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文档简介

今晚7点半直播：⿏标点点，GEO+TCGA整合分析⼿把⼿教你实现！TCGA和GEO是两⼤公共数据库，是⽬前⽣信数据挖掘的主要来源，⽬前普通的分析已经很难轻松发表，⽽多组学，多平台联合分析将会成为趋势。今晚这⼀期直播由911师兄为⼤家讲解如何使⽤在线⼯具，零代码，不花⼀分钱，复现⼀篇GEO+TCGA联合分析⽂章，⽂章标题：Identificationof5HubGenesRelatedtotheEarlyDiagnosis,TumourStage,andPoorOutcomesofHepatitisBVirus-RelatedHepatocellularCarcinomabyBioinformaticsAnalysis.这篇⽂章是今年9⽉底发表在COMPUTATIONALANDMATHEMATICALMETHODSINMEDICINE，20年影响因⼦在2.23，⽂章主要研究的是通过⽣物信息学分析鉴定⼄型肝炎肝癌患者中与早期诊断、预后相关的Hub基因。分数虽然不⾼，但最基本的逻辑脉络较为经典，理解好了，在此基础上添加内容，扩展分析就会变得容易，5分6分就不会是难事。我们看下这篇⽂章中都做了哪些分析：1）数据源：GSE55092、GSE121248和TCGA的424例HCC（374例肿瘤和50例正常）转录组数据和相应的临床数据2）HCC中DEG的鉴定（肿瘤vs正常）3）差异基因KEGG和GO富集分析4）PPI⽹络构建与Hub基因分析5）HCC患者的Hub基因表达和临床病理参数6）Hub基因的⽣存分析6）Hub基因的⽣存分析7）⼈类蛋⽩质图谱数据库中hub基因组织学图像10⽉11⽇晚上19点半，我们相约腾讯会议直播间(需要先安装腾讯会议软件)会议ID：908268480关注以下官⽅视频号，我们将进⾏同步直播。，为”⽣信0代码”⽽⽣！弗雷赛斯-浙江⼤学硕博创建于2015年查重|润⾊|绘图|在线课程|课题合作|SCI写作神器|

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