分子识别元件及其反应基础

分子识别元件及其反应基础第1页/共47页22.2酶及酶反应酶：由生物体产生的具有催化能力的蛋白质酶的蛋白质性质：酶的催化性质：

1）高度专一性，锁和钥匙的关系。这种关系在生物大分子的相互作用中具有普遍性第2页/共47页32.2酶及酶反应2）催化效率高，是其它催化剂的107-1013倍。

3）催化条件要温和，极端条件下会失活。

4）有些酶催化时需要辅酶

5）酶在体内的活力受多种方式调控

6）酶促反应产生多种形式的信息变化第3页/共47页42.2酶及酶反应酶量表示方法

酶活力单位IU，一个活力单位指特定条件下，1min内能转化1μM底物分子的酶量。

酶比活力，指1mg酶所具有的酶活力，单位IU/mg

酶含量指每克或每毫升酶制剂中含有的活力单位数，IU/g或IU/ml第4页/共47页52.2酶及酶反应酶的作用机理

1）降低反应活化能活化能的定义第5页/共47页62.2酶及酶反应酶的作用机理2）结构专一性

即酶只能对特定的一种或一类底物起作用，这种专一性是由酶蛋白的结构特性所决定的。可分为：

相对专一性：这类酶对结构相近的一类底物都有作用。包括族专一性和键专一性。

绝对专一性：有些酶只作用于一种底物，催化一个反应，而不作用于任何其它物质。

立体专一性：这类酶不仅要求底物有一定的化学结构，而且要求有一定立体结构。只对其中的某一种构型起作用，而不催化其他异构体。第6页/共47页72.2酶及酶反应酶的作用机理3）酶的辅助因子酶的辅因子有辅酶或辅基，其主要作用是作为电子、原子或某些基团的载体参与反应并促进整个催化过程。(1)传递电子体：如卟啉铁；(2)传递氢（递氢体）：如黄素单核苷酸（FMN）(3)金属酶：Zn2+Mg2+(4)传递碳基团：如四氢叶酸；(5)传递磷酸基：如ATP，GTP；第7页/共47页82.2酶及酶反应酶的作用机理

4）酶的活性中心酶(Enzyme)1、特殊催化能力只局限于一定区域2、活性中心往往位于凹穴处活性中心有2个功能部位：结合域催化域第8页/共47页92.2酶及酶反应酶的作用机理5）邻近效应和定向效应邻近效应：底物在活性中心的浓度极高定向效应：反应基团的分子轨道交叉，使分子间反应近似于分子内反应第9页/共47页102.2酶及酶反应酶的作用机理6）诱导契合假说催化反应第10页/共47页112.2酶及酶反应酶的作用机理7）酶催化的化学形式共价催化：形成过渡态的中间物酸碱催化：质子供体与质子受体的催化相关功能基团：羧基、氨基等E+SESE+P在中性条件下，有一半是酸形式、一半是碱形式。因此既可进行酸催化，又可进行碱催化，所以咪唑基是酶分子最有效、最活泼的一个功能基团。第11页/共47页12VmaxKm22.2酶及酶反应酶促反应的米氏动力学第12页/共47页132.2酶及酶反应酶促反应的米氏动力学

为了要解释这一现象，Michaelis&Menten提出了中间复合物学说。第13页/共47页142.2酶及酶反应酶促反应的米氏动力学

经推导后得出底物浓度与反应速度的关系方程Km——

米氏常数由于Km=(k2+k3)/k1

，∴为复合常数。

Km是酶的特征常数，经常表示酶与底物的亲和力。

Km值越大，亲和力越小。

第14页/共47页152.2酶及酶反应酶促反应的米氏动力学

酶动力学稳态期反应物质浓度变化第15页/共47页162.2酶及酶反应酶促反应的米氏动力学

Vmax·[S]V=------------------Km+[S]根据米氏方程可以说明以下关系：当[S]＜＜Km时,Vmax[S]Vmaxv=────=───[S]=K[S]KmKm

这时底物浓度低,酶没有全部被底物所饱和。第16页/共47页172.3微生物反应微生物反应的特点：

1）与酶促反应的共同点

2）特殊性第17页/共47页182.3微生物反应微生物反应的类型：

根据物质代谢流向分为：第18页/共47页192.3微生物反应微生物反应的类型：

根据对营养的要求分为：自养型异养型光能自养型：化能自养型：如：硝化细菌如：绿硫细菌动物，寄生腐生的细胞与真菌新陈代谢第19页/共47页202.3微生物反应微生物反应的类型：

根据微生物反应对氧的需求分为：新陈代谢好氧型厌氧型兼氧型枯草杆菌、青霉菌大肠杆菌、酵母菌破伤风菌第20页/共47页212.3微生物反应微生物反应的类型：细胞能量的产生与转移高能化合物：ATP来源：1）代谢物脱氢或脱水引起分子内能量重新分布，而形成的高能磷酸键转移给ADP生成ATP2）氧化磷酸化产生ATP,是指电子从NADH或FADH2经电子传递链传递给分子氧生成水,并偶联ADP和Pi生成ATP的过程。它是需氧生物合成ATP的主要途径。第21页/共47页222.3微生物反应分析微生物学：定义：利用微生物完成定量分析任务的学科1）细胞增殖法的原理2）呼吸法的原理第22页/共47页232.4免疫学反应第23页/共47页242.4免疫学反应第24页/共47页252.4免疫学反应免疫学经历了四个迅速发展阶段1876年后，多种病原菌被发现，用已灭活及减毒的病原体制成疫苗，预防多种传染病，使疫苗得以广泛发展和使用。1900年前后，抗原与抗体的发现，揭示出“抗原诱导特异抗体产生”这一免疫学的根本问题，促进了免疫化学的发展及抗体的临床应用。第25页/共47页262.4免疫学反应免疫学经历了四个迅速发展阶段

