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Lecture8-1MetabolicRegulation(Regulationofgeneexpression)When,where,howmuchshouldproteinbeWhatistrueforE.coliisalsotrueforelephant,onlymoresoCanE.colicellschoosetheirfavoredfood?Ifglucoseandlactosearebothavailable,E.coliwillutilizeglucosefirst.Onlyafterallglucosehasbeenusedup,canlactosebeusedascarbonsource.Onlyafterglucosehasbeenusedup,b-galactosidasewillbeproducedMajormodesofRegulationisthechangeinamountandactivityofproteins(enzymes)Rateofsynthesisofproteinscanchangeover1000foldrangeActivitychangeofThThThTheproducproducproductooofgengengeneAiiisenzymenzymenzymewhicwhicwhichiiisdycarriecarrierriesououutititisreactionreaction.EnzymEnzymeBalsalsosynthesizesynthesizedconstitutivelconstitutivelybubutsactivitciiycanbeinhibited.ThesynthesisoftheproductofgeneCcanbepreventedbycontrolatthelevelofTheproductofgeneAisenzymeA,whichissynthesizedconstitutivelyandcarriesoutitsreaction.EnzymeBisalsosynthesizedconstitutivelybutitsactivitycanbeinhibited.ThesynthesisoftheproductofgeneCcanbepreventedbycontrolattheleveloftranslation.ThesynthesisoftheproductofgeneDcanbepreventedbycontrolattheleveloftranscriptionRegulationofEnzymeActivity(Posttranslationallevelregulation)Noncovalentenzymeinhibition酶活FeedbackinhibitionoccursprimarilyintheregulationofentirebiosyntheticpathwaysEndproductinhibitsactivityofthefirstenzymeFigure:08-
Theactivityofthefirstenzymeofthepathwayisinhibitedbytheendproduct,thuscontrollingproductionofendAnallostericenzymehastwobindingsitesAnallostericenzymehastwobindingsitestheActivesite,wherethesubstratebinds,andtheAllostericsite,wheretheinhibitorbindsFeedbackinhibitioninabranchedbiosyntheticN-acetylglutamatesynthaseAGS)乙酰谷氨酸合成酶andg-glutamylkinase(GK)谷氨酰激酶Isozymesasawayof-aromaticaminoacidThesynthesisofaromaticaminoacidscontainsThesynthesisofaromaticaminoacidscontainsthreeisozymesofDAHPsynthetase.Eachenzymesisspecificallyfeedback-inhibitedbyoneofthearomaticaminoacids.CovalentModificationofSomeenzymescanberegulatedbybeingcovalentlymodified,usuallybyadditionordeletionofsomesmallorganicmolecule. AdenylylatedGSsubunitsareinactive,sotheoverallGSactivitydecreasesasmoresubunitsareadenylylated.Anyremainingunadenylylatedsubunitsremainactivebuttheyhaveincreasedsensitivitytofeedbackinhibition.DNA-BindingProteinsandRegulationofTranscriptionbyNegativeandPositiveControl(Transcriptionallevelregulation)Evidencesshowingthein ction/bindingofproteinswithDNAProteinbindsDNAatspecificsequenceManyDNA-bindingproteinsaredimers.ThespecificDNAsequencesthat ctwiththeproteinareinvertedrepeats.Figure:Figure:8-Thehelix-turn-helixstructureofsomeDNAbindingproteins螺旋-转角-螺旋结Figure:Figure:08-Therecognitionhelixcanin ctsspecificallywithDNA.Therecognitionhelixislinkedtothreeaminoacids.Thestabilizinghelixstabilizesthefirsthelixbyin hydrophobicallywithit.EukaryoticDNAbindingproteinsThezincfingerstructure锌指结构TheaminoacidsholdingtheZn2+ionalwaysincludeatleasttwocysteineresidues(C)withtheotherresiduesbeinghistidine(H).(a-Helicesarerepresentedbycylinde
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