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文档简介

现代分子生物学重要名词解释大全分子生物学以核酸、蛋白质等生物大分子的结构、功能及相互作用为核心,揭示生命活动的分子机制。以下是该领域关键名词的专业解释,涵盖基础理论、技术方法及前沿应用,为科研、教学及产业应用提供实用参考。一、核酸与基因基础1.DNA(脱氧核糖核酸)由脱氧核苷酸(含A、T、C、G四种碱基)通过磷酸二酯键连接形成的双链大分子,典型结构为双螺旋(Watson-Crick模型):两条反向平行的链通过碱基互补配对(A-T、G-C)稳定结合,磷酸-脱氧核糖骨架位于外侧,碱基对堆叠于内部。作为绝大多数生物的遗传物质,DNA存储、传递遗传信息,决定生物的表型、发育过程及功能特性,其复制确保遗传信息的世代传递,突变则为进化提供原材料。2.RNA(核糖核酸)单链核酸分子,核苷酸含核糖(取代DNA的脱氧核糖),碱基为A、U、C、G(U取代DNA的T)。功能高度多样化:mRNA(信使RNA)传递DNA的遗传信息,指导蛋白质合成;tRNA(转运RNA)通过反密码子识别mRNA的密码子,转运特定氨基酸至核糖体;rRNA(核糖体RNA)与蛋白质构成核糖体,是翻译的“分子机器”;非编码RNA(ncRNA)(如miRNA、lncRNA)则在基因表达调控、染色质重塑等过程中发挥核心作用。部分病毒(如HIV、新冠病毒)以RNA为遗传物质。3.基因组(Genome)细胞或生物体的全套遗传物质(DNA或RNA),包含编码基因、非编码序列(如调控元件、重复序列)及结构元件(如端粒、着丝粒)。原核生物基因组通常为环状、连续的DNA分子,结构相对简单;真核生物基因组(如人类)则高度复杂,包含大量内含子、重复序列(如转座子),其大小、结构与生物的进化地位、功能复杂性相关。基因组学研究基因组的结构、功能及演化规律,为疾病机制、物种进化等研究提供基础。4.基因(Gene)遗传信息的功能单位,通常包含:①编码区:转录为mRNA并翻译为蛋白质(或直接转录为功能RNA,如tRNA、rRNA);②调控区:如启动子、增强子,调控转录的时空特异性。基因通过转录(DNA→RNA)和翻译(RNA→蛋白质,或RNA直接发挥功能)实现对生物性状(如酶活性、结构蛋白组成)的控制,其突变或表达异常与疾病(如肿瘤、遗传病)密切相关。5.等位基因(Allele)同源染色体(或同源DNA片段)相同位置上,控制同一性状的不同基因形式。源于基因突变,例如人类ABO血型系统中,IA、IB、i为等位基因:IA和IB为显性,i为隐性,不同组合决定血型表型(A型、B型、AB型、O型)。等位基因的多样性是遗传变异和生物表型多样性的基础,也是群体遗传学、遗传病诊断的核心研究对象。6.基因突变(GeneMutation)DNA序列的可遗传改变,包括:①点突变:单个碱基的替换(如A→G)、插入或缺失,可导致密码子改变(错义、无义、移码突变);②片段突变:DNA片段的重复、倒位、易位或大片段缺失/插入。突变可自发产生(如DNA复制错误),或由诱变剂(如紫外线、化学致癌物)诱导。多数突变无表型效应,但部分可导致疾病(如肿瘤的驱动突变、镰状细胞贫血的点突变),或为生物进化提供原材料。遗传物质的重新组合过程,包括:①自然重组:减数分裂时同源染色体的交叉互换(产生配子的遗传多样性)、细菌的转化/转导/接合;②人工重组:基因工程中通过限制性内切酶、连接酶等工具,将外源基因与载体DNA拼接(如重组质粒构建)。基因重组是生物进化、育种(如杂交育种、基因编辑育种)及基因治疗的核心机制,可大幅增加遗传多样性或实现特定基因的功能改造。二、基因表达与调控1.中心法则(CentralDogma)遗传信息的传递规律:DNA通过转录(DNA→RNA)将信息传递给RNA,RNA通过翻译(RNA→蛋白质)合成具有功能的蛋白质;部分RNA病毒(如HIV)可通过逆转录(RNA→DNA)将遗传信息整合到宿主基因组;朊病毒(如疯牛病病原体)则可能通过蛋白质构象改变实现“蛋白质→蛋白质”的信息传递(争议性假说)。中心法则是分子生物学的核心理论,描述了遗传信息从存储到功能实现的路径。2.