[医药卫生]诊断试验数据挖掘及其临床应用ppt课件

1、泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 诊断实验诊断实验数据发掘及其临床运用数据发掘及其临床运用(Data Mine &Clinical Application of Diagnosis Test)泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授大中型医院临床运用研讨的广泛课题大中型医院临床运用研讨的广泛课题泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 诊断与鉴别诊断？3？ CA72

2、-4、CEA、CA199、胃镜、钡餐等等对胃癌的诊断效率如何？真实性、可靠性、适用性？4？ 胃癌的诊断、鉴别、筛查究竟应该恳求哪些检查？循证医学实际？泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 主题词主题词诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 荟萃分析荟萃分析meta analysis 3 数据发掘数据发掘Data Mine4 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话： 138

3、08281350e-mail: 诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 诊断实验含义是广泛诊断实验含义是广泛的，它包括各种化验室检的，它包括各种化验室检查，讯问病史，体检所获查，讯问病史，体检所获得的资料以及各种影像诊得的资料以及各种影像诊断和仪器诊断等。断和仪器诊断等。 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 诊断实验主要运用于疾病诊断、疾病随访、诊断实

4、验主要运用于疾病诊断、疾病随访、疗效考核以及药物毒副作用的监测。根据不同的疗效考核以及药物毒副作用的监测。根据不同的目的选择适当的诊断实验。普通说来，临床医师目的选择适当的诊断实验。普通说来，临床医师经过一定期限的临床实际以后，都积累了选择诊经过一定期限的临床实际以后，都积累了选择诊断实验的阅历。但单凭阅历难免不够稳妥，有时断实验的阅历。但单凭阅历难免不够稳妥，有时可以耽搁诊断，未能给患者及时有效的治疗，甚可以耽搁诊断，未能给患者及时有效的治疗，甚至呵斥不可弥补的损失。掌握科学的研讨和评价至呵斥不可弥补的损失。掌握科学的研讨和评价诊断实验的方法可为其选择合理的诊断方法奠定诊断实验的方法可为其选

5、择合理的诊断方法奠定根底，同时可防止单凭阅历呵斥的错误。根底，同时可防止单凭阅历呵斥的错误。 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 普通说来，临床医师须在较长时间内多次运用某项普通说来，临床医师须在较长时间内多次运用某项诊断方法，而且在患同种疾病但不同类型的病例身上运诊断方法，而且在患同种疾病但不同类型的病例身上运用后方可对其性质和适用价值有较深化的了解。掌握科用后方可对其性质和适用价值有较深化的了解。掌握科学的研讨

6、方法就可缩短上述过程。从文献中人们不难看学的研讨方法就可缩短上述过程。从文献中人们不难看到，当推出一项新诊断实验时，研讨人员对该项实验倍到，当推出一项新诊断实验时，研讨人员对该项实验倍加称誉，但运用一段时间后，发现其诊断价值并不理想加称誉，但运用一段时间后，发现其诊断价值并不理想，因此只需不断地积累阅历，才干对它有较全面的认识，因此只需不断地积累阅历，才干对它有较全面的认识。如开场在临床上运用癌胚抗原时，人们以为它诊断结。如开场在临床上运用癌胚抗原时，人们以为它诊断结肠癌非常有价值，但后来发现这种抗原在其他癌症也会肠癌非常有价值，但后来发现这种抗原在其他癌症也会出现，甚至在近出现，甚至在近20

7、%20%未患癌症的吸烟者中也呈阳性。该当未患癌症的吸烟者中也呈阳性。该当说，开场在临床上运用时，研讨人员并非有意夸张其效说，开场在临床上运用时，研讨人员并非有意夸张其效率，而是在当时缺乏科学的研讨和评价方法。率，而是在当时缺乏科学的研讨和评价方法。 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 诊断实验临床效能：诊断实验临床效能：对一项诊断实验的评价主要从三个方面予以思索：对一项诊断实验的评价主要从三个方面予以思索：真实性真实性validity。可靠性可靠性(reliability)。适用性适用性pr

8、acticability。诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: u 诊断实验的真实性诊断实验的真实性: u 反映患病实践情况的程度称作真实性反映患病实践情况的程度称作真实性validity 。u 一项诊断实验的真实性包括灵敏度一项诊断实验的真实性包括灵敏度sensitivity, Sen和特异度和特异度specificity, Spe两方面两方面 。诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Te

