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文档简介
血缘关系调查方案一、概述
血缘关系调查方案旨在通过科学、系统的方法,对个体间的遗传关系进行验证或分析。本方案适用于个人隐私调查、基因亲子鉴定辅助、遗传病溯源等场景,确保调查过程客观、准确、合规。调查需遵循伦理原则,保护当事人隐私,避免信息泄露。
二、调查准备
(一)明确调查目的
1.验证亲子关系:确认个体间的遗传联系,适用于法律或个人需求。
2.遗传病溯源:分析家族遗传史,辅助医学咨询。
3.个人身份确认:用于非法律场景的基因关系验证。
(二)准备调查材料
1.调查对象信息:姓名、年龄、联系方式等基础资料。
2.样本采集需求:血液、唾液或口腔拭子等生物样本,确保样本质量。
3.伦理授权文件:如需第三方参与,需提供书面同意书。
三、调查流程
(一)样本采集
1.选择采集方式:
(1)血液采集:适用于实验室检测,精度较高。
(2)唾液采集:操作简便,适用于家庭自测。
2.采集步骤:
(1)消毒采集工具(如采血针、拭子)。
(2)按规范采集样本(血液3-5ml,唾液1-2ml)。
(3)标记样本管并记录采集时间。
(二)样本检测
1.实验室检测流程:
(1)样本前处理:DNA提取与纯化。
(2)PCR扩增:针对STR(短串联重复序列)位点进行扩增。
(3)电泳分析:通过毛细管电泳分离扩增产物。
2.数据分析:
(1)比对等位基因频率。
(2)计算亲缘系数(如父权指数、母权指数)。
(三)结果报告
1.报告内容:
(1)调查结论(如“确认父子关系”或“遗传相似度XX%”)。
(2)数据支持(STR位点比对结果)。
2.交付方式:电子版或纸质报告,确保保密性。
四、注意事项
(一)伦理合规
1.严格保密:调查过程及结果仅向授权方透露。
2.避免诱导:不得以利益或威胁方式促使调查对象配合。
(二)样本处理
1.保存条件:样本需冷藏保存(血液-20℃冷冻,唾液4℃保存24小时)。
2.样本运输:使用合规包装(防漏、防污染)。
(三)结果解读
1.专业指导:建议由遗传咨询师解释结果。
2.误差控制:STR位点重复性高,误判率低于0.1%。
五、质量控制
(一)设备校准
1.定期校准电泳仪、PCR仪等关键设备。
2.使用标准品验证检测灵敏度。
(二)人员培训
1.实验室人员需持证上岗。
2.每季度进行操作考核。
(三)流程追溯
1.记录样本全流程信息(采集-检测-报告)。
2.建立电子档案备查。
**一、概述**
血缘关系调查方案旨在通过科学、系统的方法,对个体间的遗传关系进行验证或分析。本方案适用于个人隐私调查、基因亲子鉴定辅助、遗传病溯源等场景,确保调查过程客观、准确、合规。调查需遵循伦理原则,保护当事人隐私,避免信息泄露。方案的成功实施依赖于严谨的流程设计、专业的技术支持和严格的质量控制。其核心目标是提供可靠的遗传关系证据,满足委托方的特定需求。
**二、调查准备**
(一)明确调查目的
1.验证亲子关系:确认个体间的遗传联系,适用于法律或个人需求。例如,在非婚生子女认领、遗产分配前的身份确认、个人对遗传特征的追溯等场景。调查结果可为后续的法律文书、家庭关系调整或医学咨询提供依据。
2.遗传病溯源:分析家族遗传史,辅助医学咨询。通过调查家族成员间的遗传关系,识别遗传病的高风险个体,为早期筛查和预防提供信息支持。适用于常染色体显性遗传病、隐性遗传病等的初步筛查路径规划。
3.个人身份确认:用于非法律场景的基因关系验证。例如,个人对家族谱系中亲属关系的疑问进行核实,或对已知的家族遗传特征进行个体确认,以增进对自身遗传背景的理解。
(二)准备调查材料
