医学信息检索与利用PPT课件

1、医学信息检索与利用总 论 中山大学医学文献检索教研室中山大学医学文献检索教研室罗淑莲罗淑莲一、一、学习医学信息检索课学习医学信息检索课的目的和意义的目的和意义 （一）（一） 提高信息素质与信息检索提高信息素质与信息检索 （二）（二） 科科技创新技创新与信息检索与信息检索（一）信息素质教育与信息检索（一）信息素质教育与信息检索信息素质信息素质( (Information Literacy)Information Literacy) 人们在工作中人们在工作中运用信息运用信息、学、学习习信息技术信息技术、利用信息利用信息解决问题的解决问题的能力。能力。 信息素质的构成要素：信息素质的构成要素： （1

2、 1）信息意识信息意识 （2 2）信息能力信息能力 信息检索力信息检索力: :指熟悉各种信息源，掌指熟悉各种信息源，掌握信息检索的握信息检索的基础理论基础理论和基本和基本技术技术，熟，熟练地利用各种手工练地利用各种手工检索工具检索工具和计算机检和计算机检索系统查找所需信息的能力索系统查找所需信息的能力 （3 3）信息道德信息道德 信息素质能力的评价标准信息素质能力的评价标准“美国高等教育中美国高等教育中学生学生信息信息素质能力标准素质能力标准”：能能确定确定信息资源的特点和信息资源的特点和范围范围；能有效地能有效地获取获取所需信息；所需信息；能能评价评价信息及其来源，利用其知识基础和信息及其来

3、源，利用其知识基础和价值系统价值系统选择选择适当的信息；适当的信息；能有效能有效利用利用所获得的信息实现特定的目标；所获得的信息实现特定的目标；在信息获取和利用时自觉遵守在信息获取和利用时自觉遵守道德规范道德规范和和有关的法律。有关的法律。（二）科技创新与信息二）科技创新与信息检索检索科技信息是知识创新的源泉：科技信息是知识创新的源泉： 世界上任何一项科研成果或创新都世界上任何一项科研成果或创新都是在是在吸取吸取和和借鉴借鉴前人或他人研究成果前人或他人研究成果的基础上，再加上自己的的基础上，再加上自己的钻研钻研和和创新创新所获得的。所获得的。科技信息是科研的先决条件。科技信息是科研的先决条件。

4、 科研选题科研选题与信息与信息检索检索 科研选题科研选题就是形成、选择和确定就是形成、选择和确定所要研究和解决的课题。所要研究和解决的课题。 科研选题是科学研究的起始步骤。科研选题是科学研究的起始步骤。它关系到科学研究的它关系到科学研究的方向方向、目标目标和和内内容容，直接影响科研的，直接影响科研的途径途径和和方法方法，决，决定着定着科研成果科研成果的水平，价值和发展前的水平，价值和发展前途。途。1 1、科研选题的步骤一般是：、科研选题的步骤一般是： 文献文献调研调研和实际和实际考察考察提出提出选选题题初步初步论证论证评议和评议和确定确定课题。课题。 2 2、选题的过程选题的过程是一个不断是一

5、个不断反馈调整反馈调整的的过程，常常需要过程，常常需要反复文献调研和多次反复文献调研和多次论证，要继承已有的研究成果，并防论证，要继承已有的研究成果，并防止低水平重复。止低水平重复。3 3、科研选题应遵循的基本原则、科研选题应遵循的基本原则 科学性科学性原则原则 创造性创造性原则原则 需要性需要性原则原则 可行性可行性原则原则http:/ 1）科学性原则科学性原则： 科研选题既要科研选题既要尊重尊重所依据的所依据的科学科学理论理论和和科学事实科学事实，同时还要随着基础，同时还要随着基础事实和背景理论的改变而对选择的课事实和背景理论的改变而对选择的课题进行题进行调整调整。（2 2）创造性原则：）