9、st 1 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: u 诊断实验的真实性诊断实验的真实性:u 灵敏度和特异度的关系：灵敏度和特异度的关系：u 灵敏度和特异度是矛盾的一致体，如下图，灵敏度和特异度是矛盾的一致体，如下图，他们随着诊断分界点阈值的变化而变化他们随着诊断分界点阈值的变化而变化。诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail

10、: u 诊断实验的真实性评价方法诊断实验的真实性评价方法: 诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 诊断实验诊断实验金规范金规范病例病例非病例非病例合计合计阳性阳性a aTPTPb bFPFPTP+FPTP+FP阴性阴性c cFNFNd dTNTNFN+TNFN+TN合计合计TP+FNTP+FNFP+TNFP+TNN N泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 尤登指数尤登指数Youdens index又称正确指数，是又称正确指数，是指灵敏度和特异度之和减去指

11、灵敏度和特异度之和减去1，是综合评价真实，是综合评价真实性的目的。理想的实验应为性的目的。理想的实验应为1。其计算公式为：。其计算公式为： 尤登指数尤登指数 = ( Sen + Spe ) 1 准确度准确度 实验的准确度实验的准确度(accuracy，ACC) ，也称，也称效率效率efficiency，可用真阳性与真阴性人数，可用真阳性与真阴性人数之和占受试人数的百分率表示。理想的实验应为之和占受试人数的百分率表示。理想的实验应为100%。其计算公式为：。其计算公式为： ACC = (TP+TN)/N 100 诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 泸州医

12、学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 似然比似然比似然比似然比likelihood ratio，LR是指患病人群中实验结果是指患病人群中实验结果的概率与无病人群中实验结果概率之比的概率与无病人群中实验结果概率之比阳性似然比阳性似然比在诊断性实验中，真阳性率在诊断性实验中，真阳性率 (TPR)与假阳性率与假阳性率(FPR)的比值的比值即为阳性似然比即为阳性似然比(positive likelihood ratio, +LR)，可用，可用以描画诊断性实验阳性时，患病与不患病的时机比。假设以描画诊断性实验

13、阳性时，患病与不患病的时机比。假设该比值大于该比值大于1，那么随比值的增大，患病的概率也增大；，那么随比值的增大，患病的概率也增大；假设其比值小于假设其比值小于1，那么患病的概率较小。，那么患病的概率较小。 +LR=TPR/FPR阴性似然比阴性似然比在诊断性实验中，假阴性率在诊断性实验中，假阴性率(FNR)与真阴性率与真阴性率(TNR)的比值的比值即为阴性似然比即为阴性似然比(negative likelihood ratio, -LR) 。可。可用以描画诊断性实验阴性时，患病与不患病的时机比。其用以描画诊断性实验阴性时，患病与不患病的时机比。其比值愈大，那么患病的概率愈小，其比值愈小，那么患

14、病比值愈大，那么患病的概率愈小，其比值愈小，那么患病的概率愈大。的概率愈大。-LR=FNR/TNR诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 预测值预测值 预测值预测值predictive value，PV亦称预告值，它是亦称预告值，它是表示实验能做出正确判别的概率。表示实验能做出正确判别的概率。 阳性预测值是指真阳性人数占实验结果阳性人数的百分阳性预测值是指真阳性人数占实验结果阳性人数的百分比，表示实验结果阳性者属于真病

15、例的概率。比，表示实验结果阳性者属于真病例的概率。 阳性预测值计算公式：阳性预测值计算公式：P PV = TP / (TP+FP)100 阴性预测值是指真阴性人数占实验结果阴性人数的百分比阴性预测值是指真阴性人数占实验结果阴性人数的百分比，表示实验结果阴性者属于非病例的概率。，表示实验结果阴性者属于非病例的概率。 阴性预测值计算公式：阴性预测值计算公式：NPV = TN / (TN+FN)100 诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350

16、 e-mail: u 诊断实验的可靠性诊断实验的可靠性: u 可靠性可靠性reliability是指一项诊断实验在完全一样是指一项诊断实验在完全一样的条件下，反复作实验时获得一样结果的稳定程度。的条件下，反复作实验时获得一样结果的稳定程度。%100试验总次数的次数重复试验获得相同结果符合率诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 真实性与可靠性关系真实性与可靠性关系 ：A A实验：真实且可靠实验：真实且可靠 B B实验：