1.调查对象信息:收集并核实所有参与调查个体的基本信息,包括但不限于姓名(可用编码代替)、性别、出生日期、联系方式(仅限调查联络)、以及与调查目的相关的简要背景描述。确保信息的准确性和完整性,为后续样本匹配和结果追溯提供基础。
2.样本采集需求:明确所需生物样本的类型、数量和质量标准。常用样本包括血液、唾液或口腔拭子。血液样本(通常需3-5ml,具体依检测项目而定)适用于需要高精度检测的场景;唾液样本(通常收集1-2ml唾液)采集操作简便,对被采集者干扰小,适用于家庭自测或初步筛查。需明确样本的采集容器(如含有EDTA的抗凝管、无RNA酶的收集管)、保存条件(如血液需-20℃冷冻,唾液需4℃保存24小时内送检,或根据具体要求干燥处理)和运输要求(使用符合生物样本运输标准的包装盒,确保防漏、防污染、保温)。
3.伦理授权文件:若调查涉及第三方或未成年人,必须获取书面授权同意书。授权书需明确说明调查目的、样本用途、保密措施、潜在风险及受益,并由被授权人(如监护人)亲笔签名。对于成年参与者,需确保其充分理解调查内容并自愿同意参与。所有授权文件需妥善保管,作为合规操作的证明。
**三、调查流程**
(一)样本采集
1.选择采集方式:
(1)血液采集:适用于实验室检测,精度较高。适用于需要高分辨率STR分型或进行复杂遗传分析的场景。操作步骤需由专业人员在符合生物安全级别的环境中进行。
-准备工作:核对受采集者信息,准备采血针、消毒棉签(75%酒精)、抗凝管、采血巾、止血带等。检查所有耗材是否在有效期内且包装完好。
-核对身份:再次确认受采集者身份信息。
-消毒操作部位:选择手臂内侧或前臂静脉,用酒精棉签按从内到外螺旋式消毒,待酒精挥发。
-戴无菌手套:进行无菌操作。
-采血:用止血带适当加压,采用标准采血技术(如静脉穿刺法)抽取所需血量,注意避免气泡混入。
-处理样本:立即将血液注入抗凝管,轻轻混匀,避免剧烈震荡。按需分装至多个样本管(用于不同检测项目或备份),清晰标记样本管(包含编码、姓名、采集日期、采集者等信息),记录采集时间、地点和操作人员。
-止血与包扎:用无菌棉签按压穿刺点,松紧适宜,直至血液不再流出,然后用创可贴或纱布包扎。
(2)唾液采集:操作简便,适用于家庭自测或对隐私要求较高的场景。适用于STR位点检测的初步筛查。
-准备工作:准备无RNA酶的唾液收集管(如含促凝剂或吸附棉棒的管子)、消毒漱口水(可选)、一次性纸巾、标记笔。
-指导受采集者:告知其采集要求,如采集前避免吸烟、饮食至少30分钟、用清水漱口(不含漱口水)。
-采集唾液:受采集者坐在舒适位置,放松,用舌头搅动口腔壁(脸颊内、上下颚)约2-3分钟,鼓起腮帮,将收集到的唾液(通常需1-2ml,以能湿润棉棒或达到管内指示线为准)吐入收集管中。确保唾液不含食物残渣或鼻涕。
-处理样本:若管内有棉棒,需旋转混匀唾液;若无,轻轻颠倒收集管数次。按指示将样本充分混匀或让棉棒充分吸收。盖紧管盖,清晰标记(包含编码、姓名、采集日期、采集者等信息)。
-保存与运输:根据要求保存(如室温下立即送检或冷藏),使用合规包装运输。
2.采集步骤:
(1)消毒采集工具:所有接触皮肤或样本的工具必须使用75%酒精或相应消毒剂彻底消毒,并确保完全干燥后再使用,防止交叉污染。
(2)按规范采集样本:
-血液采集:遵循无菌操作原则,穿刺深度和角度适宜,避免损伤神经血管。抽取血量精确,记录实际抽取量。
-唾液采集:指导受采集者正确漱口和吐唾液,避免气泡混入,确保样本量达到要求。
(3)标记样本管并记录采集时间:使用防水标记笔或专用标签,在样本管上清晰、永久地记录唯一编码(用于匿名化处理)、姓名(或编码)、性别、出生日期、采集日期时间、采集地点、采集人员等信息。同时,在调查记录表上同步记录这些信息,确保样本信息与记录一一对应。采集完成后,立即拍照存档样本外观及标记情况。
(二)样本检测
1.实验室检测流程:
