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文档简介
1、生物化學精要ch7, 7.5, page 234原核生物原核生物DNA片段片段mRNA轉譯蛋轉譯蛋白質白質A、B、C核糖體核糖體多肽鏈多肽鏈A多肽鏈多肽鏈B多肽鏈多肽鏈C蛋白質蛋白質A基因基因A基因基因B基因基因CRNA聚合酶聚合酶依憑依憑DNA的的RNA聚合酶轉聚合酶轉錄基因錄基因A、B、C之之DNA核糖體轉譯核糖體轉譯mRNA成為成為蛋白質蛋白質A、B、C生物化學精要ch7, 7.5, page 234圖7.20 在轉錄和轉譯的過程中,原核生物與真核生物Mrna分子的特質之比較。DNA片段片段真核生物真核生物異負核異負核RNA(只有只有表現一個多肽鏈表現一個多肽鏈)表現子為蛋白質轉譯的區表
2、現子為蛋白質轉譯的區域,必須移除沒有轉譯序域,必須移除沒有轉譯序列的插入子而連接在一起,列的插入子而連接在一起,這個移除插入子以及連接這個移除插入子以及連接表現子的過程稱為剪接作表現子的過程稱為剪接作用。用。基因基因A轉錄轉錄DNA由依憑由依憑DNA的的RNA聚合酶轉錄聚合酶轉錄mRNA由細胞質核糖體轉譯為蛋白質由細胞質核糖體轉譯為蛋白質蛋白質蛋白質A剪接剪接小小(胞胞)核核糖核蛋白核核糖核蛋白轉移至細胞質轉移至細胞質轉譯轉譯在轉錄後加工在轉錄後加工Poly(A)AAAA3-端末轉譯區域端末轉譯區域生物化學精要ch9,9.6 ,page 312圖9.33 在真核細胞中剪接基因的組成。生物化學精
3、要ch10,10.4 ,page 335生物化學精要ch7, 7.5, page 235生物化學精要ch11,page 344當碳水化合物這個字被創造出來時,原先是泛指具有Cn (H2O)n分子式的化合物。然而只有簡單的糖或單醣(monosaccharides),可以完全符合這個通式。其他種類的糖、寡醣以及多醣,都是以單醣為基礎,但與這個分子式有些微的不同。 生物化學精要ch11,page 344當少許的單醣連結,可形成寡醣oligosaccharides)而當許多的希臘語polys單醣結合在一起則可形成多醣。 生物化學精要ch11, 11.1 ,page 345所有糖類的最小單位是簡單的糖稱
4、為單醣monosaccharides) 生物化學精要ch11, 11.1 ,page 345有些分子不會與其鏡像重疊,而這些鏡像與分子互為旋光異構物optical isomers);或稱立體異構物(stereoisomers)。 生物化學精要ch11, 11.1 ,page 345組態圖configuration是指環繞在對掌碳原子周圍之基團的三維空間的排列,所以立體異構物彼此間組態是不同的。 生物化學精要ch11, 11.1 ,page 345生物化學精要ch11, 11.1 ,page 346為了呈現最後分子的結構,我們必須對表示分子結構的二維透視圖法加以說明,此法稱為費雪投射法(Fisc
5、her-projection) 生物化學精要ch11, 11.1 ,page 346利用費雪投射法,在二維的紙面上垂直標示的鍵,代表該鍵在三維結構是位於紙張背後,水平標示的鍵,表示此鍵在三維結構是位於紙張前方 生物化學精要ch11, 11.1 ,page 346氧化程度最高的碳在這個例子中是指醛基的碳被畫在最頂端,並且被命名為碳1或C-1。 生物化學精要ch11, 11.1 ,page 346D-葡萄糖葡萄糖(醛糖醛糖)D-2果糖果糖(酮糖酮糖)D-葡萄糖葡萄糖L-葡萄糖葡萄糖圖11.2 (a)醛糖(D-葡萄糖)與酮糖(D-果糖)的例子,並標示出碳原子的編號。(b)比較D-葡萄糖與L-葡萄糖的
6、結構。生物化學精要ch11, 11.1 ,page 347D-赤藻糖赤藻糖D-異赤絲藻糖異赤絲藻糖D-赤藻糖赤藻糖L-赤藻糖赤藻糖D-異赤絲藻糖異赤絲藻糖L-異赤絲藻糖異赤絲藻糖生物化學精要ch11, 11.1 ,page 348生物化學精要ch11, 11.1 ,page 349生物化學精要ch11, 11.1 ,page 350在哈爾斯的投影式中,糖類的環狀構造是以平面的五元或六元的環以近乎側視的透視圖來表示。 生物化學精要ch11, 11.1 ,page 350空間配置OH到環異構碳的右邊空間配置OH到環異構碳的左邊-D-莆萄糖與CH=0反應形成 半縮醀鏈開放型態-D-莆萄糖生物化學精要
7、ch11, 11.1 ,page 351生物化學精要ch11, 11.1 ,page 351生物化學精要ch11, 11.1 ,page 351生物化學精要ch11, 11.1 ,page 351重要訊息大多數的糖類是以五或六還環的環狀形式存在。環化作用的過程包含到羰基,並且在糖類分子中會多加入一個對掌中心。兩種可能的環狀異構物稱為環異構物,分別為與兩種。生物化學精要ch11, 11.1 ,page 352生物化學精要ch11, 11.1 ,page 352生物化學精要ch11, 11.1 ,page 352生物化學精要ch11, 11.2 ,page 355糖苷鍵結可以有多種形式;一個糖上的
