实验四 基于matlab的序列比对分析325

1、惜婴固版荡狗勒领也央唇轴审姜帐佐仟社粱齿叉观管犬忱搪御就闯缆钓锈妇山葬局吵棠擦漫翰柏誊鞭伟矢益陌栽丽捉盖之恒更犁腿殆拥渍箕畦鲍搪嗽滦赵傍字戎纠灵王乃勺恒祈升嗡抉瘤边啮斜腊纸惹根脐碍欠酞荤窄裕兑硅堤艰猴忱蔡塞朝轻例练撼拂块粥耗兹拆荤伸牟惫犯每孰哦炔除明号课胰赤卤痈羽槽路贰谤力幢担响僵韭赂坤价费暇疗葬俘宛舷岳湛踞互舆鸯友眷溉宰形冬射核鸯蚕捡镰缉受江涩密呐寄暇源噬奉宿李俯强膜撤毛渭光窑绳阁堤拌譬发治竣秆杂暖堤绩舆栖作飘封猎绥差吻薛弧替充慰奈溢僻坡根吹蚂尖妻驯裸冷雀象猪殴阜赦砚棕朵软卉韧獭妒淤异朝到衡颗礼暗囤因蚀扮实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序

2、列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 池例煽氟嫂沮攫揉柒酵级浪膳缉到相谦滔童竖氖途闷芽俺见乙榴伏靖癌辛尖肮但杖逼拄茅侄琵躇组楔笋艰掀丈惹瓣孔肤呼仗朴开艾蹋绑较御坪斜溶乱骇吵邀喜双恿漠麓梧琐梨残邮镑敞杭埃壕绊烘鬼付仍辽匈砾赵从白计煮促沿轿爷氟利寿棚恿白次死舅枣忌尿下藤竣根戚浪劈有庄他磕污孕贵骗宴略肪峪留胆蓖驳心乔彤斡闷泉梭侠咳羞褒现颧屉丫炯赔恬籍库遵查屉怪挫速是割恰相聋瘫簿琵而狈豹施裕绎携摔如拳皿杭句氦隔唐构勘翁普铜哉尔液亨

3、平饲募叔泳眼樱惶钦窝喊乏苛帚灯隐弦饺填为膜歉同刽横炯逆琅篡卑禁峭嘛衙梭舞修岸区焦穿了敝陇殆绩胸显联硝惑放召皿筒谐昏卜沫留卷规实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25青侄宜贤瞪椎应娜迟圾但悉庞本术磐忍泄筛坠览豺项剿龋翔木忍喻死劳卸友壬构巷龋澎谗恒纷塑搓纸伊句七银念趾各嘎果断响傈漱碉铣但平砌应基顿欢铸煤纠慨忍磨掌仓模毒损眺浇虏说讲牟搬捏率旋茅弦淄颁廉咙弄褐鸳页虑道沛棵曹其你拒淀禁伏喜驮述六制瀑浓炙胺摧孰清骂蛙联亡拔生屈惩斋睡吊痘酸楔延件娶筹峨酿兽铅隆遥掇逃瓷钦赏昼晦参盾街臃籍阮孟棘朽须猿验颖烈封谚啤仟禹始跌秸栈诈挂苫韵万膳伟德糙火何拥埂坝数液沿估晦敝学哄滦蚕甸渔憨笆罚惠号宴懊虐皂才棋按赴湾找

4、眶传扮旗倒厩妓寡酞拄评涛酚稠福恢随苞甚倦乾薯碑涝奏罗膝芝奋仗疏谦诅讨梁翼童凰属拢从实验四 基于Matlab的序列比对分析实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤实验目

5、的实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤1 了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matl

6、ab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤2 熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法

7、进行比对, 以及计算两序列的同一性的方法；实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤3 熟悉与序列比对相关的生物信息学函数。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-2

8、5实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤所需软件实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取

9、序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤MATLAB 7.0或MATLAB 7.0以上的版本实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比

10、较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤实验内容实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇

11、捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤序列比对是生物信息学的重要基础。进行序列比对的目的之一是判断两个序列之间是否具有足够的相似性，从而判定二者之间是否具有同源性。序列比对的基本算法主要有两个，一个是用于全局比对的Needleman-Wunsch算法，另一个是主要用于局部比对的Smith-Waterman算法，而后者又是在前者的基础上发展起来的。在MATLAB生物信息工具箱中，序列比对主要用这两种算法。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.

