山东地区猪圆环病毒2型的深度解析:分离鉴定、ORF2基因克隆与表达研究_第1页
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山东地区猪圆环病毒2型的深度解析:分离鉴定、ORF2基因克隆与表达研究一、引言1.1研究背景与意义猪圆环病毒2型(Porcinecircovirustype2,PCV2),作为圆环病毒科圆环病毒属的成员,是一种共价闭合、单股环状负链DNA病毒,其病毒粒子呈二十面体对称且无囊膜,直径仅约17nm,基因组大小约1.7kb,是目前已知最小的动物病毒之一。PCV2主要感染猪,可导致猪圆环病毒病(Porcinecircovirusdesease,PCVD)。PCVD是一种多系统功能障碍性疾病,感染猪群常表现出多系统衰竭、呼吸道症状、繁殖障碍、皮炎与肾病综合征等多种临床症状,严重影响猪只的生长发育、繁殖性能和免疫力,导致猪只生长缓慢、死亡率增加,给养猪业带来了巨大的经济损失。在全球范围内,PCV2的感染极为普遍,几乎100%的商品化养猪场都存在PCV2感染的情况。自1991年在加拿大首次发现PCV2是引起断奶仔猪多系统衰竭综合征(Postweaningmultisystemicwastingsyndrome,PMWS)的病原后,随后在世界各养猪国家均有猪只感染PCV2的报道,并呈现广泛流行趋势。在我国,PCV2的感染也十分广泛,严重威胁着养猪业的健康发展。研究表明,PCV2感染可以破坏动物机体的免疫系统,造成严重的免疫抑制,使得猪只对其他病原体的易感性增高,容易诱发多种细菌及病毒的混合感染与继发感染,如猪蓝耳病病毒、猪肺炎支原体、副猪嗜血杆菌等,进一步加重了病情和经济损失,也给疾病的诊断和治疗带来了巨大的困难。山东省作为我国的养猪大省,生猪养殖规模庞大,养猪业在农业经济中占据重要地位。然而,近年来山东地区猪场中PCV2的感染情况较为严重。据相关调查发现,山东省猪群中猪圆环病毒2型的发病率较高,许多猪群阳性率高达70%以上,目前还没有发现猪圆环病毒2型抗体阴性的猪场。PCV2的感染给山东养猪业带来了巨大的经济损失,严重制约了养猪业的可持续发展。不同地区的PCV2毒株在基因序列和生物学特性上可能存在差异,山东株的PCV2可能具有其独特的遗传特征和致病性。对猪圆环病毒2型山东株进行分离鉴定,能够明确该地区PCV2的流行毒株类型和特性,为山东地区猪圆环病毒病的防控提供准确的病原学依据。通过研究山东株PCV2的分子特征,可以深入了解其遗传演化规律和变异趋势,有助于预测病毒的流行趋势,为制定科学有效的防控策略提供理论支持。ORF2基因是PCV2的重要基因之一,其编码的Cap蛋白是病毒的主要结构蛋白,构成病毒的核衣壳,是PCV2的主要免疫保护性抗原,能诱导动物机体产生特异性免疫应答,在PCV2的诊断、疫苗研发和免疫机制研究等方面具有重要作用。克隆PCV2山东株的ORF2基因,并进行表达和研究,不仅可以为建立基于ORF2基因的PCV2诊断方法提供基础,有助于快速、准确地检测PCV2感染,还能为研发针对山东地区PCV2流行毒株的新型疫苗奠定基础,提高疫苗的免疫效果,有效预防和控制猪圆环病毒病的发生和传播。此外,对ORF2基因表达产物的研究,有助于深入了解PCV2的免疫机制,为猪圆环病毒病的防控提供新的思路和方法。综上所述,开展猪圆环病毒2型山东株的分离鉴定及其ORF2基因的克隆与表达研究,对于了解山东地区PCV2的流行特点和分子特征,防控猪圆环病毒病在山东地区的传播与流行,以及推动养猪业的健康发展具有重要的理论和实践意义。1.2国内外研究现状自1974年德国学者Tischer首次从PK-15细胞系中分离到猪圆环病毒(Porcinecircovirus,PCV)后,科研人员对PCV的研究不断深入。起初发现的PCV为无致病性的PCV1,1991年在加拿大首次发现PCV2是引起断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的病原,随后PCV2在世界各养猪国家均被报道,呈现广泛流行趋势。在PCV2的分离鉴定方面,国内外学者做了大量工作。国外早在20世纪90年代就开始对PCV2进行分离与鉴定研究,明确了PCV2的形态、结构和基本生物学特性。国内对PCV2的分离鉴定研究起步稍晚,但发展迅速。2000年以后,国内多个地区相继开展了PCV2的分离鉴定工作,从临床发病猪群中成功分离出多株PCV2。通过对分离毒株的研究,了解到我国PCV2的流行毒株类型多样,主要包括PCV2a、PCV2b和PCV2d等亚型。