基因组技术与精准医学备课讲稿

基因组技术与精准医学IlluminaHiSeq系列测序仪（高通量系列）有大量的临床样本需要非常高的通量临床癌基因组测序肿瘤异质性三代测序技术：PacificBiosciences单分子测序仪最新版本的PB，可以最长测到20Kb准确率也大幅提高。1Gb价格8000元左右，建高精准库要5000元以上。微生物基因组人类基因组测序费用2016年基本达到1000美元测一套人类基因组（30倍覆盖率）2017年基本达到100美元测一套人类基因组（30倍覆盖率）生物信息学:解码基因组的学科应用计算机和信息学技术解释DNA里面蕴含的基因信息。AGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGT生物信息学(bioinformatics)应用计算机和信息学技术解释DNA里面蕴含的基因信息。AGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTGene1Gene2Gene3单核苷酸多态性(SNP)分析

SingleNucleotidePolymorphism/Indel正常人遗传病患者GAC(Asp/D)天冬氨酸GCC(Ala/A)丙氨酸SNV点突变检测Insertion/deletion(indel)检测1、2、3basesindel，一般小于10个碱基的，称为indel非3的倍数的indel，会导致读码框的改变，更为致病精准医学应用的范畴医疗临床诊断技术（体细胞突变检测，Somaticmutation）通过检测DNA突变，实现对疾病的诊断辅助生殖与第三代试管（生殖细胞突变检测,Germlinemutation）降低先天性出生缺陷，提高试管成功率基因组大健康（易感基因突变检测,Predisposinggene）预测发病风险，疾病防控肿瘤精准治疗精准用药、化疗各类基因检测产业的发展阶段赚钱中…亏本中…烧钱中…观望中…政府出手规范市场行业标准重新洗牌2016/11/01

来源：银河证券2016/11/01

来源：银河证券精准医学应用的范畴医疗临床诊断技术（体细胞突变检测，Somaticmutation）通过检测DNA突变，实现对疾病的诊断辅助生殖与第三代试管（生殖细胞突变检测,Germlinemutation）降低先天性出生缺陷，提高试管成功率基因组大健康（易感基因突变检测,Predisposinggene）预测发病风险，疾病防控以肿瘤为代表的疾病精准治疗精准用药、化疗精准医学是基因组数据与基因组技术共同驱动的结果辅助临床诊断类基因检测——单基因遗传病单基因遗传病特点传统检测方法染色体原位杂交AFLPPCR-RFLPPCR-SSCP现代检测方法二代测序（WGS、WES）特点：低效确诊率低高胱氨酸尿症（homocystinuria）阜外医院；编号：AD387；男孩临床症状：高挑身材；细长手指；萎缩纹患者父母均正常全外显子测序发现患者CBS（胱硫醚β-合酶）基因存在复合杂合突变（compoundheterozygote）来自父亲的突变为NM_000071.2:c.1359-1G>C，位于剪接受体区（spliceacceptor）

来自母亲的突变为NM_000071.2:c.749T>A，造成250位甲硫氨酸突变为赖氨酸（MET250LYS）初期怀疑为马凡氏综合征（Marfansyndrome）扩张性心肌病（Dilatedcardiomyopathy）阜外医院；编号：HJ30；男孩临床症状：扩张性心肌病患者父母均正常检测结果:发现符合临床症状的疑似致病基因突变检测到的基因突变:[命名方式遵从HGVS国际规范(/mutnomen/)]DOLK(NM_014908.3);c.1413G>C;p.Lys471Asn

