微生物的分类与鉴定课件

Chap.12微生物的分类和鉴定§.1通用分类单元§.2微生物在生物界的地位

§.3各大类微生物的分类系统纲要§.4微生物的鉴定

Chap.12微生物的分类和鉴定●微生物分类学（microbialtaxonomy）

●分类:在研究微生物相似性的基础上，把每一微生物编排在一定的分类单元中，制定出检索表。

●鉴定：运用现代分类系统，通过具体菌株描述，给未知物一个具体的分类位置。●命名：按照国际命名法规，给每个新的分类群一个新的学名。

（一）种的概念

●种(species)：微生物的基本分类单位，具有许多共同特征的菌株的集合。

●典型菌株（typestrain）模式种（typespecies）

●亚种

●型、菌株§.1通用分类单元●菌种保藏中心与菌种目录ATCC：美国典型菌种保藏中心CCTCC：中国典型菌种保藏中心：---下设：CCGMC、ACCC、CICC、CMCC等6个中心---菌种目录及菌种保藏和购买二、学名的命名及有关法规

●双名法：Bacillussubtilis●三名法：Acetobacterpasteurianussubsp.pasteurianus

●名字的应用：BacillussubtilisCMCC63501

BacillussubtilisCohn1874

Bacillussp.Bacillusspp.●缩写：B.subtilis§.2微生物在生物界的地位

五界系统：

●三域学说●真核生物起源的内共生学说

●古细菌生物学特征：

2.细菌的分类●《系统手册》（一版，1984~1989年，共4卷）

卷类型群（Section）主要代表Vol.1G-1~11section肠杆菌，假单孢菌，Vol.2G+12~17section芽孢杆菌，梭菌，Vol.3古生菌等18~25section甲烷菌，嗜盐菌，光合细菌Vol.4产孢放线菌26~33section链霉菌3.真菌（Fungi）的分类系统●Ainsworth系统《Thefungi》,Ainsworth,1973《AinsworthandBisby’sDictionaryoftheFungi》----7版，1983年，Hawksworth----8版，1995年，Hawksworth

一、经典分类鉴定方法（生理生化为主，形态为辅）

●通常指长期以来，在常规鉴定中普遍采用的（形态、生理、生化、生态、生活史、血清学反应等指标）

◆传统分类的细菌鉴定程序二、现代分类鉴定方法●细菌化石

二、现代分类鉴定方法1．微生物遗传型的鉴定（1）DNA碱基比例的测定（G+C）mol%：●(G+C)mol%值只能做否定判断；●（G+C）mol%值差别>5，属不同的种；差别>10，属不同的属。（2）核酸分子杂交法

DNA-DNA杂交（固相杂交法）单链DNA（待测菌株）↓转硝酸纤维素膜↓加入放射性标志参照菌DNA（单链）↓洗去未杂交DNA↓闪烁计数器计数测定放射强度结论：1.DNA同源性≥60%（同种）2.DNA同源性≥70%（同亚种）3.DNA同源性60~70%（不同亚种）4.DNA同源性20~60%（同属）●相似性结果的一般判断：1.SAB≥95%同种2.SAB为85~95%同属3.SAB≤85%不同属2．细胞化学组分的鉴定（放线菌）细胞结构成分壁肽聚糖、化学组分

膜枝菌酸（棒杆菌酸；分枝菌酸）甲基萘醌全细胞水解糖类1.细胞壁化学类型（分为9种类型）

-----氨基酸：DAP（二氨基庚二酸）

、Gly、Lys、Asp、Orn----糖类：阿拉伯糖、半乳糖（2）全细胞水解液的糖型糖类型特征糖类A半乳糖、阿拉伯糖、B马杜拉糖C无特征糖类D木糖、阿拉伯糖E半乳糖

3．数值分类法（统计分类法）------

相似系数的计算；（1）菌株选择（OUT—操作分类单位）（2）选择实验项目（3）数字编码（4）计算机分析

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列出相似度矩阵