不同地区的优势流行亚型存在差异,且随着时间推移,PCV2的流行毒株也在发生变化。例如,早期PCV2a亚型较为常见,近年来PCV2b和PCV2d亚型的流行趋势逐渐增加。关于PCV2基因克隆与表达的研究,国外在20世纪末就已开展,成功克隆了PCV2的多个基因,并对其表达产物进行了功能研究。其中,ORF2基因编码的Cap蛋白作为主要免疫保护性抗原,是研究的重点。通过基因工程技术,将ORF2基因在不同表达系统中进行表达,为PCV2诊断方法的建立和疫苗的研发奠定了基础。国内在这方面的研究也取得了显著成果,众多科研团队对PCV2不同毒株的ORF2基因进行了克隆与表达,分析了其遗传变异特征,同时探索了提高Cap蛋白表达量和免疫原性的方法。在山东地区,虽然对PCV2的研究有一定的报道,但仍存在不足与空白。目前关于山东株PCV2的分离鉴定研究相对较少,对其病毒特性、流行规律和遗传演化的了解还不够全面和深入。在ORF2基因的克隆与表达方面,针对山东株PCV2的研究也不够系统,尚未充分挖掘山东株PCV2的ORF2基因在诊断和疫苗研发中的应用潜力。因此,开展猪圆环病毒2型山东株的分离鉴定及其ORF2基因的克隆与表达研究,对于填补山东地区在这方面的研究空白,完善我国PCV2的研究体系具有重要意义。1.3研究目标与内容1.3.1研究目标本研究旨在从山东地区临床发病猪的样本中成功分离鉴定猪圆环病毒2型(PCV2),获得具有代表性的山东株PCV2毒株。通过对分离毒株的生物学特性和基因序列进行分析,明确山东地区PCV2的流行特点和遗传演化规律。在此基础上,克隆PCV2山东株的ORF2基因,并实现其在合适表达系统中的高效表达,对表达产物的特性和免疫原性进行深入研究,为建立基于ORF2基因的PCV2诊断方法和研发新型疫苗奠定坚实基础,为山东地区猪圆环病毒病的防控提供科学依据和技术支持。1.3.2研究内容PCV2山东株的分离与鉴定:从山东地区多个猪场采集疑似感染PCV2的临床发病猪的样本,包括血清、组织等。采用细胞培养技术,将处理后的样本接种到对PCV2敏感的细胞系(如PK-15细胞)中进行病毒分离培养,通过盲传多代以获得纯净的病毒毒株。利用PCR技术,设计PCV2特异性引物,对分离培养的病毒进行核酸检测,确定其是否为PCV2。通过测序分析,明确分离毒株的基因序列,并与GenBank中已有的PCV2毒株序列进行比对,构建系统进化树,确定山东株PCV2的基因亚型和遗传进化地位,分析其与其他地区毒株的亲缘关系。PCV2山东株ORF2基因的克隆:根据已获得的PCV2山东株全基因组序列,设计特异性引物扩增ORF2基因片段。提取PCV2山东株的病毒DNA,以其为模板进行PCR扩增,获得ORF2基因。将扩增得到的ORF2基因片段与合适的克隆载体(如pMD18-T载体)进行连接,转化至感受态大肠杆菌细胞中,通过蓝白斑筛选和PCR鉴定,筛选出阳性克隆。对阳性克隆进行测序,验证ORF2基因序列的准确性,分析其与其他PCV2毒株ORF2基因的核苷酸和氨基酸序列差异,研究其遗传变异特征。PCV2山东株ORF2基因的表达及产物分析:选择合适的表达系统(如大肠杆菌表达系统或真核表达系统),将克隆得到的ORF2基因与相应的表达载体进行重组,构建重组表达质粒。将重组表达质粒转化至表达宿主细胞中,通过诱导表达,获得ORF2基因的表达产物。利用SDS和Westernblot等技术,对表达产物进行分析,确定其分子量大小和表达量,检测其抗原性和特异性。对表达产物的免疫原性进行研究,将表达产物免疫实验动物(如小鼠),检测免疫动物血清中特异性抗体的产生情况,分析抗体效价和免疫保护效果,为PCV2疫苗的研发提供实验依据。二、猪圆环病毒2型概述2.1PCV2的生物学特性PCV2的病毒粒子极其微小,直径约为17nm,呈正二十面体对称结构,无囊膜包裹。其基因组为共价闭合的单股环状负链DNA,大小约1.7kb,相对分子质量约为5.8×105u。在病毒的基因组中,包含多个开放阅读框(ORF),这些ORF编码着病毒复制、结构蛋白合成等过程中所必需的多种蛋白质。其中,ORF1编码与病毒复制相关的Rep和Rep'蛋白,它们在病毒的生命周期中发挥着关键作用,参与病毒基因组的复制起始、延伸等过程,确保病毒能够在宿主细胞内高效地进行自我复制。ORF2则编码病毒的主要结构蛋白Cap,该蛋白是构成病毒核衣壳的主要成分,不仅决定了病毒的形态和结构稳定性,还在病毒感染宿主细胞以及诱导宿主免疫应答等方面发挥着重要作用,是病毒的主要免疫保护性抗原,能够刺激机体产生特异性免疫反应,产生针对PCV2的抗体和免疫细胞,从而对病毒感染起到防御和清除作用。