杂合，疑似致病突变DOLK(NM_014908.3);c.1617G>C;p.Ter539TyrextTer28杂合，疑似致病突变结果解释:1.检测到受检者DOLK基因的一个杂合错义突变和一个杂合终止密码子突变。2．DOLK基因突变可引起扩张性心肌病，以常染色体隐性的方式遗传。临床突变解读:DOLK(NM_014908.3:c.1413G>C;p.Lys471Asn)杂合，疑似致病突变。该突变为错义突变（预期造成编码蛋白第471位氨基酸由Lys变为Asn），突变遗传自受检者母亲。统计学分析预测该突变为有害突变（PolyPhen=0.999；SIFT=0），且该位点保守性较高（GERP=3.57，AF=0）。DOLK(NM_014908.3:c.1617G>C;p.Ter539TyrextTer28)杂合，疑似致病突变。该突变为终止密码子突变（预期造成编码蛋白不能够正常终止），突变遗传自受检者父亲。突变分别来自受检者父母，形成复合杂合突变。综合考虑，认为这两个突变为疑似致病突变。限制性心肌病（RestrictiveCardiomyopathy）阜外医院；编号：HJ23；男孩临床症状：限制性心肌病；心房扑动；右心房扩张受检者父亲：房颤，右心房扩张受检者祖母：房颤检测结果:发现符合临床症状的疑似致病基因突变检测到的基因突变:[命名方式遵从HGVS国际规范(/mutnomen/)]FLNC(NM_001127487.1)Exon40;c.6790G>A;p.Val2264Met杂合，疑似致病突变FLNC(NM_001127487.1)剪接区;c.7463-5C>T;杂合，未知突变结果解释:1.检测到受检者FLNC基因的一个杂合错义突变和一个剪接区杂合突变。2．FLNC基因突变可引起限制性心肌病，以常染色体显性的方式遗传，杂合突变的患者有50%的几率将致病突变传递给子代。患者父母的其它亲属亦具有携带相同致病突变的风险。临床突变解读:FLNC(NM_001127487.1)Exon40:c.6790G>A;p.Val2264Met杂合，常染色体显性遗传。该突变为错义突变（预期造成编码蛋白第2264位氨基酸由Val变为Met），突变遗传自受检者父亲，受检者祖母同样携带此突变。统计学分析预测该突变为有害突变（PolyPhen=0.999；SIFT=0），且该位点为保守位点（GERP=4.86）。文献报道显示该基因产物在1624或2160位置的氨基酸突变会造成限制性心肌病，症状为心房扩张[1]。综合考虑，认为该突变为疑似致病突变。此外，该受检者还存在一个遗传自母亲的FLNC基因剪接区的杂合突变（AF=0.00174），有可能造成受检者的情况比父亲和祖母更严重。通过全外发现罕见遗传病（raregeneticdisorder）的致病基因主要目的主要方法临床外显子组测序（CES）家系全外（trio-CES）vs病人全外（prohand-CES）文章结论：总体诊断率26%；其中trio-CES31%，

prohand-CES22%。大健康：易感基因检测

遗传风险评估癌症易感(predeposited)基因筛查癌症易感基因筛查结果CHEK2全基因测序已知SNP位点样品的变异位点中度风险的基因CHEK2，这个基因旁边的相关癌症清单很长：女性乳腺癌、男性乳腺癌、结肠癌、前列腺炎、甲状腺癌、肾癌、子宫癌肾近曲小管上皮细胞尿酸盐由血液向尿液运输基因尿酸盐由尿液向血液逆向运输基因尿液血液发生突变的尿酸盐运输基因阴离子阴离子尿酸盐尿酸盐尿酸盐

