XR的质体 标识基因 重组大分于表达系统 生物体的张力 生物体的参數 细胞排列 标识 ATCC numbe 标识表达分于的特殊器官 标识表达分于的特殊组织 裘示细胞类型 标识细胞器官 标识位昼 标识载体类型如质粒，病毒，粘粗等 标识常用载体 在重组试验中常用质粒 重组试验中常用的基因的名 表示别处给出的信息来源 用来详细描述记录中每个生物大分子的生物或化学来源。用习惯命名和系统命名共同描述. 记录格式 列 數据类型 宇段名称 定义描述 1-6 Record name HS()URC

29、 E” 9-10 Coniinuarion continuation 允许多重记录串联裘示不同行的顺序号 11 -70 Specification list sreName 分子来源名 细节 同COMPND样,对SOURCE描述也细分为如下: 记号 M()L_1D SYNTHETIC FRAGMENT ()RGANISM_SCI ENT3 FIG ORCrANISM.COMMON STRAIN VARIANT CELL_L1NE ATCC ORGAN TISSUE CELL ORGANELLE SECRETION CELLULAR.LOCATION PLASMID GENE EXPR ESS1

30、()N_SYSTEI EXPRESSK)N_SYSTEM_STRA1N EXPRESSK)N_SYSTEM_VAR1ANT EXPR ESS1()N_SYSTEI_CELL_L1NE EXPRESSK)N_SYSTENLATCC_NUMB ER EXPR ESS1()N_SYSTEM_( )RGAN EXPR ESS1()N_SYSTEI_T1SSUE EXPR ESS1()N_SYSTEM_CELL EXPR ESS1()N_SYSTEM_()RGANELLE EXPR ESS1()N_SYSTEM_C ELUJLAR_L()CAT1()N EXPRESS1()N_SYSTEM_VECT()

31、R_TYPE EXPRESSK)N_SYSTEM_VECTOR EXPR ESS1()N_SYSTEI_PLASM1D EXPRESS ( )N_S YSTEM.G ENE ()THER_D ETAILS 示例 1 234567 1234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 SOURCE MOLJD: 1; SOURCE 2 ORCtANISM.SCIENTIFIC: AVIAN SARCOMA VIRUS; SOURCE 3 STRAIN: SCHM1DT-RUPPIN B; SOURCE 4 E

32、XPRESSION.SYSTEM: ESCHERICHIA C()LI; SOURCE 5 EXPRESSION.SYSTEI_PLASM】D: PRC23IN SOURCE MOLJD: 1; SOURCE 2 ORCtANISM.SCIENTIFIC: GALLUS GALLUS; SOURCE 3 ORCtANISM.COMMON: CHICKEN; SOURCE 4 ORGAN: HEART; SOURCE 5 TISSUE: MUSCLE KEYWS（关键词） 综述 该部分主要用来描述关于该罢白质的一些关键宇，用逗号分开。 记录格式 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1-6 Reco

33、rd name ” KEYWDS” 9-10 Continuation Continuation 允许多重记录串联裘示不同行的顺序号 11 一 70 List kuvwds 各个不同的关键宇用逗号分开 细节 在该记录中描逑的关键宇的內容可以畏：功能分类，代谢角色，在生物或化学上的活性，结构分类等。 示例 1234567 12345678901234567890123456789()1234567890123456789012345678901234567890 KEYWDS LYASE, TRCARBOXYLIC AGIO CYCLE, MITOCHONDRION, OX1DAT1VE KEY

34、WDS 2 METABOLISM EXPDTA（测定结构所用的实验方法） 综述 该记录用来描述关于试验的一些信息,主要是做试验时用的方法：电子衍射，光纤衍射，吨光传递，中子衍射，NMR（核磁共振），理论模型，光 衍射等。 记录格式 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1-6 Record name ”EXPDTAH 9-10 Continuation Continuation 允许多重记录串联表示不同行的顺序号 11 一 70 SList technique 试验用的方法 细节 该记录是必须出现的；如杲有多于一种的方法被使用，用分号分开。对某一方法的评论出现在分号前面。 示例 1234567 1

35、2345678901234567890123456789()1234567890123456789012345678901234567890 EXPDTA X-RAY DIFFRACTION EXPDTA NEUTRON DIFFRACTION; X-RAY DIFFRACTION EXPDTA NMR. 32 STRUCTURES AUTHOR（结构测定者） 综述 该记录存储有关科学家的名宇倍息。多个名宇用逗号分开。 记录格式 列 數据类型 宇段名称 定义描述 1 -6 Record name AUTHOR 9-10 Coniinuarion Conrinuarion 允许多重记录串联表示不