6、创造性原则： 概念概念、理论理论、方法方法、或、或应用应用上的上的创新创新 创造性原则实质上是要求做到：创造性原则实质上是要求做到：在在选题选题时熟悉别人已经进行过的工作，时熟悉别人已经进行过的工作，避免重复劳动；避免重复劳动；课题论证课题论证时恰当估计课时恰当估计课题的意义和可能包含创造性成份。题的意义和可能包含创造性成份。 二、医学信息检索的基本概念二、医学信息检索的基本概念（一）信息（一）信息知识知识文献文献 信息：信息： 对现实世界事物的反映对现实世界事物的反映。 在自然界、人类社会以及人类思维活在自然界、人类社会以及人类思维活动中动中普遍存在普遍存在，是物质存在方式及其运动，是物质存

7、在方式及其运动的规律、特点的的规律、特点的外在表现外在表现。 知识：知识：人们通过信息对世界的认识与掌握，人们通过信息对世界的认识与掌握，是人的大脑通过思维是人的大脑通过思维重新组合重新组合的的系统化信系统化信息息的集合。的集合。 文献：文献：记录有记录有知识知识的一切的一切载体载体。（二）信息检索与文献检索二）信息检索与文献检索 信息资源：信息资源： 可供人类开发利用的各类可供人类开发利用的各类信息信息的的集集合。分合。分为为非文献信息资源非文献信息资源和和文献信文献信息资源息资源两大类。两大类。信息检索：信息检索： 收集收集、组织组织、存储存储一定范畴的信息，一定范畴的信息，并可供用户按需

8、要并可供用户按需要查询信息查询信息的技术和过程。的技术和过程。 信息组织的方法即信息加工、标引等信息组织的方法即信息加工、标引等（主题词、分类（主题词、分类. .） 信息检索可分为三类信息检索可分为三类 ： 事实型事实型信息检索信息检索 数据型数据型信息检索信息检索 文献型文献型信息检索信息检索 文献检索：文献检索： 以某些特定的以某些特定的文献文献信息资源信息资源为检为检索索对象对象，以，以获取文献信息获取文献信息为目的的信为目的的信息检索。息检索。 检索结果检索结果是切题是切题文献文献或相关文献或相关文献的文献线索或具体的文献。的文献线索或具体的文献。 根据检出内容的祥略，文献检索根据检出

9、内容的祥略，文献检索又可以分为又可以分为书目检索书目检索和和全文检索全文检索。 （三）文献信息资源的分类（三）文献信息资源的分类1、按文献的出版形式分、按文献的出版形式分 图书图书 期刊期刊 报纸报纸 特种文献特种文献：科技报告、会议文献、科技报告、会议文献、专利文献、学位论文、档案资料、产专利文献、学位论文、档案资料、产品资料等。品资料等。期期 刊刊核心期刊：核心期刊：刊载刊载某学科某学科文献密度大、载文文献密度大、载文率、率、被引用率被引用率及及利用率利用率较较高高，深受本学，深受本学科专家和读者关注的期刊中的精华。科专家和读者关注的期刊中的精华。评价期刊的常用工具：评价期刊的常用工具：

10、医学核心期刊指南医学核心期刊指南 中文核心期刊要目总览中文核心期刊要目总览 JCR（Journal Cition Report，期刊期刊引用报告）。引用报告）。确定确定核心期刊核心期刊和评价期刊质量的常用方和评价期刊质量的常用方法：载文率法和法：载文率法和引文法引文法。IF（影响因子）影响因子）= 某年内某年内SCI来源刊引来源刊引用该刊前二年发表论文总次数用该刊前二年发表论文总次数 / 该刊该刊前二年发表论文篇数前二年发表论文篇数II（当年被引率）当年被引率）=某刊当年发表的论某刊当年发表的论文被文被SCI来源刊引用的次数来源刊引用的次数 / 该刊当年该刊当年发表论文篇数发表论文篇数 2、按