高血尿酸症及痛风发生的分子机理

肾小管上皮细胞中负责尿酸盐运输的基因发生突变，可以导致尿酸盐在血液和尿液之间的运输效率降低，从而引起尿酸在血液中的积累，导致高血尿酸症以及诱发痛风。精准医疗：痛风基因检测原理介绍HGPRT基因缺陷60余个基因的100余个变异位点与痛风发生相关应用全基因组关联分析(GWAS)在14万名欧美和1万名汉族高血尿酸症和痛风患者中的研究，发现60余个基因的100余个变异位点，与高血尿酸症和痛风的发生有关。这些基因的变异位点将作为痛风基因检测的分子标记，可采用基因分析设备对痛风病患的基因突变类型进行分析。正常人的葡萄糖激酶调节基因GCKR的DNA序列痛风病人的测序结果发现GCKR发生了T到C的变异即单核苷酸多态性(SNP)痛风基因检测原理介绍常见肿瘤与慢病易感基因检测检测项目检测内容男性高发肿瘤易感基因检测肺癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、食管癌、胰腺癌、胶质瘤、肾癌、膀胱癌、前列腺癌女性高发肿瘤易感基因检测肺癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、食管癌、甲状腺癌、乳腺癌、宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌心脑血管疾病易感基因检测心肌梗死、脑卒中、高血压、高血脂“四高”易感基因检测高血压、高血脂、高血糖、高尿酸常见慢病易感基因检测肺癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、食管癌、胰腺癌、胶质瘤、肾癌、膀胱癌、甲状腺癌、前列腺癌、乳腺癌、宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌、高血压、高血脂、高血糖、高尿酸、心肌梗死、脑卒中、肥胖、阿尔兹海默症、抑郁症唇腭裂基因筛查、风险评估与孕前营养预防综合征型(染色体异常)、非综合征型(遗传缺陷)唇腭裂唇裂(“兔唇”)、腭裂(“狼咽”)、唇腭裂并发单侧腭裂、双侧腭裂、隐性腭裂按发病程度分为Io、IIo、IIIo中国1.8‰vs.欧美0.6‰

维族3.1‰vs.汉族1.8‰唇腭裂在中国人群的高发生率是遗传基础(基因变异)的差异，还是孕期营养管理不善所致？能否通过对孕妇的精准营养管理，降低新生儿唇腭裂发生率？能否通过对夫妻双方的唇腭裂基因筛查，预测新生儿唇腭裂的遗传风险？能否通过对唇腭裂患儿的基因筛查，提高患儿术后恢复效果？唇腭裂易感基因筛查的临床意义唇腭裂由60-70%遗传因素和20-30%环境因素导致汉族、维族病例与对照样本选择500名亚洲正常人（对照组）100名汉族唇腭裂（病例组）200名维族正常人（对照组）300名维族唇腭裂（病例组）对43个SNP标记（20个唇腭裂易感基因）在对照和病例组进行基因型分析分析方法计算43个风险基因标记在病历与对照组的分布频率计算每个标记的OR值、确认风险基因型与保护基因型建立唇腭裂易感基因的遗传风险评估模型建立罗杰斯蒂回归模型对某一样品进行分类单个标记预测效力的评估、建立最小标记集合从已发表的GWAS数据筛选43个标记重点关注风险突变的纯和基因型频率变化IRF6基因的rs642961风险突变的频率在对照与病例组变化显著唇腭裂对照组汉族人群维族人群风险基因型频率1.9%19.4%风险型等位基因：A保护性等位基因：G汉族唇腭裂遗传风险评估模型相对风险概率相对风险概率唇腭裂对照组1-Specificity

相对风险概率是绝对风险系数在对照人群中的排序位置

维族唇腭裂遗传风险评估模型相对风险概率相对风险概率1-Specificity对照组唇腭裂在维族群体中，43个标记对唇腭裂和对照组的区分效果不是很显著，可能主要是由于标记在汉族和维族群体中的差异所致罗杰斯蒂回归模型分类效果明显应用了七种机器学习的方法进行分类预测，其中罗杰斯蒂回归表现最好标记逐步递增方法对分类效果评估其他胚胎发育相关已知基因叶酸代谢途径基因维生素代谢途径基因雄性激素响应相关基因风险基因型

ACGTGACGGGTAGGTCAC正常基因型

ACGTGACGAGTAGGTCAC根据SNP标记设计基因检测探针取样口腔内壁擦拭获取少量细胞，提取DNA就医产检唇腭裂患儿、孕妇、备孕夫妻24个唇腭裂易感基因标记筛查基因检测G:AG:G唇腭裂易感基因筛查应用模式指导建议风险评估唇腭裂基因检测报告罗杰斯蒂回归发病概率预测遗传风险评估与因素分析叶酸代谢基因参与唇腭裂的发生rs1801133,667位置的C->T非同义突变，导致Ala->Val氨基酸改变