36、同行的顺序号 11 -70 List authorList 作者的名宇，用逗号分开 细节 个人姓名的表-First names和middle names在姓之前大写于词首，后跟一句点. -只有作者的姓完整给出. -若为作者名宇的一部分可用连宇号. -姓可用省珞符号裘示 -Junior不是简珞. -夾音或其他宇符修改都耒给出 个人姓名的结构:-词首大写宇谆和其后的句点后么没有空格 空格只用在姓中或姓和Junior, II,或III之间 -缩写作为姓的一部分如St.或Stu.与其后的姓的下一部分之间有一句点和空格. 褒体名宇的表示:-所有作者的团体名宇应该完整拼写. -大团体的名称应在其细分名称之

37、前，如某所大学的化学系. 倚殊情况：-名宇若有英X译本就用英文裘示,否则就用不本土语言，必要时可音译. 示例 1234567 1234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 AUTHOR M.B.BERRY,B.MEAP()KT.BLD ERBACKPLIANGLGLAS ER, AUTHOR 2 G.N.PHILL1PS JUNIOR.T.L.ST. STEVENS AUTHOR C.-I.BRANPENC.J.BIRKETT-CLEWSL.R1VA PI SANSAVER1XO REVDAT(修订

38、日期及相关内容) 综述 该记录用耒描述曽经修改过的历史记录。 记录格式 列 數据类型 宇段名称 定义描述 16 Record name HREVPATH 8-10 Integer modNum 修改的号码 11 - 12 Continuation continuation 允许多畫记录串联裘示不同行的顺序号 14-22 Date modDatc 更改的日期，不再重复 24-28 String) modld 标识这个特殊修改 32 Integer modTypc 用一个整数来裘示更改的类型 40-45 LString(6) record 更改的记录的名宇 47-52 LString(6) rec

39、ord 更改的记录的名宇 54-59 LString(6) record 更改的记录的名宇 61 -66 LString(6) record 更改的记录的名宇 细节 对餐白质的每一次修改，标识其修改的号码就増一；该记录出现的次序是递减的，最近的修改先出现。修改类型用數宇表示如下: 0晟初发市的记录 1 混杂的 2 修改CQNECT记录. 3 修饰坐标或构型 4-9没有定义 示例 1234567 12345678901234567890123456789()1234567890123456789012345678901234567890 REVPAT 3 15-OCT-89 1PRCB 1RE

40、MARK REVPAT 2 19-APR-89 1PRCA 2CON ECT REVPAT 109-JAN-89 1PRC 0 SPRSDE(巳撤销或更改的相关记录) 综述 存储巳经作废了的in code氏替换的Pcodc. 一条记录可能代替很多，只有结构的主要调査人才有权收回它. 记录格式 列 數据类型 宇段名称 定义描述 1-6 Record name HSPRSPEM 9-10 Continuation continuation 允许多賣记录串联表示不同行的顺序号 12-20 Date sprsdeDate 替换日期,不重复 22-25 IDeode idCodc 匣来的】Dc（）如不重

41、复 32-35 IDeode sldCodc 替换的IDeode 37-4() IDeode sldCodc 替換的IDeodu 42-45 IDeode sldCodc 替换的IDeodu 47-50 IDeode sldCodc 替换的IDeode 52-55 IDeode sldCodc 替換的IDeodu 57-60 IDeode sldCodc 替换的IDeodu 62-65 IDeode sldCodc 替换的IDeode 67-70 IDeode sldCodc 替换的ID code 细节 IP code列表在第一个空白的slPcodc区域结束 示例 1234567 123456

42、7890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 SPRSP E17-JUL-84 4HHB1HHB SPRSPE27-FEB-95 1GPJ1LH4 2LH4 JRNL(发表坐标集的文献) JKNL (发表坐标集的文献) 综述 存储用来描述试验的文献引用。 记录格式 列 数据类型 字段名称 左义描述 1 - 6 Record name ”JRNL ” 13 - 70 LString text 看下而的详细描述 细节 如下表格用来描述该记录的亚记录，细分为： 1. AUTHOR （作者） 包含引用的著明出版刊物上的

43、论文或投稿的作者的列表. 列 数据类型 字段名称 左义描述 1 - 6 Record name ” JRNL ” 13 - 16 LString (4) AUTH” 出现在所有连续记录中 17 - 18 Continuation continuation 允许多重记录串联表不不同行的顺序号 20 一 70 List authorList 作者名单 2. TITL （参考书的标题） 详细说明参考书目的标题. 列 数据类型 字段需称 左义描述 1-6 Record name ”JRNL ” 13 一 16 LString (4) 17 一 18Continuation continuation 2