11、文献的载体形式按文献的载体形式 印刷型文献印刷型文献 缩微型文献缩微型文献 声像资料声像资料 机读型电子出版物机读型电子出版物 电子期刊电子期刊 电子期刊的定义：电子期刊的定义： 指从指从投稿投稿、编辑编辑、出版出版、发行发行、订订购购、阅读阅读乃至读者意见乃至读者意见反馈反馈的全过程都的全过程都是在是在网上进行网上进行，任何阶段都不需用纸的，任何阶段都不需用纸的新型出版物，称网络电子期刊。新型出版物，称网络电子期刊。 电子期刊的特点：电子期刊的特点： 信息速发性信息速发性高高、信息量大信息量大、信息、信息共共享性强享性强、交互性强、可读性强、交互性强、可读性强、易检索易检索、良好的信息良好的

12、信息扩展性扩展性、内容、形式多样、内容、形式多样 从网络获取电子期刊的方式：从网络获取电子期刊的方式： 出版商出版商、代理商代理商、搜索引擎搜索引擎、其它网站的友好其它网站的友好链接链接、专门专门收集期收集期刊的刊的站点站点 3、按文献的内容加工级次、按文献的内容加工级次 一次文献：一次文献：原始文献原始文献 二次文献：二次文献：对一次文献进行加工整对一次文献进行加工整序后衍生得到的文献。主要是揭示和报序后衍生得到的文献。主要是揭示和报道一次文献，提供查找一次文献的线索。道一次文献，提供查找一次文献的线索。 三次文献：三次文献：包括综述、评论、进展包括综述、评论、进展等。等。 零次文献：零次文

13、献：未经发表或进入社会交未经发表或进入社会交流、未经系统加工整理的原始文献记录。流、未经系统加工整理的原始文献记录。 三、文献信息检索语言三、文献信息检索语言 文献信息检索语言：文献信息检索语言： 根据文献信息检索的需要而创根据文献信息检索的需要而创制的制的人工语言人工语言。 检索语言检索语言分为描述文献分为描述文献外表特征外表特征的的语言和描述文献语言和描述文献内容特征内容特征的检索语的检索语言两大类。言两大类。描述文献外表特征的检索语言：描述文献外表特征的检索语言： 题名索引、著者索引、引文索引、序号索题名索引、著者索引、引文索引、序号索引等。引等。描述文献内容特征的检索语言：描述文献内容

14、特征的检索语言： 分类分类检索语言检索语言 主题主题检索语言检索语言 代码代码检索语言：用代表事物的代码作为标检索语言：用代表事物的代码作为标识系统的索引语言。（化合物分子式索引、环识系统的索引语言。（化合物分子式索引、环状化合物环系索引、化学物质号索引等）状化合物环系索引、化学物质号索引等） 。（一）分类语言及中图法（一）分类语言及中图法分类语言分类语言： 一种用一种用分类号分类号表达文献中的各种概表达文献中的各种概念，按念，按学科、专业学科、专业对各种概念加以分类对各种概念加以分类和系统排列的文献信息检索语言。和系统排列的文献信息检索语言。 （美国国会图书馆图书分类法、杜威（美国国会图书馆

15、图书分类法、杜威十进分类法、国际十进分类法、中国图十进分类法、国际十进分类法、中国图书馆分类法、国际疾病分类等）书馆分类法、国际疾病分类等） 我国文献分类的主要依据是我国文献分类的主要依据是中国中国图书馆分类法图书馆分类法（简称（简称中图法中图法）。）。 中图法中图法 定义：定义： 依一定的思想观点，以依一定的思想观点，以学科分类学科分类为基础，综合图书资料的内容、特点，为基础，综合图书资料的内容、特点，分门别类组成的分门别类组成的分类表分类表。 以以等级制等级制为标记制度，依照从总为标记制度，依照从总分、一般分、一般特殊、低级特殊、低级高级、高级、简单简单复杂的逻辑次序，逐层展开各复杂的逻辑

