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文档简介
第四章翻译——从mRNA到蛋白质4.1遗传密码和遗传信息的翻译系统4.2蛋白质合成的过程4.3蛋白质合成的干扰和抑制4.4蛋白质的运转机制Chapter4:Translation4.2蛋白质合成的过程
4.2.1氨基酸的活化转运4.2.2核蛋白体循环
4.2.3真核生物与原核生物蛋白质合成的异同4.2.4翻译后加工
4.2.1氨基酸的活化转运氨基酸的活化:氨基酰tRNA合成酶来催化的。
活化:
aa+ATP+E*氨基酰-AMP-E+PPi
转移:氨基酰-AMP-E+tRNAaa-tRNA+AMP+E氨基酸的活化必需组分:20种氨基酸20种氨酰-tRNA合成酶20种或更多的tRNAATP,Mg2+4.2.2核蛋白体循环
以原核生物中蛋白质合成为例,将核蛋白体循环人为地分为起始、肽链延长和终止三个阶段。
4.2.2.1肽链的起始
4.2.2.2肽链的延长4.2.2.3肽链的终止4.2.2.1肽链的起始
肽链的起始必需组分:mRNAN-甲酰甲硫氨酰-tRNA(fMet-tRNAfMet)mRNA上的起始密码子(AUG)30S核糖体小亚基50S核糖体大亚基GTP,Mg2+起始因子(IF-1,IF-2,IF-3)
起始因子(initiationfactor,IF)参与蛋白质起始复合物的形成。IF-1:促进IF-2和IF-3的活化。IF-2:促进fmet-tRNAfmet与30S小亚基结合的作用,并有依赖核糖体的GTP酶活。IF-3:使30S亚基释放,辅助mRNA与小亚基结合,并阻止大小亚基重新聚合。起始复合物的形成:
(1)IF-3和核糖体30SrRNA结合使16SRNA和mRNA的SD序列结合a.使30S保持游离b.形成起始复合体I(2)IF-2+GTP+氨酰甲硫氨酸中间复合体。(3)IF-1置换出IF-3,50S亚基可和30S亚基结合。(4)50S+30S复合体III,释放IF-1,IF-2。Initiationprokaryotes4.2.2.2肽链的延长
肽链的延长必需组分:功能核糖体(起始复合物)AA-tRNA延长因子(elongationfactor,EF)GTP,Mg2+
肽基转移酶延长因子(elongationfactor,IF)
EF-Tu:与氨酰-tRNA及GTP结合形成EF-Tu.GTP.AA-tRNA,将氨酰tRNA转入A位,但它不能识别fmet-tRNA。
EF-Ts:在GTP供能时,使EF-Tu.GDP转变为EF-Tu.GTP.
EF-G:依赖于核糖体的GTPase,使GTP水解,并有移位酶作用。肽链的延长具体过程包括:
进位转肽脱落移位以后肽链上每增加一个氨基酸残基,就按:①进位(新的氨基酸tRNA进入“A位”)②转肽(形成新的肽键)③脱落(转肽后“P位”上的tRNA脱落)④移位(核蛋白体挪动的同时,原处于“A位”带有肽链的tRNA随之转到“P位”)
4.2.2.3肽链的终止
肽链的终止必需组分:ATPmRNA上的终止密码子释放因子(RF-1,RF-2,RF-3)终止因子(terminationfactor,TF)又称为释放因子(releasefactor,RF)
功能是识别mRNA上的终止密码子,终止肽链的合成并释放出肽链。
RF-1:识别密码子UAA及UAG
RF-2:UAA及UGA
RF-3:结合GTP,并促进RF-1及RF-2与核糖体的结合。
参与原核生物蛋白质合成的一些因子
作用阶段因子作用
起动
IF1使带氨基酰的tRNA与小亚基结合
