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文档简介
新版细菌耐药系统V10培训讲稿当前第1页\共有53页\编于星期四\0点2部门组织结构卫计委监测中心大区监测中心大区监测中心省级监测中心省级监测中心医院医院医院医院省级监测中心医院医院省级监测中心医院医院当前第2页\共有53页\编于星期四\0点3数据上报流程示意图当前第3页\共有53页\编于星期四\0点4触发预警信息示意图当前第4页\共有53页\编于星期四\0点5监测报告信息反馈当前第5页\共有53页\编于星期四\0点6系统核心架构当前第6页\共有53页\编于星期四\0点7软件版本划分当前第7页\共有53页\编于星期四\0点8系统形式使用主流最新版浏览器直接登录无须完装任何软件当前第8页\共有53页\编于星期四\0点9系统硬件要求计算机必须连接互联网(Internet)网速至少达到1M(推荐4M)当前第9页\共有53页\编于星期四\0点10系统软件要求使用主流的最新版浏览器,支持如下版本:微软IE11浏览器(推荐)微软IE10浏览器微软IE9浏览器(不推荐)谷歌浏览器【Chrome】(推荐)火狐浏览器【Firefox】(推荐)苹果浏览器【Safari】(推荐)Opera浏览器(推荐)搜狗、百度、遨游浏览器(必须升级为最新版本)360极速浏览器(必须升级为最新版本)360安全浏览器(需要使用极速模式,不推荐)当前第10页\共有53页\编于星期四\0点11不支持的浏览器清单系统不支持低内核版本的IE浏览器或者是使用低版本IE内核的非IE浏览器具体如下:360安全浏览器(使用兼容模式)猎豹安全浏览器世界之窗浏览器QQ浏览器如果您本机已经安装了微软IE10以上版本的浏览器,您也可以使用这些浏览器。当前第11页\共有53页\编于星期四\0点12系统官方网址请牢记网站的永久域名:carss/当前第12页\共有53页\编于星期四\0点13登录系统所有系统用户均使用此方式登录,不单独区分点击页面右侧的【立即登录】按钮,如下图:当前第13页\共有53页\编于星期四\0点14输入用户名及密码后点击登录按钮当前第14页\共有53页\编于星期四\0点15使用系统前的准备工作修改原始密码补充个人资料电子邮箱确认手机号码确认本院科室维护(目前为非强制,下次升级后会变为强制)当前第15页\共有53页\编于星期四\0点16快速入门【首页】功能可以快速完成数据上报工作及时获取最新的资讯信息包括常见问题与系统升级日志将来会加入预警信息等等【本院科室】功能维护本院科室信息,专用于【WARD】字段的校验,可以理解为实现了【BacLink】的某些功能。【数据管理】功能可以对已经上报成功的数据进行管理和查看,与首页的部分功能重叠,但略有差异。【消息接收】功能可查看来自本省、本大区以及卫计委给本院发送的消息通知【个人设置】功能修改密码修改个人资料更改已绑定的电子邮箱更改已绑定的手机号码当前第16页\共有53页\编于星期四\0点17帮助功能(您的小秘书)使用手册为您提供软件如何操作与使用等等相关学习资料常见问题为您解答在您日常使用过程中所遇到的系统问题以及系统针对数据文件中的每一个字段的要求与校验规则的详细介绍。系统升级日志:您可以及时了解到系统最近的升级情况增加了哪些功能更改了哪些字段的校验规则修复了哪些错误消息当前第17页\共有53页\编于星期四\0点18数据上报相关要求上报频率:目前系统要求1个季度上报一个文件系统能接收的数据文件格式:WHONET5.6标准DBF格式,文件扩展名必须为(.DBF),否则系统不识别Office2003Excel格式,文件扩展名必须为(.XLS)Office2010Excel格式,文件扩展名必须为(.XLSX)不支持早期的Excel格式(Excel5.0/95)当前第18页\共有53页\编于星期四\0点19数据文件来源通过WHONET软件录入后,导出的DBF文件。通过LIS系统导出的符合WHONET数据标准的DBF文件或者Excel文件(推荐)通过人工录入的方式自己使用Excel表格进行管理的文件(不推荐)当前第19页\共有53页\编于星期四\0点20对于数据文件的整体校验规则系统如何判断一个文件能够上报成功系统对数据文件中的每一列都有一个最低校验通过率的要求,当所有的字段列达到这个最低要求,就可以上报成功;达不到就算上报失败。例如:系统要求【ORGANISM】字段的最低校验通过率为100%,其实也就是要求该字段不能出现任何错误,如果您上传了100条记录,其它字段都填写正确,只有【ORGANISM】字段发现了1个错误,那么这个字段的通过率为99%,但是系统要求是100%,因此整个文件都不会被接收,如果100个全填写对了,就可以上报成功,至于【ORGANISM】字段本身的校验规则,在后面会有详细介绍。