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文档简介
1、个体育种值的估计与选种指数的制订第一页,共22页。一、个体育种值的估计第二页,共22页。基本概念 个体育种值 简称育种值,又称为种用价值,在决定数量性状表型值的遗传效应中,只有基因的加性效应(A)能稳定遗传给下一代, 个体加性效应(A)的高低反映了该个体在育种上贡献大小,因而称其为育种值估计育种值(estimated breeding value ,EBV) 由于育种值是不能直接度量,只能利用统计学原理和方法,通过表型值和个体间的亲缘关系进行估计,由此得到的估计值称为估计育种值。估计传递力(estimated transmitting ability,ETA) 个体育种值的一半能够传递给下一代
2、,在遗传评估中将它定义为估计传递力第三页,共22页。育种值估计的信息来源 全同胞全同胞同胞同胞 半同胞半同胞后裔后裔种用价值种用价值自身性能自身性能系谱系谱 祖父祖父父父 祖母祖母 外祖父外祖父 母母 外祖母外祖母第四页,共22页。育种值估计方法的分类 单性状的育种值估计(个体育种值) 根据单一信息来源进行估计 本身、同胞、后裔、系谱 根据多种信息来源进行估计 复合育种值估计 单性状的BLUP 多性状的育种值估计(综合育种值) 综合选择指数 多性状的BLUP第五页,共22页。育种值估计的基本原理 利用表型值估计育种值 依据表型值与育种值间的回归关系:第六页,共22页。bAP计算: 式中: 表示
3、提供信息的个体与估计育种值个体间的亲缘系数 为各测量的表型值间的表型相关 当信息来源是一个个体多次度量均值时, 等于多次度量的重复率 ; 当信息来源是n个同类个体单次度量均值时, 等于同类个体间的亲缘系数与性状遗传力的乘积( )。 表示提供信息的个体之间的亲缘系数第七页,共22页。混合家系的平均亲源相关系数: d为配种并产仔的母畜数第八页,共22页。利用单一来源资料估计育种值 根据资料来源的不同,计算出bAP,然后代入公式 ,可得被估个体的估计育种值 由于亲属间亲缘相关的差异,不同来源的资料的重要性程度不同,要利用不同的偏回归系数对各项资料进行加权,以求得复合育种值利用多项来源资料估计育种值第
4、九页,共22页。简化的复合育种值估计 计算偏回归系数的过程复杂! 简化处理的方法: 在单项育种值基础上,根据资料的重要性程度不同给予不同的加权值,并使各项加权值之和为1。最简单的方式: 式中的A1A4分别代表某种信息估计的育种值 具体代表哪种,根据性状的遗传力决定第十页,共22页。性状遗传力A1A2A3A4h2 0.2亲本自身同胞后裔h2 0.6亲本同胞自身后裔h2 0.6亲本同胞后裔自身如果缺少某项资料,该项以零计! h12、 h22、 h32、 h42即不同信息来源时的bAP第十一页,共22页。简化的复合育种值计算步骤 根据性状遗传力,确定A1、A2、A3、A4分别代表那种资料来源 根据资
5、料来源的差异,分别计算出遗传力系数(bAP) 根据公式: 将各个体不同来源的表型值、群体均值代入,计算出各个体的估计育种值 根据估计育种值大小进行排序,选出具有最高估计育种值的个体留种。22111222223334441234222211223344();();();()0.10.20.30.40.1()0.2()0.3()0.4()xAPP hPAPP hPAPP hPAPP hPAAAAAPP hPP hPP hPP hP22111222223334441234222211223344();();();()0.10.20.30.40.1()0.2()0.3()0.4()xAP P hPAP
6、P hPAPP hPAPP hPAAAAAP P hPP hPP hPP hP22111222223334441234222211223344();();();()0.10.20.30.40.1()0.2()0.3()0.4()xAP P hPAPP hPAPP hPAPP hPAAAAAP P hPP hPP hPP hP第十二页,共22页。作业一: 今有下列10头母牛和其亲属的产乳量记录如下表,为了充分利用各种资料,尽可能准确地进行选种工作,要求通过复合育种值的计算,选出最优秀的3头母牛留种。 已知: 该牛群的全群平均产量为4820kg 产乳量的遗传力为0.3 产乳量的重复力为0.4 第十
7、三页,共22页。表1 10头母牛及其亲属的产乳量记录(单位:kg) 牛号牛号本身本身母亲母亲半姐妹半姐妹女儿女儿平均平均乳量乳量记录记录次数次数平均平均乳量乳量记录记录次数次数平均平均乳量乳量头数头数平均平均乳量乳量头数头数00145003480065520235000100255205500085020375050200360001470045300330004490024900553003300055000348006582050006375015500543207200074500560008474022480020085500844001158408550040096500345006
8、50704647001010390045000750906645002实验教程上列出了计算过程,供参考!实验教程上列出了计算过程,供参考!第十四页,共22页。二、选种指数的制订第十五页,共22页。多性状的选择方法 顺序选择法 独立淘汰法 指数选择法 多性状的BLUP法第十六页,共22页。综合选择指数 按各性状的育种学重要性和经济学重要性制订加权值,对个体不同性状的进行加权,得到一个选择指数,根据指数的高低留种 一般只利用个体本身的性状表型值综合育种值 按各性状的育种学重要性和经济学重要性制订加权值,对个体不同性状的进行加权,得到综合育种值,作为选种的依据综合选择指数是对综合育种值的一种估计!第
9、十七页,共22页。 常用的简化选择指数公式: 为第i个性状的经济加权值; 为第i个性状的遗传加权值(遗传率); 为第i个性状的个体表型值; 为第i个性状的群体均值; 为简化选择指数。 iW2ihiPiPI简化的综合选择指数制订第十八页,共22页。 为了选种上的方便,把各性状都处于畜群平均数的个体指数值订为100 这时指数公式需作进一步变换: 怎样才能满足这一条件?制订方法:这里: 令:第十九页,共22页。 根据各性状的经济加权值和性状遗传力计算出各性状的加权系数ai 制订出选种指数公式: 将各个体各性状的表型值、各性状的群体均值代入,计算出各个体的选种指数 根据选种指数高低进行留种制订步骤:第二十页,共22页。制订选择指数的注意事项 1、突出主要经济性状:24个为宜 2、所选性状容易度量 3、尽可能是早期性状:早期选种 4、对“向下”选择的性状,加权值为负 5、负相关的性状尽可能合并为一个性状第二十一页,共22页。作业二
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