17、真实但不可靠实验：真实但不可靠C C实验：不真实但可靠实验：不真实但可靠 D D实验：不真实又不可靠实验：不真实又不可靠泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: u 诊断实验的适用性诊断实验的适用性: u 技术难度技术难度:人员要求、设备要求。人员要求、设备要求。u 可行性：标本采集和处置、储存要求、检测物可行性：标本采集和处置、储存要求、检测物的变化频度，实验前的预备要求，药物等易干的变化频度，实验前的预备要求，药物等易干扰程度。扰程度。u 实验环节和流程复杂程度，实验时间长短。能实验环节和流程

18、复杂程度，实验时间长短。能否流水作业还是成批实验，对照实验等。否流水作业还是成批实验，对照实验等。u 实现质控体系、自动化、规范化实现质控体系、自动化、规范化u 本钱和效益情况。本钱和效益情况。u 实验对象接受程度。实验对象接受程度。诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 主题词主题词诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 荟萃分

19、析荟萃分析meta analysis 3 数据发掘数据发掘Data Mine4 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: u诊断阈值诊断阈值CUT-OFFCUT-OFF: : 理想的诊断实验正常群体与病理想的诊断实验正常群体与病人群体分布曲线人群体分布曲线 实践的诊断实验正常群体与病实践的诊断实验正常群体与病人群体分布曲线人群体分布曲线 挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808

20、281350 e-mail: u诊断阈值诊断阈值CUT-OFFCUT-OFF: : 挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 ROC曲线的构建和意义ROC 是受试者任务特征Receiver Operating Characteristic 或相对任务特性曲线Relative Operating Characteristic 的缩写。对于大多数诊断来说，疾病的概率分布和正常分布是重叠的。任何分界值

21、或阈值都将导致一些具有疾病的病人错分为正常，或一些没有疾病的个体错分为病人，或两种情况都有。运用低的阈值降低假阴性结果的数量高灵敏度，但假阳性的数量添加低特异度；另一方面，添加阈值会添加假阴性低灵敏度，且降低假阳性的数量高特异度。这样，在灵敏度和特异度之间成互交的关系，一个高的灵敏度伴随着低特异度，而一个低的灵敏度伴有高特异度。泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: ROC曲线的构建：曲线的构建：例：铁蛋白例：铁蛋白(Ft)测定鉴别诊断恶性胸腹水研讨测定鉴别诊断恶性胸腹水研讨 首先以首先以n个诊

22、断界值建立个诊断界值建立n个四格表，计算个四格表，计算n个个Sen和和1-Spe。CUTCUTOFF(OFF(g/L)g/L)灵敏度灵敏度特异度特异度1-1-特异度特异度0 01. 0001. 0000. 0000. 0001. 0001. 00050501. 0001. 0000. 0000. 0001. 0001. 0001001001. 0001. 0000. 1440. 1440. 8560. 8562002001. 0001. 0000. 2500. 2500. 7500. 7503003000. 940. 940. 6380. 6380. 3620. 3624004000. 845

23、0. 8450. 8750. 8750. 1250. 1255005000. 7410. 7410. 9430. 9430. 0560. 0566006000. 5000. 5000. 9810. 9810. 0190. 0197007000. 3270. 3270. 9930. 9930. 0070. 0078008000. 1890. 1891. 0001. 0000. 0000. 0009009000. 0860. 0861. 0001. 0000. 0000. 000100010000. 0170. 0171. 0001. 0000. 0000. 000挪动阈值挪动阈值Floating

24、 CUT-OFF2 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 绘制绘制ROCROC曲线时，是以实验的曲线时，是以实验的灵敏度为纵坐标，以灵敏度为纵坐标，以1-1-特异度为特异度为横坐标，按照延续分组测定的数横坐标，按照延续分组测定的数据，分别计算灵敏度及据，分别计算灵敏度及1-1-特异度特异度表表4-44-4，将给出各点联成曲，将给出各点联成曲线，即为线，即为ROCROC曲线图曲线图4-54-5，距，距左上角最近的一点，即为诊断分左上角最近的一点，即为诊断分界点界点(cut off point )