转录(Transcription)以DNA的一条链为模板,在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程,分为三个阶段:①起始:RNA聚合酶结合启动子(如真核的TATA盒、原核的-10/-35区),DNA双链局部解旋;②延伸:RNA聚合酶沿DNA模板移动,以核糖核苷酸为原料合成RNA链(5’→3’方向);③终止:RNA聚合酶识别终止信号,释放RNA和DNA模板。转录产物包括mRNA(编码蛋白质)、tRNA(转运氨基酸)、rRNA(构成核糖体)及ncRNA(调控基因表达),是基因表达的第一步,决定基因表达的时空特异性。3.翻译(Translation)以mRNA为模板,在核糖体、tRNA参与下合成蛋白质的过程:①起始:核糖体小亚基结合mRNA的起始密码子(AUG),tRNA携带甲硫氨酸(真核)或甲酰甲硫氨酸(原核)与之配对;②延伸:核糖体沿mRNA移动,tRNA依次识别密码子、转运氨基酸,肽酰转移酶催化肽键形成,多肽链逐步延长;③终止:核糖体识别终止密码子(UAA、UAG、UGA),释放因子结合并终止翻译,多肽链折叠为功能蛋白。翻译是遗传信息“解码”为蛋白质的关键步骤,密码子(mRNA的三联体碱基)与氨基酸的对应关系(遗传密码表)具有通用性(少数例外)。4.启动子(Promoter)DNA上RNA聚合酶结合并启动转录的特定区域,含保守的核心序列(如真核的TATA盒、原核的Pribnow盒)。启动子决定转录的起始位点和基础转录效率,是基因表达调控的核心元件:强启动子(如CMV启动子)可驱动基因高效表达,弱启动子则维持低水平转录。启动子的序列变异(如SNP)可影响基因表达,与疾病易感性相关。5.增强子(Enhancer)远距离调控转录的顺式作用元件,通常位于基因上游、下游或内含子中,可结合转录因子(如激活蛋白),通过染色质环化与启动子互作,大幅增强转录效率。增强子的活性具有组织特异性和时空特异性(如胰岛素基因的增强子仅在胰岛β细胞中激活),是基因表达精准调控的关键(如胚胎发育中细胞分化的基因调控)。6.沉默子(Silencer)抑制基因转录的DNA元件,通过结合阻遏蛋白(如转录抑制因子),改变染色质结构或干扰转录复合物组装,降低转录效率。沉默子参与基因表达的负调控,维持细胞功能的特异性(如造血干细胞中,红细胞相关基因的沉默子抑制其在其他细胞中表达)。7.操纵子(Operon)原核生物中功能相关基因的成簇组织形式,包含:①结构基因:多个功能相关的基因(如乳糖操纵子的lacZ、lacY、lacA),共享同一启动子和终止子;②调控序列:如操纵基因(operator,阻遏蛋白结合位点)、启动子。操纵子通过阻遏-诱导机制调控:无诱导物(如乳糖)时,阻遏蛋白结合操纵基因,抑制转录;有诱导物时,阻遏蛋白构象改变,脱离操纵基因,转录启动(如乳糖操纵子在乳糖存在时表达,分解乳糖供能)。操纵子是原核生物适应环境的高效基因调控方式。8.外显子(Exon)真核基因中编码蛋白质或功能RNA的DNA序列,转录后经剪接保留在成熟RNA中,通过剪接与其他外显子连接,形成连续的编码区(如mRNA的开放阅读框)。外显子的可变剪接(同一基因产生多种mRNA异构体)是真核生物蛋白质组多样性的重要来源(如人类基因约90%存在可变剪接)。9.内含子(Intron)真核基因中不编码的间隔序列,转录后被剪接体识别并切除,不参与成熟RNA的编码。内含子的存在增加了基因的复杂性,其序列变异可影响剪接效率(导致疾病,如脊髓性肌萎缩的剪接异常)。部分内含子含调控元件(如增强子),或可通过“自剪接”(核酶)去除(如四膜虫的rRNA内含子)。10.剪接体(Spliceosome)由snRNA(小核RNA)和蛋白质组成的大分子复合物,识别内含子的5’剪接位点(GU)、3’剪接位点(AG)及分支点(A),催化RNA剪接:①内含子形成套索结构;②外显子连接,内含子被切除。剪接体的异常(如snRNA突变、蛋白质组分失调)可导致剪接错误,与肿瘤、神经疾病(如脊髓性肌萎缩)密切相关。11.转录因子(TranscriptionFactor,TF)结合DNA调控序列(如启动子、增强子)的蛋白质,通过以下方式调控转录:①招募RNA聚合酶或转录辅助因子(如共激活因子),促进转录起始;②改变染色质结构(如招募组蛋白修饰酶),激活或抑制转录。转录因子分通用转录因子(如TFIID,参与所有基因的基础转录)和特异转录因子(如MyoD,仅调控肌肉发育相关基因),是基因表达时空特异性的核心调控者(如胚胎发育中细胞分化的基因调控网络)。