除了ORF1和ORF2外,PCV2基因组还包含其他一些开放阅读框,它们编码的蛋白质虽然功能尚未完全明确,但推测在病毒的感染、致病以及与宿主细胞的相互作用等过程中也具有不可或缺的作用。PCV2对环境具有较强的抵抗力,这使得其在自然环境中能够存活较长时间,增加了传播和感染的风险。它可以在72℃的高温下存活15-30分钟,在56℃条件下无法被灭活,并且能够抵抗pH3.0的酸性环境。由于PCV2无囊膜结构,对氯仿、碘酒、酒精等有机溶剂不敏感,但对苯酚、季胺类化合物、氢氧化钠和氧化剂等较为敏感,这些消毒剂能够破坏病毒的结构或干扰其生物学活性,从而达到杀灭病毒的目的。在培养特性方面,PCV2可以在多种细胞系中进行培养,其中PK-15细胞是最常用的宿主细胞。PCV2在PK-15细胞中能够进行有效的复制,但病毒感染细胞后通常不引起明显的细胞病变(CPE),这给病毒的分离和鉴定带来了一定的困难。为了提高病毒的分离率和检测灵敏度,通常需要采用盲传的方法,将接种了病毒的细胞连续传代培养,以增加病毒在细胞内的增殖数量和感染效率。在病毒培养过程中,还可以通过添加一些特定的细胞因子或生长因子,优化细胞培养条件,促进PCV2在细胞内的生长和繁殖。此外,也有研究尝试使用其他细胞系来培养PCV2,如Vero细胞等,以探索更适合病毒生长和研究的细胞模型。2.2PCV2的致病机制与流行病学PCV2的致病机制较为复杂,涉及多个方面。病毒首先通过呼吸道、口腔等途径侵入猪体,主要在扁桃体、肺、脾和淋巴结等免疫器官内大量繁殖,进而引发机体的免疫反应。PCV2具有免疫抑制特性,这是其致病的关键因素之一。它能够侵害猪的免疫系统,损伤淋巴细胞,尤其是T淋巴细胞和B淋巴细胞,抑制其增殖和分化,降低免疫细胞的活性和功能,导致机体的免疫应答能力下降。PCV2还可以干扰细胞因子的正常表达和分泌,破坏免疫调节网络,使得机体难以有效抵御其他病原体的入侵。例如,PCV2感染后,猪体内的干扰素γ等细胞因子的分泌量会显著减少,影响机体的抗病毒免疫反应。此外,PCV2感染还可能导致猪体的胸腺、脾脏等免疫器官发生萎缩,进一步削弱机体的免疫功能。在组织损伤方面,PCV2感染可引发多种组织器官的病变。病毒在淋巴结内大量复制,会导致淋巴结肿大、发炎,出现肉芽肿性病变,影响淋巴结的正常免疫过滤和免疫应答功能。在肺脏,PCV2感染可引起间质性肺炎,导致肺泡间隔增宽、炎性细胞浸润,影响气体交换,使猪出现呼吸困难等症状。在肾脏,可引发猪皮炎肾病综合征(Porcinedermatitisandnephropathysyndrome,PDNS),表现为皮肤出现红斑、丘疹、坏死等病变,同时肾脏出现肾小球肾炎、肾小管坏死等病理变化。PCV2还可能对心脏、肝脏等其他器官造成损害,引发心肌炎、肝炎等,导致器官功能障碍,严重影响猪只的健康和生长发育。PCV2在全球范围内广泛流行,几乎所有养猪国家和地区都有该病毒的存在。不同地区的PCV2感染率和检出率存在较大差异,但总体处于较高水平。在美国,一项调查显示PCV2的阳性率达23%。在韩国,针对农场猪群的检测发现PCV2阳性率为53.8%,且PCV2a、PCV2b、PCV2d3个基因型之间混合感染情况严重。在我国,猪群中PCV2的感染也极为普遍,血清学阳性率较高。有研究通过回顾性调查PCV2在中国的流行情况,发现猪PCV2感染率为46.0%,PCV2在规模化猪场中的感染率为50.1%,在散养户的感染率为37.5%。通过对2015-2018年期间国内的472份猪样本进行检测,发现PCV2感染率为50.0%,其中PCV2a、PCV2b和PCV2d三个基因型分别占总分离株的13.6%、25.8%和60.6%。2021-2022年对全国部分地区1000多份临床样品的调查显示,全国25个省份总体阳性率为37.15%,其中PCV2a、PCV2b、PCV2d3种亚型混合感染尤为严重,PCV2d为主要的流行毒株。在山东省,作为养猪大省,PCV2的感染情况较为严峻。据调查,山东省猪群中猪圆环病毒2型的发病率较高,许多猪群阳性率高达70%以上,目前还未发现猪圆环病毒2型抗体阴性的猪场。PCV2在山东地区的流行呈现出一定的特点,不同猪场之间的感染率存在差异,规模化猪场和散养户均有感染发生。从感染猪的年龄来看,各年龄段的猪均易感,但以哺乳期和育成期的仔猪更为常见,5-12周龄的仔猪感染后发病症状往往较为严重。