25、(cut off point )，这一点，这一点下的曲线面积最大。用该点数值下的曲线面积最大。用该点数值区分正常与异常，其灵敏度及特区分正常与异常，其灵敏度及特异度都比较高，而误诊及漏诊例异度都比较高，而误诊及漏诊例数之和最小。作数之和最小。作ROCROC曲线不能只曲线不能只靠一、二次实验结果找到正确的靠一、二次实验结果找到正确的临界点，普通要求最少有五组延临界点，普通要求最少有五组延续分组测定数据用以制图。续分组测定数据用以制图。 挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808

26、281350 e-mail: ROCROC曲线的临床运用：曲线的临床运用：1 1选择最正确分界值选择最正确分界值 前面已述分界值对于诊断实验准确性的影响，取前面已述分界值对于诊断实验准确性的影响，取ROCROC曲曲线上的拐点作为分界值将会得到最大的准确性，但是必需结合似然比、尤登指数线上的拐点作为分界值将会得到最大的准确性，但是必需结合似然比、尤登指数以及筛查和确诊等实验目的综合确定。以及筛查和确诊等实验目的综合确定。2 2诊断效率分析诊断效率分析 利用利用ROCROC曲线，除了选择最正确临界值外，还可利用曲线下曲线，除了选择最正确临界值外，还可利用曲线下的面积来评价不同检验工程或不同检测方法

27、对某种疾病的诊断价值。曲线下面积的面积来评价不同检验工程或不同检测方法对某种疾病的诊断价值。曲线下面积越大，其诊断价值就越大，它是一种非常直观的表达方式。越大，其诊断价值就越大，它是一种非常直观的表达方式。 3 3对检验结果的评价对检验结果的评价 动态阈值概念动态阈值概念挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 挪动阈值的概念和运用：挪动阈值的概念和运用： 从从ROC曲线可知，灵敏度曲线可知，灵敏度和特异度随着诊断分界点的升和特异度随着诊断分界点

28、的升高或降低而变化。实践上阴性高或降低而变化。实践上阴性预测值和阳性预测值也随之而预测值和阳性预测值也随之而变化变化(预测值是灵敏度和特异度预测值是灵敏度和特异度与患病率的函数与患病率的函数)，如表，如表4-6，当，当分界点为分界点为100g/L时，阴性预时，阴性预测值为测值为92.6%，但阳性预测值只，但阳性预测值只需需12.1%。分界点提高到。分界点提高到700g/L时阴性预测值只需时阴性预测值只需23.7%，而阳性预测值高达，而阳性预测值高达88.2%。分界点分界点( (g/L)g/L)灵敏度灵敏度特异度特异度阴性预测阴性预测值值阳性预测阳性预测值值0 01. 0001. 0000. 0

29、000. 0001. 0001. 0000 050501. 0001. 0000. 0000. 0001. 0001. 0000 01001001. 0001. 0000. 1440. 1440. 9260. 9260.1210.1212002001. 0001. 0000. 2500. 2500. 8650. 8650.2250.2253003000. 940. 940. 6380. 6380. 8310. 8310.5610.5614004000. 8450. 8450. 8750. 8750. 8020. 8020.7500.7505005000. 7410. 7410. 9430. 9

30、430. 6860. 6860.7890.7896006000. 5000. 5000. 9810. 9810. 4190. 4190.8310.8317007000. 3270. 3270. 9930. 9930. 2370. 2370.8820.8828008000. 1890. 1891. 0001. 0000. 0800. 0800.9290.9299009000. 0860. 0861. 0001. 0000. 0200. 0200.9460.946100010000. 0170. 0171. 0001. 0000. 0100. 0100.9770.977挪动阈值挪动阈值Floati

31、ng CUT-OFF2 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 挪动阈值用于详细病人：挪动阈值用于详细病人：假设某病人餐后假设某病人餐后2 2小时血糖小时血糖值为值为6.0Mmol/L6.0Mmol/L，患糖尿病，患糖尿病的能够性多大？的能够性多大？1 1、首先要知道获得该研讨、首先要知道获得该研讨数据代表的总体：来自于：数据代表的总体：来自于：体检人群；门诊病人；体检人群；门诊病人；内分泌科病人；糖尿病内分泌科病人；糖尿病复检；其他住院病人。