当前第20页\共有53页\编于星期四\0点21系统不接收的数据系统目前只接收革兰阳性菌与革兰阴性菌,除此以外的其它细菌类型的监测数据系统不接收,例如:真菌等。系统不接收质控类标本数据,即【SPEC_TYPE】为【qc】并且【SPEC_CODE】为【75】或者【SPEC_TYPE】为【ex】并且【SPEC_CODE】为【99】的数据。以上两类数据,如果在上报的数据文件中出现,系统会把这些数据忽略,根本不去做校验。不影响每一个字段的最低通过率校验,也就是说,这些数据对文件是否上报成功一点影响都没有。当前第21页\共有53页\编于星期四\0点22每一个字段的最低校验通过率清单当前第22页\共有53页\编于星期四\0点23KB法字段填报规则填写结果只能为6至80之间的整数,否则视为填写错误,系统会将该值忽略,这会影响该列的通过率。对应的字段名应为:抗生素英文代码+“_ND”+抗生素含量例如:AMK_ND30、AMX_ND25切记:不能为(S、I、R)不能有小数不能带任何符号(.><=等等)当前第23页\共有53页\编于星期四\0点24MIC法字段填报规则对于除高浓度庆大霉素和高浓度链霉素以外的MIC法字段,系统要求只能为小数或者1、2、4、8、16、32、64、128、256、512,不在这些数字范围内的,均为非法值。可以有前导【>、<、=】符号。合法情况举例:等于纯整数数字或者小数数字:4、4.0大于或者大于等于上述两类数字:>4、>=4、>4.0、>=4.0小于或者小于等于上述两类数字:<4、<=4、<4.0、<=4.0对应的字段名应为:抗生素英文代码+“_NM”例如:AMK_NM、AMX_NM切记:不能为(S、I、R)不能为非2的平方数:6、7、99、100等等当前第24页\共有53页\编于星期四\0点25MIC法特殊字段-【GEH_NM】
高浓度庆大霉素的填写规则以下特殊规则直接替代普通MIC法的校验规则,具体如下:仅允许出现如下值:250,256,500,512,513,1000,1024,1025,不在这些数字范围内的,均为非法值,影响通过率。可以有前导【>、<、=】符号如果填写了【SYN-S】,系统将自动替换为【<=500】如果填写了【SYN-R】,则将自动替换为【>=1000】当前第25页\共有53页\编于星期四\0点26MIC法特殊字段-【STH_NM】
高浓度链霉素的填写规则以下特殊规则直接替代普通MIC法的校验规则,具体如下:仅允许出现如下值:500,512,1000,1024,2000,2048,2049,不在这些数字范围内的,均视为非法值可以有前导【>、<、=】符号如果填写了【SYN-S】,系统将自动替换为【<=1000】如果填写了【SYN-R】则将自动替换为【>=2000】当前第26页\共有53页\编于星期四\0点27MIC法字段的容错规则特殊符号≧和≥将自动转换为>=特殊符号≦和≤将自动转换为<=全角特殊符号>将自动转换为>全角特殊符号<将自动转换为<全角特殊符号=将自动转换为=全角特殊符号.将自动转换为.全角特殊符号。将自动转换为.当数字中含有斜杠时包括正反斜杠(“/”,“\”),系统会忽略斜杠后面的部分,仅保留前面的部分,例1:4/32、4.0/32、4\32、4.0\32,容错后的结果分别为:4、4.0、4、4.0例2:>4/32、>4.0/32、>4.0\32、>4.0\32,容错后的结果分别为:>4、>4.0、>4、>4.0例3:<=4/32、<=4.0/32、<=4\32、<=4.0\32,容错后的结果分别为:<=4、<=4.0、<=4、<=4.0当前第27页\共有53页\编于星期四\0点28国家字段【COUNTRY_A】系统要求校验通过率100%可以不填写,系统会自动生成【CHN】,不影响通过率如果填写了,并且填写的不是【CHN】,则系统会自动将其替换为【CHN】,不影响通过率当前第28页\共有53页\编于星期四\0点29来源字段【ORIGIN】系统要求校验通过率100%可以不填写,系统会自动生成【h】,不影响通过率如果填写了,并且填写的不是【h】,则系统会自动将其替换为【h】,不影响通过率当前第29页\共有53页\编于星期四\0点30医院字段【INSTITUT】非必填字段,最低通过率要求为0此字段为系统统一分配的国家标准代码,标准6字符前两位为国家标准省级代码(如北京为11,云南为53等),后4位为各省编码(从0001开始),例如:昆明医科大学第一附属医院可能为(530001)无须填写,数据上传后系统自动补充已注册的医院标准代码,不影响通过率若填写则必须与本院的代码一致,否则系统会自动替换为正确代码,不影响通过率。