(1)样本前处理:这是保证检测准确性的关键步骤。
-提取DNA:根据样本类型(血液需白细胞裂解,唾液需去除细胞杂质),采用合适的DNA提取试剂盒或方法(如柱式提取、试剂盒法),从样本中纯化高质量的基因组DNA。检查DNA浓度和纯度(如通过核酸蛋白测定仪检测OD260/280值),合格的DNA用于后续扩增。记录提取日期、操作人员和DNA质量参数。
-精确定量:使用Qubit、NanoDrop等设备精确测定DNA浓度,确保扩增反应中模板量适宜(通常为10-100ng),避免抑制或假阴性。
(2)PCR扩增:利用聚合酶链式反应(PCR)技术特异性地扩增DNA样本中目标STR位点(短串联重复序列)。
-设计引物:针对每个待测STR位点设计特异性引物,这些引物序列需已知且经过验证。
-配置PCR反应体系:包含提取的DNA模板、引物对、dNTPs(脱氧核糖核苷三磷酸)、PCR缓冲液(含Mg²⁺)、DNA聚合酶(如Taq酶)。体系需优化,确保扩增效率。
-进行PCR扩增:在PCR仪上设置扩增程序(包括变性、退火、延伸三个基本步骤,以及循环次数等参数)。常用的扩增程序条件可能为:95℃预变性5分钟;然后进行30-35个循环,每个循环包括:95℃变性30秒,XX℃退火30秒(XX℃根据引物Tm值设定),72℃延伸1分钟(或按模板长度调整);最后72℃延伸10分钟。PCR产物通常在6-10个循环后达到平台期。
-检测扩增效果:可通过凝胶电泳或QPCR检测PCR产物的大小和量,确认目标片段是否成功扩增,以及扩增产物是否单一、无杂带。
(3)电泳分析:将PCR产物进行分离和检测,以确定每个STR位点上重复序列的个数(等位基因)。
-准备电泳系统:组装好毛细管电泳仪,检查缓冲液pH值和离子强度是否符合要求。
-加样:将PCR产物与含有荧光标记引物的混合物(如GeneScan™或同样配套的混合物)混合,上样至毛细管中。通常每个样本会设置内对照(Ladder)和空白对照。
-电泳分离:设定电泳参数(电压、时间),在缓冲液作用下,不同大小的荧光标记片段会按大小顺序迁移。
-检测与成像:使用荧光检测器和成像系统捕获电泳过程中的荧光信号。通常使用FITC(绿色)、HEX(橙色)、NED(红色)等不同荧光标记的引物,可以在同一毛细管中同时检测多个STR位点。
-数据采集:记录每个样本在每个STR位点上的等位基因峰型图。
2.数据分析:
(1)比对等位基因频率:将检测到的样本等位基因与数据库中的参考等位基因频率数据(如国际标准数据库CODIS或本地区人群数据库)进行比对。对于个体识别,主要关注个体本身的STR型谱;对于亲缘关系鉴定,则需比较多个STR位点上的等位基因组合。
(2)计算亲缘系数:对于亲子鉴定等场景,需计算亲权指数(PI)和累积亲权指数(CPI)。根据父/母已知STR型谱和子代检测到的型谱,利用遗传学统计方法计算每个可能的父/母来源的亲权指数。例如,若子代在某位点为13/15,父代为13/18,母代为5/15,则需分别计算子代型谱由父代13/15和母代5/15组合的概率,以及由父代13/18和母代5/15组合的概率,并选取概率更高的来源计算PI。最终通过所有位点数据的乘积得到CPI。若CPI值大于99.99%或99.999%,则可认定父子(女)关系;若CPI较低,则关系不被支持。
(3)计算遗传相似度:对于非亲子关系的亲缘关系鉴定(如兄弟姐妹、祖孙、表亲等),可计算共享等位基因对(SAlleles)数量或遗传距离(如DS值),以量化个体间的遗传相似程度。例如,同卵双生遗传相似度接近100%,而随机个体间的相似度通常较低。
(三)结果报告
1.报告内容:
(1)调查结论:清晰、明确地给出最终结论。例如,“根据STR分型结果,样本A(子代)与样本B(疑似父亲)的遗传信息符合父系遗传规律,支持父子关系;或‘样本C与样本D的遗传相似度较低,不支持亲缘关系’;或‘根据家族谱系信息及遗传检测,样本E与已知遗传病风险基因型存在关联,建议进行进一步医学咨询’。”结论需基于可靠的数据分析,避免模糊不清的表述。
(2)数据支持:提供详细的检测数据作为结论的依据。包括但不限于:
-所有检测的STR位点列表。
-每个样本在每个位点检测到的等位基因(以峰图或表格形式展示)。
-参考数据库来源(若适用)。
-关键计算结果,如亲权指数、累积亲权指数、遗传相似度值等。
-任何异常结果或需要特别说明的情况(如发现混合峰、等位基因缺失等)。
2.交付方式:根据委托方需求选择合适的报告形式。
-电子版:可通过加密邮件、安全文件传输平台或云存储服务发送。文件需设置密码或数字签名,确保传输和阅读过程的安全性。
-纸质版:打印在专用保密纸张上,通过机要或专人递送方式送达。报告需加封,并由签收人签字确认。
3.结果解读指导:在报告中可附上简要的解读说明,解释关键术语(如等位基因、基因型、亲权指数)和结论的意义。同时,强烈建议委托方或报告接收方咨询专业的遗传咨询师或相关领域的专家,以全面理解和应用调查结果。
四、注意事项
(一)伦理合规
1.严格保密:调查过程中的所有信息,包括样本信息、检测数据、分析结果、参与者身份等,均需严格保密。未经授权,不得向任何第三方泄露。建立完善的保密制度和数据访问权限管理机制。对参与人员签署的授权书进行审核,确保其具有法律效力且内容符合伦理要求。
2.避免诱导:在调查过程中,不得以任何形式(如金钱、利益、威胁、欺骗)诱导或强迫任何调查对象参与或提供样本。需确保所有参与者的参与是完全自愿的,并已充分了解调查的目的、流程、风险和权益。
(二)样本处理
1.保存条件:样本在采集后至检测前的保存条件至关重要。
-血液样本:需尽快分离血浆或直接用于DNA提取,若需运输,应置于4℃保存,并在规定时间内(通常24小时内)送达实验室。若需长期保存,应置于-20℃或-80℃冷冻,并添加防腐剂(如EDTA)。需记录样本冻融次数,避免反复冻融影响DNA质量。
-唾液样本:含细胞成分的唾液样本(如用于DNA提取的原始唾液)需在4℃保存,并在规定时间内(通常24-48小时内)送达实验室。若使用含棉棒的收集管,需确保样本充分浸润棉棒。干燥的唾液样本(如用于芯片检测的样本)需避光、干燥保存。
2.样本运输:使用符合生物样本运输标准的包装盒(如UN3373标记的容器)。血液样本需使用防漏容器;唾液样本需确保包装密封。选择合适的运输方式(如冷藏快递),记录运输时间、温度和签收信息。确保运输过程中的样本安全,防止物理损伤、污染或温度失控。
(三)结果解读
1.专业指导:调查结果,尤其是涉及遗传信息的结论,具有专业性。因此,强烈建议委托方或报告接收方寻求专业遗传咨询师、医学遗传学家或相关领域专家的帮助,对结果进行深入解读。专业人士可以结合个体的具体情况、家族史、医学背景等信息,提供更全面、准确的建议。
2.误差控制:虽然STR分型技术具有较高的精度和特异性,但在实际操作中仍可能存在误差来源。需了解并评估潜在的误差率,主要包括:
-样本污染:实验室内部或运输过程中的交叉污染可能导致假阳性结果。
-检测错误:仪器故障、试剂问题、操作失误可能导致假阴性或错误的等位基因分型。
-数据分析错误:对峰图判读、等位基因识别、数据计算等方面的错误可能导致结论偏差。
-生物因素:样本降解、DNA提取不全、低拷贝数模板等可能导致结果无法判读或准确性下降。
通过严格的实验室质控(如空白对照、内对照、重复实验、使用标准品)、操作标准化、多人复核和系统优化,可将这些误差降至最低。在报告中应明确说明检测的置信区间或可能的误差范围。
五、质量控制
(一)设备校准