32、复检；其他住院病人。2 2、本次实验目的是筛查还、本次实验目的是筛查还是诊断或者作出治疗决策。是诊断或者作出治疗决策。筛查那么追求高灵敏度。阳筛查那么追求高灵敏度。阳性概率性概率PPV64.2%PPV64.2%低于阴性概低于阴性概率率NPV87.2%NPV87.2%筛查阴性；作为筛查阴性；作为糖尿病治疗，要求高特异性糖尿病治疗，要求高特异性，更不予思索。，更不予思索。餐后餐后2 2小时小时血糖血糖Mmol/LMmol/LSen%Sen%Spe%Spe%Ppv%Ppv%Npv%Npv%4.44.41001001.21.250.301850.30181001004.954.9598.698.67.

33、37.351.542151.542183.90883.9085.55.597.197.125.325.356.519256.519289.716389.71636.056.0592.992.948.448.464.290764.290787.207287.20726.66.688.688.668.268.273.58873.58885.678485.67847.157.1585.785.782.482.482.962282.962285.21285.2127.77.774.374.391.291.289.410389.410378.015478.01548.258.2564.364.396.1

34、96.194.281594.281572.972.98.88.855.755.798.698.697.548297.548268.999368.99939.359.3552.952.999.699.699.249599.249567.893767.89379.99.9505099.899.899.601699.601666.622266.622210.4510.4544.344.399.899.899.550699.550664.180164.1801111137.137.110010010010061.387461.3874泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：

35、电话：13808281350 e-mail: 挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 在糖尿病，如以不同的血糖程度作为诊断规范时，同样可以看到灵敏度和特异度的上述反比关系，如表所示。随着血糖程度阳性界限的增高，实验的灵敏度下降，特异度升高，反之亦然。看来将糖尿病诊断实验阳性界限或规范规定在7.15mmol/L130mg/dl时为宜，因此时灵敏度和特异度均处在80%左右。以不同血糖程度作为糖尿病诊断规范时的灵敏度和特异度餐后2小时的血糖水平灵敏度% 特异度Mmol/LMg/dl4.40801001.24.956098.67.35.5010097.125.36

36、.0511092.948.46.6012088.668.27.1513085.782.47.7014074.391.28.2515064.396.18.8016055.798.69.3517052.999.69.9018050.099.810.4519044.399.811.0020037.1100.0 病人已有典型的糖尿病病症：口渴、多饮、多尿、多食、消瘦等，同时查空腹血糖7.8mmolL140mgdl或及餐后2小时血糖11.1mmolL200mgdl，不需做糖耐量实验即可诊断为糖尿病。 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13

37、808281350 e-mail: 例如：某病人的胸水标本检测例如：某病人的胸水标本检测Ft为为800g/L，我们对该检验结果作何解，我们对该检验结果作何解释？释？假设送检标本符合研讨推断的总体，假设送检标本符合研讨推断的总体，也就是说患病率一样的话，我们把分也就是说患病率一样的话，我们把分界点定位于界点定位于800g/L，此时诊断恶性，此时诊断恶性胸腹水的阳性预测值或诊断概率为胸腹水的阳性预测值或诊断概率为92.9%，阴性预测值或误诊概率为，阴性预测值或误诊概率为8%，我们判别我们判别 A.阳性阳性(恶性胸水恶性胸水):诊断概率诊断概率0.929，误诊率误诊率0.08。 B.阴性阴性(良性胸

38、水良性胸水)：诊断概率：诊断概率：0.08，漏诊率：漏诊率：92.9。答案是只能选择答案是只能选择“A分界点分界点( (g/L)g/L)灵敏度灵敏度特异度特异度阴性预测阴性预测值值阳性预测阳性预测值值0 01. 0001. 0000. 0000. 0001. 0001. 0000 050501. 0001. 0000. 0000. 0001. 0001. 0000 01001001. 0001. 0000. 1440. 1440. 9260. 9260.1210.1212002001. 0001. 0000. 2500. 2500. 8650. 8650.2250.2253003000. 94

