DB42-T 2215-2024 甘蓝型油菜品种真实性及其实质性派生品种MNP鉴定法

DB42DB42/T2215—2024甘蓝型油菜品种真实性及其实质性派生品种MNP鉴定法Rapeseedvarietiesauthenticityandessentialderivedvarieties—MNPtestmethod2024-03-26发布2024-05-26实施湖北省市场监督管理局发布I III 1 1 1 1 2 2 2 3 5本文件按照GB/T1.1—2020《标准化本文件实施应用中的疑问，可咨询湖北省农业农村厅，联系电话邮箱：1本文件规定了油菜品种鉴定多核苷酸多态性（multiplenucleotidepolymorphism,本文件适用于甘蓝型油菜（BrassicanapusL.）3.3平均覆盖倍数averagecoverage检出的标记位点detectedm利用多重聚合酶链式反应扩增(PCR)和二代高通量测序，获得样品基因组上的MNP标记位点的多态25.17.1操作要求按多重PCR扩增与文库构建试剂盒的说明书进行DNA质控、多重PCR扩增、文库构建与纯化。高通量测序的平均覆盖倍数设置为700倍以上，测序拼接后完整长度大于标记引物7.6测序数据质量控制38.1结果计算GS——待测品种与对照品种的遗传相似度（%8.2结果判定4当待测品种与对照品种的遗传相似度（GS8.3结果表述例1：待测品种A与对照品种B比较位点数为502，差异位点数为2，遗例3：待测品种A与对照品种B比较位点数为487，差异位点数为1525序号体1GGGTTTGCATGTTTAATAAAAACTGTGTGTGTATGGTTCG2ACCAGCCAAACACAAAAGACTAATTTATATCAGAGGTTTTCTCCTC3TGTTGCCTCTAAGTTTCAACGGATATTCTCACATTAGCTACTC4TCCAATTACCGATACAAGAGACTGCAAAGTCTCCCACACTGGAAA5AAATAAAATTCAGTTTCTAATGCGATTTC6TATCTAGGGAAGTTCTAACA7GATACGAAGTTTTCAAATCAGTAAATAGAAGTGTAGTCAATTATTGTTG8ATAAAATGTGGAAAGCAAACCAAAATACTTAAATGGAGAGATTCGA9AAGTACGTCTCCGATGAATGACGTTTGATTGCCTTCAGTACGTCTTTCTGTAATCACATCGCGAAAACAAACCGAAATTCTGAAAATCGGATGAAAAGCAGACCTACGTGAGATTCTCTCTTTCTAAATAAAATAATCACGCAAGTCACAATACATCAAATTCTCACTAACATGATCCAATGATTGATTGAGCTCTGAACCGAACTTGAAGCAAAATTAGTGTTTCAATCATTATGAATGTGTCTACCACGGGAATTCAAAGAAATTCCGACATTTGGAGAACCTATAGAGCGGAATAAATGTTGAAGAAGTATGGCTGCTGTTCAAAGTGTTCCAATCAAATCAAATCAAAT6序号体CATTGGTACGTTAGTTTATAGAATTTCATTGTCAGACTGTGTTAACGATCACAGCATATAACTTCATGTATGCAAAGCACAAAGACAACAATACCAGCTTCAAATGGAGTTTAGATCCCGAATGAAGTCGAAGATAAGACCGAACTTTTTGAAAAAGTTTGAGGCAATTGTTCTAACAAACCTTGAAAATGTCTCGGAGGATCCATTATAAAAGCATTGTCTGTGCAATTTAATCCACGAATTCAAATTTATGATGAGCAGCTCCAGTGATACATCTCCTCGCATAAGCGGTAGTGAGAAAGAAAGTTCGTTACAAACTATGACAGATGTGAACGTATAGCTAACATCATTTAGATAGACGATTTTACAAGCGACAATTGATAGTTGGTGAACTTTTATATGCAAATGTTTACTTCTTTAAAAGGGCTATCATTAGTAAAGAGTCTTTAAGTACCTCAACTGTCCACTGGCAATACGTAATTGATTTATTTCACTCGTTTTCATATACAACTCAGAGACTTGAAAGCCTTTCTTTTTAGACTCTATTTCTGTGGGAATTTTAGACTTGCGCAAAATTATTTTTGATTTTTGAATTATATTGGAGTATTTTTTGTGAAAGGGTTTAAACAACTCAAAAATCCTTCCAGATGTTACATAAGTTAAGAGATTCTTCAAATAGAAGTTCATGAGAAGTGAACATTATTGGTCATTCATCCCTGAATCGCGTGATAGC7序号体ACATTTATACCCGTGCTGGAAAAGATCATATCAGCTAAATTTTGAGCCTTCCTAGTAAATGCATATGCATAGCTTCGGTGGACTAACCAGCGATCGCTTCCAGATATTTTACAACTTTATAACATGTATTCGACATGTTTTGCAATACTATGTTTCCGACCTGAGATCTCTAGACATTTAATCAGTGTGAATCTGGCTTTATTTGGTGTTGATTAACCATGTGTTCTTTTTAGATGGTTTAATTTTCTCTTTTCCAAATCTGTAAATTTGAGAGGATTATGGAATTGATTTTGTGATGACTTCTACGTGATTATGAGATGAAACAAGAATTCCAACGCTCTTTAGTTGCAATTGAAATGCACCGTTCATAGTTCCTATCCAAAAGCTCTAATAATAATGGATCATGCATTTAGGCATTACTATTTGATCGAAAACGATCGATTTCAAAAGAGTCTTAGAGTGGTATCACTACAATAAATATGCAATTCATGATCTGAATTCCATAGAGAAACTAGGTGAATCTCAAGAATCCACGAATGGATATTCTTTCTGATAGTGTGATGCATGTAAAATCATTAATTGAAAATCTTGCATGACAACTGGCATATACTGACATCTGTTGAGTATACAAGTACTTTACTAGGGGAAAACAAGTTAAAAGTCATTTAATCCTTTAAGAACCCAAACTAAGGCAAGACACAATTTATCAATTCTAGTTTCTTGTTTTCAGTGAACATTTTGGTAGAATTGTTGAATGGTCAGTAACCTTATACTTGAA8序号体AGCAAAAGCCATGTAACCATTATATTTCATTAACCCTCGAGAGACTCTTCTAAATCGTTTTGGTTATGAATGATTTAGTGATTGTTGTCTCAGCTAGAAATACGACTCTGAACGTAGAGGAATTTACATGGTGAAACATAAATTTGCAAGCCTAAAGCAAAAATAAAAGATCAAGAAAAATTATGATGGCGATTTTGCTCAAAATCCATAGAAAAGTACAAGACAACGGTTCATTTCAAAAATATGTCAACTTTCAAGGCCTAAAGAATACCATAATATTTTAAATGGCCATGTTTCATCATTCATTTCATCCAACGGCTTTTAGCCCATAATATATTCAGAAACTGCCGACATGTCTTATTAATGTTAGCCCTATGAATAGTCGATCCTATTAACATAGACAAGTCTGGGAATATGTTCACTACAAAATGACCACGGCGCGAATCTTAACCTAGTTTGTCAATATAATCATCTTCAACCATATGATTGTTTGGATAAACTCTCTTAACACATGATCATCCATGTTTTATGCCCTTACAGTGCCTATACAGTCTAAGTGAACCTTGATATCAAAACTTCCAATTCAGACAACCGTTTTCATCATTAATTTGCAGAAAGATGGAGTTGTTGAAGTGCACCAAAATAGAATCATCGTATTATGTCCAACTTTTTCATGGAGTTTTGCTGAAATAATAGAGTGGAGTTGGAGAAATTTTTACTGGAGAGAAATAGAGTAAGAA9序号体AAGCTGACTTAGGATTTGTGAAACTTAATAGTTTGTGGTGCTCCATTCAATTTTTGTTTGATTTGTTTCCAATCTCATTTGGTTTCTAAACAGCCATAACCACAAACAAAGGTGATGATTGTTTCGCCTATTAGCCCAATTCAAATAAAACCTCATAATTCGATCATAGCTAAATGTCTAGAGTTCTTTTTCTTAGTTGCCAGAAAACATCACGAAAATGTATCACCATAAGAAGAAACCAACAAGCACTTCATGTATTAAAATATCCACTACGGTTTTACTCTAAGGAGGAAACTAACACATTAAAAAATCTCAACAAATATGAGAGAGTTTTACTAAGCAAGATGATGATATGAGCTTATAAAGCTTTTGGAACATCAAATTTGGTGTGAGATGGGATGTTACATTAAAATTCAAAGAACCTTTTGAACCCACCCAAATGATTAGCAAGATGCGAGAAAATGAGTGGACCATAAATTTTTGTCTTACGGAGAACTTATTCACTCATGCATAATTTTTGGACTGTAAGGTAGACAAGACAACTTTCTCAACTAACAGAATGATTCAGGAGAGACAAACGATAGCAAGCTATGAGGAGAAATTTTTTCTTATTCCTTCGTTGCATAACTTAGCATGATACATCTTGTGTTTCTTTACAAAAACGATACGGTAAACAGCCAAATTTTAAAGTACTTTTTCAATTTGTTACGGTTGATCGCTATATCACATGTACTTACGTTAATAGATTTGGTGGTGATAGGAGAAACATAAAACTTGTGCTCTTAAACAAACTCACCCAACAATTTGAGAATGATTGGAATTGGAACGGATGAACCATGTCAAAAGACTCAA序号体AGAACGAAATTACAAGCAAATAGTTCAGCTGACAAAGATGTCGTGTATAATGGTTTACGTTTTTGTTGTCTGTGCTACTTCGTGTAGTTCATAATGTCATCATCGAAAGCTATATGATCTTCATACATCACGTTAGCCGGACTAGTATATCATATTCTTGTCGAGACTACAACAGAATCAGTGGATGAGTTTCAAAAACTCGGTGCAGATTTATTCTTTGACGTAGAATCCGTCAACTTTCTAAAATATACCATTGACAAGATGCTTGATGAATTCATCATTTATGACTGGACAAACAAATATTTTATCACAGAGAAAAAGCACCATTGAATCGACCTTTTACACGCTAATCTCTCCGAAATTTGACCTCTTACAATTAAGACATGAAGATTTTCTTACATAAGCCTTCAAACTTCTTGTTTTGATGCAATAAGCGTACATGATATTAATTAATTTCCAGTGGCATAATCTGTAAGTAGGTTATATTTGGATATTTTCTCTCTGTTTAATGCTTAATAGGAAGTTTTAAGAGGGCATGCACCCCTCCCACATCTAAACTGGTACAGATAATTGTGGTCACTATCGCATAACTCTGAATTTTTAACGGAGTCGCAAGAAAAATAACAGTGTGATACAGTCCTCCACTTTTTGTTAATGGGCTTAACACTTGTTTTAATTTTTGTGCCATTGTTTTTTTCTAAAGACTCTCTCTTATGAAATTCATGCAATGTTTCATTCTTTCC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