IF2同上,并具有GTP酶活性
IF3促进小亚基与mRNA特异结合,在终止阶段促使已脱落的核蛋白体解离为亚基
延伸FTu、EFTs促进氨基酰tRNA进入核蛋白体的“受体”具有GTP酶的活性
EFG
终止
RF
识别终止信号,使大亚基团转肽酶将“给位”上已合成的多肽链水解释放具有GTP酶的活性,使转肽后,失去肽链(或蛋氨酰)的tRNA,从“给位”上脱落,并促进移位4.2.3真核生物与原核生物蛋白质合成的异同
4.2.3.1
mRNA
4.2.3.2核蛋白体4.2.3.3tRNA4.2.3.4合成过程4.2.3.2核蛋白体真核生物的核蛋白体(80S)大于原核生物。小亚基为40S含有一种rRNA(18SrRNA);大亚基为60S,含有3种rRNA(28SrRNA、5.5SrRNA和5SrRNA),所含的核蛋白体蛋白质亦多于原核生物。原核生物小亚基16SrRNA的3′末端有一富含嘧啶的区段,可与其mRNA启动部位富含嘌呤的SD区互补结合。在真核生物相应的rRNA(18SrRNA)中,无此互补区。
4.2.3.3tRNA真核生物起着启动作用的氨基酸tRNA为不需要甲酰化的Met-tRNAMet。原核生物中为fMet-tRNAfMet,系Met-tRNAfMet经蛋氨酰tRNA转甲酰基酸催化后的产物。4.2.3.4合成过程启动真核生物的启动因子(eIF)有9-10种,真核生物核蛋白小亚基先与Met-tRNAMet结合,再与mRNA结合,此时需要一分子ATP。肽链延长真核生物中催化氨基酸tRNA进入受体的延长因子只有一种(EFT1)。催化肽酰tRNA移位的因子称为EFT2,可为白喉毒素所抑制。终止真核生物只需一种终止因子(RF),此终止因子可识别3种终止密码子,并需要三磷酸鸟苷。原核生物的终止因子有3种。哺乳动物类等真核生物线粒体中,存在着自DNA到RNA及各种有关因子的蛋白合成体系,以合成线粒体的某些多肽。该体系类似原核生物蛋白合成体系。4.2.4翻译后加工
4.2.4.1
高级结构的修饰
4.2.4.2一级产物的修饰4.2.4.3蛋白质合成的靶向输送
4.2.4.1
高级结构的修饰
折叠:蛋白立体构象的生成需要折叠,有分子伴侣,二硫键异构酶及肽链顺反异构酶等参与。
亚基聚合:具有四级结构的蛋白质由两条以上的肽链通过非共价键聚合,形成寡聚体,各亚基虽自有独立功能,但又必须相依存,才得以发挥作用。
辅基连接:蛋白质分为纯蛋白及结合蛋白两大类,糖蛋白、脂蛋白及各种带有辅酶的酶,都是常见的重要结合蛋白质。
4.2.4.2
一级产物的修饰
去除N-甲酰基或N-蛋氨酸天然蛋白质大多数不以蛋氨酸为N端第一位氨基酸。细胞内的脱甲酰基酶或氨基肽酶可以除去N-甲酰基,N-末端蛋氨酸或N-末端的一段肽。个别氨基酸的修饰磷酸化(核糖体蛋白质)、糖基化(糖蛋白)、甲基化(组蛋白及肌肉蛋白质)、羟基化(胶原蛋白)和羧基化。水解修饰无活性的酶原转变为有活性的酶,常需要去掉一部分肽链。
4.2.4.3蛋白质合成的靶向输送靶向输送:蛋白质合成后,定向地到达其执行功能的目标地点。分泌性蛋白的合成过程实际是和其他蛋白质基本一样的。但其mRNA往往要有一段疏水氨基酸较多的肽编码,这段肽称为信号肽,其作用是把合成的蛋白质转移到内质网,剪切下信号肽,然后把合成的蛋白质送出胞外。
4.3蛋白质合成的干扰和抑制
4.3.1抗生素4.3.2干扰蛋白质生物合成的生物活性物质
4.3.1抗生素4.3.1.1
四环素
4.3.1.2氯霉素4
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