39、0. 940. 6380. 6380. 8310. 8310.5610.5614004000. 8450. 8450. 8750. 8750. 8020. 8020.7500.7505005000. 7410. 7410. 9430. 9430. 6860. 6860.7890.7896006000. 5000. 5000. 9810. 9810. 4190. 4190.8310.8317007000. 3270. 3270. 9930. 9930. 2370. 2370.8820.8828008000. 1890. 1891. 0001. 0000. 0800. 0800.9290.9299

40、009000. 0860. 0861. 0001. 0000. 0200. 0200.9460.946100010000. 0170. 0171. 0001. 0000. 0100. 0100.9770.977挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 动态阈值的概念和运用：动态阈值的概念和运用：又例如：某病人腹水标本检测又例如：某病人腹水标本检测Ft为为150g/L，假设我们把分界，假设我们把分界点定位于点定位于150g/L，判别为阳，判别为阳性

41、恶性腹水的阳性预测值性恶性腹水的阳性预测值或诊断概率只需或诊断概率只需22.5%以下，而以下，而判别为阴性良性腹水的阴判别为阴性良性腹水的阴性预测值性预测值86.5%以上，因此，我以上，因此，我们不能判别为阳性误诊率们不能判别为阳性误诊率86.5以上，而选择后者阴性以上，而选择后者阴性漏诊率只需漏诊率只需22.5以下，该以下，该标本是阴性结果具有相当高的标本是阴性结果具有相当高的准确性。准确性。分界点分界点( (g/L)g/L)灵敏度灵敏度特异度特异度阴性预测阴性预测值值阳性预测阳性预测值值0 01. 0001. 0000. 0000. 0001. 0001. 0000 050501. 000

42、1. 0000. 0000. 0001. 0001. 0000 01001001. 0001. 0000. 1440. 1440. 9260. 9260.1210.1212002001. 0001. 0000. 2500. 2500. 8650. 8650.2250.2253003000. 940. 940. 6380. 6380. 8310. 8310.5610.5614004000. 8450. 8450. 8750. 8750. 8020. 8020.7500.7505005000. 7410. 7410. 9430. 9430. 6860. 6860.7890.7896006000.

43、5000. 5000. 9810. 9810. 4190. 4190.8310.8317007000. 3270. 3270. 9930. 9930. 2370. 2370.8820.8828008000. 1890. 1891. 0001. 0000. 0800. 0800.9290.9299009000. 0860. 0861. 0001. 0000. 0200. 0200.9460.946100010000. 0170. 0171. 0001. 0000. 0100. 0100.9770.977挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开

44、正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 遗憾遗憾! ! 类似的数据我们天天类似的数据我们天天在产生在产生, ,但是很少有人积但是很少有人积累和整理累和整理, ,更没有加以分更没有加以分析和提炼析和提炼! !泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 主题词主题词诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 挪动阈值挪动阈值Floating CUT-OFF2 荟萃分析荟萃分析meta analysis 3 数据发

45、掘数据发掘Data Mine4 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 荟萃分析概念: Meta意指较晚出现的更为综合的事物，而且通常用于命名一个新的相关的并对原始学科进展评论的学问。 1976年社会心思学家Glass首先提出荟萃分析(Meta-analysis)的概念: 是指对研讨目的一样、又相互独立的多项实验结果进展系统的、综合统计分析.荟萃分析作为一种定量的文献分析方法,提供了一种处理有争议和不确定问题的手段. 实施良好的荟萃分析可对一个能够导致不确定的和意见不一的结论的证据给出一个更为客

46、观的评价。 荟萃分析荟萃分析meta analysis 3 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 荟萃分析荟萃分析Meta-analysisMeta-analysis的写作要求的写作要求: :目的：阐明要综合分析、评价的问题目的：阐明要综合分析、评价的问题方法：方法：1 1检索人员：图书馆人员、研讨人员。检索人员：图书馆人员、研讨人员。2 2检索时间范围及关键词。检索时间范围及关键词。3 3检索文献检索文献言语。言语。4 4检索用软件。检索用软件。5 5检索数据库引检索数据库引见见/ /手工检

