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文档简介

1、实用标准蛋白质修饰位点分析目录实验目的 2实验平台 2实验过程 3一、“人类 connexin43 ”蛋白质磷酸化位点修饰 31、“人类 connexin43 ”蛋白质序列下载 32、uniprot 数据库查看蛋白磷酸化位点 43、在线软件预测指定蛋白磷酸化位点 . 6文案大全实用标准(1)DISPHOS 1.3 预测未知蛋白磷酸化位点 6( 2) PhosphoSitePlus 预测指定蛋白磷酸化位点 114、“人类 connexin43 ”蛋白质磷酸修饰结论 14二、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰 . 151、N型糖基化位点预测 152、O型糖基化位点预测 18( 1)哺乳动物 O型糖基化

2、位点预测 18( 2)真核生物 O型糖基化位点预测 203、uniprot 数据库查看蛋白质糖基化修饰位点 224、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰结论 22实验结论 23(特别提示 :ctrl+ 单击目录下的标题链接,可以跟踪标题; ctrl+ 单击标题后的图标 可以返回目录)实验目的找出“人类 connexin43 ”蛋白质上面的所有可能磷酸化位点, 并说明为什么(注释) 找出“人类血红蛋白”上面的糖基化位点,注释结果实验平台uniprot 数据库 : /( 查看蛋白的修饰情况)预测未知蛋白磷酸化位点DISPHOS:http:/www.dabi.te

3、/disphos/文案大全实用标准PhosphoSitePlus: 预测未知蛋白的糖基化修饰位点N型糖基化位点预测:http:/www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/O型糖基化位点预测:http:/www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/http:/www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/实验过程一、“人类 connexin43 ”蛋白质磷酸化位点修饰1、“人类 connexin43 ”蛋白质序列下载蛋白序列: fasta.txt文案大全实用标准2

4、、uniprot 数据库查看蛋白磷酸化位点网站链接:/文案大全实用标准文案大全实用标准3、在线软件预测指定蛋白磷酸化位点(1)DISPHOS 1.3 预测未知蛋白磷酸化位点网站链接: /disphos/文案大全实用标准文案大全开始预测实用标准文案大全实用标准结果DISPHOS由蛋白序列预测蛋白磷酸修饰位点,总共有 37 个丝氨酸 修饰位点, 13个苏氨酸修饰位点, 16个酪氨酸修饰位点。但是根 据打分,只有 8 个丝氨酸修饰位点可能存在。文案大全实用标准文案大全实用标准2)PhosphoSitePlus

5、 预测指定蛋白磷酸化位点网站链接: 开始预测结果筛选参考文献来源多于 5 篇的磷酸化修饰位点,丙氨酸磷酸化修饰位点数目为 1、丝氨酸为 17、苏氨酸数目为 1、酪氨酸数目为 7文案大全实用标准文案大全实用标准文案大全实用标准4、“人类 connexin43 ”蛋白质磷酸修饰结论在 线 数 据 库 查 询 和 在 线 软 件 预 测 结 果 基 本 一 致 ,“ 人 类 connexin43 ”蛋白质磷酸位点数量相对一般蛋白质较多, 且丝氨酸磷 酸修饰位点最多。“人类 connexin43 ”蛋白质极有可能是一种活性较文案大全实用标准高的蛋白质,

6、与机体的生物活性显著相关。通过各种文献阅读和网络筛选发现 connexin43 蛋白质是一种哺 乳动物连接蛋白, 是主要的细胞缝隙连接蛋白, 其表达的异常与多种 疾病的发生有关。二、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰Ncbi 下载人类血红蛋白的蛋白序列保存为: hemoglobin.txt1、N型糖基化位点预测网站链接: http:/www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/开始预测文案大全实用标准文案大全结果实用标准文案大全实用标准2、O型糖基化位点预测(1)哺乳动物 O型糖基化位点预测网站链接: http:/www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/开始预测文案大全实用标准文案大全实用标准2)真核生物 O型糖基化位点预测网站链接: http:/www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/开始预测文案大全实用标准结果文案大全实用标准3、uniprot 数据库查看蛋白质糖基化修饰位点4、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰结论在线数据库查询和在线软件预测结果基本一致, 人类血红蛋白基 本没有 O型糖基化修饰位点 , 但是存在 N型糖基化修饰位点。血红蛋 白是高等生物体内负责运载氧的一种蛋白质, 糖基化修饰可能和血红 蛋白的信号传

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