1.定期校准电泳仪、PCR仪等关键设备:按照制造商的说明和实验室的校准计划,定期对核心设备进行性能测试和校准。例如,毛细管电泳仪需定期校准激光功率、电压稳定性、温度控制系统;PCR仪需校准温度曲线准确性、循环重复性。校准结果需记录存档,确保设备运行在最佳状态。
2.使用标准品验证检测灵敏度:定期使用已知浓度的DNA标准品(如WHODNA标准品)进行检测,验证实验室检测流程(从样本处理到数据分析)的准确性和灵敏度,确保能够可靠地检测到低拷贝数的DNA或区分相近大小的等位基因。
(二)人员培训
1.实验室人员需持证上岗:所有参与样本采集、处理、检测、数据分析的人员应经过专业培训,并获得相应的上岗资格认证。培训内容应涵盖实验原理、操作规程、质量控制要求、生物安全规范、伦理原则等。
2.每季度进行操作考核:定期(如每季度)对关键操作人员进行考核,形式可包括理论测试、实际操作评估等。考核结果用于评估人员技能水平,识别培训需求,确保持续的人员能力提升。新员工或转岗员工需经过更严格的岗前培训和考核。
(三)流程追溯
1.记录样本全流程信息:建立完善的实验室信息管理系统(LIMS)或纸质记录系统,详细记录每个样本从采集到最终报告发出的每一个环节的信息。包括样本接收登记、编号、信息核对、样本处理(提取、扩增、电泳等)操作人员及日期、设备使用记录、数据分析过程、报告审核签发等。确保信息的完整性和可追溯性。
2.建立电子档案备查:所有记录均需妥善保存,形成电子或纸质档案。电子档案应进行备份,并设置访问权限。纸质档案应存放在安全、防火的环境中。保存期限应依据相关法规或实验室规定执行。当需要时(如内部审核、外部审计、结果复核),能够快速、准确地调阅相关信息。
一、概述
血缘关系调查方案旨在通过科学、系统的方法,对个体间的遗传关系进行验证或分析。本方案适用于个人隐私调查、基因亲子鉴定辅助、遗传病溯源等场景,确保调查过程客观、准确、合规。调查需遵循伦理原则,保护当事人隐私,避免信息泄露。
二、调查准备
(一)明确调查目的
1.验证亲子关系:确认个体间的遗传联系,适用于法律或个人需求。
2.遗传病溯源:分析家族遗传史,辅助医学咨询。
3.个人身份确认:用于非法律场景的基因关系验证。
(二)准备调查材料
1.调查对象信息:姓名、年龄、联系方式等基础资料。
2.样本采集需求:血液、唾液或口腔拭子等生物样本,确保样本质量。
3.伦理授权文件:如需第三方参与,需提供书面同意书。
三、调查流程
(一)样本采集
1.选择采集方式:
(1)血液采集:适用于实验室检测,精度较高。
(2)唾液采集:操作简便,适用于家庭自测。
2.采集步骤:
(1)消毒采集工具(如采血针、拭子)。
(2)按规范采集样本(血液3-5ml,唾液1-2ml)。
(3)标记样本管并记录采集时间。
(二)样本检测
1.实验室检测流程:
(1)样本前处理:DNA提取与纯化。
(2)PCR扩增:针对STR(短串联重复序列)位点进行扩增。
(3)电泳分析:通过毛细管电泳分离扩增产物。
2.数据分析:
(1)比对等位基因频率。
(2)计算亲缘系数(如父权指数、母权指数)。
(三)结果报告
1.报告内容:
(1)调查结论(如“确认父子关系”或“遗传相似度XX%”)。
(2)数据支持(STR位点比对结果)。
2.交付方式:电子版或纸质报告,确保保密性。
四、注意事项
(一)伦理合规
1.严格保密:调查过程及结果仅向授权方透露。
2.避免诱导:不得以利益或威胁方式促使调查对象配合。
(二)样本处理
1.保存条件:样本需冷藏保存(血液-20℃冷冻,唾液4℃保存24小时)。
2.样本运输:使用合规包装(防漏、防污染)。
(三)结果解读
1.专业指导:建议由遗传咨询师解释结果。
2.误差控制:STR位点重复性高,误判率低于0.1%。
五、质量控制
(一)设备校准
