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文档简介
1、MIC编程(1)MIC是什么?美国SC12大会上,英特尔正式发布了至强融核Xeon Phi,采用MIC(Intel Many Integerated Core)架构,用于高性能并行计算。MIC基于X86架构,支持多种并行模型,OpenMP、pThread、OpenCL、MPI等并行编程语言,采用C、C+和Fortran三种语言进行软件移植开发,特点以编程简单(引语方式)著称,工具链丰富。MIC基于X86架构,是众核协处理器,MIC为Xeon Phi产品的架构总称,Xeon Phi的第一代产品的架构代号为“Knights Corner”。Knights Corner采用Intel 2012开始使
2、用的3D“三门”晶体管技术,使用22nm工艺制造,MIC卡含有50个以上的核,每个核可以支持4个线程,双精性能超过1TFlops,含有512bit的向量宽度,支持8个双通道GDDR内存控制器,内存大小为6GB或8GB。MIC卡图解MIC卡通过PCI-E连接到主板上,通过一个8PIN和一个6PIN电源线供电,功耗在225-300W。MIC编程(2)MIC主要参数MIC 卡上每个核可以执行不同的指令,每个核最多支持4个硬件线程,用来隐藏存储访问延迟。MIC卡与主机端通过PCI-E连接,支持PCI-E x8或x16线宽配置。每个MIC卡可以设置独立的IP,可以把每个MIC卡当作独立的节点。MIC卡拥
3、有512bit的向量位宽,可以同时处理16个32-bit浮点/整形元素或8个64-bit浮点/整形元素的计算。MIC卡包含32KB L1指令cache和32KB L1数据cache,同时,每个核拥有全局可见的L2 cache,大小为512KB。MIC的另一个重要的特点是卡上有一个微操作系统(uos),uos使得MIC卡具有下面的两个功能:1) MIC卡可以完整的之行程序,而不需要CPU发起主函数,即只需要把程序传递到MIC卡上,uos可以使程序完整运行。2)
4、0; MIC卡包括众多的核,程序运行时可能有些核没有被用到,这时uos就可以通过关闭空闲的核减少功耗。MIC编程(3)MIC峰值性能计算方法SE10P:1. 单精度峰值性能: 32 SP FLOPs/clock/core * 61 cores * 1.1GHz =2147.2 GFLOP/s2. 双精度峰值性能: 16 DPFLOPs/clock/core * 61 cores * 1.1GHz = 1073.6 GFLOP/s3. 内存带宽: 4 Bytes/channel * 16 mem. channels * 5.5G
5、T/s= 352GB/s5110P:1. 单精度峰值性能: 32 SP FLOPs/clock/core * 60 cores * 1.053GHz =2021.76 GFLOP/s2. 双精度峰值性能: 16 DPFLOPs/clock/core * 60 cores * 1.053GHz = 1010.88 GFLOP/s3. 内存带宽: 4 Bytes/channel * 16 mem. channels * 5.0GT/s= 352GB/s注:32SP FLOPs/clock/core =512/32*2,是指512bits向量化和FMA指
6、令,双精度类似。MIC编程(4)MIC灵活高效的编程方式MIC是基于X86架构的众核处理器,CPU多核上的并行编程模型在MIC上都支持,同时MIC卡上运行一个uos,因此,MIC与CPU多核之间的编程很灵活,既可以CPU端启动主函数,也可以MIC端启动主函数,甚至可以CPU和MIC端同时各自发起主函数。CPU多核和MIC协同编程模式如下图所示,CPU多核和MIC协同计算有以下几种模式:1) Multi-Core Hosted:程序并行度较低,只在CPU多核上运行;2)
7、; Offload:加载模式,CPU端发起主函数,通过offload模式调用kernel到MIC上执行(类似于GPU的kernel执行模型);3) Symmetric:对等模式,即CPU多核和MIC各自发起主函数,采用-mmic编译选项区别MIC端可执行程序和CPU端可执行程序;4) Reverse Offload:逆转加载模式,与offload模式相反,由MIC端发起主函数;5)
8、60; Many-Core Hosted:native模式,利用-mmic编译选项编译成MIC端可执行程序,程序只在MIC上执行。MIC编程(5 )MIC驱动MPSS安装1 MIC对硬件的要求1) 主板目前,并不是所有的主板都支持MIC环境,有些主板升级BOIS后可以支持MIC环境。MIC需要在主板BOIS中启用大型基本地址寄存器 (BAR) 支持,MMIO大于4GB的寻址。默认情况下,大多数平台BIOS实施将其设为禁用,因此必须在平台 BIO
9、S 设置中将其手动启用。有些系统默认的散热速度并未设置成全速,当使用被动散热的MIC卡时,需要改动系统的散热速度,设置其为全速散热才能保证MIC卡的正常运行。MIC需要安装在专业的服务器上运行,还没有看到PC机器上成功安装的情况。2) 电源目前,MIC卡的功率为225W或300W,因此,系统中配置的电源需要足够才可。3) PCI-E接口MIC卡需要通过PCI-E 2.0 x16以上的接口与主板连接。2 目前M
