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文档简介

1、计算A、B分子间的弱相互作用能,不能简单地通过E(interaction)=E(AB)-E(A)-E(B)来计算,因为E(AB)能量相对于E(A)+E(B)的降低来自两方面,一方面是真实的A、B分子间的相互作用能,这是我们要求的;另一方面来自于A、B分子的基函数在复合物体系中重叠,相当于增大了复合物的基组而使E(AB)能量降低,这个部分贡献如果也掺入E(interaction),则高估了相互作用能,所以要去掉,它称为BasisSetSuperpositionError(BSSE)。所以双分子的相互作用能应该表述为E(interaction)=E(AB)-E(A)-E(B)+E(BSSE)。有时

2、在分子内相互作用能计算时也要考虑BSSE。计算E(BSSE)有多种方法,Gaussian03用的是目前广泛使用的Boys、Bernardi发展的counterpoisecorrection方法。设E(i)为第i个分子在自身基组下的能量,E(i)为第i个分子在全部n个分子上的基函数都出现下的能量,贝U计算n个分子相互作用能中的E(BSSE)=KE(i)-E(i),这里E(BSSE)为正值。注意计算E(i)与E(i)时的分子几何结构与处在复合物中时的一致。要计算A、B两个分子的相互作用能,在Gaussian03中使用Counterpoise=2关键字,会计算5个体系,输出的能量按照如下顺序:E(A

3、B):A、B基组下AB复合物的能量E(A,bAB):A、B基组下A的能量E(B,bAB):A、B基组下B的能量E(A):A基组下A的能量E(B):B基组下B的能量最后会输出correctedenergy(E(corrected)和BSSEenergy(E(BSSE).这里E(corrected)就是消除了因单体基组重叠造成的能量降低后的AB复合物能量,E(corrected)=E(AB)+E(BSSE)。E(BSSE)=(E(A)-E(A,bAB)+(E(B)-E(B,bAB)。BSSE校正后的真实的相互作用能可以这样计算:E(interaction)=E(corrected)-(E(A)+E

4、(B)。也可以这样计算,是等价的:E(interaction)=E(AB)-E(A,bAB)-E(B,bAB)计算过程中会输出类似这样的语句:Counterpoise:doingDCBScalculationforfragment1.这里就是说明接下来计算的是E(A,bAB)(假设A分子为fragment1),其中DCBS代表dimercenteredbasisset,说明以A、B分子为中心的基函数都出现,但是计算中并不纳入B的电子和原子核,这称为计算A的能量时添加了B的ghost轨道;如果是doingMCBScalculationforfragment1,就是要计算E(A),MCBS代表monomercenteredbasisset,计算中只出现属于A分子的基函数。若计算n个分子,则关键字为counterpoises,结果输出顺序与计算相互作用能的方法与双分子的情况是一样的。能量按如下顺序输出:E(AB),E(l),E(2).E(n),E(l),E(2).E(n)。E(BSSE)=E(l)-E(l)+E(2)-E(2)+.+E(n)-E(n)。E(corrected)=E_complex+E(BSSE)E(interaction)=E(corrected)-(E(l)+E(

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