北京市科学技术研究院

1、北京市科学技术研究院市级财政项目测试化验加工委托合同书项目名称：创新工程-预研-基于多维数据的2型糖尿病预警模型研究 委托任务：2型糖尿病预警模型构建及2型糖尿病多维数据采集及应用平台开发委托单位：北京市理化分析测试中心 承担单位：北京市计算中心承担任务负责人：裴智勇起止时间：2019年05月至2019年10月北京市科学技术研究院二一九年四月填 写 说 明1.本合同书由北京市科学技术研究院（以下简称“市科研院”）科研开发处监制，适用于承担市科研院市级财政专项项目的院属单位以测试化验加工费形式支付给承担单位的检验、测试、化验及加工等费用的管理。2.测试化验加工费是指申报单位由于自身技术、工艺和设

2、备等条件限制，必须支付给外单位的检验、测试、设计、化验及加工等费用，不涉及资产和知识产权相关费用。3.经费明细中不得列支测试化验加工费。4.本合同书一式三份，双方签章后生效，双方各执一份，并于十五日之内报送市科研院科研开发处一份备案。分条目列明委托任务目标及考核指标，包括定性目标和定量目标2型糖尿病预警模型构建1、目标利用600例健康对照及600例2型糖尿病患者基因组、肠道微生物测序及临床生化指标数据，构建2型糖尿病预警模型。2、考核指标（1）完成600例健康对照及600例2型糖尿病患者基因组靶向位点测序数据分析。（2）完成600例健康对照及600例2型糖尿病患者肠道微生物测序数据分析。（3）

3、完成基于人工智能算法的2型糖尿病预警方法开发。（4）构建2型糖尿病预警模型，模型准确率达80%以上。2型糖尿病多维数据采集及应用平台开发1、目标总体目标：2型糖尿病多维数据采集及应用平台开发。2.考核指标平台系统能够实现以下功能：平台前、后端系统，数据关联分析，数据信息管理、数据传输、门户网站访问、数据检索/查询等功能。平台系统性能指标要求如下：（1）平台整合600例健康对照及600例2型糖尿病患者基本信息、临床信息、基因组、肠道微生物四大类数据。（2）对业务功能界面单一操作的系统响应时间小于3秒, 平台页面响应时间不超过800毫秒；普通查询响应时间不超过1秒；全文检索查询响应时间不超过3秒；

4、（3）数据下载响应时间一般应小于10秒，拓扑界面展示响应时间小于10s；文档显示速度不超过5秒；上传速度不低于100kbps；下载速度不低于150kbps。（4）满足500注册用户的管理需要，用户登录时间不超过3秒；访问平均并发数可达到50人，在线用户数100个。（5）系统架构支持高可用，支持7*24小时安全稳定运行，全年系统可用性达到90%以上。二、任务内容（委托的检验、测试、设计、化验或加工内容具体明确，与目标相对应）2型糖尿病预警模型构建(1) 基因组靶向位点测序数据分析600例健康对照及600例2型糖尿病患者基因组靶向位点数据分析，包括数据质控、比对、变异检测、变异注释。(2) 肠道微

5、生物测序数据分析600例健康对照及600例2型糖尿病患者肠道微生物测序数据分析，包括数据质控、微生物种类鉴定、群落组成比较、多样性分析。(3) 预警模型方法开发对检测的差异SNP位点，通过关联分析、PCA分析等方法，鉴定在健康对照和糖尿病患者间频率具有显著差异的SNP位点；进行与临床生理生化指标关联分析，进一步筛选纳入模型候选位点。对检测的特征微生物种类，通过关联分析、PCA分析等方法，鉴定在健康对照和糖尿病患者间具有显著差异的微生物种类；进行与临床生理生化指标关联分析，进一步筛选纳入模型的微生物种类开发基于支持向量机、随机森林、神经网络的人工智能算法，用于预警模型构建。(4) 预警模型构建基

6、于开发的人工智能算法，以及筛选的指标，进行综合预警模型构建，比较基于不同人工智能算法构建模型的效能，选择最优模型。2型糖尿病多维数据采集及应用平台开发2型糖尿病多维数据采集及应用平台总体功能需求为在对本项目产生的基因测序、肠道微生物测序、临床数据及预警模型的进行数字化的基础上，构建生物医学知识库及生物信息分析方法及流程，实现糖尿病多维度数据分析及患病风险预测，并提供数据查询、浏览和分析服务。为实现以上需求，需要完成四方面工作：（1）系统架构建设；（2）平台数据系统建设；（2）平台管理系统建设；（3）平台应用系统建设。1、系统架构建设数据采集接口设计、生物信息学分析软件与数据库部署、生物信息学分