12.顺式作用元件(Cis-actingElement)位于同一条DNA分子上的调控序列(如启动子、增强子、沉默子、操纵基因),仅调控同-DNA分子上的基因表达,是转录调控的“DNA基础”。顺式作用元件的序列变异(如SNP、插入/缺失)可直接影响基因表达,与疾病易感性、表型变异相关。13.反式作用因子(Trans-actingFactor)由其他基因编码、通过扩散(如核孔运输)结合顺式作用元件的蛋白质(如转录因子、RNA结合蛋白),可调控不同DNA分子上的基因表达。反式作用因子是转录调控的“蛋白质执行者”,其表达或活性的改变(如磷酸化、泛素化)可广泛影响基因网络,参与细胞信号转导、环境适应等过程。三、RNA与非编码RNA1.mRNA(信使RNA)携带DNA遗传信息、指导蛋白质合成的RNA分子。转录后需经加工:①5’端加帽(m7GpppN),保护RNA、促进核糖体结合;②3’端加尾(多聚腺苷酸,polyA),增加稳定性、促进核输出;③剪接(去除内含子、连接外显子),形成成熟mRNA。mRNA的半衰期较短(数分钟至数小时),其丰度直接反映基因的转录活性,是基因表达分析的核心靶标(如RNA-seq、RT-PCR)。2.tRNA(转运RNA)含反密码子、负责转运氨基酸至核糖体的RNA分子,二级结构呈“三叶草形”(含氨基酸臂、反密码子环、DHU环等),三级结构为“L形”。每种tRNA对应一种氨基酸(由氨酰-tRNA合成酶催化加载),通过反密码子与mRNA的密码子碱基配对(wobble原则,允许密码子-反密码子的非严格配对),确保翻译的准确性(如G-U配对)。3.rRNA(核糖体RNA)构成核糖体的RNA分子,原核生物含16S(小亚基)、23S和5S(大亚基)rRNA,真核生物含18S(小亚基)、28S、5.8S和5S(大亚基)rRNA。rRNA与核糖体蛋白(如S10、L24)共同构成核糖体的“催化核心”,其中肽酰转移酶活性由rRNA(核酶)提供,是翻译过程中肽键形成的关键。4.cDNA(互补DNA)以mRNA为模板,经逆转录酶催化合成的DNA分子,不含内含子(仅保留编码序列)。cDNA是基因克隆、表达分析的核心工具:①构建cDNA文库(含某组织/细胞的全部编码基因),用于筛选功能基因;②通过RT-PCR扩增,定量基因表达(如qPCR检测mRNA丰度);③作为重组蛋白表达的模板(如原核表达载体中的cDNA)。5.ncRNA(非编码RNA)不编码蛋白质的RNA分子,长度从数十nt(如miRNA)到数万nt(如lncRNA),功能涵盖基因表达调控、RNA加工、染色质重塑等。根据长度,ncRNA分为:①短ncRNA(<200nt):如miRNA、siRNA、piRNA(调控转座子沉默);②长ncRNA(>200nt):如lncRNA、circRNA。ncRNA的异常表达与肿瘤、神经疾病、发育畸形等密切相关,是当前研究热点。6.miRNA(微小RNA)长度约22nt的单链非编码RNA,由基因组的非编码区转录,经Drosha(核内)、Dicer(胞质)加工为成熟体。miRNA通过种子序列(5’端2-8nt)与靶mRNA的3’UTR互补结合,抑制翻译或促进mRNA降解,调控细胞增殖、分化、凋亡等过程(如let-7调控细胞周期,miR-122调控肝脏代谢)。miRNA的异常表达是肿瘤、心血管疾病的重要驱动因素。7.siRNA(小干扰RNA)长度约21-23nt的双链RNA,可通过转染(如脂质体)或病毒载体导入细胞,触发RNA干扰(RNAi):siRNA与Argonaute蛋白结合形成RISC复合物,解旋后以正义链为模板,识别并切割互补的靶mRNA,实现基因沉默。siRNA是基因功能研究的经典工具(如敲低特定基因),也用于抗病毒(如HIV)、抗肿瘤治疗的研发。8.lncRNA(长链非编码RNA)长度>200nt的单链RNA,结构类似mRNA(含5’帽、polyA尾),但无开放阅读框。lncRNA通过多种机制调控基因表达:①顺式调控:结合邻近基因的启动子,调控其转录;②反式调控:作为“分子海绵”结合miRNA,解除其对靶基因的抑制;③染色质重塑:与组蛋白修饰酶、DNA甲基转移酶互作,调控染

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