PubMed 数据库使用介绍

1、 Copyright 2006 马马 彬彬兰州大学循证医学中心兰州大学循证医学中心教育部循证医学网上合作研究分中心教育部循证医学网上合作研究分中心 Copyright 2006 一、一、PubMedPubMed简介简介由美国国立医学图书馆由美国国立医学图书馆( (NLM)NLM)附属附属的的国立生物技术信息中心国立生物技术信息中心( (NCBI)NCBI)研制研制的基于的基于WebWeb的文献数据库。的文献数据库。是是NCBINCBI检索系统数据库之一。检索系统数据库之一。检索服务具有收录范围广检索服务具有收录范围广、内容全内容全、检索途径多检索途径多、访问速度快访问速度快等优点。等优点。 C

2、opyright 2006 （一）（一）MEDLINE 全世界全世界70多个国家和地区的多个国家和地区的4800余种生物医学期刊余种生物医学期刊 自自1966年至今数据年至今数据1400万余条万余条 内容每周更新一次，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、内容每周更新一次，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、 卫生保健和前临床科学等。卫生保健和前临床科学等。 标识标识PubMed - indexed for MEDLINE (二二) OLDMEDLINE 1950 年到年到1965年全世界生物医学期刊年全世界生物医学期刊 目前数据大约目前数据大约200多万条多万条 标识标识PubMed -

3、OLDMEDLINE for Pre1966（三）（三）In Process Citations 1996年年8月开始增加该数据库，只提供基本的引文信息和文摘，月开始增加该数据库，只提供基本的引文信息和文摘， 每天更新，经过标引以后进入每天更新，经过标引以后进入MEDLINE，并从并从PreMEDLINE 中删除这些记录。中删除这些记录。 标识标识MEDLINE in process Copyright 2006 （四）（四）Publisher Supplied Citation 接受出版商提供的文献数据，这种数据带有接受出版商提供的文献数据，这种数据带有MEDLINE record in p

4、rocess的说明，其标识为的说明，其标识为Record as supplied by publisher。 每天都在不停地向每天都在不停地向In Process Citations数据库中传送，但其数据库中传送，但其 中有些条目由于超出了中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将数据库的收录范围，将 永永 远不会被远不会被In Process Citations或或MEDLINE条目所取代条目所取代 (例如例如 在综合性的科学杂志在综合性的科学杂志Science或或Nature上发表的地理学上发表的地理学 文章文章)，其标识符有，其标识符有PubMed - as supplied

5、 by publisher 或或 PubMed 。 先于印刷版的文献先于印刷版的文献 ，其标识为，其标识为Epub ahead of print Copyright 2006 三、PubMed PubMed 系统的主要特点（系统的主要特点（1 1）（一）词汇自动转换功能（一）词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping） （MeSH Translation Table） 包括包括MeSH词、参见词、副主题词等词、参见词、副主题词等 在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的的MeSH词和词和Text Wo

6、rd词。例如：词。例如：“Vitamin h” “Biotin MeSH Terms OR Vitamin h Text word”（Journal Translation Table）包括刊名全称、包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和形式的缩写和ISSN号号该转换表能把键入的刊名全称转换为该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写缩写Journal Name”后进行检索后进行检索,例如：例如：“new england journal of medicine”“N Engl J Med Journal Name” Copyright 2006 三、三、PubMedPubMed系统

7、的主要特点（系统的主要特点（2 2）3. 包括包括MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学 语言系统和补充概念（物质）名称表语言系统和补充概念（物质）名称表。 如果如果PubMed 系统在系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相和刊名转换表中未发现与检索词相 匹配的词，就会查找短词表。匹配的词，就会查找短词表。4. 键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词 是一个后面跟有是一个后面跟有12个字母的短语，个字母的短语，PubMed即查著者索引。即查著者索引。 如果仍找不到匹配

8、词，如果仍找不到匹配词，PubMed就会把该词断开后再重复上述就会把该词断开后再重复上述 自动词汇转换过程，直到找到与键入的词语相匹配词语为止。自动词汇转换过程，直到找到与键入的词语相匹配词语为止。 若仍然没有匹配词，单个词会被联一起（用若仍然没有匹配词，单个词会被联一起（用AND）在全部字段在全部字段 中检索。中检索。 Copyright 2006 三、三、PubMed PubMed 系统的主要特点（系统的主要特点（3 3） （二）截词检索功能（二）截词检索功能 允许使用允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如：键入号作为通配符进行截词检索。如：键入“bacter *”，系统会找到那些前一

