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SDSPAGE电泳注意事项SDSPAGE电泳注意事项3/3SDSPAGE电泳注意事项SDS是阴离子去污剂,作为变性剂和助溶试剂,它能断裂分子内和分子间的氢键,使分子去折叠,破坏蛋白分子的二、三级结构。强还原剂如巯基乙醇,二硫苏糖醇能使半胱氨酸残基间的二硫键断裂。在样品和凝胶中加入还原剂和SDS后,分子被解聚成多肽链,解聚后的氨基酸侧链和SDS结合成蛋白-SDS胶束,所带的负电荷大大高出了蛋白原有的电荷量,这样就除掉了不同样分子间的电荷差别和结构差别。浓缩胶的作用是有积聚作用,凝胶浓度较小,孔径较大,把较稀的样品加在浓缩胶上,经过大孔径凝胶的迁移作用而被浓缩至一个狭窄的区带。聚丙烯酰胺凝胶由单体丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺聚合而成,催化聚合的常用方法有两种:化学聚合法和光聚合法。化学聚合以过硫酸铵(AP)为催化剂,以四甲基乙二胺(TEMED)为加速剂。不连续系统由电极缓冲液、浓缩胶及分别胶所组成。浓缩胶是由AP催化聚合而成的大孔胶,凝胶缓冲液为的Tris-HCl。分别胶是由AP催化聚合而成的小孔胶,凝胶缓冲液为Tris-HCl。电极缓冲液是Tris-甘氨酸缓冲液。2种孔径的凝胶、2种缓冲系统、3种pH值使不连续体系形成了凝胶孔径、pH值、缓冲液离子成分的不连续性,这是样品浓缩的主要因素。SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳经常应用于提纯过程中纯度的检测,纯化的蛋白质平时在SDS电泳上应只有一条带,但若是蛋白质是由不同样的亚基组成的,它在电泳中可能会形成分别对应于各个亚基的几条带。注意问题1.样品办理上样缓冲液的作用:形成SDS-蛋白复合物,使其带负电;SDS和巯基乙醇使蛋白质解离,综上两点为了在电泳中,只依照分子量来分别。SDS作用:去蛋白质电荷、解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠,还有助溶剂的作用。SDS电泳凝胶中各主要成分的作用(1)浓缩与分别胶凝固的利害直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境亲近相关。提高SDS电泳分辨率的路子待凝胶在室温凝固后,可在室温下放置一段时间使用。忌即配即用或4度冰箱放置,前者易以致凝固不充分,后者可以致SDS结晶。一般凝胶可在室温下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。4..“微笑”(两边翘起中间凹下)形带原因主若是由于凝胶的中间部分凝固不均匀所致,多出现于较厚的凝胶中。办理方法:待其充分凝固再作后续实验。“皱眉”(两边向下中间鼓起)形带原因主要出现在蛋白质垂直电泳槽中,一般是两板之间的底部缝隙气泡未消除干净。办理方法:可在两板间加入合适缓冲液,以消除气泡。带出现拖尾现象主若是样品融解收效不好或分别胶浓度过大引起的。办理方法:加样前离心;选择合适的样品缓冲液,加合适样品促溶剂;电泳缓冲液时间过长,重新配制;降低凝胶浓度。带出现纹理现象主若是样品不溶性颗粒引起的。办理方法:加样前离心;加合适样品促溶剂。溴酚蓝不能够起到指示作用实验中常会遇到溴酚蓝已跑出板底,但蛋白质却还未跑下来的现象。主要与缓冲液和分别胶的浓度相关。办理方法:更换正确pH值的Buffer;降低分别胶的浓度。电泳的条带很粗电泳中条带很粗是常有的事,主若是未浓缩好的原因。办理方法:合适增加浓缩胶的长度;保证浓缩胶贮液的pH正确();合适降低电压;电泳电压很高而电流却很低呢比方电压50v以上,可电流却在5mA以下。主若是由于电泳槽没有正确装置,电流未形成通路。包括:a.内外槽装反;b.外槽液过少;c.电泳槽底部的绝缘体未去掉(比方倒胶用的橡胶皮)。浓缩胶与分别胶断裂、板间有气泡对电泳影响一般对电泳不会有太大的影响。前者主要原因是拔梳子用力不均匀或过猛所致;后者是由于在清除制胶的夹子后,板未压紧而致空气进入引起的。12.凝胶时间不对,或慢或快平时胶在

30MIN-1H

内凝。若是凝的太慢,可能是

TEMED,APS剂量不够也许无效。

APS应该现配现用,

TEMED不牢固,易被氧化成黄色。

若是凝的太快,可能是

APS和

TEMED用量过多,此时胶太硬易裂,电泳时易烧胶。13.电泳时间比正常要长可能由于凝胶缓冲系统和电级缓冲系统地PH选择错误,即缓冲系统地PH和被分别物质的等电点差别太小,或缓冲系统的离子强度太高。分别胶加上后为什么要马上加水加入分别胶后,马上覆一层双蒸水,一是为了使分别胶界面保持水平,用水就可以把它压平,使蛋白质分子跑时在同一水平线上;二是阻拦空气中的氧气对凝胶聚合的控制作用。注意:SDS电泳要点在于胶可否制得均匀平展,自然这跟灌胶用的模具和方法有必然关系。加入TEMED和过硫酸铵后丙烯酰胺开始聚合,但是过硫酸铵易被氧化,所以操作要迅速,而且最后要液封,保证模具内不漏气才能使胶聚合的很好。同时不要把制胶用的玻璃板中间压太紧,这样

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