聚类分析和NMDS分析的基本步骤

1、聚类分析和NMDS分析的基本步骤以 z q夏季重量为例1.打开primer,选择已经输入为“站位x种类渔获率” 矩阵的excel文件（图1）。在excel file properties对话框按照默认选项。 Sample data properties对话框也按照,默认选项， Title可以输 入标志此表的名称。2.打开excel文件如图，注息行首名称为samples ，列首为variables 。 Samples即聚类分析中的样本，variables即聚类分析中的指标。我们就是要把这么多种类的渔获率作为指标来 分析站位间的相似性。Samples*"q"*>3.生成相

2、似性矩阵。选择 data>similarity ,在similarity对话框含义如图。PRIIKR分析哪个序列的相似性>计算多位空间距离的方法对数据进行转变的方法,圣法使用四次方根， 但我不JCH491 |MJ2E|ZDMJK591 ZD -MJK570| ZH-MJK5+5|MJ2O |MJ16MJIOEDMJK的 |MJ 能ZD+kggZDWJT55l|田氏四益耳00112年14A?DDnal5D.D737153.2920001DG23双00口0aDD0na011.D500班靖0QQg0等5型QQ0Q0QQ0义城拍00000000Q0Q0展无料乌00Bill0QD0DD000

3、0置母弼ID000QD0DD035.9205300小修椎身掘17 SI034.41花13a前274 SB1魄制S31.E457B.&3S9.5527nm249.%35740%254 39JM003CL0DD5a 350a0flQ多蛇的枳品00aBDDn 1G3.19294门始21905方F聃0000Q9的0JIM0Q0耕口0000000Q0Q00知道什么原因选中表示在分析前对数据进行标准化,建议选中4 .相似性矩阵如下:5 .聚类分析：选择 analyse >cluster, cluster对话框选择如图，聚类按照群组平均值P PRI1ERFile Edi t Vi ewCLUS

4、TER.MDS.MVDISP.RELATE.2STAGE.ANOSIM.AB0SIM2.Oji t i ons Window Help结果:Ffiu 口匚i回回I OSI 83I 35I MIri-nr-JII式*n E-fsYTi-M 113 宏良 I sentI 一品 f 一崽F3Z 号I 00具 IM屋I mH-忘出二 hihI建艮RB TEEsf 耨HI门息6 .NMDS ：回至ij相似性矩阵窗口，选择 analyse>MDS,RELATE结果的初步分析，从 cluster图可以看出有四个，那么最后可以在站点图上把每一个类的站 位都改成一样的，就看出在空间上的相似趋势来了。全部按照默认值，ok即可。结果如下可以调整字体等来显示CLUSTER .MVDISF .EiJi!由 一加工 1111bdor卬圉口| 4| x>|n| 司朝，| T|Opti ons Window HelpDllHl <1邮项ANDSIM2.jnwainr；n-皿便由加.10ZIMIJES3T3-