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文档简介
1、2012-10-10DMEM/F12培养基配制gibco D-MEM/F-12干粉培养基,每包装配1L。直接溶于1L纯净水中,加2.438g碳酸氢钠,搅拌2小时,pH试纸检测中性。0.22m滤器过滤180ml培养基入250ml血清瓶。5瓶180ml,1瓶不到180ml。其中1瓶180ml培养基加入FBS 20ml。2012-10-11CHO-S细胞复苏:41迅速溶解1min;2ml细胞液+6ml DMEM/F12 10%FBS加入离心管,轻柔吹散。离心1000rpm 5min;弃上清;加入3ml DMEM/F12 10%FBS,轻柔吹散,加入75ml细胞方瓶,补3ml DMEM/F12 10%
2、FBS;轻柔混匀,镜下观察,细胞密度85%-90%,细胞呈圆形悬浮;37 CO2培养;2012-10-12细胞观察:贴壁,90%密度;95%呈圆形,少量有梭型倾向,密度过高,决定传代;细胞传代:13:00弃上清;加入胰酶,2滴管(37回温);室温显微镜下观察,有微量脱落,1min;倒出胰酶,加入5ml DMEM/F12 10%FBS,9区吹扫程序3次;1传2,补2.5ml DMEM/F12 10%FBS;原瓶中还有未脱落细胞,又加入5ml DMEM/F12 10%FBS继续培养,胶布标记。2012-10-13观察细胞状态:贴壁,有少量呈梭型,大部分为原型,但并不圆润。2012-10-15观察细
3、胞:大部分为梭型,少量为原型,约80%,培养基开始变浅。细胞传代:两瓶量多的1传2;2012-10-16观察细胞:传代时分散不好的细胞过夜培养后镜下观察,成团状生长,有展开细胞。换培养液:13:00未脱落细胞换液,生长良好。配PBS:NaCL 1.6g, KCL 0.04g, KH2PO4 0.04g, Na2HPO4.12H2O 0.726g, H2O 200ml, 高压灭菌。2012-10-17胰酶消化分散传代:PBS清洗2遍;胰酶侵润,立即倾倒或保持;显微镜下观察1min;加入5ml培养基;吹扫分散,1传2;2012-10-18细胞观察:尹骏传代的4瓶有2瓶没贴壁,我怀疑是第一次做的时候
4、胰酶消化的时间过长,损伤了细胞壁;(需要严格控制消化时间,尤其注意,胰酶在倒出后,应立即加入终止培养基。)我传代的6瓶贴壁生长正常,但还是有团块生长;(这种团块生长可能是第一次传代为吹匀所致,并不是第二次传代可以吹散的,计划降低接种比例,延长生长时间,逐步减少团块数量。)2012-10-19配制胰酶:life science进口分装胰酶;0.25%,100mlPBS溶解;0.22m过滤;冻存液配制:5%DMSO,250LDMSO,4750L含血清培养基。细胞冻存:选密度较高,展开细胞较多,团块较少的4瓶细胞消化冻存;倒掉培养基;2ml胰酶,室温60秒静置;倒掉胰酶;加入5ml培养基,9区吹扫,
5、液面下吹打80次;1000rpm离心5min;倒掉上清;加入冻存液;立即放入4,1h;-20,3h;液氮口过夜;装入液氮存储核;6B416B426B346B22其中有一只冻存管细胞较少,已标明。细胞传代:一瓶1传2;一瓶1:4传代。(新配的胰酶很好用,细胞容易打散)2012-10-20尹骏传代的两瓶贴壁不好的细胞今日换液,去除死细胞2012-10-21细胞观察:1:4传代的一瓶(原瓶)培养基变黄,细胞贴壁展开非常好,比其他几瓶都好,未见染菌。推测细胞展开良好,没有接触抑制,代谢旺盛,生长迅速。建议立即换液。细胞换液:1:4传代的一瓶(原瓶)2012-10-22细胞观察:前日培养基颜色变化很大的
