文献检索与论文写作-如何查找和阅读文献

1、1 文献检索与论文文献检索与论文写作（四）写作（四） 如何如何查找和阅读查找和阅读文献文献 最基本的要求最基本的要求 n“四会四会” 会会查查：查找文献：查找文献 会会看看：阅读、理解分析文献：阅读、理解分析文献 会会用用：利用文献、引用文献：利用文献、引用文献 会会写写：写论文：写论文 课程内容与教学计划课程内容与教学计划 课程课程设置设置 3 Science Express: 科学快讯科学快讯 Outstanding labs : 牛人牛事牛人牛事 授课内容授课内容 Recommended Reading：推荐阅读：推荐阅读 Science Express: 科学快讯科学快讯 4 v10月

2、2日和3日：Cell，Mol. Cell和Genes Dev.杂志, v环状RNA的产生机制 问题：外显子在什么情况下会成环？问题：外显子在什么情况下会成环？ Circles reshape the RNA world 启发：需要哪些蛋白参与环状启发：需要哪些蛋白参与环状RNARNA的成环？的成环？ Genes Dev. 2014 Oct 3. Mol Cell. 2014 Oct 2;56(1):55-66. Rajewsky N实验室 Wilusz JE实验室 Science Express: 科学快讯科学快讯 5 v9月5、10日：Nature和Cell杂志, vMIT两个实验室，非编码

3、RNA和mRNA的假尿嘧啶修饰 问题：除问题：除rRNArRNA和和snRNAsnRNA外，哪些外，哪些RNARNA还会还会被假尿嘧啶修饰？被假尿嘧啶修饰？ Cell. 2014 pii: S0092-8674(14)01098-8. 启发：利用高通量的测序技术结合传统实验方法，全基因组的鉴定其他的修饰类型？启发：利用高通量的测序技术结合传统实验方法，全基因组的鉴定其他的修饰类型？ Nature. 2014. doi: 10.1038/nature13802. Science Express: 科学快讯科学快讯 6 v9月8日：Cancer Cell杂志, v拷贝数变异区的长非编码RNA在肿瘤

4、中的作用 问题：位于癌基因组拷贝数变异区有哪些问题：位于癌基因组拷贝数变异区有哪些lncRNAlncRNA，他们是否是癌的，他们是否是癌的driverdriver基因？基因？ 启发：生物信息学分析结合传统实验方法，全基因组的鉴定启发：生物信息学分析结合传统实验方法，全基因组的鉴定lncRNAlncRNA的功能。的功能。 Cancer Cell. 2014 Sep 8;26(3):344-57. 7 Outstanding labs : 牛人牛事牛人牛事 超分辨率荧光显微技术领域取得的成就 8 Outstanding labs : 牛人牛事牛人牛事 无法分辨间距小于0.2微米（200纳米）的物体

5、 STED显微镜显微镜 用尺寸非常小的光斑逐步扫描整个区域的方 法将间距小于0.2微米的物体分辨开来 单分子显微镜单分子显微镜 阿贝阿贝极限极限 通过图像重叠的方法分辨出间距小于0.2微米的物体 引自：科学公园网站的描述 换取空间 跟踪和获取科学文献跟踪和获取科学文献 9 WHY: 为什么要跟踪科学文献 WHEN：什么时候去获取或阅读科学文献 WHERE：从哪里获取科学文献 HOW：怎样高效地获取科学文献 WHAT：我们应该获取什么样的科学文献 一、一、为什么为什么要跟踪科学文献要跟踪科学文献 10 温故而知新温故而知新 论语论语 温故看旧的文献旧的文献，把握某个领域的 历史发展情况 知新看最

6、新的文献最新的文献，把握某个领域 的当前发展状况 11 Science 298:2296(2002) microRNAmicroRNA（微（微RNARNA）一）一种全新的基因表达调控机制种全新的基因表达调控机制 Nature 420:732(2002) microRNA在多种真核生在多种真核生 物中发挥基因调控作用物中发挥基因调控作用， 引起科学界广泛关注。引起科学界广泛关注。 -生命科学重要领域生命科学重要领域。 2002年，年，MicroRNA赢赢 得得Science杂志评选的杂志评选的 十大科技突破第一名。十大科技突破第一名。 一、一、为什么为什么要跟踪科学文献要跟踪科学文献 1. 1.