1.定期校准电泳仪、PCR仪等关键设备。
2.使用标准品验证检测灵敏度。
(二)人员培训
1.实验室人员需持证上岗。
2.每季度进行操作考核。
(三)流程追溯
1.记录样本全流程信息(采集-检测-报告)。
2.建立电子档案备查。
**一、概述**
血缘关系调查方案旨在通过科学、系统的方法,对个体间的遗传关系进行验证或分析。本方案适用于个人隐私调查、基因亲子鉴定辅助、遗传病溯源等场景,确保调查过程客观、准确、合规。调查需遵循伦理原则,保护当事人隐私,避免信息泄露。方案的成功实施依赖于严谨的流程设计、专业的技术支持和严格的质量控制。其核心目标是提供可靠的遗传关系证据,满足委托方的特定需求。
**二、调查准备**
(一)明确调查目的
1.验证亲子关系:确认个体间的遗传联系,适用于法律或个人需求。例如,在非婚生子女认领、遗产分配前的身份确认、个人对遗传特征的追溯等场景。调查结果可为后续的法律文书、家庭关系调整或医学咨询提供依据。
2.遗传病溯源:分析家族遗传史,辅助医学咨询。通过调查家族成员间的遗传关系,识别遗传病的高风险个体,为早期筛查和预防提供信息支持。适用于常染色体显性遗传病、隐性遗传病等的初步筛查路径规划。
3.个人身份确认:用于非法律场景的基因关系验证。例如,个人对家族谱系中亲属关系的疑问进行核实,或对已知的家族遗传特征进行个体确认,以增进对自身遗传背景的理解。
(二)准备调查材料
1.调查对象信息:收集并核实所有参与调查个体的基本信息,包括但不限于姓名(可用编码代替)、性别、出生日期、联系方式(仅限调查联络)、以及与调查目的相关的简要背景描述。确保信息的准确性和完整性,为后续样本匹配和结果追溯提供基础。
2.样本采集需求:明确所需生物样本的类型、数量和质量标准。常用样本包括血液、唾液或口腔拭子。血液样本(通常需3-5ml,具体依检测项目而定)适用于需要高精度检测的场景;唾液样本(通常收集1-2ml唾液)采集操作简便,对被采集者干扰小,适用于家庭自测或初步筛查。需明确样本的采集容器(如含有EDTA的抗凝管、无RNA酶的收集管)、保存条件(如血液需-20℃冷冻,唾液需4℃保存24小时内送检,或根据具体要求干燥处理)和运输要求(使用符合生物样本运输标准的包装盒,确保防漏、防污染、保温)。
3.伦理授权文件:若调查涉及第三方或未成年人,必须获取书面授权同意书。授权书需明确说明调查目的、样本用途、保密措施、潜在风险及受益,并由被授权人(如监护人)亲笔签名。对于成年参与者,需确保其充分理解调查内容并自愿同意参与。所有授权文件需妥善保管,作为合规操作的证明。
**三、调查流程**
(一)样本采集
1.选择采集方式:
(1)血液采集:适用于实验室检测,精度较高。适用于需要高分辨率STR分型或进行复杂遗传分析的场景。操作步骤需由专业人员在符合生物安全级别的环境中进行。
-准备工作:核对受采集者信息,准备采血针、消毒棉签(75%酒精)、抗凝管、采血巾、止血带等。检查所有耗材是否在有效期内且包装完好。
-核对身份:再次确认受采集者身份信息。
-消毒操作部位:选择手臂内侧或前臂静脉,用酒精棉签按从内到外螺旋式消毒,待酒精挥发。
-戴无菌手套:进行无菌操作。
-采血:用止血带适当加压,采用标准采血技术(如静脉穿刺法)抽取所需血量,注意避免气泡混入。
-处理样本:立即将血液注入抗凝管,轻轻混匀,避免剧烈震荡。按需分装至多个样本管(用于不同检测项目或备份),清晰标记样本管(包含编码、姓名、采集日期、采集者等信息),记录采集时间、地点和操作人员。
-止血与包扎:用无菌棉签按压穿刺点,松紧适宜,直至血液不再流出,然后用创可贴或纱布包扎。
(2)唾液采集:操作简便,适用于家庭自测或对隐私要求较高的场景。适用于STR位点检测的初步筛查。