10、IC开发环境支持的操作系统对应Red Hat同一版本的CentOS也支持windows版本也已提供支持:Microsoft* Windows 7 Enterprise SP1 (64-bit), Windows 8 Enterprise (64-bit), Windows Server 2008 R2 SP1 (64-bit) Windows Server 2012 (64-bit)3 目前支持MIC开发的软件环境Intel编译器对MIC提供了完全的支持,同时针对IntelMIC架构进行了特定的优化,使用Intel编译器可以获得较好的性能。开源编译器gcc支持native模式的开发。目前支持M
11、IC的第三方工具包括编译器,各种编程规范,常用的应用库等,具体可参见:4 MIC开发环境下载地址请根据操作系统选择合适的开发环境下载,下面的网站也提供了MIC环境安装步骤。可以购买或者下载试用版本的Intel开发工具5 MPSS安装步骤(linux)1) 在安装英特尔(R) MPSS 软件之前禁用 SELinux,以避免 SELinux 覆盖标准 Linux*权限设置。2) 检查先前已安装版本的英特尔(R) MPSS 程序包。 如果存在,则停止服务并卸载程序包。
12、 user_prompt> sudo rpm -qa | grep intel-mic user_prompt> sudo service mpss stop 3) 卸载先前版本的英特尔(R) MPSS 驱动程序(如果存在)。 Red Hat* Enterprise Linux* user_prompt> sudo yum remove -noplu
13、gins -disablerepo=* intel-mic* SUSE* Linux* Enterprise Server user_prompt> sudo zypper remove intel-mic* 4) 解压缩并安装英特尔(R) MPSS 程序包(以mpss_gold_update_3-2.1.6720-13-rhel-6.0为例) user_pro
14、mpt> tar xvf mpss_gold_update_3-2.1.6720-13-rhel-6.0.tar user_prompt> cd mpss_gold_update_3 Red Hat* Enterprise Linux* user_prompt> sudo yum install -nogpgcheck -nop
15、lugins -disablerepo=* *.rpm SUSE* Linux* Enterprise Server user_prompt> sudo zypper -no-gpg-checks install *.rpm5) 英特尔(R) 至强融核(TM) 协处理器 SMC Bootloader 更新(1) 将协处理器设为“就绪”状态
16、60; user_prompt> sudo micctrl -r user_prompt> sudo micctrl -w user_prompt> mic0: ready(2) 仅对英特尔(R) 至强融核(TM) 硬件已安装的 B0 或 B1 卡更新 SMC &
17、#160;固件,如果系统为C0卡,不需要刷flash。user_prompt>sudo /opt/intel/mic/bin/micflash -Update /opt/intel/mic/flash/<EXT_HP2_SMC_Bootloader_version> -device all其中,<EXT_HP2_SMC_Bootloader_version> 代表一个再此发行版中名为EXT_HP2_SMC_Bootloader_1_8_4326.css_ab 的 SMC 固件文件。6) 启动英特尔
18、(R) MPSS 服务 若是新安装,使用 user_prompt> sudo micctrl -initdefaults 若要保留现有配置,使用 user_prompt> sudo micctrl -resetdefaults&
19、#160; 启动mpss服务 user_prompt> sudo service mpss start 配置英特尔(R) MPSS 服务在主机 OS 启动时启动 user_prompt> sudo
20、160;chkconfig mpss on 禁止英特尔(R) MPSS 服务在主机 OS 启动时启动 user_prompt> sudo chkconfig mpss off6 MIC安装中遇到的问题1) MIC卡插到主板上,但6PIN和8
21、PIN接口没有接入电源,导致系统找不到MIC卡。2) MIC 驱动(MPSS)版本和操作系统版本不一致,导致运行MIC程序时提示找不到MIC设备。3) MIC运行作业时会因为温度过高导致MIC停止工作。当MIC温度过高停止工作时,需要系统断电后重启机器才可以恢复MIC正常工作,若不断电,系统重启后MIC仍不能使用。导致该问题的是散热方案,有些系统默认的散热速度并未设置成全速,当使用被动散热的MIC卡时,需要改