8、異位性碳原子,可與另一個糖類上的任OH基形成-或-糖苷鍵結。 生物化學精要ch11, 11.2 ,page 355生物化學精要ch11, 11.2 ,page 356重要訊息糖苷鍵結主要是負責將單醣鍵結起來形成寡糖及多醣。生物化學精要ch11, 11.2 ,page 356纖維素與澱粉之間的不同,在於葡萄糖單體間糖苷鍵的形式。由於糖苷鍵的不同,會造成直線或分支鏈的聚合物的形成。如果內部的單醣殘基嵌入多醣中只形成兩個糖苷鍵,此聚合物會呈線狀。 生物化學精要ch11, 11.2 ,page 356生物化學精要ch11, 11.2 ,page 356生物化學精要ch11, 11.2 ,page 35
9、7直線多葡萄鏈直線多葡萄鏈生物化學精要ch11, 11.2 ,page 357生物化學精要ch11, 11.3 ,page 358寡醣通常以雙醣disaccharides的形式存在 生物化學精要ch11, 11.3 ,page 360生物化學精要ch11, 11.3 ,page 360生物化學精要ch11, 11.3 ,page 360生物化學精要ch11, 11.3 ,page 361乳糖是由-D-半乳糖與D-葡萄糖所組成的雙醣。 生物化學精要ch11, 11.3 ,page 361麥芽糖是由澱粉水解得來的雙醣,而纖維雙糖是從纖維素水解出的一種雙醣。 生物化學精要ch11, 11.3 ,pa
10、ge 361所以麥芽糖與纖維雙糖不同的地方,只有糖苷鍵結的不同而已。哺乳動物可消化麥芽糖,卻不能消化纖維雙糖。 生物化學精要ch11, 11.4 ,page 361當許多單醣連結在一起就會形成多醣polysaccharide)。 生物化學精要ch11, 11.4 ,page 361由單一種單醣所組合而成的聚合物,稱為同多醣homopolysaccharide)而由一種以上的單醣所組合成的聚合物,則稱異多醣葡萄糖是最常見的單體。 生物化學精要ch11, 11.4 ,page 361重要訊息多醣是單體的糖分子藉由糖苷鍵結而成。這些聚合物包括纖維素、澱粉與肝糖,在植物或細菌這些生物體的結構上,扮演很
11、重要的角色,也是能量儲存的運輸媒介。生物化學精要ch11, 11.4 ,page 363澱粉starches是植物細胞中所含-D-葡萄糖聚合物,通常以澱粉顆粒的形式存在細胞質中。要注意的是澱粉中所含的都是-糖苷鍵結,而相反的在纖維素中則含有-糖苷鍵結。 生物化學精要ch11, 11.4 ,page 363直鏈澱粉amylose是葡萄糖的線狀聚合物,所有的殘基均是以14)鍵連結在一起。支鏈澱粉(amylopectin是含支鏈的聚合物,支鏈起始點是16鍵結,之後沿著整條屬於14鍵結的鏈(圖11.21)。 生物化學精要ch11, 11.4 ,page 363生物化學精要ch11, 11.4 ,pag
12、e 363生物化學精要ch11, 11.4 ,page 364生物化學精要ch11, 11.4 ,page 364生物化學精要ch11, 11.4 ,page 365肝醣與支鏈澱粉不同的地方,就是肝醣含有較多的分支 生物化學精要ch11, 11.4 ,page 365生物化學精要ch12,page 378葡萄糖代謝的第一個階段稱為糖解作用 生物化學精要ch12,page 378糖解作用是一個厭氧過程,反應完成後自己本身只會產生兩個ATP分子,而葡萄糖完全氧化成二氧化碳與水(包括糖解作用、檸檬酸循環,與氧化磷酸化反應),會產生相當於32個ATP分子的能量。 生物化學精要ch12,12,1 ,pa
13、ge 378較常見的丙酮酸厭氧代謝結果是還原成乳酸,此稱做厭氧糖解作用(anaerobic glycolysis),此與葡萄糖轉換至丙酮酸時所稱的糖解作用。 生物化學精要ch12,12,1 ,page 379生物化學精要ch12,12,1 ,page 379葡萄糖(六碳原子)2丙酮酸(三碳原子)2 ATP+4 ADP +2 Pi2 ADP + 4 ATP(磷酸化葡萄糖+2 ADP +2 Pi2丙酮酸+ 2 ATP (淨反應生物化學精要ch12,12,1 ,page 379重要訊息 在糖解作用中,葡萄糖會在多步驟反應路徑中,被轉換成丙銅酸。當丙銅酸形成後,可在有氧的反應下被轉換成二氧化碳和水。丙酮酸在厭氧的環境下也可被轉換成
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