-准备工作:准备无RNA酶的唾液收集管(如含促凝剂或吸附棉棒的管子)、消毒漱口水(可选)、一次性纸巾、标记笔。
-指导受采集者:告知其采集要求,如采集前避免吸烟、饮食至少30分钟、用清水漱口(不含漱口水)。
-采集唾液:受采集者坐在舒适位置,放松,用舌头搅动口腔壁(脸颊内、上下颚)约2-3分钟,鼓起腮帮,将收集到的唾液(通常需1-2ml,以能湿润棉棒或达到管内指示线为准)吐入收集管中。确保唾液不含食物残渣或鼻涕。
-处理样本:若管内有棉棒,需旋转混匀唾液;若无,轻轻颠倒收集管数次。按指示将样本充分混匀或让棉棒充分吸收。盖紧管盖,清晰标记(包含编码、姓名、采集日期、采集者等信息)。
-保存与运输:根据要求保存(如室温下立即送检或冷藏),使用合规包装运输。
2.采集步骤:
(1)消毒采集工具:所有接触皮肤或样本的工具必须使用75%酒精或相应消毒剂彻底消毒,并确保完全干燥后再使用,防止交叉污染。
(2)按规范采集样本:
-血液采集:遵循无菌操作原则,穿刺深度和角度适宜,避免损伤神经血管。抽取血量精确,记录实际抽取量。
-唾液采集:指导受采集者正确漱口和吐唾液,避免气泡混入,确保样本量达到要求。
(3)标记样本管并记录采集时间:使用防水标记笔或专用标签,在样本管上清晰、永久地记录唯一编码(用于匿名化处理)、姓名(或编码)、性别、出生日期、采集日期时间、采集地点、采集人员等信息。同时,在调查记录表上同步记录这些信息,确保样本信息与记录一一对应。采集完成后,立即拍照存档样本外观及标记情况。
(二)样本检测
1.实验室检测流程:
(1)样本前处理:这是保证检测准确性的关键步骤。
-提取DNA:根据样本类型(血液需白细胞裂解,唾液需去除细胞杂质),采用合适的DNA提取试剂盒或方法(如柱式提取、试剂盒法),从样本中纯化高质量的基因组DNA。检查DNA浓度和纯度(如通过核酸蛋白测定仪检测OD260/280值),合格的DNA用于后续扩增。记录提取日期、操作人员和DNA质量参数。
-精确定量:使用Qubit、NanoDrop等设备精确测定DNA浓度,确保扩增反应中模板量适宜(通常为10-100ng),避免抑制或假阴性。
(2)PCR扩增:利用聚合酶链式反应(PCR)技术特异性地扩增DNA样本中目标STR位点(短串联重复序列)。
-设计引物:针对每个待测STR位点设计特异性引物,这些引物序列需已知且经过验证。
-配置PCR反应体系:包含提取的DNA模板、引物对、dNTPs(脱氧核糖核苷三磷酸)、PCR缓冲液(含Mg²⁺)、DNA聚合酶(如Taq酶)。体系需优化,确保扩增效率。
-进行PCR扩增:在PCR仪上设置扩增程序(包括变性、退火、延伸三个基本步骤,以及循环次数等参数)。常用的扩增程序条件可能为:95℃预变性5分钟;然后进行30-35个循环,每个循环包括:95℃变性30秒,XX℃退火30秒(XX℃根据引物Tm值设定),72℃延伸1分钟(或按模板长度调整);最后72℃延伸10分钟。PCR产物通常在6-10个循环后达到平台期。
-检测扩增效果:可通过凝胶电泳或QPCR检测PCR产物的大小和量,确认目标片段是否成功扩增,以及扩增产物是否单一、无杂带。
(3)电泳分析:将PCR产物进行分离和检测,以确定每个STR位点上重复序列的个数(等位基因)。
-准备电泳系统:组装好毛细管电泳仪,检查缓冲液pH值和离子强度是否符合要求。
-加样:将PCR产物与含有荧光标记引物的混合物(如GeneScan™或同样配套的混合物)混合,上样至毛细管中。通常每个样本会设置内对照(Ladder)和空白对照。
-电泳分离:设定电泳参数(电压、时间),在缓冲液作用下,不同大小的荧光标记片段会按大小顺序迁移。
-检测与成像:使用荧光检测器和成像系统捕获电泳过程中的荧光信号。通常使用FITC(绿色)、HEX(橙色)、NED(红色)等不同荧光标记的引物,可以在同一毛细管中同时检测多个STR位点。