6、一瓶细胞,换液过夜后颜色变化依然很大,并且细胞形态由展开向收缩发展,决定放弃。细胞传代:取三瓶细胞形态较好的1:4传代;共传6瓶,计划4瓶冻存,2瓶用于DNA提取;使用吸管吹散,细胞分离不完全,见2-8个聚集。培养基配制:从马格非分装血清中分出80ml,其中20ml加入180ml培养基中待用,60ml储存。细胞复苏:尹骏复苏了2012-10-19冻存的细胞一只。2012-10-24细胞观察:22日1:4传代细胞有聚集有展开,不是最佳状态,可能不适于冻存,原因可能是上次用吸管吹的力度比较小,为完全吹散;按照罗成的建议可以适当这延长消化时间,尽量减少吹打的损伤;胰酶消化和枪吹散哪种更损伤细胞?20
7、12-10-25细胞冻存:冻存4只细胞(有一只打破了还剩3只)冻存液配制:10%DMSO,400LDMSO,3600L含血清(10%)培养基。细胞冻存:倒掉培养基;PBS漂洗2遍;2ml胰酶,室温70秒静置;倒掉胰酶;加入5ml培养基,9区吹扫,液面下吹打80次;1000rpm离心5min,弃上清;加入1ml冻存液,迅速混匀;41h,-202h,液氮口过夜(绳子太长了接触到液氮了),放入液氮存储盒里,6B34/6B22/6C23。胰酶消化一瓶细胞,离心收集,用于全DNA提取。2012-10-25CHO-S全DNA提取:2012-10-26细胞传代:3ml吹扫,0.3:4.7接种;1ml枪弹簧很
8、松,吹打了110下,细胞基本分散;传代4瓶。2012-10-27细胞复苏:19:002012-10-25冻存细胞(10%DMSO);离心管加入4ml培养基;细胞瓶加入2ml培养基:取出冻存细胞,42水浴,快速震荡,至融化。加入到含4ml培养基离心管;离心1000rpm,1min;弃上清;加入5ml培养基,短暂吹打,重悬;加入含2ml培养基细胞瓶,7ml过夜培养(加大对DMSO的稀释比例)。2012-10-28细胞观察:9:0027日复苏细胞有30%贴壁,呈圆形,未展开,分布均匀;26日传代细胞贴壁,50%展开,有少量悬浮,计划29日换液。细胞换液:对27日复苏细胞进行换液,为进一步降低DMSO
9、影响。2012-10-28引物稀释:8Lout加H2O 521l稀释为10M,分装3管10l;8Rout加H2O 636l稀释为10M,分装3管10l。2012-10-2926日传代细胞观察:26日传代细胞状态良好,展开率高。27日复苏细胞观察:27日复苏细胞基本没有分裂,形态介于展开间,形态异常2012-10-29Prime STAR PCR:buffer 10ldNTP Mix 4lCHO-S DNA(10/25) 1l8Lout 1l 8Rout 1l Prime STAR 1l H2O 32l1:95 5min2-30:94 30s 52 30s 72 30s31:72 5min 20
10、12-10-3026日传代细胞冻存:3只5B52/6B22/6C23传代4瓶:0.5:4.52012-10-302012-10-3130日传代细胞观察:有一瓶明显展开率偏低,还观察到一个异常的大细胞,内部有几个膨胀囊泡,用白胶布做标记。27日复苏细胞观察:随生长缓慢,但以开始展开,未见悬浮死亡。2012-10-31电泳:在500左右位置可见一相对高亮条带,但比较模糊,无法提取。见弥散性杂带,提高退火温度可以缓解。可条带貌似比500小,理论应该比500大。2012-11-130日冻存细胞复苏:30日传代细胞观察:异常的那瓶细胞出现死亡现象,漂浮细胞明显增多;计划下午三点对其余三瓶细胞换液。27日
11、复苏细胞观察:细胞形态趋于正常。2012-11-12012-11-22012-11-22012-11-330日传代细胞再传代:8瓶,1传4比例,用于冻存,建立野生型细胞库。2012-11-3CHO-DNA提取:1瓶细胞提2管,双倍的GB,70共40分钟,少量不溶胶状物用枪挑出,电泳可见条带。Prime STAR PCR:buffer 10ldNTP Mix 4lCHO-S DNA(11/3) 1l8Lout 1l 8Rout 1l Prime STAR 1l H2O 32l1:95 5min2-30:94 30s 58 30s 72 30s31:72 5min 10/31的PCR显示特异性和效
