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文档简介

基因集富集分析

GSEA

(Gene-setenrichmentanalysis)

2021.08.11一种是基于筛选的差异基因

另一种是不筛选差异基因,预定义的基因集A,自己的表达数据集B(排序)。富集分析:图片来源:

MolOmics.2019;15(1):50-58.

Geneexpressionprofile-baseddrugscreenidentifiesSAHAasanoveltreatmentforNAFLD†每一条垂直线表示基因集中的一个基因。

ES:代表基因集下基因在排序列表的顶部或底部被过表达的程度。

图片来源:FrontOncol.2020;18;10:591356.

DevelopmentofaNovelAutophagy-RelatedPrognosticSignatureandNomogramforHepatocellularCarcinoma累计的ES

归一化后的ES

FDRq-val是多重假设检验矫正后的p值

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