7、 知道自己知道自己研究领域研究领域的的更多更多问题问题 一、一、为什么为什么要跟踪科学文献要跟踪科学文献 12 1.1.知道自己知道自己研究领域研究领域的的更多更多问题问题 u 一个基因组中一个基因组中miRNA有多少是有功能的？有多少是有功能的？ u 一个一个miRNA的靶基因有多少？的靶基因有多少？ u miRNA如何去识别靶标的？如何去识别靶标的？ u miRNA的表达受到哪些蛋白的调控的表达受到哪些蛋白的调控？ u miRNA的非经典配对的靶标互作有什么生物学功能的非经典配对的靶标互作有什么生物学功能 ？ u ceRNA在哺乳动物中是否真正的起作用？在哺乳动物中是否真正的起作用？ 一、

8、一、为什么为什么要跟踪科学文献要跟踪科学文献 13 2.2.下下一个新项目一个新项目：新理论、新方法、新新理论、新方法、新ideaidea 题 问题：外显子在什么情况下会成环？问题：外显子在什么情况下会成环？ 启发：是否还有其他的成环机制？启发：是否还有其他的成环机制？ Nature. 2013 Mar 21;495(7441):333-8. 中科院：杨力和陈玲玲教授实验室 一、一、为什么为什么要跟踪科学文献要跟踪科学文献 14 问题：外显子在什么情况下会成环？问题：外显子在什么情况下会成环？ 启发：是否还有其他的成环机制？启发：是否还有其他的成环机制？ Cell. 2014 Sep 25;1

9、59(1):13-4.Mol. Cell, 51 (2013), pp. 792806 2.2.下下一个新项目一个新项目：新理论、新方法、新新理论、新方法、新ideaidea 15 20 Feb 2009 28 Jul 2011 27 Apr 2012 n 肿瘤中大批肿瘤中大批miRNA的的 变化因何而起？功能变化因何而起？功能 是什么？是什么？ n 作为作为“RNA语言语言”的的 主角，主角，miRNA如何协如何协 调各种调各种RNA的活动？的活动？ n miRNA在生物学过程在生物学过程 鲁棒性的赋予中的作鲁棒性的赋予中的作 角色是什么？角色是什么？ 一、一、为什么为什么要跟踪科学文献要跟

10、踪科学文献 3.3.研究研究领域的困难、问题和现状领域的困难、问题和现状 16 一、一、为什么为什么要跟踪科学文献要跟踪科学文献 4. 4. 有助于有助于自己论文的自己论文的写作写作引用最新进展引用最新进展 Research Topic 介绍 protein-lncRNA互作网络。 Editor： Carlo M. Croce, The Ohio State University, USA 17 一、一、为什么为什么要跟踪科学文献要跟踪科学文献 5. 5. 有助于有助于提升自己的批判能力提升自己的批判能力 Impact factor: 8.808 5-Yr impact factor: 8.3

11、78 18 一、一、为什么为什么要跟踪科学文献要跟踪科学文献 5. 5. 得知奇异得知奇异和有趣的科学和有趣的科学新闻新闻谈资谈资 中山大学发现中山大学发现“逆天逆天”好病毒，专杀癌细胞好病毒，专杀癌细胞 一、一、为什么为什么要跟踪科学文献要跟踪科学文献 19 避免：避免： v重复前人已经做的工作 v重复思考前人已经或即将解决的问题 v3. 写当前软件已经能够完成的代码去 解决问题 二、什么时候去获取或阅读科学文献二、什么时候去获取或阅读科学文献 20 随时随地读文献随时随地读文献 一切可以利用的时间一切可以利用的时间都可用都可用于读文献于读文献 三、三、从哪里获取科学文献从哪里获取科学文献