7、析流程集成与二次开发。设计数据采集接口，实现基因信息、生理生化信息、基因组信息、肠道微生物信息的采集。部署上述数据分析需要的软件及生物学数据库，开发生物信息学分析流程，整合2型糖尿病风险预警模型。2、平台数据系统建设包括基本信息数据库、生理生化指标信息数据库、基因组数据库、肠道微生物数据库、并发症数据库五大子数据库。完成数据库设计与实现、数据收集模块设计与实现、数据整合与分析模块设计与实现以及后台管理建设。基本信息数据库：记录患者姓名、性别、年龄、身高、体重、肥胖、籍贯、电话、邮箱、婚姻状况、家族史、糖尿病病程、服用药物、肠道情况、既往病史、饮食习惯、生活习惯信息。生理生化指标数据库：记录患者

8、丙氨酸氨基转移酶、天门冬氨酸氨基转移酶、尿素、肌酐、尿酸、空腹血糖、糖尿血红蛋白、总胆固醇、甘油三脂、高密度脂蛋白胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇信息。基因组数据库：记录患者基因组靶向测序数据分析得到的变异位点、变异基因等信息。肠道微生物数据库：记录患者肠道微生物测序数据分析得到的微生物种类、微生物多样性等信息。并发症数据库：3、平台管理系统建设包括信息管理、用户管理、数据访问管理。具体如下：1）信息管理：对站内数据及信息进行管理。管理员可对数据库进行录用、删除、修改、查询和发布操作。2）用户管理：用户管理包括用户注册、用户权限管理和用户信息管理。管理员负责用户的创建、用户信息维护、用户删除和用户权

9、限控制，便于用户的层次化管理。3）数据访问管理：针对不同的平台用户，系统为其分配不同的数据访问端口和数据格式标准。4、平台应用系统建设提供信息浏览服务、信息检索服务、数据分析服务。三、分阶段任务实施方案（分阶段任务实施按月或季度填写，不得超过所属项目的期限）2型糖尿病预警模型第一阶段：（2019年4月-2019年5月）对招标采购单位提供的300例健康对照及300例2型糖尿病患者基因组靶向位点及肠道微生物测序数据进行分析。开发基于支持向量机、随机森林、神经网络的人工智能算法，用于预警模型构建。验收方案：提供相关分析方法及结果纸质报告并进行PPT汇报。第二阶段：（2019年6月-2019年7月）对

10、招标采购单位提供的300例健康对照及300例2型糖尿病患者靶向位点及肠道微生物测序数据进行分析。对第一阶段构建的模型进行优化。验收方案：提供相关分析方法及结果纸质报告并进行PPT汇报。第四阶段：（2019年8月-2019年9月）基于十倍交叉验证法、抽样稳定性检验等方法对模型进行验证，并根据验证结果进一步优化模型。验收方案：提供相关分析方法及结果纸质报告并进行PPT汇报。第五阶段：（2019年10月）培训、工作总结及验收根据考核指标进行工作总结，提交相应材料。验收方案：投标人向招标采购单位提供相关分析方法及结果纸质报告并进行PPT汇报。2型糖尿病多维数据采集及应用平台2型糖尿病多维数据采集及应用

11、平台开发分四个阶段进行，各阶段进度安排及验收方式如下：第一阶段：（2019年4月-2019年5月15日）需求分析阶段：确定开发范围和具体需求。验收方案：完成项目需求分析。提供2型糖尿病多维数据采集及应用平台需求报告1份。第二阶段：（2019年5月16日-2019年6月）设计阶段：对系统的解决方案、功能分配、模块化分、程序的总体结构、输入输出和接口设计、运行设计及出错设计等方面进行全面的概括性的说明，再次基础上进一步明确系统结构，详细地介绍系统的各个模块，为进行后面的开发实现和测试做准备。验收方案：提供2型糖尿病多维数据采集及应用平台平台开发设计报告1份。第三阶段：（2019年7月-2019年8

12、月）系统编码阶段：整合2型糖尿病多维数据采集及应用平台门户网站首页展示内容、风格的定制开发，以及完成对2型糖尿病多维数据采集及应用平台系统架构、2型糖尿病多维数据采集及应用平台数据系统、2型糖尿病多维数据采集及应用平台管理系统、2型糖尿病多维数据采集及应用平台应用服务系统的建设，根据需求进行开发及二次开发。验收方案：提供2型糖尿病多维数据采集及应用平台开发报告1份。第四阶段（2019年9月）集成测试阶段：完成2型糖尿病多维数据采集及应用平台系统集成测试验收方案：提供2型糖尿病多维数据采集及应用平台测试报告1份。第五阶段：（2019年10月）培训、工作总结及验收根据考核指标进行工作总结，提交相应