44、0 - 70 LString title 允许多重记录串联表示不同行的顺序号 文章的标题 3. EDIT （编辑） 编辑非左期刊物上的相关参考. 列 数据类型 1 - 6 Record name 13 - 16 LString(4) 17 - 18 Continuation 20 - 70 List 字段需称 ”JRNL ” EDIT continuation editorList 左义描述 允许多重记录串联表示不同行的顺序号 编者的需单 4. REF （参考） 分两种情况: 4a如果参考书目还没有被出版，.亚记录类型有如下格式: 列 数据类型 字段需称 左义描述 16 Record name

45、 ”JRNL ” 13 - 16 LString(3) REF 17 - 18 LString (15) TO BE PUBLISHED 4b.参考书目已经出版了, REF亚记录类型包括适当领域关于出版物名称，附录，报笥卷页，年等的信息. 列 数据类型 字段洛称 怎义描述 1-6 Record name ”JRNL ” 13 - 16 LString (3) REF 17 - 18 Continuation continuation 允许多重记录串联表不不同行的顺序号 20 - 47 LString pubName N出版物的划字 50 - 51 LString(2) V. 只出现在第一个亚记

46、录中 右对齐空格补足 52 - 55 String volume 说明：只出现在第一个亚记录中 57 - 61 String page 文章的第一页，出现在第一个亚记录中 63 - 66 Integer year 出版的时间，出现在第一个亚记录中 5. PUBL（出版者的名字或出版的地方） 列 数据类型 字段需称 左义描述 1 - 6 Record name ，ZJRNL ” 13 - 16 LString(4) PUBL 17 - 18 Continuation continuation 允许多重记录串联表不不同行的顺序号 20 - 70 LString pub 出版的城市和出版者的名字 6

47、. REFN（对引用参考书目的编码） 分两种情况： 4a.引用没有被岀版REF厂亚记录类型的格式: 列 数据类型 字段需称 左义描述 1-6 Record name ”JRNL ” 13 - 16 LString(4) “REFN” 67 一 70 LString(4) 0353 未出版著作的CCDC/PDB分类编号 4b.引用被出版REFN亚记录类型的格式: 列 数据类型 字段需称 左义描述 1-6 Record name ”JRNL ” 13 一 16 LString (4) REFT 20 - 23 LString (4) ASTM 25 - 30 LString(6) astmASTM

48、设计分类编号 在OCLC/MARC目录形式中详细说明的岀版 33 - 34 LString (2) 边国家（可选随意） 36 - 39 LString(4) ISBN or ISSN 国际标准书名号或ISSN国际标准序号 41 - 65 Lstring isbn ISSN or ISBN号码（最后一个数字可能是字母并包含一 个或多个破折号）. 67 - 70 LString(4) coden CCDC/PDB分类编号列表代码. 示例 7 1 2 3 456 123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789

49、0 TRNLAUTH N. THANKI, J. K. M. RAO, S. I. FOUNDLING, W. J. HOWE, JRNL JRNL JRNL JRNL JRNL AUTH 2 A. G. TOMASSELLI, R. L. HEINRIKSON, S. THAISRIVOGS, AUTH 3 A. WLODAWER TITL CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX OF HIV-1 PROTEASE TITL 2 WITH A DIHYDROETHYLENE-CONTAINING INHIBITOR: TITL 3 COMPARISONS WITH MO

50、LECULAR MODELING REFTO BE PUBLISHED REFN JRNL JRNL JRNL AUTHG. FERMI, M. F PERUTZ, B. SHAANAN, R. FOURME TITLTHE CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DEOXYHAEMOGLOBIN AT TITL 2 1.74 A RESOLUTION REFJ. MOL. BIOLV. 175159 1984 JRNL REFN ASTM JMOBAK UK ISSN 0022-2836 0070 REMARK 综述 该记录用来描述试验细节，注解，评论和别的记录上没有的信息。

51、列 数据类型 字段名称 左义描述 1-6 Record name ”REMARK” 8-10 Integer REMARK 码 REMARK号码 12 - 70 LString 空 左边是一个空格 REMAKK 1（有关夫献） 该记录用来列举重要出版物有关的倍息。每个REMARK记录的首行用作空格有助阅读具体又细分为如下: 1. REFERENCE 丧示记录中的参考号 列 数据类型 宇段名称 定义描述 16 Record name ”REMARK” 10 LString(l) it it 12-20 LString(9) ” REFERENCE” 22-70 Integer refNum 参考