携带TT纯和风险基因型的人会有，高同型半胱氨酸、低叶酸、低B12的症状携带TT风险突变的孕妇极可能是由于叶酸的供应不足导致胎儿唇腭裂的发生，以及引起神经管缺陷、先天性心脏病、唇腭裂、妊娠期高血压疾病，自发性流产5-甲基四氢叶酸盐(L-甲基叶酸盐)100%level正常CC风险CTTT10%水平65%水平folicacidtomethylfolate四氢叶酸叶酸维生素A代谢基因参与唇腭裂的发生(2011)NutritionReviewsVol.69(10):613–624视黄醇结合蛋白RBPretinolbindingproteinrs10882272(RBP4)风险突变：CC携带CC突变的孕妇血清RBP蛋白运输维生素A的能力，以及胎儿吸收维生素A的能力都有可能大幅降低，从而诱发唇腭裂的发生RBP4在唇腭裂中的分子机制尚无报道RBP4风险突变可导致先天性眼失明作者建议：RBP4基因缺陷孕妇，可考虑用视黄醛或视黄酯替代维生素A唇腭裂基因筛查应用范畴婚前：直系或旁系家族成员中有唇腭裂病史的未婚男女男女双方基因检测，估算唇腭裂出生概率区间给予婚配建议，购买生育险等孕前：头胎为唇腭裂患儿，想继续生育第二胎的家庭患儿、夫妻双方基因检测，推测遗传与环境因素比例给予二胎怀孕建议，科学营养管理，积极防范，B超重点筛查孕期：高龄产妇、妊娠呕吐等反应剧烈者夫妻双方基因检测，估算唇腭裂出生概率区间科学营养管理，积极防范，B超重点筛查孕期：3~6个月B超疑似唇腭裂胎儿胎儿DNA基因检测，进一步确认，重点筛查产后：夫妻双方为唇腭裂风险基因携带者新生儿DNA基因检测，排除隐性腭裂风险治疗：确诊为唇腭裂患儿，建立精确序列治疗方案排除隐性腭裂，确认唇腭裂类型和等级，建立术后骨愈合营养方案精准用药基因检测药物不良反应的严峻状况05

2015年全国药品不良反应监测网络收到新的和严重药品不良反应/事件报告:显示过去10年之间我国的药物不良反应报告数目一直是处于增长状态。什么是药物不良反应？WHO（联合国世界卫生组织）对于药物不良反应的定义为“预防、诊断或治疗疾病，或为改善生理功能而服用适当剂量药物所引起的有害的、非预期的或治疗上不需要的反应。

指合格的药品在正常用法用量下出现的与用药目的无关或意外的有害反应。0405环境因素药物相互作用遗传变异在药物毒性发生中的作用环节药物毒性遗传变异细胞靶点代谢转运体药物基因组学基因组药物学或基因组药理学，是药理学或基因组学的一个分支。它是研究基因组或基因变异对药物在人体内吸收、代谢、疗效及不良反应产生影响的现象及其机制，从而指导新药开发和合理用药的一门新学科。06基因检测和药物吸收的关系——药物基因组学药物A无效、有毒副作用有效精准分类药物B药物A有效有效基因检测传统医学和现代医学的区别0708卫生部关于印发《医疗机构临床检验项目目录》的通知卫医发〔2007〕180号

各省、自治区、直辖市卫生厅局，新疆生产建设兵团卫生局：为加强对医疗机构临床实验室管理，提高临床检验水平，保证医疗质量和医疗安全，根据《医疗机构临床实验室管理办法》（卫医发[2006]73号）的规定，医疗机构临床实验室应当按照卫生部规定的临床检验项目和临床检验方法开展临床检验工作。基因检测指导用药在我国的开展情况肿瘤亚型分类与靶向药用药指导我国卫计委于今年7月发布《肿瘤个体化治疗检测技术指南（试行）》，推荐肿瘤患者治疗前进行基因检测，指导医生用药方案抗栓治疗的个体化用药之“氯吡格雷”心和泰检测项