蛋白质的生物合成(翻译)Protein Biosynthesis,Translation《生物化学》复习提要_第1页
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文档简介

蛋白质的生物合成(翻译)ProteinBiosynthesis,Translation概述,就是将核酸中由4密码破译的方式解读为蛋白质一级结构中20第一节蛋白质合成体系ProteinBiosynthesisSystem参与蛋白质生物合成的物质包括:RNAmRNA(messengerRNA,RNA)rRNA(ribosomalRNA,RNA)tRNA(transferRNA,转移RNA)20(AA)作为原料酶及众多蛋白因子,如、eIFGTP、无机离子一、翻译模板mRNA及遗传密码——mRNA是遗传信息的携带者。原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的mRNA多顺反子(polycistron)。mRNA单顺反子(singlecistron)。 53AUG3(tripletcodon)。起始密码(initiationcodon):AUG;终止密码(terminationcodon):UAA,UAG,UGAmRNA5端起始密码子AUG3端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读框架(open reading ORF)。遗传密码的特点:1. 连续性(commaless):编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码间既无间断也无交叉。2.简并性(degeneracy):遗传密码中,除色氨酸和甲硫氨酸仅有一个密码子外,其、、46个三联体为其编码。3. 通用性(universal):蛋白质生物合成的整套密码,从原核生物到人类都通用。已发现少数例外,如动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体。4. 摆动性(wobble):转运氨基酸的tRNA的反密码需要通过碱基互补与mRNA上的遗传密码反向配对结合,但反密码与密码间不严格遵守常见的碱基配对规律,称为摆动配对。不同细胞核蛋白体的组成核蛋白体结构模式:P位肽酰位(peptidylsite) A位氨基酰位(aminoacylsite) 原核E位排出位(exitsite)三、tRNA与氨基酸的活化(一)氨基酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNAsynthetase)第一步反应:氨基酸+ATP-E—→氨基酰-AMP-E+AMP+PPi第二步反应:氨基酰-AMP-E+tRNA 氨基-tRNA+AMP+E氨基酰-tRNAtRNA都有高度特异性。氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreadingactivity)。氨基酰-tRNA的表示方法:Ala-tRNAAla Ser-tRNASer Met-tRNAMet(二)起始肽链合成的氨基酰-tRNA真核生物:Met-tRNAiMet 原核生物:fMet-tRNAifMet第二节蛋白质生物合成过程(TheProcessof ProteinBiosynthesi(60分钟)翻译过程从阅读框架的5´-AUG开始,按mRNA模板三联体密码的顺序延长肽链,直至终止密码出现。整个翻译过程可分为:翻译的起始(initiation) 翻译的延长(elongation) 翻译的终止(termination)一、肽链合成起始:指mRNA和起始氨基酰-tRNA分别与核蛋白体结合而形成翻译起始复合物(translationalinitiationcomplex)。原核、真核生物各种起始因子的生物功能(一)原核生物翻译起始复合物形成核蛋白体大小亚基分离; mRNAS-D序列:起始氨基酰-tRNA的结合;核蛋白体大亚基结合。(二)真核生物翻译起始复合物形成核蛋白体大小亚基分离;起始氨基酰-tRNA结合;mRNA核蛋白体大亚基结合。二、肽链合成延长mRNANC止的过程。(ribosomalcycle)进位(entrance);成肽(peptidebond转位(translocation)延长因子(elongationfactor,原核生物:EF-T(EF-Tu,EF-Ts);EF-G真核生物:EF-1、EF-2(一进位又称注册(registratiomRNA-tRNA进入核蛋白体A位。