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文档简介

1、分子内坐标输入以含H2O的高斯输入格式为例:# P HF/STO-3GHC3)Water en ergy0 1OH 1H 1HC3)0.9560.956 2 104.5计算的最基本格式如上例所示，第一行表示计算方法和基组，然后空一行，第三行表示名称，然后空一行，蓝色的一行两个数字分别表示分子电荷和自旋 多重度，红色部分为分子内坐标。在分子内坐标系中， 与另一化学键间的键角，以理解为原子在空间的相对位置， 置。分子中每个原子的相对位置是用与它成键的另一原子间键长、该键以及后者与和它有一条公共边的另一键角所成的二面角来确定。可取分子中的一个原子作为参考原子逐步确定其他原子的位需注意：键长的默认单位

2、为？；0o< 键角< 1800。二面角的定义为包含原子其取值区间为-1800, 180o。二面角所取的正负符号由A、1、2的平面与包含原子 1、2、3的平面所成的夹角,右旋法则”确定。用“右旋法则”确定二面角的正负时，取包含参考 3个原子的平面为基准面、 参考原子 2指向参考原子1的位矢方向为基转轴的正方向。若被定义的原子A与参考原子1、2构成的平面位于基准面的逆时针方位，则其二面角参量为正号，否则为负号。以上是关于内坐标的解释，我们在输入分子内坐标时大多依靠软件（view）进行。下面以甲烷为例说明：首先使用chem3D画一个甲烷分子；chem3D 禾R gaussEjJ* VE.

3、hl 丄 _A. :*4*. dJ垃a 电 i*- A ,> - ；!-t yw 2*、*、-一 A w - +3 t» £ 二 i '= ® JLF然后另存为格式为 gjf車面L .最近诂问的垃置Admiristratorxf飞L速台也网第文件名00；喋存歩塑（T）：CH4Gaus S； an Ijipu-t (*. £ £)保存G）取消使用记事本打开保存的文件，如果是内坐标表示完成；如果显示的是笛卡尔坐标如下文件旧确旧巒式CO盘M 理朗旧）rt SP TestNo TitleCHHHH0.293103 -0. 0541201.

4、405320 -Cl ns觥加 -Cl 0E9o090. oooooo0. oooooo氏 oooooo d g 临 ER -0. 903795-k 5344S3 -0.477031 -L55957S -2.n50615 -2.050515000000关掉文件，再使用 gauss view打开文件后，右击，选择file f savea乍 吕匚tivi ty sp test文件储存类型选择 Gaussian Input Files (*gjf), write Cartesians (表示的是笛卡尔坐标)前面 不打勾。保存的文件即为甲烷的内坐标。lb Titlsl1CH H HHQ1.112995S01.112y*Jy51. 113000031.11300003lOQ.餡舶招豐109. 470

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