GaussView5基础教程

1、GaussView教程【1】界面介绍Gview是一个专门设计丁高斯配套使用的软件，其主要用途有两个：构建高斯的 输入文件；以图的形式显示高斯计算的结果。除了可以自己构建输入文件外， Gview还可读入Chem3D HyperChenft晶体数据等诸多格式的文件。从而使其可 以丁诸多图形软件连用，大大拓宽了使用范围。开启GaussView会看到一大一小两个窗口，后面灰色背景的窗口为选择窗口， 在 里面选择要输入的分子或基团；前面紫色的窗口为绘图窗口，使用鼠标绘制想要 绘制的图形。File EdH Vie-w Caleulate Result? Windows Jle-lp菜单栏File】主要功能

2、是建立，打开，保存和打印当前的文件Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等【View】与显示分子相关的都在这个菜单下，如显示氢原子、键、 元素符号、坐标等Calculate】直接向Gaussian提交计算Results】接收并显示Gaussian计算后的结果【WindowSI控制窗体，如关闭、恢复等Help帮助快速工具栏Carbon Tetrahedral【左面第一个】选择元素与价键，单击打开会看到一个元素周期表，通过它可以 选择需要绘制的元素以及价态。【左面第二个】环工具，作用与上一个差不多，只是这里提供的都是环状化合物 残基；【左面第二个】提供常用的R基团模板，其中包括乙基、丙基、异

3、丙基、异丁基R-Group Fragments【左面第四个】 氨基酸残基，使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团，您可以将常用的基团存放到此处歹半|镉不言777)这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。跳Dlr KI G 樊建加3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的，几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2构建分子这里以构建一个问氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算

4、为例来说明1、开启 Gview2、双击按钮，选择苯基（第一个），会看到主程序框体中出现苯环在工作窗口单击，可以看到工作窗口也出现了一个苯环。单击左键，可以将主程序框体中的分子或基团加入到工作窗口；按上下左右键，或者左键单击不放移动鼠标，可以调节分子的角度;滚动鼠标滚轮，可以放大缩小分子；按住shift键，左键单击不放移动鼠标，可以移动分子；当工作窗口内有多个分子时（在构建大的分子时，这种情况很容易出现）用Shift+Alt+鼠标左键组合，移动想要移动的分子；用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调节其中一个分子的角度；双击 邑1图标（或者左键不放），在元素周期表中选择【F】元素，回到工作窗 口在苯的

5、任意一个【H】上单击，使之变成【F】GliMLVl - New虢鸿留影12 ator&Sj, 50al,Build Select Flaz世真双击：HI图标，从链轻库中选择【乙基】（第一个），然后点击问位上的【 H 即可GliMlVl - New®至此，分子式已经构建完成，Gview存储个人常用分子的功能，双击view上的 图标，在下面的对话框中键入相关项目，保存即可。（注：我的程序此项功能不行，用户自定义基团） X Mhifjr />xm 擂 w 两 W fr 寸心1¥料11 lal 31Ft 9Fe*9*M AFt 屏部E '饪 QkMll;Vi

6、- Mm查看分子坐标：单击Gview界面的#图标，查看分子的坐标日-ATOffi Lin EditfiJEl 普 E4* E/wCulurtbhM Hfil p% n j；:HEX蛔/Hl Chillih Kfl wTai$Ri«lreK心AudiIShw1CzShw2GtL 315003C211. J94T! £1ISO OOS&32214C3E1谊 9941*55%州5C43t1.MI8ZS1119.9939923-16SlUH6CZ31.3<8«1ll«免枫龄T7It2I&I.PW553119 9000 0488MI321.O

7、9M801110 DB1142Ig9H54tI MWttO120.0113434LOSI板10H(121 09M040ISO D079970USimiir3!1I /SWJOO皿Q!娜网L212c1681 MOOOOOISO 000199L3SXm13CL21&l.SOOCWO110 71S9HSL414M12LB1 I17L4B2皿Fei 1 ttrx孤留影至此，我们保存一下我们构建好的问氟苯乙烷分子，在绘图界面右键单击【File】【Save】然后选择保存路径即可。GaussView教程【3】向Gaussian提交计算上一讲我们已经构建好了一个问氟苯乙烷分子，现在打开问氟苯乙烷分子。

8、点击Gview界面上的【Calculate】【Gaussian Calculate Setup 】tr* GaussView 5.D.8*H 叵 耳日从对话框中我们可以选择许多参数，下面依次选择一下3 Cl=II:Yl&w33i.4m C&Lculat ian SetupEE1L虬Tills Cui E蜘&乏此w剪 >f/3-21E EeriBc»ini*ietlviij: U 1Jot Type Hat Had Title | Ll ti± fl G«Ti£ral | Ghaee NEE" | ?3F§

9、 口 "nti 西 | Idi ImpAlAJl ti'XzvaJL ECeyw-jrAs' |VpdeLteSlhene: |p©e£auiFSd»ne）三 4B|Submit. j Qu izk LmtuizIi QaruzeL |1,0. L , |Ee IsiiiHHhlIIm | Help【Job Type工作类型：Energy 能量】|【Optimization 优化】|【Frequency 频率】|【Opt+Freq 优化+频率】|【Scan扫描】|【Stability稳定性】|【NM漱磁】，这里我们选择【NMR核磁【Met

10、hod】方法：每种计算模式都提供了若干种方法，这里选择默认值即可Title】题目：这项可以根据自己的项目自行命名Link 0】给检查点文件命名其它选择默认即可 选好后点击【Submit】提交至Gaussian,并保存。（最好存到安装文件所在磁 盘）系统会询问是否提交至 Gaussian,选择【O" , Gaussian会自动开启并计算, 计算时间因硬件配置而异计算完毕后系统会提示关闭Gaussian ,点击【是】计算完毕后会生成两个文件，.log的是系统日志，便丁查看计算结果。这里我们选择.chk文件【Ok但这次我们【SummarJ接下来我们乂一次看到了刚才绘制的那个分子， 表面上没什么不同, 可以预言它的许多性质了，在 GView的主界面点击【Results】 可以看到刚才的计算总结，点击【View File】可以看到日志文件。也 G2：M1:VJ - Gaussian Calculation Summary因为我们刚才选择计算模式是【NMR核磁，所以我们点击【Results】一一【NMR, 随即我们看到了很熟悉的核磁图谱，但似乎很乱，因为这是