当前第30页\共有53页\编于星期四\0点31实验室字段【LABORATORY】非必填字段,最低通过率为0%最长3个字符系统不再将此作为医院标识,无具体格式要求在数据上传时此字段不建议填值如果填值,系统也不做任何校验,只要不超长,系统就会接收,不影响通过率。如果超长,则系统会给出报错信息并清空该值,不影响通过率。当前第31页\共有53页\编于星期四\0点32病历号字段【PATIENT_ID】此字段要求最长填写16字符,如果超出这个长度,系统会提示错误信息,影响通过率。此字段对于住院病历,系统要求最低通过率为95%,也就是说要至少填写95%以上。对于门诊病历,系统要求尽量填写,无论填写与不填写,系统都不做校验,并且不影响通过率。系统判断门诊病历与住院病历的准则为:【DEPARTMENT】字段所填写的值如果为【out】(代表门诊)或者【eme】(代表急诊),则系统会认为是门急诊病历,也就可以不填写【PATIENT_ID】字段。【DEPARTMENT】字段所填写的值不为【out】(代表门诊)和【eme】(代表急诊),则系统会认为是住院病历,也就要求必须填写【PATIENT_ID】字段,如果不填写,则影响通过率,当然系统在住院病历中,允许有5%的病历不填写病历号,用来应对特殊情况的出现。当前第32页\共有53页\编于星期四\0点33病人姓名字段【LAST_NAME】、【FIRST_NAME】、【FULL_NAME】【FULL_NAME】字段为必填项,并且最低填报率要达到95%【FULL_NAME】字段的最大填写长度为50个字,中英文不限。系统不要求【FIRST_NAME】和【LAST_NAME】必须填写。【FIRST_NAME】如果填写,则其最大长度不能超过20个字,中英文不限。【LAST_NAME】如果填写,则其最大长度不能超过30个字,中英文不限。容错处理:当系统发现【FULL_NAME】字段没有填写的时候,系统会自动将【LAST_NAME】与【FIRST_NAME】相加,将相加之后的结果写入【FULL_NAME】字段,但这样会提示出警告信息,影响数据的高质量数据占比,不影响通过率。例如:【LAST_NAME】填写为【张】,【FIRST_NAME】填写为【飞】,则相加后的结果【张飞】将写入【FULL_NAME】字段。本质上系统是要求这三个字段至少填写1个,整体校验通过率为95%。当前第33页\共有53页\编于星期四\0点34性别字段【SEX】字段要求必填,最低校验通过率为95%最长1个字要求只能填写“f”或者“m”容错处理:系统允许填写“男”和“女”,当发现填写了男或者女,系统会自动将“男”替换成“m”,将“女”替换成“f”。当前第34页\共有53页\编于星期四\0点35年龄字段【AGE】此字段要求必填,最低通过率为95%最长3个字符。标准规则及举例格式要求:不带任何后缀的1~3位整数或者1~2位数字+“y”后缀,代表年龄是按岁计算,例如:1、18、18y、103、1y。1~2位数字+"d"即代表年龄按天计算,例如:1d、18d、28d、99d。1~2位数字+"w"即代表年龄按周计算,例如:1w、2w、4w、99w。1~2位数字+"m"即代表年龄按月计算,例如:1m、2m、3m、99m。不符合合法标准的规则均为非法值,需要重新填写,影响通过率如下特殊情况也算做非法数据:【0】或者【0y】或者【0m】,出现这种值,对于【AGE】来说格式上是符合要求的,但是从数据规则上来说,它是不符合要求的,因为系统无法判断这个年龄到底归为【新生儿】还是【儿童】,而【新生儿】的判断标准为:<=28天,而【0、0y、0m】可以理解为<=28天,也可以理解为>=28天<=1岁,因此出现这样的结果造成系统对于【新生儿】与【儿童】的统计结果不准确。因此,一但出现这样的数据,系统会认为是非法数据,需要重新填写,影响通过率。容错处理:当填写了8.9,这种带小数的年龄,系统可以进行容错处理,系统会把8.9认为是8岁,仅保留8,不进行四舍五入。当前第35页\共有53页\编于星期四\0点36年龄类型字段【PAT_TYPE】本字段目前要求为必填项,最低校验通过率为95%并且本字段的值,是根据年龄字段【AGE】的值自动生成的,而WHONET软件生成的【PAT_TYPE】字段的值与本系统所定义的标准是有差别的,请大家参照下面的规则自行改正,本系统的具体规则如下:当年龄小于等于28天为新生儿,PAT_TYPE的值应该为:new。当年龄大于28天且小于等于14岁的为儿童,PAT_TYPE的值应该为:ped。当年龄大于14岁且小于等于65岁的为成人,PAT_TYPE的值应该为:adu。当年龄大于65岁为老年人,PAT_TYPE的值应该为:ger。当由于特殊原因不知道病人的年龄的时候,PAT_TYPE的值应该为:unk,代表未知。当前第36页\共有53页\编于星期四\0点37年龄类型字段【PAT_TYPE】