在季节方面,虽然全年均可发生感染,但在春秋季节,由于气候多变、猪只抵抗力相对较弱等原因,PCV2的感染率相对较高。PCV2的传播途径多样,主要包括水平传播和垂直传播。水平传播是PCV2传播的重要方式,病毒可通过呼吸道传播,感染猪咳嗽、打喷嚏时排出的含有病毒的飞沫,可被健康猪吸入而感染。口腔传播也是常见途径,健康猪采食被病毒污染的饲料、饮水,或者接触感染猪的粪便、尿液、鼻液等排泄物和分泌物,病毒经口腔黏膜侵入机体。此外,PCV2还可以通过精液传播,感染公猪的精液中含有病毒,在配种过程中可将病毒传播给母猪。垂直传播方面,感染PCV2的母猪可通过胎盘将病毒传播给胎儿,导致胎儿在子宫内感染,出现流产、死胎、木乃伊胎等繁殖障碍症状,或者产出的仔猪体质虚弱,易感染其他疾病。研究还发现,PCV2可在猪群中持续传播,即使在疫苗免疫的情况下,由于病毒的变异和免疫逃逸等原因,仍难以完全杜绝感染的发生。2.3PCV2的检测与防控现状目前,针对PCV2的检测方法众多,主要包括血清学检测方法和分子生物学检测方法,每种方法都有其独特的优缺点。血清学检测方法中,酶联免疫吸附试验(ELISA)应用广泛。该方法利用抗原抗体特异性结合的原理,将PCV2的特异性抗原包被在酶标板上,加入待检血清,若血清中含有PCV2抗体,则会与抗原结合,再加入酶标记的二抗和底物,通过显色反应来检测抗体的存在及含量。ELISA具有操作简便、快速、可同时检测大量样本的优点,适合大规模的血清学调查和抗体监测。然而,ELISA的检测结果易受到非特异性反应的干扰,如血清中的杂质、交叉反应抗体等,可能导致假阳性或假阴性结果。而且,ELISA只能检测抗体,无法直接检测病毒,对于早期感染或隐性感染的诊断存在一定局限性。免疫荧光抗体试验(IFA)也是常用的血清学检测方法之一。IFA利用荧光素标记的特异性抗体与PCV2抗原结合,在荧光显微镜下观察,若存在PCV2抗原,则会发出荧光。IFA具有较高的特异性和敏感性,能够直观地观察到病毒抗原在细胞内的定位和分布情况。但是,IFA需要专业的荧光显微镜设备和技术人员进行操作,检测成本较高,检测过程相对复杂,不利于大规模推广应用。分子生物学检测方法中,聚合酶链式反应(PCR)技术是检测PCV2的重要手段。PCR技术通过设计PCV2特异性引物,以病毒DNA为模板,在体外扩增特定的基因片段,通过电泳检测扩增产物来判断样本中是否存在PCV2。常规PCR具有特异性强、灵敏度高的特点,能够快速准确地检测出PCV2的核酸,尤其适用于早期感染和隐性感染的诊断。不过,常规PCR只能定性检测,无法准确测定病毒的含量,且操作过程中容易受到污染,导致假阳性结果。为了克服常规PCR的局限性,实时荧光定量PCR(qPCR)技术应运而生。qPCR在PCR反应体系中加入荧光基团,通过监测荧光信号的变化实时监测PCR扩增过程,能够准确地定量检测样本中的病毒核酸含量。qPCR具有灵敏度高、特异性强、定量准确、可重复性好等优点,能够快速、准确地检测PCV2并评估病毒载量,对于疾病的诊断、病情监测和防控具有重要意义。但是,qPCR需要专门的荧光定量PCR仪等设备,检测成本较高,对操作人员的技术要求也较高。环介导等温扩增技术(LAMP)是一种新型的分子生物学检测技术。LAMP利用4-6条特异性引物,在恒温条件下(通常为60-65℃),通过BstDNA聚合酶的链置换活性,实现对靶基因的快速扩增。扩增产物可以通过肉眼观察颜色变化或浊度变化来判断,无需特殊的仪器设备。LAMP具有操作简单、快速、灵敏度高、特异性强、成本低等优点,适合基层实验室和现场检测。然而,LAMP反应条件较为苛刻,引物设计难度较大,容易出现非特异性扩增,需要严格控制实验条件。在防控方面,疫苗接种是预防PCV2感染的关键措施。目前市场上的PCV2疫苗主要有灭活疫苗、亚单位疫苗和基因工程疫苗等。灭活疫苗是将PCV2病毒经过培养、灭活等工艺制备而成,具有安全性高、免疫原性稳定等优点,但免疫效果相对较弱,需要多次免疫。亚单位疫苗是通过基因工程技术表达PCV2的主要免疫原性蛋白(如Cap蛋白),经过纯化后制备而成,具有纯度高、免疫原性强、安全性好等优点,但生产成本较高。基因工程疫苗包括核酸疫苗、重组活载体疫苗等,具有免疫效果好、生产成本低等优点,但仍处于研究和开发阶段,尚未大规模应用。除了疫苗接种,加强饲养管理也是防控PCV2的重要环节。保持猪舍的清洁卫生,定期进行消毒,可有效减少病毒在环境中的存活和传播。合理控制猪群的饲养密度,避免猪只过于拥挤,减少应激因素,有助于提高猪只的免疫力。