12、率不高,退火温度为52,本次11/4提高了退火温度到58,为见PCR条带,怀疑退火温度提高太大,引物Tm值为61到63,理论退火温度56。为了兼顾效率和特异性计划使用touchdown PCR。2012-11-4touchdown PCR1: 95 30s2-14: 94 30s 58-52 30s 72 30s14-32: 94 30s 52 30s 72 30s33: 72 5minPrime STAR PCR:buffer 10ldNTP Mix 4lCHO-S DNA 1l8Lout 1l 8Rout 1l Prime STAR 1l H2O 32l电泳未显示条带,发现有人将第二次基因
13、组提取时用的乙醇换成了TIRS,正是第二次提取的DNA两次PCR都没有条带。2012-11-510/30冻存11/1复苏转瓶:消化,分散,全转新瓶。2012-11-5用第一次提取的DNA进行PCR,Prime STAR和Taq两组,touchdown PCR条件。Prime STAR PCR:buffer 10ldNTP Mix 4lCHO-S DNA 1l8Lout 1l 8Rout 1l Prime STAR 1l H2O 32lTaq PCR:Buffer 5l MgCl2 5ldNTP 8l8Lout 1l 8Rout 1l CHO-S DNA 1lTaq 1lH2O 28l 1: 9
14、5 30s2-14: 94 30s 58-52 30s 72 30s14-32: 94 30s 52 30s 72 30s33: 72 5min目的条带亮度很低,与普通PCR条件相比目的条带附近杂带较少,而大分子量杂带较多。按照位置推算正确。做基因提取应该可以。考虑染色体结构庞大复杂,建议延长变性时间。条带回收:第二轮Prime STAR PCR:1:95 5min2-30:94 30s 52 30s 72 30s31:72 5min 2012-11-611/3传代细胞冻存:7只,有一瓶培养基变黄,与其他7瓶颜色明显不同,未见染菌,放弃;使用HYCLONE南美血清配制培养基,用于分散离心,用原
15、培养基配5%DMSO冻存;由于处理量比较大,先消化分散,加入离心管,带都操作完统一离心,后发现在离心管中停留的时间太长,细胞重新贴壁,离心后堆积较少,仔细观察壁上细胞较多,加入DMSO培养基重悬,不敢过长时间吹打,冻存细胞密度可能偏低。3C54 11/6, 5B52 11/6, 6B41 11/6, 6B42 11/6, 6B33 11/6, 6B34 11/6, 6C22 11/6 10/30冻存11/1复苏11/5全转新瓶细胞生长良好。2012-11-6回收:Taq PCR:Buffer 5l MgCl2 5ldNTP 8l8Lout 1l 8Rout 1l FUT81lTaq 1lH2O
16、 28l 1:95 5min2-30:94 30s 52 30s 72 30s31:72 5min 2012-11-7电泳:未成功2012-11-82012-11-92012-11-102012-11-112012-11-122012-11-13Taq PCR:Buffer 5l MgCl2 5ldNTP 8l8Lout 1l 8Rout 1l FUT81lTaq 1lH2O 28l 1:95 5min2-30:94 30s 52 30s 72 30s31:72 5min2012-11-13DH5甘油菌200l接种Amp LB 20ml 过夜37;2012-11-14电泳:切胶分离:回收:发现