计算规则与容错规则系统可根据【AGE】字段推算出本字段的值,具体计算规则如下:当AGE字段的值后缀为d,也就是按天计算时规则:小于等于28天为新生儿也就是PAT_TYPE的值应该为:new。否则应该算做儿童:PAT_TYPE的值应该为:ped。当AGE字段的值后缀为w,也就是按周计算时规则:小于等于4周为新生儿也就是PAT_TYPE的值应该为:new。否则应该算做儿童:PAT_TYPE的值应该为:ped。当AGE字段的值后缀为m,也就是按月计算时规则:大于等于1月为儿童也就是PAT_TYPE的值应该为:ped。系统不接受0m,因为0m可能会代表28天以下或者29天、30天,此时系统无法推算PAT_TYPE的值到底应该为【新生儿new】还是【儿童ped】。当AGE字段的值后缀为y或者没有后缀时,也就是按岁计算时规则:年龄至少要填写为1或者1y,不接受0或者0y,原因同上。容错处理:只要上报的数据中【AGE】字段的值填写正确,那么无论【PAT_TYPE】字段是否填写,或者填写是否正确,系统均会根据计算结果自动替换【PAT_TYPE】字段的值,不影响通过率。如果由于【AGE】字段没有填写或者填写错误,导致系统无法推算本字段的值,则影响通过率。当前第37页\共有53页\编于星期四\0点38科室类别【WARD_TYPE】系统不要求必填,最低校验通过率为0%最大长度为3个英文字符该项如果填写,则应该填写WHONET标准代码,见系统常见问题中的【WARD_TYPE】标准字典编码。该字段无论是否填写,都不影响通过率。该字段如果填写,但是超过了3个字符,则系统会提示错误,并且清空该值,但依然不影响通过率。该字段如果填写,但是为非WHONET标准代码,则系统会提示错误,并且清空该值,但依然不影响通过率。当前第38页\共有53页\编于星期四\0点39标本编号【SPEC_NUM】本字段为必填项,最低校验通过率为100%标本编号字段的填写规则比较宽松,只要字符长度不超过30个字符就可以。如果超长,则系统会给出错误提示,这会影响通过率。当前第39页\共有53页\编于星期四\0点40标本日期【SPEC_DATE】本字段为必填项,最低校验通过率为100%!系统只接收特定的日期格式,例如2014年11月5日可以有如的表示方式:20141105(长度必须为8位)20141105或者20141152014-11-05或者2014-11-52014/11/05或者2014/11/52014年11月05日或者2014年11月5日Nov052014,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表Nov-05-2014,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表Nov/05/2014,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表05Nov2014,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表05-Nov-2014,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表05/Nov/2014,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表201405Nov,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表2014-05-Nov,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表2014/05/Nov,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表2014Nov05,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表2014-Nov-05,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表2014/Nov/05,其中Nov为英文的11月有简写,其它月份的简写请参照下面的附表错误的日期格式举例:2014115中间没有任何分隔符,并且长度不为8位,系统无法识别这到底是11月5日还是1月15日呢?