47、索情况。手工检索情况。6 6检索到的文献类型及检索到的文献类型及数量。数量。7 7纳入文献规范。纳入文献规范。8 8metameta分析涉分析涉及的统计学分析所用专业软件及的统计学分析所用专业软件 结果：结果：1 1共纳入随机对照临床实验数量。共纳入随机对照临床实验数量。2 2分析结果应包括重要数据。分析结果应包括重要数据。结论：经过上述综合分析、评价后得到的较为客结论：经过上述综合分析、评价后得到的较为客观的总结性言语。观的总结性言语。荟萃分析荟萃分析meta analysis 3 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808

48、281350 e-mail: 荟萃分析荟萃分析meta analysis 3 荟萃分析方法举例荟萃分析方法举例:SELDITOFMS技术对肝癌诊断价值的系统技术对肝癌诊断价值的系统评价评价胡琼英胡琼英 王开正王开正 丁银环丁银环 郑旅芳郑旅芳 梁双花梁双花泸州医学院附属医院检验科泸州医学院附属医院检验科 四川泸州四川泸州 646000 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 主题词主题词诊断实验诊断实验Diagnosis TestDiagnosis Test 1 挪动阈值挪动阈值Floating

49、 CUT-OFF2 荟萃分析荟萃分析meta analysis 3 数据发掘数据发掘Data Mine4 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 提高诊断实验效能的方法数据发掘提高诊断实验效能的方法数据发掘 4 数据发掘是从大量的、不完全的、有噪声的、模糊的、随机的数据发掘是从大量的、不完全的、有噪声的、模糊的、随机的数据集中识别有效的、新颖的、潜在有用的，以及最终可了解的数据集中识别有效的、新颖的、潜在有用的，以及最终可了解的方式的非平凡过程。它是一门涉及面很广的交叉学科，包括机器方式的非平凡

50、过程。它是一门涉及面很广的交叉学科，包括机器学习、数理统计、神经网络、数据库、方式识别、粗糙集、模糊学习、数理统计、神经网络、数据库、方式识别、粗糙集、模糊数学等相关技术。数学等相关技术。 根据数据发掘的方法分，可粗分为：统计方法、机器学习方根据数据发掘的方法分，可粗分为：统计方法、机器学习方法、神经网络方法和数据库方法。统计方法中，可细分为：回归法、神经网络方法和数据库方法。统计方法中，可细分为：回归分析多元回归、自回归等、判别分析贝叶斯判别、费歇尔分析多元回归、自回归等、判别分析贝叶斯判别、费歇尔判别、非参数判别等、聚类分析系统聚类、动态聚类等、判别、非参数判别等、聚类分析系统聚类、动态聚

51、类等、探求性分析主元分析法、相关分析法等、以及模糊集、粗糙探求性分析主元分析法、相关分析法等、以及模糊集、粗糙集、支持向量机等。机器学习中，可细分为：归纳学习方法决集、支持向量机等。机器学习中，可细分为：归纳学习方法决策树、规那么归纳等、基于范例的推理策树、规那么归纳等、基于范例的推理CBR、遗传算法、贝叶、遗传算法、贝叶斯信心网络等。神经网络方法，可细分为：前向神经网络斯信心网络等。神经网络方法，可细分为：前向神经网络BP算算法等、自组织神经网络自组织特征映射、竞争学习等等。法等、自组织神经网络自组织特征映射、竞争学习等等。数据库方法主要是基于可视化的多维数据分析或数据库方法主要是基于可视化

52、的多维数据分析或OLAP方法，另方法，另外还有面向属性的归纳方法。外还有面向属性的归纳方法。 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 串联实验：串联实验： serial test 并联实验并联实验parallel test 数学模型数学模型mathematical models 人工神经网络诊断模型人工神经网络诊断模型ANN 支持向量机诊断模型支持向量机诊断模型SVM 数据发掘数据发掘提高诊断实验效能的方法数据发掘提高诊断实验效能的方法数据发掘 4 泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王

53、开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 提高诊断实验效能的方法数据发掘提高诊断实验效能的方法数据发掘 4 传统的数据发掘方法由于太繁琐传统的数据发掘方法由于太繁琐, ,建立诊断建立诊断模型特别复杂模型特别复杂, ,运用时也非常费事运用时也非常费事, ,因此不易推因此不易推行行, ,至今依然停留在期刊杂志或研讨报告中至今依然停留在期刊杂志或研讨报告中! ! 而且而且, ,传统的数据发掘方法是建立在严密的传统的数据发掘方法是建立在严密的数理逻辑根底之上数理逻辑根底之上, ,用于分析模糊的疾病景象用于分析模糊的疾病景象( (黑箱黑箱), ),确实