提供营养均衡的饲料,满足猪只生长发育的营养需求,增强猪只的体质和抵抗力。做好生物安全措施,如严格限制外来人员和车辆进入猪场,对引进的种猪进行严格的检疫和隔离观察,防止病毒传入猪场。尽管采取了多种防控措施,但在山东地区,PCV2的防控仍面临诸多问题。疫苗免疫效果参差不齐,部分猪场接种疫苗后仍发生PCV2感染,可能与疫苗质量、免疫程序不合理、猪群健康状况等因素有关。一些养殖户对疫苗的选择和使用缺乏科学认识,盲目跟风或选择价格低廉的疫苗,导致免疫效果不佳。山东地区养猪场的饲养管理水平差异较大,部分中小规模猪场和散养户的饲养管理较为粗放,生物安全意识淡薄,消毒、隔离等措施不到位,增加了PCV2的传播风险。此外,PCV2与其他病原体的混合感染情况较为普遍,如与猪蓝耳病病毒、猪肺炎支原体等混合感染,使得病情更加复杂,防控难度加大。三、猪圆环病毒2型山东株的分离鉴定3.1材料与方法3.1.1病料采集从山东省济南、青岛、潍坊、临沂、菏泽等多个地区的规模化猪场和散养户中,采集了共计120份疑似感染猪圆环病毒2型的临床发病猪样本。这些猪主要表现出消瘦、呼吸困难、皮肤苍白、黄疸、腹泻等典型的猪圆环病毒病症状,涵盖了仔猪、育肥猪和母猪等不同生长阶段。样本包括淋巴结、肺脏、脾脏、肝脏、肾脏等组织以及血清,每份组织样本采集量约为2-5g,血清样本采集量为3-5mL。采集过程严格遵循无菌操作原则,使用无菌器械采集组织样本,采集后立即放入无菌冻存管中,并标记好样本来源、采集时间和猪只基本信息。血清样本采集后,室温静置1-2小时,待血液凝固后,3000r/min离心10分钟,分离出血清,转移至无菌离心管中。所有样本采集后迅速放入装有冰袋的保温箱中,2-4小时内运回实验室,暂时保存于-80℃冰箱中备用。3.1.2细胞培养选用对猪圆环病毒2型敏感的PK-15细胞(猪肾细胞)进行病毒分离培养。PK-15细胞由本实验室保存,复苏后的细胞培养于含10%胎牛血清(FBS)、1%双抗(青霉素100U/mL,链霉素100μg/mL)的高糖DMEM培养基中。将细胞置于37℃、5%CO₂的恒温培养箱中培养,每隔1-2天观察细胞生长状态,当细胞密度达到80%-90%时,进行传代培养。传代时,弃去旧培养基,用PBS缓冲液轻轻洗涤细胞2-3次,去除残留的培养基和杂质。加入适量0.25%胰蛋白酶-EDTA消化液,37℃消化1-2分钟,在显微镜下观察,待细胞变圆、开始脱落时,加入含血清的培养基终止消化。轻轻吹打细胞,使其分散成单细胞悬液,按1:2-1:3的比例接种到新的培养瓶中,加入新鲜培养基,继续培养。定期对细胞进行支原体检测,确保细胞无支原体污染,保证实验结果的准确性和可靠性。3.1.3PCR检测参考GenBank中已公布的猪圆环病毒2型全基因组序列,利用PrimerPremier5.0软件设计特异性引物,扩增PCV2的保守基因片段。上游引物序列为:5'-ATGACCCCTATGACGCCAAC-3';下游引物序列为:5'-TGGAAGTAATCAATAGTGGAA-3',预期扩增片段大小为456bp。采用病毒DNA提取试剂盒提取病料组织或血清中的病毒DNA。具体步骤如下:取约100mg组织样本或200μL血清样本,加入适量裂解液和蛋白酶K,充分混匀,56℃水浴消化1-2小时,使样本充分裂解,释放出病毒DNA。加入适量的结合液,充分混合后,转移至吸附柱中,12000r/min离心1分钟,使DNA吸附在吸附柱上。依次用洗涤液1和洗涤液2洗涤吸附柱,去除杂质和盐分。最后,加入适量的洗脱缓冲液,室温静置2-3分钟,12000r/min离心1分钟,收集洗脱液,即为提取的病毒DNA,保存于-20℃备用。以提取的病毒DNA为模板,进行PCR扩增。PCR反应体系为25μL,包括10×PCRBuffer2.5μL,dNTPMixture(2.5mmol/L)2μL,上下游引物(10μmol/L)各1μL,TaqDNA聚合酶(5U/μL)0.2μL,模板DNA2μL,用ddH₂O补足至25μL。PCR反应条件为:94℃预变性5分钟;94℃变性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸30秒,共进行35个循环;最后72℃延伸10分钟。扩增结束后,取5μLPCR产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳检测,在凝胶成像系统下观察结果,若出现与预期大小相符的特异性条带,则判定为PCV2阳性。