16、次序，逐层展开各门学科知识的类目等级体系，系统地门学科知识的类目等级体系，系统地组组织文献织文献。 中图法中图法第四版第四版将文献知识分为将文献知识分为5 5大部类，即大部类，即马、列、毛泽东思想；哲马、列、毛泽东思想；哲学；社会科学；自然科学；综合性图学；社会科学；自然科学；综合性图书书。下分。下分2222个基本大类。个基本大类。 例如例如 O：数理科学、化学数理科学、化学 Q：生物科学生物科学 R：医药卫生医药卫生 每个每个类目类目采用采用拉丁字母和阿拉伯数字拉丁字母和阿拉伯数字相结合的混合号码相结合的混合号码R 医药、卫生（医药、卫生（17个二级类目）个二级类目） 1 预防医学、卫生学预

17、防医学、卫生学 2 中国医学中国医学 3 基础医学基础医学 4 临床医学临床医学 5 内科学内科学 6 外科学外科学 71 妇产科学妇产科学 72 儿科学儿科学 73 肿瘤学肿瘤学 74 神经病学与精神病学神经病学与精神病学 75 皮肤病学与性病学皮肤病学与性病学 76 耳鼻咽喉科学耳鼻咽喉科学 77 眼科学眼科学 78 口腔科学口腔科学 79 外国民族医学外国民族医学 8 特种医学特种医学 9 药学药学 每个类目还可细分至六、七级类目，如每个类目还可细分至六、七级类目，如 ： R6 外科学外科学 R65 外科学各论外科学各论 R655 胸部外科学胸部外科学 R655.1 胸壁胸壁 R655.

18、2 胸膜胸膜 R656 腹部外科学腹部外科学 R656.1 急腹症急腹症 R656.2 腹部疝腹部疝 R656.3 腹壁腹壁 R656.31 腹壁炎症腹壁炎症 R656.32 腹壁损伤腹壁损伤（二）文献标识码（二）文献标识码 文献标识码文献标识码与与中图法分类号中图法分类号不是一回事不是一回事 根据中国学术期刊检索与评价数据规根据中国学术期刊检索与评价数据规范的规定，对范的规定，对文献标识码规定文献标识码规定如下：如下： A理论与应用研究学术论文理论与应用研究学术论文（含综述）（含综述） B实用性技术成果报告实用性技术成果报告 C业务指导与技术管理性文章业务指导与技术管理性文章 D一般动态性信

19、息（通讯、报一般动态性信息（通讯、报导、会议活动、专访等）导、会议活动、专访等） E文件、资料文件、资料 （三）主题语言（三）主题语言 主题检索语言：主题检索语言：一种采用一种采用描述文献主题描述文献主题内容内容的词语标识并按照字顺排检文献的的词语标识并按照字顺排检文献的检索语言。主要包括检索语言。主要包括主题词主题词和和关键词关键词两两种。种。 叙词法：叙词法：严格严格规范化规范化、可进行概念组配、可进行概念组配、具有完善参照系统、具有范畴索引等。具有完善参照系统、具有范畴索引等。 关键词法：关键词法：以出现在文献的标题、摘要以出现在文献的标题、摘要或全文中或全文中能表达文献实质内容的词能表

20、达文献实质内容的词或关或关键性专业名词术语作为检索标识。键性专业名词术语作为检索标识。1 1、主题语言、主题语言主题词主题词 主题词主题词： 又称又称叙词叙词，是以规范化的词汇来表，是以规范化的词汇来表达文献内容的主题。达文献内容的主题。 规范化规范化也就是对文献中的也就是对文献中的同义词、同义词、近义词、多义词近义词、多义词等加以规范，同一主题等加以规范，同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下。概念的文献相对集中在一个主题词下。 采用采用参照系统参照系统间接反映主题概念之间的间接反映主题概念之间的关系关系 如：如：“肾功能衰竭肾功能衰竭” renal failure 或或 Kidney f

