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文档简介
1、Stats制作OR/RR的95%CI森林图,及横坐标X轴调整,如何产生长短不均坐标轴最近在做危险因素OR的森林图,stata效果较好。但也遇到问题,如一些文献中横坐标X轴坐标尺不一样,如何调整,论坛里一直每一找到这方面太多的解释,但在公卫人里面的peking_sky里面提到了这个问题的解决方法。坛里有朋友说是对数转换,是正解呀,但没有给出步骤。我就来个抛砖引玉吧,跟大家一起学习Stata做森林图,一个采用命令metan;是用鼠标,即UserMeta-analysisF面的选项、一、数据步:数据中输入4个变量分别为factorORCI1CI2(分别代表OR值,CI下限、CI上限),并输入数值。产
2、生新变量,对数据进行对数转换。程序:genelnor=ln(OR)genelncil=ln(Cll)genelnci2=ln(CI2)二、作图步:作图,我们看到的横坐标标尺不一样,即是使用了对数转换,使用eform这个命令:MetanInorIncilInci2,eformlabel(namevar=factor)我们常常在X轴上要添加坐标数值,常常0.5,1.0,10也要写上,用xlabel语句,如xlabel(0.5,1.0,10),数值可随意增加和修改,用逗号分开即可;X轴的坐标尺采用xtick命令,xtick只显示坐标轴下面的小线条即坐标尺,不出现数值,女口xtick(2,3,4,5,
3、6,7,&9)。我们如果是做危险因素OR的森林图,那我们常常不需要最后一行stata直接给出的overall,那就用nooverall,即overall那一行的OR不出现;不需要出现最右边加权项的值,则用noowt;图中的OR点上有时候去会看到灰色的人方块,这个灰色方块表示权重的大小,常常不好看,若不需要显示则用nobox。好,那综合这个功能,做OR的森林图程序就是metanInorIncilInci2,eformlable(namevar=factor)xlable(o.5,1.0,10)xtick(2,3,4,5,6,7,8,9)nowtnooverallnobox若作图了,我们可以看到横
4、坐标的标尺是不均衡的,这是由于上面采用了对数转换的关系。但是,我们现在一般是采用鼠标点击UserMeta-analysisofbinaryandcontinuous进行操作。在鼠标操作用,若要横坐标标尺不一致,使用的数据必须对数In转换(用excel或者前面的gene命令语句),同时在effect选上Exponentiate。MainJmetan1.86-Meta-analysisofBinary&Contin.Binary.Continuous.Effect.GraphOptsi/inG-eneralOptions:TypeofData:Count/Continuous;Eect/CIEff
5、ect/SEOnoKeepd匸gE*tuth讥“粉皿匚upmWinthtlnorlncilInc12釆用InW数W换的数据迸行分析LabelsforBata:Vlirajne:Year:factorByOptions:-noSubGroup厂sgVieightOKCanc-alSuLmitJmetan1.86-Meta-analysisofBinary&Contin.Jmetan1.86-Meta-analysisofBinary&Contin.MainBinar、Continuous.Effect.Gr&phOptsif/inFileKameIISavegrapk:X-axisTickLat
6、els(commabetween):0Set:回Fofg0.5,2,3,4,5,6,1,8,9ScleTickRmgw1Counts|Grp1:0noWeights0noOverallIInoStats0noBoxLegend:AllowedGraph了Options:BBFUEectDirectionLabels,Leftoptionbl():Right:POKCnclSuLmit这是采用了横坐标对数转换的图。(即使用In数据,和选上Effect中的Exponentiate的结果)StudyOddsIDRatio(95%Cl)SEX-1.95(0.89?4.25)age1.02(1.00,1
7、.04)AT779(4.13,14.69)B1.01(0.97,1.05)C1.08(1.02,1.13).5123456789对比一下,如果我们采用原始数据OR,Cll,CI2作图的话,同时不勾选Exponentiate(F面这个图的横坐标标尺是一致的、等距的)StudyOddsIDRatio(95%Cl)SEXageABc1.95(0.89,4.25)1.02(1.00,1.04)7.79(4.13,14.69)1.01(0.97,1.05)1.08(1.02,1.13)0.523456789这两个森林图相比,可能第一个比较方便,尤其是有OR的CI比较接近且小时候,第二个等间距坐标较难看,而且近似一个点。当然第二个森林图的标记线在x=o处,这是我们不需要的;我们需要的是X=1出,即在GraphOpts增加一个null(l)即可;若不写,此处默认是null(0),即x=o处。XJmetan1.86-Meta-analysisofBinary&Contin.StudyOddsIDSEXageABRatio(95%Cl)1.95(0.89,4.25)1.02(1.00,1.04)7.79(4.13,14.69)1.01(0.97,1.05)1.08(1.02,1.13).5123456789好了,对比这几张森林图,我想,关于横坐标转换,标尺不一致的问题大家应该了解
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