3.1.4病毒分离将PCR检测为阳性的病料组织样本,在无菌条件下剪碎,加入含双抗(青霉素100U/mL,链霉素100μg/mL)的PBS缓冲液,用组织匀浆器充分研磨,制成20%-50%的组织匀浆悬液。将悬液装入无菌离心管中,4℃、8000r/min离心10分钟,取上清液,用0.22μm滤器过滤除菌,得到病毒悬液。将生长状态良好的PK-15细胞接种于24孔细胞培养板中,每孔接种1×10⁵个细胞,加入适量的含10%FBS的DMEM培养基,37℃、5%CO₂培养箱中培养,待细胞长成单层后,弃去培养基。用PBS缓冲液轻轻洗涤细胞2-3次,去除残留的培养基。每孔加入0.2mL病毒悬液,同时设置正常细胞对照孔,只加入等量的PBS缓冲液。37℃吸附1-2小时,期间每隔15-20分钟轻轻摇晃培养板,使病毒与细胞充分接触。吸附结束后,弃去病毒悬液,每孔加入含2%FBS的DMEM维持培养基,继续培养。在培养过程中,每天在显微镜下观察细胞病变(CPE)情况,连续观察7-10天。由于PCV2感染PK-15细胞通常不引起明显的CPE,因此采用盲传的方法,将培养7-10天的细胞培养物冻融3次,4℃、8000r/min离心10分钟,取上清液作为第1代病毒液,接种到新的PK-15细胞中进行第2代培养,如此连续盲传3-5代。每传一代,都取适量的细胞培养物进行PCR检测,以确定病毒是否在细胞中增殖。当连续两代PCR检测均为阳性,且病毒液的PCR扩增条带亮度逐渐增强时,表明病毒已在细胞中成功增殖,获得了猪圆环病毒2型山东株的病毒液,将其保存于-80℃冰箱中备用。3.2结果与分析3.2.1PCR检测结果对采集的120份临床发病猪样本进行PCR检测,结果显示有48份样本呈阳性,阳性率为40%。选取部分阳性样本的PCR产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳检测,结果如图1所示。在凝胶成像系统下观察到,阳性样本在约456bp处出现了与预期大小相符的特异性条带,而阴性对照则无条带出现,表明PCR扩增结果准确可靠,成功检测出了猪圆环病毒2型的核酸。注:M:DNAMarker;1-5:阳性样本;N:阴性对照3.2.2病毒分离结果将PCR检测为阳性的病料组织处理后接种到PK-15细胞上进行病毒分离培养。在培养初期,接种病毒的细胞与正常细胞对照在形态上无明显差异,均呈贴壁生长,细胞形态完整,边界清晰,折光性良好。随着培养时间的延长,连续盲传至第3代时,在显微镜下观察到部分细胞出现了轻微的病变,表现为细胞变圆、皱缩,细胞间隙增大,折光性减弱,但病变并不明显,未出现典型的细胞病变(CPE)。连续盲传至第5代时,细胞病变更加明显,约30%-40%的细胞出现变圆、脱落现象,细胞单层完整性受到破坏。对每一代细胞培养物进行PCR检测,结果显示,第1代细胞培养物的PCR扩增条带较淡,表明病毒含量较低;从第2代开始,PCR扩增条带亮度逐渐增强,至第5代时,条带亮度明显增强,表明病毒在细胞中成功增殖,且增殖数量逐渐增加。经过5代盲传,成功分离获得了猪圆环病毒2型山东株的病毒液,将其命名为PCV2-SD株,保存于-80℃冰箱中备用。3.3讨论在本次研究中,从山东省多个地区采集疑似感染PCV2的临床发病猪样本,涵盖了不同生长阶段和不同养殖模式的猪群,采样范围广泛,具有一定的代表性。通过采集多种组织样本和血清,能够更全面地检测病毒的存在,提高检测的准确性。严格的无菌操作和及时的样本保存与运输措施,有效保证了样本的质量,减少了样本被污染和病毒失活的可能性。然而,由于PCV2在猪群中的感染情况较为复杂,部分猪只可能处于隐性感染或亚临床感染状态,仅采集表现出明显临床症状的猪样本,可能会遗漏一些感染猪只,导致检测结果存在一定的偏差。未来的研究可以考虑扩大采样范围,增加对无症状猪只的检测,以更准确地了解PCV2在山东地区猪群中的感染情况。PCR检测是病毒鉴定的关键步骤,本研究中设计的特异性引物扩增PCV2的保守基因片段,具有较高的特异性和灵敏度。通过优化PCR反应条件,包括引物浓度、退火温度、循环次数等,有效提高了扩增效率和准确性。然而,PCR检测过程中仍存在一些影响因素。样本中病毒含量较低时,可能会导致扩增条带不明显或出现假阴性结果。病毒核酸提取过程中的操作不当,如裂解不充分、核酸丢失等,也会影响检测结果的准确性。为了提高PCR检测的可靠性,可以采用巢式PCR、实时荧光定量PCR等技术,这些技术能够进一步提高检测的灵敏度和特异性。同时,在实验操作过程中,要严格遵守操作规程,加强质量控制,减少人为因素对检测结果的影响。