21、ailureMESH: renal failure see Kidney failure 采用主题词检索，能实现采用主题词检索，能实现较高的查全率较高的查全率和和查准率查准率。 2 2、主题语言、主题语言关键词关键词 关键词关键词： 非规范化非规范化（未经严格规范化处理）检（未经严格规范化处理）检索语言，属于索语言，属于自然语言范畴自然语言范畴。能够及时能够及时反映文献的最新信息，用法简便。反映文献的最新信息，用法简便。 如：如：Apoptosis 但但对同义词、近义词未经严格规范，对同义词、近义词未经严格规范，因此同一主题概念的因此同一主题概念的文献文献标引相对标引相对分散分散，容易导致容易

22、导致漏检和误检漏检和误检。3 3、医学主题词词表、医学主题词词表MeSHMeSH Medical Subject Headings（MeSH） 美国国立医学图书馆编制的美国国立医学图书馆编制的权威性主权威性主题词表题词表。 规范化的可扩充的规范化的可扩充的动态性叙词表动态性叙词表。 汇集约汇集约18,00018,000多个医学主题词。多个医学主题词。 MeSH 附有各种附有各种参照和注释参照和注释，它是对生，它是对生物医学文献进行物医学文献进行标引和检索的依据标引和检索的依据。 MeSH引入引入范畴表范畴表(树形结构树形结构,Tree Structure)，将主题词按其学科性质、将主题词按其学

23、科性质、词义范围的词义范围的上下类属上下类属及派生关系，分别及派生关系，分别划为划为15大类大类，其中有，其中有9类又分若干子类类又分若干子类目，子类目下面又分若干更小的类目。目，子类目下面又分若干更小的类目。18,000多个主题词按其学科概念的性质多个主题词按其学科概念的性质分别列入各自所属的类目之下。分别列入各自所属的类目之下。 GASTROIN TESTINAL NEOPLASMS胃肠肿瘤胃肠肿瘤 INTESTIINAL NEOPLASMS 肠肿瘤肠肿瘤 CECAL NEOPLASMS 盲肠肿瘤盲肠肿瘤 APPENDICEAL NEOPLASMS 阑尾肿瘤阑尾肿瘤 COLONIC NEO

24、PLASMS 结肠肿瘤结肠肿瘤 COLONIC POLYPS 结肠息肉结肠息肉 . . . . DUODENAL NEOPLASMS 十二指肠肿瘤十二指肠肿瘤 ILEAL NEOPLASMS 回肠肿瘤回肠肿瘤 . . . . 副主题词副主题词(Subheadings)又称限定词又称限定词，与与主题词进行组配，对某一主题词的概念主题词进行组配，对某一主题词的概念进行进行限定或复分限定或复分，使主题词具有更高的，使主题词具有更高的专指性专指性。 如：诊断（如：诊断（Diagnosis，DI）、）、药物治疗药物治疗（Drug Theray，DT）。）。 MeSH有副主题词有副主题词92个个 在检索中

25、，主题词与副主题词的组配在检索中，主题词与副主题词的组配（主题词主题词/副主题词副主题词）须有）须有逻辑关系逻辑关系。 如：如：阿司匹林治疗感冒阿司匹林治疗感冒 阿司匹林阿司匹林/治疗应用；感冒治疗应用；感冒/药物疗法。药物疗法。 四、医学信息检索的方法、途径四、医学信息检索的方法、途径 检索途径检索途径 常用检索方法常用检索方法 检索步骤及检索策略检索步骤及检索策略 检索效果评价指标检索效果评价指标 提高机检查全率、查准率的方法提高机检查全率、查准率的方法 1 1、常用的检索途径、常用的检索途径（1 1）主题主题途径途径（2 2）著者著者途径途径（3 3）代码代码途径途径（4 4）题名题名途

