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文档简介
1、医学图像格式转换及读取与显示医学图像格式转换通常从机器拷贝出来的医学图像数据为DICOM格式,如果是多种模态图像混合,则需要使用Dcm2AsiszImg.exe工具把多模态图像分类出来,软件如下图所示:DIICOM转IME程序UZCCOK接收输出巨录端口:L2?.0.0.1接收输出目录C.lfsersImigEDesktopbackup档Ttolbox.Dcm廿尝|1rILL:阀專才尖厂原始囹稼分强萃flTTM图悔冃录|好SOCi25E技化(C)I退出IDcm2AsiszImg是一个接收、发送DICOM图像、把DICOM图像进行分类、把DICOM转化为安科Img图像格式的软件工具。功能l,DI
2、COM图像接收,可以在接收磁共振、CT扌H描系统或PACS系统发送的DTCOM图像。DICOM图像发送,用可以任本机发送DICOM图像到英他计算机,如PACS.也包括本机.DICOM图橡分类,如果使用光盘刻录DICOM图像,可以进行分类,申常容易的辨认D1C0M图像是那次检杳、那个序列扫描的.DICOM图像转化为空科lmg格式亠立持彩色图像,如功能磁共振统让激活图、扩散张量图像的彩色各向异性系数图像、灌注扩散图像等目前手术计划或导航需要图像为256x256矩阵,软件白动判断,如果不是,会白动转化为256x256分辨率图像。TextEdit用法:“输出目录”选择待转化的图像保存路径“DICOM图
3、像分类”选择要转化的原始图像目录,最后点击“DICOM图像分类”,输出图像分辨率为256*256。常用的图像格式还有ANALYZE和NIFTI,ANALYZE格式的图像包括图像文件.img和头文件.hdr,应用于SPM2NIFTI把图像文件和头文件合并为.nii文件,应用于SPM8、FSL、FreeSurfer等。可以利用MRICron软件的dcm2niigui.exe插件把DICOM格式转化为ANALYAZE和NIFTI格式。Qdcm.2niiFileEditHelpCutoutFormat:SPN8C3DNlfTlnii)ChrisRlordensdcmZnii:2MAY2.01664bi
4、tBSDLicense:(upgradetodcrnZniksuggested)eadingpreferencesfileC:UserslmageDeslctopbackup5tSToolboxIMriccm2niigui.ini在Help下的preferenee处可设置输出参数:GOutput;JOHN_DOEOutputFilenameAcquis-itionDateInputFilenameIIProtocolName0PatientName_AcquisitionSeriesSavepatientnameinINIfTIheaderscanandpatientdetails)0匚oIl
5、apsefoldersPIIReorientlargeimagestorreares-torthogonalplane|Stack3DimageswithsameacquistionnumberSaveSosourcefolder读取与显示DICOM图像Matlab提供了dicominfo、dicomdict、dicomdisp、dicomread、dicomuid、dicomwrite函数,可实现DICOM格式图像的读取、显示、保存等操作,以及查看扫描信息。读取与显示NIFTI格式MRIcro软件可以显示NIFTI图像FihEdrtHaftdrViowROID曲rl*yElcX啤MRJcri
6、:-He-Mfa-Inlwirtalm1-450Mb團侮N卿rti曲旳于n勺笔15:jj1_z)i盘i勿之嘶岂bahIGhhffc|611亡山)卜亡I|dltwl国VdjnM1耳Z|1.DMID士IrtHKdQJMMDO占SkeUeMerc+:fl呂口k匕WKda|呂弱I巳日tn爾处l-口.R&qicfloflntehdr,filetype,fileprefix,machine=load_nii_hdr(output.hdr);img,hdr=load_nii_img(hdr,filetype,fileprefix,machine);save_nii(nii,filename,old_RGB);SPM方法:helpspm_read_volsV=spm_vol_nifti(output.hdr)Y,XYZ=spm_
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