22、动系统的散热速度,设置其为全速散热才能保证MIC卡的正常运行。MIC编程(6 )MIC对等模式配置方法基于InfiniBand网络的对等模式还没有配置成功过,下面以以太网的配置方法为例说明其过程。首先安装MIC驱动-MPSS包,详细安装过程见“MIC编程(5 )MIC驱动MPSS安装”通过service mpss status命令查看mpss的运行状态,若返回mpss is running,则先关闭mpss服务:service mpss stop下面以host端IP为:192.168.1.100,MIC0:192.168.1.101,MIC1:192.168.1.102为例新建 /etc/sy
23、sconfig/network-scripts/ifcfg-br0,内容:DEVICE=br0TYPE=BridgeONBOOT=yesDELAY=0NM_CONTROLLED="no"MTU=9000BOOTPROTO=staticNOZEROCONF=yesIPADDR=192.168.1.100NETMASK=255.255.0.0修改/etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0为:DEVICE=eth0ONBOOT=yesBRIDGE=br0MTU=9000micctrl -addbridge=br0 -type=Externa
24、l -ip=192.168.1.100 mic0 mic1micctrl -network=static -bridge=br0 -ip=192.168.1.101:192.168.1.102 mic0 mic1echo "MTU=9000" >> /opt/intel/mic/filesystem/mic0/etc/sysconfig/network/ifcfg-mic0echo "MTU=9000" >> /opt/intel/mic/filesystem/mic1/etc/sysconfig/network/ifcfg-mi
25、c0service network restartservice mpss start多节点可以采用类似的配置方法,配置成功后,不同节点主机与主机,主机与MIC,MIC与MIC可以互相访问。MIC编程(7 )offload语法MIC编程中最基本的语法就是offload语句,offload语句的作用为将程序和数据由CPU端传递到MIC端,并在MIC上执行,offload语法为:C/C+: #pragma offload target(mic: id) in(.) out(.)Fortran: !dec$ OFFLOAD target(mic: id) i
26、n(.) out(.)或:!DIR$ OFFLOAD BEGIN target(mic: id) in(.) out(.).!DIR$ END OFFLOAD target指定在哪块卡上运行,id代表设备编号,如果id等于-1,系统将自动选择一块计算设备(现在来说只有MIC卡),如果没有符合要求的设备(如只有CPU),程序将退出并报错;如果id大于等于0,程序将offload到相应的id号mic上。target(mic)不指定运行在哪块MIC卡上,这时程序会轮回的执行在不同的MIC卡上,如系统有两块MIC卡,第1次offload到mic0上执行,第2次offlo
27、ad到mic1上执行,第3次offload到mic0上执行,第4次offload到mic1上执行,.in() out()代表数据传递方向,in为数据从CPU内存传递到MIC内存上,out为数据从MIC内存上回传到CPU内存中。具体语法后面再详细介绍。下面以向量加为例说明:1. #include <stdio.h>2. #include <stdlib.h>3. #include <omp.h>4.5. #define N 2000006.7. _attribute_(target(mic)8. void VecAdd_mic(float* A,
28、float* B, float* C, int size)9. 10. #pragma omp parallel for11. for(int i=0;i<size;i+)12. Ci = Ai + Bi;13. 14.15. int main( int argc, char* argv)16. 17. int i;18. int size = N * si
29、zeof(float);19.20. float *A,*B,*C;21. A = (float*)malloc(size);22. B = (float*)malloc(size);23. C = (float*)malloc(size);24.25. srand(2013);26. for(i=0;i<N;i+)27. 28. Ai=rand()%10;29. Bi=rand()%10;30. 31.32. #pragma offload tar
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