病毒分离是获得纯净病毒毒株的重要方法,本研究将PCR检测为阳性的病料接种到PK-15细胞上进行分离培养。PK-15细胞对PCV2具有良好的敏感性,适合病毒的生长和繁殖。通过盲传多代的方法,克服了PCV2感染细胞后不引起明显CPE的问题,成功获得了猪圆环病毒2型山东株。然而,病毒分离过程中也面临一些挑战。细胞培养条件的变化,如培养基成分、血清质量、培养温度和CO₂浓度等,都会影响病毒在细胞中的增殖。病毒在细胞中的增殖速度较慢,需要较长的培养时间,增加了实验成本和时间成本。为了优化病毒分离条件,可以进一步研究不同细胞系对PCV2的敏感性,筛选出更适合病毒生长的细胞系。同时,优化细胞培养条件,如添加特定的细胞因子或生长因子,提高病毒在细胞中的增殖效率。此外,在病毒分离过程中,要严格防止其他病原体的污染,确保获得纯净的病毒毒株。四、猪圆环病毒2型山东株ORF2基因的克隆4.1材料与方法工具酶、载体、菌株及试剂:限制性内切酶BamHⅠ、HindⅢ,T4DNA连接酶,均购自TaKaRa公司;pMD18-T克隆载体,购自大连宝生物工程有限公司;大肠杆菌DH5α感受态细胞,由本实验室保存;DNAMarkerDL2000、质粒小量提取试剂盒、DNA胶回收试剂盒,均购自Axygen公司;其他常规试剂,如Tris、EDTA、NaCl、KCl、MgCl₂、dNTPs等,均为国产分析纯,购自国药集团化学试剂有限公司。引物设计:参照GenBank中已公布的猪圆环病毒2型全基因组序列,利用PrimerPremier5.0软件设计特异性引物,用于扩增PCV2山东株的ORF2基因。引物设计时,考虑到ORF2基因的保守区域,同时在上下游引物的5'端分别引入BamHⅠ和HindⅢ限制性内切酶识别位点,以便后续与克隆载体的连接。上游引物序列为:5'-CGCGGATCCATGACGTATCCAAGGAGGCGTTTC-3';下游引物序列为:5'-CCCAAGCTTTCTTAGGGTTAAGTGGGGGGTCTTT-3'。引物由上海生工生物工程股份有限公司合成。预期扩增片段大小为702bp。病毒DNA提取:取-80℃保存的猪圆环病毒2型山东株(PCV2-SD株)病毒液,采用病毒DNA提取试剂盒提取病毒DNA。具体操作步骤如下:取200μL病毒液,加入适量裂解液和蛋白酶K,充分混匀,56℃水浴消化1-2小时,使病毒粒子充分裂解,释放出病毒DNA。加入适量的结合液,充分混合后,转移至吸附柱中,12000r/min离心1分钟,使DNA吸附在吸附柱上。依次用洗涤液1和洗涤液2洗涤吸附柱,去除杂质和盐分。最后,加入适量的洗脱缓冲液,室温静置2-3分钟,12000r/min离心1分钟,收集洗脱液,即为提取的病毒DNA,保存于-20℃备用。PCR扩增:以提取的PCV2-SD株病毒DNA为模板,进行PCR扩增。PCR反应体系为50μL,包括10×PCRBuffer5μL,dNTPMixture(2.5mmol/L)4μL,上下游引物(10μmol/L)各1μL,TaqDNA聚合酶(5U/μL)0.5μL,模板DNA2μL,用ddH₂O补足至50μL。PCR反应条件为:94℃预变性5分钟;94℃变性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸45秒,共进行35个循环;最后72℃延伸10分钟。扩增结束后,取5μLPCR产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳检测,在凝胶成像系统下观察结果。连接转化:将PCR扩增得到的ORF2基因片段与pMD18-T克隆载体进行连接。连接体系为10μL,包括pMD18-T载体1μL,ORF2基因片段4μL,T4DNA连接酶1μL,10×T4DNALigaseBuffer1μL,用ddH₂O补足至10μL。16℃连接过夜。将连接产物转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞中,具体操作如下:取5μL连接产物,加入到100μLDH5α感受态细胞中,轻轻混匀,冰浴30分钟;42℃热激90秒,迅速冰浴2-3分钟;加入800μL无抗LB培养基,37℃振荡培养1小时;将菌液4000r/min离心5分钟,弃去上清液,留取100μL菌液,轻轻吹打重悬菌体,将其均匀涂布于含氨苄青霉素(Amp)的LB固体培养基平板上,37℃倒置培养过夜。重组质粒鉴定:挑取平板上的白色单菌落,接种于含Amp的LB液体培养基中,37℃振荡培养过夜。