-数据采集:记录每个样本在每个STR位点上的等位基因峰型图。
2.数据分析:
(1)比对等位基因频率:将检测到的样本等位基因与数据库中的参考等位基因频率数据(如国际标准数据库CODIS或本地区人群数据库)进行比对。对于个体识别,主要关注个体本身的STR型谱;对于亲缘关系鉴定,则需比较多个STR位点上的等位基因组合。
(2)计算亲缘系数:对于亲子鉴定等场景,需计算亲权指数(PI)和累积亲权指数(CPI)。根据父/母已知STR型谱和子代检测到的型谱,利用遗传学统计方法计算每个可能的父/母来源的亲权指数。例如,若子代在某位点为13/15,父代为13/18,母代为5/15,则需分别计算子代型谱由父代13/15和母代5/15组合的概率,以及由父代13/18和母代5/15组合的概率,并选取概率更高的来源计算PI。最终通过所有位点数据的乘积得到CPI。若CPI值大于99.99%或99.999%,则可认定父子(女)关系;若CPI较低,则关系不被支持。
(3)计算遗传相似度:对于非亲子关系的亲缘关系鉴定(如兄弟姐妹、祖孙、表亲等),可计算共享等位基因对(SAlleles)数量或遗传距离(如DS值),以量化个体间的遗传相似程度。例如,同卵双生遗传相似度接近100%,而随机个体间的相似度通常较低。
(三)结果报告
1.报告内容:
(1)调查结论:清晰、明确地给出最终结论。例如,“根据STR分型结果,样本A(子代)与样本B(疑似父亲)的遗传信息符合父系遗传规律,支持父子关系;或‘样本C与样本D的遗传相似度较低,不支持亲缘关系’;或‘根据家族谱系信息及遗传检测,样本E与已知遗传病风险基因型存在关联,建议进行进一步医学咨询’。”结论需基于可靠的数据分析,避免模糊不清的表述。
(2)数据支持:提供详细的检测数据作为结论的依据。包括但不限于:
-所有检测的STR位点列表。
-每个样本在每个位点检测到的等位基因(以峰图或表格形式展示)。
-参考数据库来源(若适用)。
-关键计算结果,如亲权指数、累积亲权指数、遗传相似度值等。
-任何异常结果或需要特别说明的情况(如发现混合峰、等位基因缺失等)。
2.交付方式:根据委托方需求选择合适的报告形式。
-电子版:可通过加密邮件、安全文件传输平台或云存储服务发送。文件需设置密码或数字签名,确保传输和阅读过程的安全性。
-纸质版:打印在专用保密纸张上,通过机要或专人递送方式送达。报告需加封,并由签收人签字确认。
3.结果解读指导:在报告中可附上简要的解读说明,解释关键术语(如等位基因、基因型、亲权指数)和结论的意义。同时,强烈建议委托方或报告接收方咨询专业的遗传咨询师或相关领域的专家,以全面理解和应用调查结果。
四、注意事项
(一)伦理合规
1.严格保密:调查过程中的所有信息,包括样本信息、检测数据、分析结果、参与者身份等,均需严格保密。未经授权,不得向任何第三方泄露。建立完善的保密制度和数据访问权限管理机制。对参与人员签署的授权书进行审核,确保其具有法律效力且内容符合伦理要求。
2.避免诱导:在调查过程中,不得以任何形式(如金钱、利益、威胁、欺骗)诱导或强迫任何调查对象参与或提供样本。需确保所有参与者的参与是完全自愿的,并已充分了解调查的目的、流程、风险和权益。
(二)样本处理
1.保存条件:样本在采集后至检测前的保存条件至关重要。
-血液样本:需尽快分离血浆或直接用于DNA提取,若需运输,应置于4℃保存,并在规定时间内(通常24小时内)送达实验室。若需长期保存,应置于-20℃或-80℃冷冻,并添加防腐剂(如EDTA)。需记录样本冻融次数,避免反复冻融影响DNA质量。
-唾液
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