9、部分是系统会找到那些前一部分是bacter的单词（如的单词（如bacteria，bacterium，bacteriophage等），并对其分别进行检索。等），并对其分别进行检索。 如果这类词少于如果这类词少于150个，个，PubMed会逐词检索，若超过会逐词检索，若超过150个，个，PubMed将显示如下警告信息：将显示如下警告信息：“Wildcard search forterm*used only the first 150 variations.Lengthen the root word to search for all endings”。 截词功能只限于单词，对词组无效。如：截词功

10、能只限于单词，对词组无效。如：“infection*”包括包括“infections”，但不包括，但不包括“infection control”等。等。 使用截词功能时，使用截词功能时，PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。系统会自动关闭词汇转换功能。 （三）强制检索功能（三）强制检索功能 允许使用双引号（允许使用双引号（“”“”）来强制系统进行短语检索。例如）来强制系统进行短语检索。例如“Single cell”，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。检索。 使用双引号检索，会自动关闭词汇转换功能。使用双引号检

11、索，会自动关闭词汇转换功能。 （四）（四）PubMed系统允许使用布尔逻辑检索，但要在提问框中键入布尔逻系统允许使用布尔逻辑检索，但要在提问框中键入布尔逻辑运算符（辑运算符（AND，OR或或NOT），但布尔逻辑运算符必须大写。如：），但布尔逻辑运算符必须大写。如：vitamin c OR zinc。 Copyright 2006 三、PubMed PubMed 系统的主要特点（系统的主要特点（4 4）（四）链接功能（四）链接功能链接相关文献链接相关文献 链接链接NCBINCBI（National Center for BiotechnologyNational Center for Biote

12、chnology Information Information）数据库数据库链接外部资源链接外部资源 PubMedPubMed提供从检索结果到期刊全文、提供从检索结果到期刊全文、生物学数据、序列中心等的链接。生物学数据、序列中心等的链接。链接相关图书链接相关图书 点击点击“ “ Books”Books”，可参考相关书籍的文可参考相关书籍的文摘页。摘页。 PubMed PubMed向用户提供期刊的缩写名称和向用户提供期刊的缩写名称和ISSNISSN号。号。 Copyright 2006 四、四、PubMedPubMed检索检索 在浏览器地址栏输入在浏览器地址栏输入http:/www.ncbi.

13、/pubmed，获得获得PubMedPubMed一般检索界面一般检索界面/ / PubMedPubMed主主页。页。 PubMedPubMed系统检索范围为系统检索范围为MEDLINEMEDLINE数数据库和据库和PreMEDLINEPreMEDLINE数据库数据库。 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 单单/ /多引文多引文匹配检索匹配检索临床询问临床询问专题查询专题查询 Copyright 200

14、6 主题词检索主题词检索在研研究在研研究查询查询期刊查询期刊查询 Copyright 2006 1、基本检索、基本检索Stomach cancer Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 2、主题检索（、主题检索（MeSH Database） Copyright 2006 Stomach cancer Cop

15、yright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 副主题词副主题词限定主要概限定主要概念词念词扩展检索扩展检索 Copyright 2006 Copyright 2006 副主题词副主题词限定主要概限定主要概念词念词扩展检索扩展检索 Copyright 2006 Copyright 2006 3、临床询问（、临床询问（Clinical Queries）进入临床询问界面，界面上列有医生常用的类目，如：therapy、diagnosis、etiology、prognosis、clinical prediction guides，检索时

16、，只需在检索框内键入主题词，然后用鼠标点选上述项目即可，这样更方便临床医生检索。Clinical Queries提供sensitivity(一般相关文献)和specificity（密切相关文献）两种检索方式。 Copyright 2006 AIDS Copyright 2006 Copyright 2006 4、单引文匹配检索（、单引文匹配检索（Single Citation Matcher） Copyright 2006 Frey DM, Wildisen A, Hamel CT, et al. Randomized clinical trial of Lichtensteins opera

17、tion versus mesh plug for inguinal hernia repair. Br J Surg. 2007;94(1):36-41.200794136Br J Surg200794136Frey DM Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 5、专题询问（、专题询问（Special Queries） Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 6、期刊查询（、期刊查询（Journal Database） Copyri

18、ght 2006 AIDS Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 7、在研研究查询（、在研研究查询（Clinical Trials） Copyright 2006 Copyright 2006 Lung cancer Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006

19、Copyright 2006 8、高级检索（、高级检索（Advanced search）高级检索不仅提供可多的检索组配，还可对研究高级检索不仅提供可多的检索组配，还可对研究结果进行进一步限定。结果进行进一步限定。 Copyright 2006 8、高级检索（、高级检索（Advanced search） Copyright 2006 8、高级检索（、高级检索（Advanced search）-逻辑组配逻辑组配Stomach cancer Copyright 2006 gastric cancer Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 Copyright 2006 8、高级检索（、高级检索（Advanced search）-条件限定条件限定 Copyright 2006 9、结果的显示、保存、结果的显示、