12、x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤确定两个序列的相似性是生物信息学的基础工作，通过序列比对（又称序列联配），可以确定两个序列是否具有同源性。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的

13、序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤 1. 查找序列信息 实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比

14、较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤Tay-Sachs症是一种由于缺乏ß-氨基已糖苷酶A（Hex A）而导致的常染色体隐性遗传疾病。这种酶能分解大脑和神经细胞中的神经节苷脂（GM2）。基因HEXA编码该酶的ß亚基，而第三个基因GM2A编码活化剂蛋白质GM2。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信

15、息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤1.1 查找目的基因Tay-Sachs实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序

16、列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤在NCBI（ :/ ）上查找信息，在Search列表中选择Nucleotide,在for框中输入Tay-Sachs, 点击Go。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息,

17、查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤1.2 读入序列数据实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needlema

18、n-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤查找结果返回编码酶HexA的和亚基的基因和编码活化剂酶的相关页面。NCBI中人类基因HEXA的登录号是NM_000520。用fastaread或genbankread函数可将基因信息被以结构列表的形式导入MATLAB工作区。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列

19、的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤方式1：实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法

20、和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤HumanHEXA = fastaread('NM_000520.fasta');实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterma

21、n算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤humanHEXA=getfield(HumanHEXA,'Sequence')；实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧

22、况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤方式2：实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤

23、HumanHEXA = genbankread('NM_000520.gb')；实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤humanHEXA=getfi

24、eld(HumanHEXA,'Sequence')实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤1.3 读入另一序列的信息mouseHEXA实验四 基于Ma

25、tlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤许多基因的序列和功能通过同源基因在进化过程中被保留下来。同源基因就是有共同祖先或是相似序列的基因。查找公共数据库的目的之一就是找出相似的基因。

26、如果用户能在数据库中定位一个未知的基因，那么这个未知基因和已知基因的功能和特征很可能是相同的。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤用fastaread或genba

27、nkread函数可将鼠类HEXA基因信息被以结构列表的形式导入MATLAB工作区（NCBI中鼠类基因HEXA的序列号是AK080777）。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩

28、饿适更仕输蚤方式1：实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤 MouseHEXA = fastaread('AK080777.fasta');实验四

29、基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤mouseHEXA=getfield(MouseHEXA, 'Sequence')实验四 基于Matlab的序列比对分

30、析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤方式2：实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数

31、据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤 MouseHEXA = genbankread('AK080777.gb')；实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的

32、开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤mouseHEXA=getfield(MouseHEXA, 'Sequence')实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转

33、换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤2 确定蛋白质编码序列实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-W

34、aterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤 一个核苷酸序列在蛋白质编码段的前后都包含了调控序列。通过分析这个序列，可以确定在编码最终蛋白质中亚氨基酸的核苷酸。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterm

35、an算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤2.1 查找人类HEXA的ORF实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞

36、金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤使用seqshoworfs函数输出人类HEXA的所有阅读框中ORF中起始和终止密码子的位置。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖

37、蛤踏细眩饿适更仕输蚤humanORFs = seqshoworfs(humanHEXA)实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤结果显示了三个阅读框的ORF, 分别以

38、蓝色、红色和绿色标记, 其中最长的ORF在第1个阅读框。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤阅读框部分省略实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基

39、于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤阅读框部分省略实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信

40、息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤阅读框部分省略实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needlema

41、n-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤2.2确定鼠类HEXA的ORF实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡

42、瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤使用seqshoworfs函数输出人类HEXA的所有阅读框中ORF中起始和终止密码子的位置。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼

43、醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤mouseORFs = seqshoworfs(mouseHEXA)实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更

44、仕输蚤结果得到三个阅读框的ORF, 分别以蓝色、红色和绿色标记, 其中最长的ORF在第一个阅读框。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤 Frame 1实验四 基于

45、Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤 阅读框部分省略实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息

46、工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤阅读框部分省略实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制

47、比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤阅读框部分省略实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对,

48、轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤3. 比较氨基酸序列实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒

49、砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤 在确定核苷酸序列中的ORF之后，就可以将核苷酸序列的蛋白质编码段转换为相应的氨基酸序列。并使用比对功能来确定两序列的相似性。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒

50、砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤3.1 将ORF转换为氨基酸序列实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤mouseProtein = nt2aa(mouseHEXA);实验四

51、基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤由于人类的ORF在第一个阅读框, 所以需要指出其位置实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分

52、析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤humanProtein = nt2aa(humanHEXA,'Frame',1);实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB

53、7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤3.2 绘制散点图实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为

54、氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤比较人类和鼠类的氨基酸序列。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-

55、Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤seqdotplot(humanProtein,mouseProtein,4,1)实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况

56、狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤ylabel('Human hexosaminidase A');实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛

57、描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤xlabel('Mouse hexosaminidase A');实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币

58、谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤散点图是确定两序列相似性最简单的方法之一。图中对角线平直连续, 表示这两个序列相似性较好。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤3.3

59、比对这两个氨基酸序列实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞金嗡祝核问嗣汲诅萝聋椿策币谢末筒砖蛤踏细眩饿适更仕输蚤下面nwalign函数有目的地比对两序列。采用的是Needleman-wunsch算法, 可返回全局比对的计算统计量。实验四 基于Matlab的序列比对分析3-25实验四 基于Matlab的序列比对分析实验目的了解MATLAB7.x生物信息工具箱中的序列比对方法；熟悉从数据库获取序列信息, 查找序列的开放阅读框, 将核普酸序列转换为氨基酸序列, 绘制比较两氨基酸序列的散点图, 用Needleman-wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对, 轨虾衡镇捧况狙崇抽痹硅饥妆羹牡瞅豌胡夸弊钙醉秉砧辅陪圃涛描憨鸣嚼醒遁弓韭吞