1957年后，细胞免疫学的兴起，人们理解到特异免疫是T、B淋巴细胞对抗原刺激所进行的主动免疫应答过程的结果，理解到细胞免疫和体液免疫的不同效应与协同功能。

1977年后，分子免疫学的发展，人们从分子水平理解抗原刺激与淋巴细胞应答类型的内在联系与机制。第26页/共47页272.4免疫学反应1.抗原定义:能够刺激机体产生免疫反应的物质1）免疫原性2）免疫反应性

种类：

1）天然抗原2）人工抗原3）合成抗原第27页/共47页282.4免疫学反应

理化性状:

1）物理性状：分子量较大104D以上环状比直线型免疫原性更好

2）化学组成：多数是蛋白质第28页/共47页292.4免疫学反应

抗原决定簇：抗原决定簇是抗原物质的一些化学基团。它们是免疫细胞和抗体识别的标志。不同的抗原所具有的抗原决定簇数目和分布不同。有的抗原的抗原决定簇数量多且分布在表面，有的则数量较少或分布于抗原内部。只有暴露的抗原决定簇能为免疫系统识别。第29页/共47页302.4免疫学反应2.抗体定义:抗原刺激机体产生的具有特异性免疫功能的球蛋白。

人类免疫球蛋白已发现有五大类IgG、IgA、IgM、IgD、IgE

抗体也具有抗原性第30页/共47页312.4免疫学反应

抗体结构抗体的结构-有4条多肽链的对称结构第31页/共47页322.4免疫学反应3、抗原-抗体反应：指抗原与相应抗体之间所发生的特异性结合反应。伴随产生凝聚、沉淀、溶解和促进吞噬抗原颗粒的现象。结合点位于Fab段，即抗体活性中心结合的两个条件：

1）形状互补2）电荷相反抗原抗体的结合是可逆的。第32页/共47页332.4免疫学反应4、免疫学分析：

1）沉淀法

2）放射免疫测定法

3）免疫荧光测定法

4）酶联免疫测定法第33页/共47页342.5核酸与核酸反应1、核酸组成与结构核酸的组成成分核酸有两大类：一是主要分布于细胞核中的脱氧核糖核酸(简写DNA)；另一是主要分布于细胞质中的核糖核酸(简写RNA)。它们是由许多单核苷酸组成的多聚物，核酸分子中核苷酸序列组成密码，用于储存和传输遗传信息，指导各类蛋白质合成，两类核酸的差异是组成核酸的单位——单核苷酸的化学组成不同。

第34页/共47页352.5核酸与核酸反应核苷酸组成1）嘌呤(purine)主要是鸟嘌呤(guanine,G)和腺嘌呤(adenine,A)，嘧啶(pyrimidine)主要是胞嘧啶(cytosine,C)、尿嘧啶(uracil,U)和胸腺嘧啶(thymine,T)。第35页/共47页362.5核酸与核酸反应第36页/共47页372.5核酸与核酸反应核苷酸组成1）嘌呤(purine)主要是鸟嘌呤(guanine,G)和腺嘌呤(adenine,A)，嘧啶(pyrimidine)主要是胞嘧啶(cytosine,C)、尿嘧啶(uracil,U)和胸腺嘧啶(thymine,T)。2）五碳糖3）磷酸RiboseDeoxyribose第37页/共47页382.5核酸与核酸反应DNA和RNA都含有鸟嘌呤(G)、腺嘌呤(A)和胞嘧啶(C)；胸腺嘧啶(T)一般而言只存在于DNA中，不存在于RNA中；而尿嘧啶(U)只存在于RNA中，不存在于DNA中DNA分子结构双螺旋结构1953年，Watson和Crick建立了DNA双螺旋结构模型

第38页/共47页392.5核酸与核酸反应2.DNA的变性变性：当温度升高，稳定核酸双螺旋次级键断裂，空间结构破坏，变成单链结构的过程。在解链过程中DNA分子溶液在260nm处吸收增加。解链温度Tm：是重要特征常数复性：当温度回复正常值时，变性核酸的互补链重新缔合成为双螺旋结构的过程称为复性第39页/共47页402.5核酸与核酸反应3.核酸分子杂交：了解其过程4.核酸功能：DNA功能1）自我复制：3个步骤2）自我修复：两道防线防止突变发生3）转录成mRNA第40页/共47页412.5生物传感器优点

RNA的功能三种类型：1）mRNA2）tRNA3）rRNA第41页/共47页422.6催化抗体定义：是抗体和酶的复合词，是具有催化活性的单克隆抗体。原理：优点：第42页/共47页432.7催化性核酸催化性RNA类型与结构

顺式剪切反式剪切