17、比预期小的位置还有一条带,看强度应该是扩增所得,prime STAR扩增未见,第一次Taq扩增也未见,也可能是第一次电泳条带太浅,怀疑是非特异性扩增。两条带都回收,计划都进行测序。2012-11-14DH5保甘油菌;制作平板AMP 4块(其中1块不含抗性,3块含AMP);每块20ml 4块80ml LBTryptone 0.8gYeast expract 0.4gNaCl 0.8g琼脂 1.6gDH5平板划线,过夜37。2012-11-15pMD18-T载体连接:Solution I 5lpMD18-T 1lFUT8-A 4l16过夜连接2012-11-15从平板上挑DH5单菌落接入20ml
18、LB,37过夜培养。2012-11-16(五)2012-11-16(五)取200l接入20ml LB,371.5-3h培养。4离心 6000rpm 5min。弃上清。600l预冷0.1M CaCl2重悬。冰浴30min。4离心 6000rpm 5min。弃上清。100l预冷0.1M CaCl2重悬。2012-11-17(六)转化:8T5/8T3 10l感受太细胞 100l冰浴 30min42 90s冰浴 2minLB 500l37 1h涂平板:过夜培养。2012-11-18单克隆摇菌管:过夜培养;2012-11-19甘油菌:8T5A/B/C,8T3A测序:结果异常2012-11-202012-
19、11-212012-11-222012-11-232012-11-242012-11-252012-11-262012-11-27新设计的引物:8LoutB,8RoutB;引物稀释:8LoutB:nmoles 25.3 0.253ml H2O 100M10l 90l H2O 10M20l 分装8RoutB:nmoles 18.6 0.186ml H2O 100M10l 90l H2O 10M20l 分装Prime STAR PCR:buffer 10ldNTP Mix 4lCHO-S DNA 1l8Lout 1l 8Rout 1l Prime STAR 1l H2O 321:95 5min2-
20、30:94 45s 53 30s 72 30s31:72 5min 电泳:2012-11-28处理细胞培养用品:2012-11-29(四)处理细胞培养用品:高压,烘干。配PBS:PBS配制:200mlNaCl 1.6gKCl 0.04gKH2PO4 0.04gNa2HPO4.12H2O 0.726gorNa2HPO4 0.58g高压灭菌。2012-12-3(一)过夜贴壁换液:hyclonen南美FBS观察(复苏后12h):感觉培养基变色较快,但未见染菌现象;部分细胞贴壁,但倒出液体后,发现一些细胞又被倒出,可能贴壁不牢固;有待后续观察。2012-12-4(二)2012-12-5(三)换液:hy
21、clonen南美FBS观察(复苏后60h):培养基颜色未见更显著变化;贴壁细胞已分裂,形成群落,约<10个细胞,细胞形态未全部展开。2012-12-6(四)100mg/ml G418配制:1g G418加10ml PBS(直接溶在原瓶中),过滤分装1.5ml EP管,-20保存。细胞观察:消化换瓶:冷胰酶消化70秒,1 ml 移液器吹扫100下。2012-12-8(六)细胞换液:1700-1800一多半细胞形态正常一些圆形未展开的细胞上有小突触还有散在的S行管状那个S型的东西我前些天看看到过 但只找到一个 还以为是什么杂质 但今天明显增多了2012-12-9(日)细胞观察:培养基变色较快,漂浮单细胞增多,为展开贴壁细胞比以前同期多,展开细胞形态正常贴补层状态良好,未见大面积脱落及成团漂浮初步排除大面积染菌的可能。乐观的解释是,在最近的24小时中,细胞进入对数增长期,培养基养分过快消耗,造成一些细胞脱落和培养基变色。如果传代后恢复正常状态,就能支持这种解释。下一步计划,传代1:4、铺板、保存原瓶细胞次日用于提取DNA。消化细胞:1:4传代铺板:0.30.4
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