蛋白质和的关系

蛋白质和的关系第1页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网AAAADDAAAADMH1第2页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网AADMMajorA-TAADMT-AMinorA-TT-AAAAAAADHG-CC-GG-CC-GMajorHDAAAADAADMinorThe4MajorGroovePatternsAreDistinct2第3页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网AAAADDAAAADMH1HyrdophobicGroupsonBases第4页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网3Helix-Turn-HelixMotif34Aº第5页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网34125N-term3’4第6页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网SpecificityDeterminants?GenericInteractions?5第7页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网6>104>103第8页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网Gln33NetworkswithGln44Ser∆∆G=4.5kcalLeu∆∆G=>6.2kcal7第9页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网ConclusionDNAbindingspecificityfrommajorgrooveinteractionsMutationinoneAAaffectsneighbors-->Protein-DNAinterfacescontainanintricateNetworkofhydrogenbonds第10页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网BDNA434Complex94basesdon’tcontactproteinButveryImportant!第11页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网FilterBindingvacuum%BoundProtein[nM]02040608010010050Kd=20nM10第12页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网Immunoprecipitaiton%BoundProtein[nM]02040608010010050Kd=20nM10ASepharose第13页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网Gel-Shift%ShiftedProtein[nM]02040608010010050Kd=20nM[Protein]11第14页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网DNAseIFootprinting%ProtectedProtein[nM]02040608010010050Kd=20nM[Protein]+DNAseI12第15页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网CooperativeDNAbindingBytherepressor13第16页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网InterferenceFootprintingDNA+MMS+Saturating[Protein]GelShift14第17页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网ElectronMicroscopy15第18页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网YFPTilt+RollTilt-Roll19TiltRoll第19页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网InteractionofTBP(TATABindingProtein)WithDNAMajorGrooveMinorGroove17第20页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网Protein-InducedDNABendingFromPositiveRoll185’3’第21页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网Pyrimidine-PurineStepsHaveLittleBaseStacking5’3’3’5’CGAT19A(Lecture1)第22页，共24页，2023年，2月20日，星期四免疫学信息网Foradvancedreading:

NucleicAcids:

Structures,Properties,andFunctions

V.A.Bloomfield

D.M.