12、21 PubMedPubMed查询专业关键词、期刊名、查询专业关键词、期刊名、 感兴趣的作者（实验室的负责人）等感兴趣的作者（实验室的负责人）等 /pubmed/ 三、三、从哪里获取科学文献从哪里获取科学文献 22 PubMedPubMed查询专业关键词、期刊名、查询专业关键词、期刊名、 感兴趣的作者（实验室的负责人）等感兴趣的作者（实验室的负责人）等 三、三、从哪里获取科学文献从哪里获取科学文献 23 PubMedPubMed查询专业关键词、期刊名、查询专业关键词、期刊名、 感兴趣的作者（实验室的负责人）等感兴趣的作者（实验室的负责人）等

13、三、三、从哪里获取科学文献从哪里获取科学文献 24 期刊出版社网站期刊出版社网站： advance online http:/ http:/ 三、三、从哪里获取科学文献从哪里获取科学文献 25 ISI Web of Science： http:/ 三、三、从哪里获取科学文献从哪里获取科学文献 26 Google Scholar http:/ 5/ 三、三、从哪里获取科学文献从哪里获取科学文献 27 科学新闻科学新闻网站网站 http:/ http:/ 三、三、从哪里获取科学文献从哪里获取科学文献 28 论坛求助论坛求助 常用论坛常用论坛： 中国生命科学论坛（检索

14、互助版块）： http:/ 小木虫论坛（文献求助版块）： http:/ 生物秀论坛（文献检索互助专区）： http:/ 丁香园： http:/ 三、三、从哪里获取科学文献从哪里获取科学文献 29 向作者索要文献向作者索要文献 DearProf.(Dr.)_， Iam_,agraduate(doctoral)studentin_University inChina.Mymajoris_. Iamveryinterestedinyourrecentlypublication:_(文章名),published in_(杂志名，发表年，卷） ButIhavenoaccesstothispaper,so

15、wouldyoupleasemailmeaPDF fileofthispaper? Thankyouforyourkindconsiderationofthisrequest. Sincerely:_（yourname） Date：Month/day/year 30 http:/ 必须筛选！必须筛选！ 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 31 RSSRSS阅读器阅读器 邮箱订阅服务邮箱订阅服务 访问出版社网站访问出版社网站 32 订阅关注的杂志订阅关注的杂志 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 33 订阅

16、杂志源的订阅杂志源的方法方法 登陆杂志官方网站 找到RSS源页面：关键词RSS、XML、RDF、 feed 直接点击RSS源或者复制链接到RSS Reader 完成订阅 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 34 订阅杂志源的订阅杂志源的方法方法 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 http:/ 35 订阅杂志源的订阅杂志源的方法方法 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 36 订阅杂志源的订阅杂志源的方法方法 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 https:/ 37 订阅杂志源的订阅杂志源的方法方法 四、四、怎样高效地获取科

17、学文献怎样高效地获取科学文献 http:/ 38 订阅杂志源的订阅杂志源的方法方法 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 /pubmed/?term=microRNA+or+miRNA 39 推荐源推荐源 CNS Cell Press Daily News Aggregator miRNA blog， lncRNA blog 生物谷、生命生物谷、生命奥秘、生物奥秘、生物360等等 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 40 E-mail E-mail 订阅订阅 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文

18、献 Gmail 免费（Google Account） 无限容量 无限邮箱名 强大的筛选器和分类标签 支持https 41 E-mail E-mail 订阅订阅 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 42 E-mail E-mail 订阅订阅 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 登陆杂志官方网站 找到Alert链接 注册，填写邮箱（推荐Gmail） 选择订阅的内容，完成 43 E-mail E-mail 订阅订阅 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 44 E-mail E-mail 订阅订阅 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 45 搜索技巧搜索技巧 特定用户： from:alertsmail.cell- to: 附件：has:attachment filename:pdf 搜索位置：in:anywhere 未读：is:unread 特定标签：label:cell miRNA 四、四、怎样高效地获取科学文献怎样高效地获取科学文献 46 v注册网站我有个习惯，要求写真名的时 候，注册Sina我就填袁新浪，注册 Yahoo我就叫袁雅虎，注册Baidu我就写 袁百度，注册Google我就改袁谷歌。今 天接到个