54、有些牵强确实有些牵强, ,甚至能够让人啼笑皆非甚至能够让人啼笑皆非! ! 新的机器学习方法借助计算机软件模块以及新的机器学习方法借助计算机软件模块以及数据库为我们开辟了从疾病景象探求疾病过程数据库为我们开辟了从疾病景象探求疾病过程的新途径！的新途径！以精神分裂症实验诊断为例，研讨蛋白组学对以精神分裂症实验诊断为例，研讨蛋白组学对精神疾病诊断的数据发掘过程。精神疾病诊断的数据发掘过程。泸州医学院附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: u 唯物主义者以为：物质决议认识！唯物主义者以为：物质决议认识！u 精神分

55、裂症的基因组学研讨，提示了不同的生理或病理生精神分裂症的基因组学研讨，提示了不同的生理或病理生理形状下基因的表达情况，阐明精神分裂症患者存在基因理形状下基因的表达情况，阐明精神分裂症患者存在基因表达的异常。表达的异常。u 蛋白质作为基因表达的最终产物也发生相应改动，并具有蛋白质作为基因表达的最终产物也发生相应改动，并具有特征性。先期有研讨报道了精神分裂症患者脑脊液、大脑特征性。先期有研讨报道了精神分裂症患者脑脊液、大脑皮层以及血清中能够有生化和免疫方面的病理变化。皮层以及血清中能够有生化和免疫方面的病理变化。数据发掘数据发掘-精神分裂症蛋白组学精神分裂症蛋白组学4 泸州医学院附属医院泸州医学院

56、附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 128例血清样本例血清样本精神分裂症精神分裂症62例例随机取精神分裂症和正常人随机取精神分裂症和正常人各各30例建立预测模型例建立预测模型检测血清蛋白质谱数据检测血清蛋白质谱数据正常人对照正常人对照66例例剩余的剩余的32例精神分裂症和例精神分裂症和36例正常人验证模型例正常人验证模型数据校正及统计学分析数据校正及统计学分析模型的建立和训练模型的建立和训练模型的盲法验证模型的盲法验证诊断实验效能评价诊断实验效能评价 数据发掘数据发掘-精神分裂症蛋白组学精神分裂症蛋白组学4 泸州医学院

57、附属医院泸州医学院附属医院 王开正王开正 教授教授 电话：电话：13808281350 e-mail: 姓名姓名Da2820Da3219Da3318Da4283Da4347Da4357SP116.814.232.721.428.916.3SP22511.823.79.517.911.4SP31112.219.614.420.113.3SP415.120.533.819.730.218.6SP524.810.716.58.69.47.6SP6206.616.710.112.46.2SP71023.439.114.741.520.9SP810.610.116.711.81

58、0.69.3SP917.86.39.33.98.14.3SP109.36.414.14.49.38.5SP1120.312.930.17.212.110.7SP1211.41127.212.712.28.2SP135.14.39.24.18.63.9SP1413.78.617.17.467.3SP1522.113.423.95.49.18SP168.15.814.83.910.411.5SP17148.811.48.710.79.4SP1813.611.47.95.39.57SP1914.39.98.99.412.711.6SP2011.18.711.25.66.14.9SP214.94.81

59、2.87.46.53.3SP223.77.188.79.65.3数据发掘数据发掘-精神分裂症蛋白组学精神分裂症蛋白组学4 姓名姓名Da2820Da3219Da3318Da4283Da4347Da4357normal17.256.13.27.86.4normal24.25.97.64.73.66.5normal315.618.44221.416.710.1normal414.516.931.1915.48.5normal51.31.20.99.51.50.1normal66.24.46.23.23.12.6normal7345.73.223.7normal864.13.54.22.71.1nor

60、mal910.48.510.72.323.2normal1013.418.349.714.217.211.1normal119.211.17.25.42.32.2normal125.65.54.63.61.51.5normal139.14.783.72.30.6normal145.822.91.40.90.3normal158.94.915.2442.1normal162.10.31.41.10.40.2normal171.61.21.11.21.10.5normal183.85.36.43.13.51.6normal191.61.94.21.51.11.4normal202.93.41.22