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文档简介
1、目录目录常用分子生物学技术的常用分子生物学技术的原理及应用原理及应用The Principle and Application of Common Used Techniques in Molecular Biology第二十章第二十章目录目录第五节第五节生物大分子相互作用研究技术生物大分子相互作用研究技术 The Method of Protein-protein and Protein-DNA Interaction Study目录目录一、蛋白质相互作用研究技术一、蛋白质相互作用研究技术 酵母双杂交酵母双杂交 各种亲和分析(标签蛋白沉淀、免疫共沉淀等)各种亲和分析(标签蛋白沉淀、免疫共沉淀
2、等)n常用蛋白质相互作用的研究技术常用蛋白质相互作用的研究技术目录目录标签融合蛋白结合实验是一个基于亲和色谱标签融合蛋白结合实验是一个基于亲和色谱原理的、分析蛋白质体外直接相互作用的方法。原理的、分析蛋白质体外直接相互作用的方法。(一)标签蛋白沉淀(一)标签蛋白沉淀标签融合蛋白结合实验主要用于证明两种蛋标签融合蛋白结合实验主要用于证明两种蛋白分子是否存在直接物理结合、分析两种分子结白分子是否存在直接物理结合、分析两种分子结合的具体结构部位及筛选细胞内与融合蛋白相结合的具体结构部位及筛选细胞内与融合蛋白相结合的未知分子。合的未知分子。 目录目录标签融合标签融合蛋白沉淀蛋白沉淀实验流程实验流程示意
3、图示意图目录目录(二)酵母双杂交技术的基本原理(二)酵母双杂交技术的基本原理和用途和用途目录目录n酵母双杂交系统的应用酵母双杂交系统的应用 证明两种已知基因序列的蛋白质可以相互作用证明两种已知基因序列的蛋白质可以相互作用的生物信息学推测。的生物信息学推测。 分析已知存在相互作用的两种蛋白质分子的的分析已知存在相互作用的两种蛋白质分子的的相互作用功能结构域或关键的氨基酸残基。相互作用功能结构域或关键的氨基酸残基。 将拟研究的蛋白质的编码基因与将拟研究的蛋白质的编码基因与BD基因融合成基因融合成为为“诱饵诱饵”表达质粒,可以筛选表达质粒,可以筛选AD基因融合的基因融合的“猎物猎物”基因表达文库,筛
4、选未知的相互作用基因表达文库,筛选未知的相互作用蛋白质。蛋白质。目录目录电泳迁移率变动测定电泳迁移率变动测定( (electrophoretic mobility shift assay,EMSA)或称凝胶迁移变动实验或称凝胶迁移变动实验( (gel shift assay)最初用于研究最初用于研究DNA结合蛋白与相应结合蛋白与相应DNA序列间的相互作用,可用于定性和定量分析,序列间的相互作用,可用于定性和定量分析,已经成为转录因子研究的经典方法。目前这一技已经成为转录因子研究的经典方法。目前这一技术也被用于研究术也被用于研究RNA结合蛋白和特定结合蛋白和特定RNA序列间序列间的相互作用。的相互作用。二、二、DNA-蛋白质相互作用分子分析技术蛋白质相互作用分子分析技术(一)电泳迁移率变动测定(一)电泳迁移率变动测定目录目录放放射射自自显显影影未结合探针未结合探针结合有蛋白的探针结合有蛋白的探针标记探针标记探针1X1X1X1X核蛋白提取物核蛋白提取物1X10X10X未标记探针未标记探针10Xn凝胶迁移实验结果示意图凝胶迁移实验结果示意图目录目录染色质免疫沉淀技术染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)是目前可是目前可以研究体内以研究体内DNA与蛋白质相互作用的与蛋白
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