26、径途径（5）分类分类途径途径 2 2、常用的检索方法、常用的检索方法 顺查法顺查法 倒查法倒查法 抽查法抽查法 追溯法追溯法 3 3、医学信息检索的一般步骤、医学信息检索的一般步骤 检索准备阶段检索准备阶段 检索实施阶段检索实施阶段 检索准备阶段检索准备阶段分析课题分析课题，明确检索，明确检索目的及要求目的及要求（课题所（课题所属的学科范围、要求的文献类型、年限、属的学科范围、要求的文献类型、年限、语种、需要的文献量等）；语种、需要的文献量等）；选择检索系统选择检索系统（包括检索工具或数据库）；（包括检索工具或数据库）；确定检索方法确定检索方法；选择检索用词及检索途径选择检索用词及检索途径。

27、检索实施阶段检索实施阶段 包括实际包括实际检索操作检索操作，检索，检索策略优化策略优化与与反馈，检索反馈，检索结果的筛选结果的筛选和整理，获取原始和整理，获取原始文献等。文献等。 4 4、检索效果评价指标、检索效果评价指标 被检出相关文献量被检出相关文献量查全率：查全率：R =R = 相关文献总量相关文献总量 被检出相关文献量被检出相关文献量查准率：查准率：P =P = 被检出文献总量被检出文献总量 未检出相关文献量未检出相关文献量漏检率：漏检率：M =M = 相关文献总量相关文献总量 被检出非相关文献量被检出非相关文献量误检率：误检率：N =N = 被检出文献总量被检出文献总量 5 5、提高

28、查全率、查准率的方法、提高查全率、查准率的方法 提高查全率的方法：提高查全率的方法： 用用主题词主题词检索；检索； 主题词、关键词、同义词间用主题词、关键词、同义词间用oror 组配；组配； 用用上位词上位词（扩展扩展下位词）检索；下位词）检索； 截词截词检索；检索； 少用副主题词少用副主题词组配。组配。 提高查准率的方法：提高查准率的方法： 用用主题词主题词检索；检索； 用用下位词下位词（专指度）检索（专指度）检索 ； 检索词的检索词的字段限定字段限定 ； 副主题词副主题词组配限制组配限制 。五、计算机检索基础五、计算机检索基础 文献文献检索检索的的技术手段技术手段 手工检索：手工检索：利用

29、各种印刷型检索工利用各种印刷型检索工具，人工查找所需的文献信息。具，人工查找所需的文献信息。 计算机检索：计算机检索：根据信息特定的需求，根据信息特定的需求，利用计算机从相关利用计算机从相关数据库数据库中检索所需要中检索所需要的文献信息。的文献信息。 网络信息检索：网络信息检索：通过互联网上提供通过互联网上提供的网络信息查询工具，从网上获取文献的网络信息查询工具，从网上获取文献信息。信息。 计算机检索系统计算机检索系统包括文献包括文献存储存储和文献和文献检检索索两部分，分别对应数据库的建立和利两部分，分别对应数据库的建立和利用。用。 计算机检索是目前广大计算机检索是目前广大医学临床与科研医学临

30、床与科研工作者获取医学文献信息工作者获取医学文献信息最常用最常用的方法的方法和手段，具有和手段，具有信息量大信息量大、操作技能、操作技能容易容易掌握掌握、方便快捷方便快捷等特点。等特点。 （一）数据库基本概念（一）数据库基本概念 数据库的定义：数据库的定义： 计算机计算机把大量的数据项有机地集中起来把大量的数据项有机地集中起来存放在数据文件中，构成一个存放在数据文件中，构成一个存放数据的整存放数据的整体体，即数据库。，即数据库。 数据库文件：数据库文件： 各项数据以各项数据以二维表格形式二维表格形式存放于数据文存放于数据文件中，一个以二维表格形式存放在磁盘上的件中，一个以二维表格形式存放在磁盘上的数据文件称为数据库文件（库文件）。数据文件称为数据库文件（库文件）。 数据库文件示意（字段、记录、文档）数据库文件示意（字段、记录、文档）篇名 著者 来源 语种 文摘 医学文献光盘检索的重点和方法 王赴仪 中华医学图书馆杂志 中文