13、材料。四、成果及其提供形式、知识产权归属与管理（预期成果形式包括：基地/示范/联盟、培养创新性人才、 培训教材、方法数据库、新方法、论文/专著、专利、技术标准、新产品 、新工艺、新装置、竞争性项目、领导批示、国际性学术会议、其他；）（一）成果及其提供形式2型糖尿病预警模型（1）600例健康对照及600例2型糖尿病患者基因组靶向位点测序数据分析报告1份，提供形式：电子和纸质文档；（2）600例健康对照及600例2型糖尿病患者肠道微生物测序数据分析报告1份，提供形式：电子和纸质文档；（3）2型糖尿病预警模型构建源代码1份，提供形式：光盘； （4）2型糖尿病多维数据预警模型构建报告1份，提供形式：电

14、子和纸质文档；2型糖尿病多维数据采集及应用平台（1）2型糖尿病多维数据采集及应用平台定制开发需求分析报告1份，提供形式：电子和纸质文档；（2）2型糖尿病多维数据采集及应用平台定制开发设计说明书1份，提供形式：电子和纸质文档；（3）2型糖尿病多维数据采集及应用平台定制开发源代码1份，提供形式：光盘； （4）2型糖尿病多维数据采集及应用平台集成测试报告1份，提供形式：电子和纸质文档；（5）2型糖尿病多维数据采集及应用平台用户使用说明书1份，提供形式：电子和纸质文档；（二）知识产权归属与管理本合同成果的知识产权归甲方所有，若在此过程中产生争议，应通过平等、友好协商予以解决。五、技术情报和资料的保密（

15、1）保密内容和范围：甲、乙双方在协议执行期内的研究数据与成果，包括原始数据、分析报告、论文和专利以及与本项目相关的技术资料。（2）乙方必须按照政府采购合同的要求从事项目研究与开发，研究开发的技术资料包括原始数据、分析报告、以及与本项目相关的技术资料全部转交甲方留存。（3）乙方必须严格遵守保密制度，未经甲方允许，乙方不得将原始数据、分析报告、以及与本项目相关的技术资料公开发表和发布、亦不得向第三方泄漏以上内容。六、委托任务费用及支付方式1. 委托任务经费不得列支测试化验加工费，其他支出明细按国家和北京市相关管理规定执行。2委托任务经费总额为人民币柒拾肆万玖仟元整（大写），即749,000.00。

16、3委托任务经费明细见附件1。4. 支付方式 签订合同后7个工作日内，中标人向招标人支付合同金额5%的履约保证金，即人民币叁万柒仟肆佰伍拾元整（37,450.00元）；招标人向中标人支付合同金额70%的款项，即人民币伍拾贰万肆仟叁佰元整（524,300.00元）；验收完成后7个工作日内，招标人向中标人支付合同金额30%的款项，即人民币贰拾贰万肆仟柒佰元整（224,700.00元）；同时中标人退还履约保证金。七、合同书双方签章甲方单位名称北京市理化分析测试中心（单位公章）2019年5月5日项目负责人（签章）管笛 李宝明财务负责人（签章）石欣地址及邮编北京市海淀区丰贤中路7号孵化楼B座四层电话及传真

17方单位名称北京市计算中心（单位公章）2019年04月29日任务承担人（签章）裴智勇财务负责人（签章）张志杰地址及邮编北京市海淀区丰贤中路7号永丰产业基地北科产业3号楼电话及传010-59341888开户银行中国工商银行股份有限公司北京永丰支行帐 号0200151819100023937备注：如用支票支付，可以不用填开户银行。八、违约责任及纠纷解决 乙方应本着科学性、准确性和真实性原则执行委托任务；并按合同书约定的时间向甲方提交完成成果。如乙方未按时提交完成成果，或完成成果不符合甲方要求，影响甲方采用的，每推后1个月交付应按合同经费的1%赔偿

18、甲方损失。若由于甲方不能按时付费给乙方，每推后1个月付费，则甲方应向乙方另外支付合同总金额1的违约金。乙方在实施委托任务过程中如取得重大进展、重要突破或发生其他重大事项，应及时向甲方报告；如因遭遇不可抗力或其他因素影响委托任务的正常执行进度，致使委托任务需要调整时，乙方应当及时向甲方提交书面报告，经甲方确定处理意见后执行。乙方对委托任务经费应单独核算、专款专用、不得挪用，并按合同书规定的开支范围列支各项费用。 在履行本合同的过程中发生争议，双方当事人和解或调解不成，可采取仲裁或按司法程序解决。（一）双方同意由北京仲裁委员会仲裁。（二）双方约定向甲方住所地人民法院起诉。附加条款甲方及上级单位有权对乙方经费使用情况进行延伸审计。序号名 称报价（单位：元）单位数量小计（单位：元）备注1基因组靶向位点测序数据分析75样本120090