52、书目序号从一开始并逐一増加 2. AUTH 丧示参考书目的作者的名宇 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1 -6 Record name ”REMARK” 10 LString(l) it 13-16 LString(4) “AUTH” 出现在所有连续记录中 17 - 18 Continuation Conunuation 20-70 List authorList 允许一个长的作者名单 作者名单. 3. TITL 丧示参考书目的标題 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1 -6 Record name ”REMARK” 10 LString(l) t it 13-16 LString(4) n

53、TlTLH 出现在所有连缕记录中 17 - 18 Continuation Continuation 允许多重记录串联表示不同行的顺序号 20-70 LString title 文章的标題. 4. EDIT 丧示非定期刊物相关参考编者的有关信息 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1-6 Record ruimc ”REMARK” 10 LString(l) VI 13-16 LString(4) ” EDIT” 出现在所有连绫记录中 17 - 18 Conrinuation Continuation 允许多重记录串联表示不同行的顺序号 20-70 LString edi torList 编者名

54、单 5.REF 记录出版物的名宇， 分两种情况： 5a.还没有被发裘 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1 -6 Record name ”REMARK” 10 LString(l) VI It 13-16 LString(3) ” REF” 20-34 LString(15) ”TOBE PUBLISHED” 5b.已经出版了 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1 -6 Record name ”REMARK” 10 LString(l) VI It 13-16 LString(3) ” REF” 17- 18 Conrinuation Continuation 准许长的出版物名称 20-4

55、7 Lstring pubNamc 出版物的名宇 50-51 LString 忖“ 仅在55列被占据时只出现在第一个记录中 右对齐空格补足 52 - 55 String volume 说明：只出现在第一的亚记录中 57-61 String X章的第一页，只出现在第一的亚记录中 63-66 Integer vear 出版的日期 6. PUBL 出版者的名宇或出版的地方 列 数据类型 宇段名称 定义描述 16 Record name ”REMARK” 10 LString(l) i it 13-16 LString(4) ” PUBL” 出现在所有连缕记录中 17- 18 Continuation

56、 Continuation 允许多重记录串联表示不同行的顺序号 20-70 LString pub 出版者的名宇和出版的城市 7. REFN 对参考书目的编码，分两种情况如下: 7a.引用没有被出赧 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1 -6 Record name ”REMARK” 10 LString(l) VI It 13-16 LString(4) ” REFN” 67-70 LString(4) MO353M 为出版著作的PHB分类编码. 7b.引用没有被出版 列 数据类型 宇段名称 定义描述 1 -6 Record name ”REMARK” 10 LString(l) VI t

57、13-16 LString(4) ” REFN” 20-23 LString(4) ” ASTM” 如杲没有用空格表示 25-30 LString astm ASTM文件编码. 33-34 LString country 由两个阿拉伯數宇缩写表示出版的罔家 36-39 LString(4) “ISBN” orMISSNM 41 -65 LString isbn ISSN 或 ISBN 号. 68-70 LString(4) coden 剑桥结晶学數据中心分类编号列喪号码 示例 1234567 12345678901234567890123456789()12345678901234567890

58、12345678901234567890 RE MARK RE MARK 1 REFERENCE 1 RE MARK RE MARK AUTH A.M.BOWINJ.A.RULLMAXNR.M.LAMERICHS.R.BOELENS, AUTH 2 R.KAPTE1N RE MARK RE MARK TITL ”ENSEMBLE” ITERATIVE RELAXAT1ON MATRIX APPROACH： TITL 2 A NEW NMR REFINEMENT PROTOCOL APPUED T()THE RE MARK RE MARK RE MARK TITL 3 SOLUTION STRU

59、CTURE OF CRAMBIN REF PROTEINS: STRUCT.,FUNCT., V. 15 385 1993 REF 2 GENET. RE MARK REFN ASTM PSFGEY US ISSN 0887-3585 0867 RE MARK 1 REFERENCE 2 RE MARK RE MARK RE MARK RE MARK RE MARK TITL 2 CRAMBIN EDIT DMS()UMPASS、TMJ()VIN REF COMPUTATION OF B1OMOLECULAR 1 1992 RE MARK RE MARK RE MARK RE MARK REF

60、 2 STRUCTURES; ACHIEVEMENTS, REF 3 PROBLEMS, AND PERSPECTIVES PUBL BERLIN : SPRIXGER-VERLAG GW ISBN 354()559515 REFN 2010 RE MARK 1 REFERENCE 3 RE MARK RE MARK AUTH R.MJ.M.LAMERICHS 2D NMR STUDIES OF REF 1989 RE MARK REF RE MARK REF RE MARK REF 2 BIOMOLECULES： PROTEIN 3 STRUCTURE AND PROTE1N-DNA 4 I