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文档简介

1、会计学1基因启动子序列的查找基因启动子序列的查找NCBI选择“Gene”输入基因的名字（）-Search第1页/共21页选择特定物种的p53基因eg.TP53(human)第2页/共21页获得TP53基因的详细信息：基因名称、全称、别名、类型等。下拉获得更多详细信息第3页/共21页基因组结构：不同版本中，此基因在染色体中的位置、转录方向等。第4页/共21页基因组区域，转录，产出：p53基因在不同转录本中的信息点击GenBank第5页/共21页GenBank :获得基因详细信息：位置、定义、登录号、版本、特征、碱基序列等。第6页/共21页FASTA :获得基因的全部序列（包括非转录区序列）。第7

2、页/共21页1、在NCBI中查找所需的基因（以p53为例）查找P53的基因序列；第8页/共21页1、在NCBI中查找所需的基因（以p53为例）选择特定物种的P53基因，例如human.第9页/共21页1、在NCBI中查找所需的基因（以p53为例）获得human p53基因的详细信息第10页/共21页2、确定此基因在染色体上的位置和转录方向（正向/反向）；转录方向：从右向左，反向转录，说明启动子区与第一外显子区位于此段基因的右侧。第11页/共21页3、确定启动子区与第一外显子区的长度；获得FASTA格式的序列信息，右侧为此段基因的长度：7668402-7687550bp.启动子区位于基因5端20

3、00bp，即7687550-7689550bp第12页/共21页3、确定启动子区与第一外显子区的长度；查找第一外显子的位置：在p53基因的详细信息页面中查找mRNA的详细信息，确定其在基因序列中的位置。第13页/共21页3、确定启动子区与第一外显子区的长度；进入P53基因mRNA的详细信息界面第14页/共21页3、确定启动子区与第一外显子区的长度；进入P53基因mRNA的详细信息界面，找到exon（第一外显子）的位置：1-174bp第15页/共21页3、确定启动子区与第一外显子区的长度；进入P53基因FASTA信息的界面，确定第一外显子的长度：第一外显子位于基因5端1-174bp的位置，由于基因为从右向左反向转录，第一外显子位于启动子（ 7687550-7689550bp ）的左侧174bp：7687376-7687550bp；第一外显子+启动子： 7687376-7689550bp第16页/共21页4、下载启动子区与第一外显子区的序列；数据保存为FASTA格式第17页/共21页4、下载启动子区与第一外显子区的序列；数据保存为FASTA格式，用word打开。第18页/共21页4、下载启动子区与第一外显子

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