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1、一章微生物的分类一章微生物的分类界、门、纲、目、科、属、种界、门、纲、目、科、属、种 种是最基本的分类单位种是最基本的分类单位 每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科.一、通用分类单元一、通用分类单元以以啤酒酵母啤酒酵母为例,它在分类学上的地位是:为例,它在分类学上的地位是: 界界(Kindom):真菌界:真菌界 门门(Phyllum):真菌门:真菌门 纲纲(Class):子囊菌纲:子囊菌纲 目目(Order):内孢霉目:内孢霉目 科科(Family):内孢霉科:内孢霉科 属属(Genus):酵母属:酵母属 种种(Species):啤酒酵母:啤酒酵
2、母1 种(种(species):是一个基本分类单位;是一大群是一个基本分类单位;是一大群表型表型特征特征高度相似、亲缘关系极其接近,与同属内其他种有明显差别高度相似、亲缘关系极其接近,与同属内其他种有明显差别的菌株的总称。如典型菌株、模式种。的菌株的总称。如典型菌株、模式种。2 菌株(菌株(strain): 表示任何由表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一切后代(起源于共同祖先并保持祖先特成的纯种群体及其一切后代(起源于共同祖先并保持祖先特性的一组纯种后代菌群)。因此,一种微生物的不同来源的性的一组纯种后代菌群)。因此,一种微生物的不同来源的纯培养物均
3、可称为该菌种的一个菌株。菌株强调的是遗传型纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。菌株强调的是遗传型纯的谱系。纯的谱系。 例如:大肠埃希菌的两个菌株例如:大肠埃希菌的两个菌株 Escherichia coli B 和和Escherichia coli K123 亚种亚种(subspecies):): 当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传特征或遗传形状,而又不足以区分成新种时,可以将这些菌株细分成两个或更形状,而又不足以区分成新种时,可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元多的小的分类单元亚种。亚种。 变种是亚种的同义词,因变种是亚
4、种的同义词,因“变种变种”一词易引起词义上的混淆,从一词易引起词义上的混淆,从1976年后,不再使用变种一词。通常把实验室中所获得的变异型菌年后,不再使用变种一词。通常把实验室中所获得的变异型菌株,称之为变种。如:株,称之为变种。如:E.coli k12(野生型)是不需要特殊(野生型)是不需要特殊aa的,而的,而实验室变异后,可从实验室变异后,可从k12获得某获得某aa的缺陷型,此即称为的缺陷型,此即称为E.coli k12的的变种。变种。4 型型(form): 常指亚种以下的细分。当同种或同亚种内不同菌株之间的性状差常指亚种以下的细分。当同种或同亚种内不同菌株之间的性状差异不足以分为新的亚种
5、时,可以细分为不同的型。异不足以分为新的亚种时,可以细分为不同的型。 例如:按抗原特征的差异分为不同的血清型。例如:按抗原特征的差异分为不同的血清型。 (一)生物的界级分类学说(一)生物的界级分类学说 动物界 植物界 林奈动物界 植物界 原生生 物界 Haeckel植物界 动物界 原始生 物界 菌界 Copeland植物界 动物界 原核生物界 原生生物界 真菌界 Whittaker五界上 加上病 毒界 细菌域 古生菌域 真核生物域 美国 Woese二、微生物在自然界的地位二、微生物在自然界的地位病毒界病毒界动物界动物界植物界植物界真菌界真菌界原核生物界原核生物界原生生物界原生生物界微藻类微藻类
6、原生动物原生动物 细菌细菌古细菌古细菌放线菌放线菌衣原体衣原体支原体支原体立克次氏体立克次氏体螺旋体螺旋体蓝细菌蓝细菌病毒病毒亚病毒亚病毒朊病毒朊病毒生物的界级分类学说:是在认识发展过程中存在的对生物的界级分类学说:是在认识发展过程中存在的对生物分类的不同阶段的不同观点。如:二界系统、三生物分类的不同阶段的不同观点。如:二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、六界系统和三原界系界系统、四界系统、五界系统、六界系统和三原界系统统 三原界系统是三原界系统是1978年由年由R.H.Whittaker和和L.Margulis提出的。提出的。 所有生物存在一个共同祖先,由它分三条进所有生物存在一个共同祖
7、先,由它分三条进化路线,就形成了三个原界:古细菌原界化路线,就形成了三个原界:古细菌原界(Archaebacter)、真细菌原界、真核生物)、真细菌原界、真核生物原界原界 提出了内共生学说,主要是提出了内共生学说,主要是Margulis的贡献的贡献三原界系统示意图三原界系统示意图 三、各大类微生物的分类系统纲要原核生物分类系统纲要原核生物分类系统纲要伯杰氏系统细菌伯杰氏系统细菌学手册学手册真菌界分类系统很多,各国采用不同的系统,真菌界分类系统很多,各国采用不同的系统,比较混乱。近年来为较多人接受的是比较混乱。近年来为较多人接受的是Ainsworth的的纲要。纲要。伯杰氏手册简介 美国的伯杰氏鉴
8、定细菌学手册编写者集国际学术界的权威学 者,为各国微生物分类学界公认的一本经典佳作。 第一版1923年出版,后一直再版至今,先后修订出版了11个版本 ,1974年出版了第八版,1994年已出至第九版,由于G+Cmol%测 定、核酸杂交和16SrRNA寡核苷酸序列测定等新技术和新指标的 引入,使原核生物分类从以往以表型、实用性鉴定指标为主的旧 体系向鉴定遗传型的系统进化分类新体系逐渐转变,现书名已改 为伯杰氏系统细菌学手册,(Bergey Mamual of Systematic Bacteriology),简称系统手册 20世纪初德国Lehmann和Neumann的细菌分类图说 前苏联克拉西尔尼可夫的细菌与放线菌的鉴定 法国A.R.Prevot的细菌分类学生物学特性生物学特性原核生物原核生物真核生物真核生物细胞结构细胞结构细胞核细胞核无核膜、核仁,单个染色体,无组蛋白有核膜、核仁,多条染色体,DNA与组蛋白结合细胞壁细胞壁大多数含肽聚糖无肽聚糖细胞膜细胞膜一般无甾醇常含甾醇内膜内膜简单,有中介体复杂,有内质网核糖体核糖体70S (50S+30S)80S (胞浆),70S (线粒体)线粒体线粒体无有其他细胞器其他细胞器无多种鞭毛结构鞭毛结构简单复杂(“9+
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