当前第40页\共有53页\编于星期四\0点41《中英月份对照附表》当前第41页\共有53页\编于星期四\0点42标本类型英文代码字段【SPEC_TYPE】本字段为必填项,最低校验通过率为100%,也就是要求100%必填,不能空,否则将导致整个文件校验失败,并且被系统拒绝接收!校验规则如下:系统只接WHONET标准【标本字典】中的英文代码,具体请参照或者下载《全国细菌耐药监测网信息系统数据上报标准》文档中的《附表(3):SPEC_TYPE与SPEC_CODE对照字典》中的【SPEC_TYPE】列。除此以外的值,均为非法值,如果有一项填写错误,将导致整个文件校验失败,并且被系统拒绝接收!意外情况:如果本字段所填写值,与从【SPEC_CODE】字段所推算出来的值不匹配,则同样会导致整个文件校验失败,并且被系统拒绝接收,必须改正之后才可以重新上传,这并不仅仅是影响单列通过率的问题!例如:痰标本的英文代码为“sp”,数字代码应该对应为“3”,如果填写了其它数字代码,会导致整个文件校验失败,并且被系统拒绝接收,必须改正之后才可以重新上传!当前第42页\共有53页\编于星期四\0点43标准类型数字代码字段【SPEC_CODE】本字段为必填项,最低校验通过率为100%,也就是要求100%必填,不能空,否则将导致整个文件校验失败,并且被系统拒绝接收!校验规则如下:系统只接WHONET标准【标本字典】中的数字代码,具体请参照或者下载《全国细菌耐药监测网信息系统数据上报标准》文档中的《附表(3):SPEC_TYPE与SPEC_CODE对照字典》中的【SPEC_CODE】列。除此以外的值,均为非法值,如果有一项填写错误,将导致整个文件校验失败,并且被系统拒绝接收!意外情况:如果本字段所填写值,与从【SPEC_TYPE】字段所推算出来的值不匹配,则同样会导致整个文件校验失败,并且被系统拒绝接收,必须改正之后才可以重新上传!例如:痰标本的英文代码为“sp”,数字代码应该对应为“3”,如果填写了其它数字代码,会导致整个文件校验失败,并且被系统拒绝接收,必须改正之后才可以重新上传!容错处理:如果本字段未填写值,则系统会自动从【SPEC_TYPE】字段推算出本列的值,并且会给出警告提示,这不影响通过率,但这会影响高质量数据占比。当前第43页\共有53页\编于星期四\0点44检验结果(细菌)字段【ORGANISM】本字段为必填项,最低校验通过率为100%!具体的校验规则如下:系统只接收革兰阳性菌与革兰阴性菌,具体请参照或者下载《全国细菌耐药监测网信息系统数据上报标准》文档中的《附表(4)细菌字典》。如果填写了超出革兰阳性菌与阴性菌以外的细菌代码(也是WHONET标准细菌代码,但可能为真菌等细菌的代码),则系统会给出警告提示,并且将忽略整条记录,不予保存,不影响通过率。如果填写了系统无法识别的细菌代码(非WHONET标准细菌代码),则系统会给出错误提示,并且将忽略整条记录,不予保存,但这会影响通过率,必须改正之后才可以上传。当前第44页\共有53页\编于星期四\0点45细菌类别字段【ORG_TYPE】本字段要求必须填写,最低校验通过率为100%!目前由于本系统只接受革兰阳性细菌和革兰阴性细菌,因此这也就意味着细菌类型字段只能接受“+”或者“-”,不接受其它值。容错处理:系统在校验本字段时,会与细菌代码字段【ORGANISM】所填写的值进行比对,如果通过【ORGANISM】所填写的细菌代码推算出来的新值与本字段所填写的值不一样,则会用新值强制替换本字段原来所填写的值,如果本字段没有填写任何值,则系统也会自动将其填写为推算出来的新值,发生以上两种情况,均不会影响通过率,从另外一个角度来看,其实您可以不填写该字段的值,但是这样会产生警告信息,影响高质量数据占比。当前第45页\共有53页\编于星期四\0点46特殊字段的填写规则以下字段的填写规则均一样:β-内酰胺酶【BETA_LACT】超广谱β-内酰胺酶【ESBL】耐甲氧西林葡萄球菌检测试验【MRSA_SCRN】诱导型克林霉素耐药试验【INDUC_CLI】霍奇试验【HODGE】碳青酶烯酶【CARBAPENEM】规则如下:这些字段均非必填字段,最低校验通过率为0%最大长度1字符,且值仅能为“+”或“-”容错处理:若填写为“n”、“ne”、“neg”、“negative”或者中文全角“-”,系统会自动将其修正为半角英文“-”若填写为“p”、“po”、“pos”、“positive”或者中文全角“+”,系统会自动将其修正为半角英文“+”。当前第46页\共有53页\编于星期四\0点47报告日
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