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文档简介
1、质粒DN碾取的原理及方法碱裂解法质粒DNA提取原理质粒DN破取主要包括以下几个方面:如何将细胞裂解释放质粒DNA如何将质粒DNA基因组DNA分离开来,如何去除 RNA亏染,如何去除蛋白质和其它杂质。质粒提取方法中,最常用的方法是碱裂解法,它具有得率高,适用面广,快速,纯度高等特点。其原理是:强碱性条件下,质粒 DN碍日基因组DNA同时从细胞中释放出来,并发生变性。在pH中性,并有高盐浓度存在的条件下,质粒DN怂迅速发生复性,仍为可溶性状态,染色体DNQ间交联形成不溶性网状结构, 在去垢剂SDS作用下,染色体DNAf变性蛋白质和细胞碎片结合 形成沉淀,通过离心去除沉淀后,再用酚氯仿抽提进一步纯化
2、质粒DNA用异丙醇或乙醇沉淀可将之纯化出来。BIOMIGA公司质粒DNA屯化系列试剂盒,采用碱裂解法质粒提取原理,在高盐环境下,采用 硅胶膜特异性的吸附质粒 DNA而蛋白质不被吸附,最后用低盐洗脱液将DNAI膜上洗脱下来,方法简单,快速,质量好,收获量高。影响质粒提取的因素影响质粒提取的因素有很多种,如质粒拷贝数,宿主菌株的种类,细菌的培养时间、培养基种类、培养条件等等。质粒拷贝数质粒DNA最终收获量取决于质粒的拷贝数和质粒的大小。BIOMIGA公司质粒DNA取系列试剂盒,操作步骤适用于高拷贝数质粒的纯化, 对于低拷贝质粒纯化提取, 应加大起始菌液量 的体积,并且相应地增加各种缓冲液的用量。下
3、表给出一些常用质粒载体的拷贝数:质粒种类复制起点拷贝数1 mL菌液质粒DNA攵获量3 g)pSC101pSC10150.1-0.2pACYCP15A 10-120.4-0.6pSuperCospMB110-200.4-1pBR322pMB115-200.6-1pGEMRMuted pMB1300-4006-7pBluescriptRColE1300-5006-8pUCMuted pMB1500-7008-12宿主菌株宿主菌株的种类将会影响质粒的收获量。含内源核酸酶的宿主菌株,如JM101, JM110, HB101,TG1以及它们的衍生菌株,通常因为内源核酸酶的存在,或者在提取过程中释放出来的
4、核酸酶的作用下,将会显著影响最终收获量,或者纯化到的质粒容易降解,推荐客户将质粒转化至不含内源核酸酶的宿主菌株中,如Top10, DH5a进行质粒纯化。如果从含内源核酸酶的宿主菌株中纯化质粒DNA请用试剂盒附送的核酸酶去除溶液,去除核酸酶的污染。或选用 HP系列试剂盒进行质粒的纯化。下表给出一些常用的宿主菌株种类:EndA- Strains of E. ColiDH&DH1DH21JM106JM109SK2267SRBXLOTOP10DH10BJM103JM107SK1590MM294Stbl2 ?XL1-BlueBJ5182DH20JM105JM108SK1592Select96 ?
5、Stbl4 ?XL10-GoldEndA+ Strains of E. ColiC600JM110RR1ABLE? CCJ236KW251P2392BL21(DE3)HB101TG1TB1ABLE? KDH12S>LE392PR700BL21(DE3) pLysSJM101JM83TKB1HMS174ES1301M1061Q358BMH 71-18All NM strainsAll Y strains菌液培养BIOMIGA公司质粒DN砒取系列试剂盒,标准操作适用于在 LB培养基中培养1216小时, OD60g 2.03.0的菌液质粒 DNA勺提取。如果使用丰富培养基,如 TB, 2 x
6、YT培养基, 请保证OD600不超过3.0。菌液过量,将会影响最终的收获量和纯度。培养方式如果用于质粒小提,请从固体培养基平板上挑取新鲜单菌落,接种到加入筛选抗生素的培养基中,震荡培养 1216小时。如果用于中提、大提或超大提,请按照以下方式制备菌液:挑取单克隆,接种到 15mL培养基中,进行初摇,然后按照1:1000的比例进行放大培养,培养瓶中培养基的体积最好不要超过培养瓶的1/4体积。抗生素浓度的选择对含有抗性的质粒载体,在进行筛选或培养时应加入相应的抗生素。各种抗生素的工作浓度请参照下表:抗生素溶解性保存条件严紧型质粒松弛型质粒氨节青霉素50 mg/mL(溶于水)-20 C20 g/mL
7、60 g/mL愈节青霉素50 mg/mL溶于水-20 C20 1 g/mL60 g/mL氯霉素34 mg/mL溶于无水乙醇-20 C25 g/mL170 g/mL卡那霉素10 mg/mL溶于水-20 C10 g/mL50 g/mL链霉素10 mg/mL溶于水-20 C10 g/mL50 g/mL四环素5 mg/mL溶于无水乙醇-20 C10 g/mL50 g/mL质粒质量鉴定纯化到的质粒DNA一般可以通过以下三种方式进行质量鉴定。琼脂糖凝胶电泳检测理想条件下,经碱裂解法纯化到的质粒DNA应该只出现超螺旋一条带。但在质粒提取过程中机械力,强碱溶液的作用等原因,纯化到的质粒常常会出现三条带,甚至有时候会出现四条带(变性超螺旋),不管是哪种形式的超螺旋,经单酶切后,呈现一条带,则说明提取结果正常,没有基因组污染。酶切鉴定纯化到的质粒,进行进一步的酶切操作,鉴定质粒的大小。紫外分光光度计检测纯化到的质粒,稀释
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