核蛋白体对氨基酰-tRNA进位具有校正作用(二)成肽是由转肽酶(transpeptidase)催化的肽键形成过程。(三)转位(四)真核生物延长过程真核生物肽链合成的延长过程与原核基本相似,但有不同的反应体系和延长因子。另外,真核细胞核蛋白体没有E位,转位时卸载的tRNA直接从P位脱落。三、肽链合成的终止mRNA-tRNA中释出,mRNA核蛋白体等分离,这些过程称为肽链合成终止。终止相关的蛋白因子称为释放因子(releasefactor,RF原核生物释放因子:RF-1,RF-2,RF-3真核生物释放因子:eRF释放因子的功能:一是识别终止密码,如RF-1特异识别UAA、UAG;而RF-2可识别UAA、UGA。二是诱导转肽酶改变为酯酶活性,相当于催化肽酰基转移到水分子-OH上,使肽链从核蛋白体上释放。核蛋白体循环(广义的肽链的循环过程。翻译的能量消耗:活化:2ATP 进位:1GTP 转位:1GTP合成一个AA至少需要4 ATP多聚核蛋白体(polysome) ——使蛋白质合成高速、高进行。第三节蛋白质合成后加工和输送Posttranslational Processing&ProteinTransportation从核蛋白体释放出的新生多肽链不具备蛋白质生物活性,必需经过不同的翻译后复杂加工过程才转变为天然构象的功能蛋白。主要包括:多肽链折叠为天然的三维结构;肽链一级结构的修饰;高级结构修饰一、多肽链折叠为天然功能构象的蛋白质新生肽链的折叠在肽链合成中、合成后完成,新生肽链N端在核蛋白体上一出现,模序、结构域到形成完整空间构象。象的基础。几种有促进蛋白折叠功能的大分子:分子伴侣(molecularchaperon)(proteindisulfideisomerase,PDI)肽(peptideprolylcis-transisomerase,PPI)分子伴侣分子伴侣是细胞一类保守蛋白质,可识别肽链的非天然构象,促进各功能域和整体蛋白质的正确折叠。热休克蛋白(heatshockprotein,HSP) HSP70、HSP40和GreE族热休克蛋白促进蛋白质折叠的基本作用——结合保护待折叠多肽片段,再释放该片段进行折叠。形成HSP70和多肽片段依次结合、解离的循环。伴侣素(chaperonins)GroELGroES家族伴侣素的主要作用——为非自发性折叠蛋白质提供能折叠形成天然空间构象的微环境。蛋白二硫键异构酶多肽链内或肽链之间二硫键的正确形成对稳定分泌蛋白、膜蛋白等的天然构象十分重要,这一过程主要在细胞内质网进行。二硫键异构酶在内质网腔活性很高,可在较大区段肽链中催化错配二硫键断裂并形成正确二硫键连接,最终使蛋白质形成热力学最稳定的天然构象。肽-脯氨酰顺反异构酶多肽链中肽酰-脯氨酸间形成的肽键有顺反两种异构体,空间构象明显差别。肽酰-脯氨酰顺反异构酶可促进上述顺反两种异构体之间的转换。肽酰-脯氨酰顺反异构酶是蛋白质三维构象形成的限速酶,在肽链合成需形成顺式构型时,可使多肽在各脯氨酸弯折处形成准确折叠。二、一级结构的修饰(一)N端的修饰(二)个别氨基酸的修饰(三)三、高级结构的修饰(一)亚基聚合;(二)(三)四、蛋白质合成后的靶向输送真核生物蛋白在胞液核蛋白体上合成后的三种去向:保留在胞液;进入细胞核、线粒体或其他细胞器;分泌到体液,输送到其靶器官和靶细胞。蛋白质的靶向输送(protein挥生物功能的细胞靶部位,这一过程称为蛋白质的靶向输送。信号序列(signalsequence):所有靶向输送的蛋白质结构中存在分选信号,主要为N末端特异氨基酸序列,可引导蛋白质转移到细胞的适当靶部位,这一序列称为信号序列。(一)分泌蛋白的靶向输送真核细胞分泌蛋白等前体合成后靶向输送过程首先要进入内质网。信号肽(signalpeptide)N信号肽引导真核分泌蛋白进入内质网第四节蛋白质生物合成的干扰和抑制Interference&InhibitionofProtein Biosynthesis蛋白质生物合成是很多天然抗生素和某些毒素的作用靶点。它们就是通过阻断真核、原核生物蛋白质翻译体系某组分功能,干扰和抑制蛋白质生物合成过程而起作用的。可针对蛋白质生物合成必需的关键组分作为研究新抗菌药物的作用靶点。同时尽量利用真核、原核生物蛋白质合成体系的任何差异,以设计、筛选仅对病原微生物特效而不损害人体的药物。抗生素(antibiotic

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