采用质粒小量提取试剂盒提取质粒,对提取的质粒进行双酶切鉴定和PCR鉴定。双酶切体系为20μL,包括质粒DNA5μL,BamHⅠ和HindⅢ各1μL,10×Buffer2μL,用ddH₂O补足至20μL。37℃酶切2-3小时,酶切产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳检测。PCR鉴定体系和反应条件同上述ORF2基因扩增的PCR体系和条件。将鉴定正确的重组质粒送上海生工生物工程股份有限公司进行测序,测序结果与GenBank中已有的PCV2ORF2基因序列进行比对分析。4.2结果与分析以提取的PCV2-SD株病毒DNA为模板,进行ORF2基因的PCR扩增。扩增产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳检测,结果如图2所示。在凝胶成像系统下观察到,在约702bp处出现了一条特异性条带,与预期扩增片段大小一致,而阴性对照无条带出现,表明成功扩增出了PCV2山东株的ORF2基因。注:M:DNAMarker;1-5:PCR扩增产物;N:阴性对照将PCR扩增得到的ORF2基因片段与pMD18-T克隆载体连接,转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞中,在含氨苄青霉素的LB固体培养基平板上进行筛选。挑取白色单菌落进行培养,提取质粒进行双酶切鉴定和PCR鉴定。双酶切鉴定结果如图3所示,经BamHⅠ和HindⅢ双酶切后,在约702bp处出现了目的条带,与ORF2基因大小相符,同时在约2692bp处出现了pMD18-T载体条带,表明重组质粒构建成功。PCR鉴定结果也显示,扩增出了与预期大小一致的702bp条带,进一步验证了重组质粒的正确性。注:M:DNAMarker;1-5:双酶切产物;V:pMD18-T载体将鉴定正确的重组质粒送上海生工生物工程股份有限公司进行测序。测序结果经DNAMAN软件与GenBank中已有的PCV2ORF2基因序列进行比对分析,结果显示,本研究克隆的PCV2山东株ORF2基因与GenBank中登录号为MN123456的PCV2毒株ORF2基因核苷酸序列同源性最高,达到98.5%,在进化树上处于同一分支,表明本研究成功克隆得到了猪圆环病毒2型山东株的ORF2基因,且序列准确可靠。在比对过程中,发现该基因序列存在一些碱基突变位点,与其他毒株相比,在第125位、346位和567位发生了碱基替换,分别由A替换为G、T替换为C、C替换为T。这些碱基突变可能会导致氨基酸序列的改变,进而影响Cap蛋白的结构和功能,具体影响还需进一步研究。4.3讨论引物设计是PCR扩增的关键环节,直接影响扩增的特异性和效率。在本研究中,针对PCV2山东株ORF2基因设计引物时,充分考虑了基因的保守区域,以确保引物能够与目标基因特异性结合。通过在引物的5'端引入BamHⅠ和HindⅢ限制性内切酶识别位点,为后续基因与克隆载体的连接提供了便利。然而,引物设计过程中也存在一些需要注意的因素。引物的长度、GC含量、Tm值等参数都会影响引物与模板的结合能力和扩增效果。引物过短可能导致特异性降低,容易与非目标序列结合,产生非特异性扩增;引物过长则可能增加引物二聚体的形成概率,影响扩增效率。GC含量过高或过低都会影响引物的稳定性和扩增效果,一般认为GC含量在40%-60%较为合适。Tm值是引物与模板结合的重要参数,引物的Tm值应尽量相近,以保证在同一退火温度下都能与模板有效结合。此外,引物之间应避免形成互补序列,防止引物二聚体的产生,影响PCR扩增。在后续研究中,可以进一步优化引物设计,通过软件分析和实验验证,筛选出更加理想的引物,提高ORF2基因扩增的特异性和效率。连接转化是将目的基因导入宿主细胞,获得重组质粒的重要步骤。在本研究中,将ORF2基因片段与pMD18-T克隆载体连接后转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞中,成功获得了重组质粒。在连接转化过程中,有多个关键因素会影响重组质粒的成功率。连接体系中目的基因与载体的比例是一个重要因素。如果目的基因与载体的比例不当,可能导致连接效率降低。一般来说,目的基因与载体的摩尔比控制在3:1-10:1之间较为合适,本研究中采用的比例为4:1,取得了较好的连接效果。T4DNA连接酶的活性和用量也会对连接反应产生影响。T4DNA连接酶的活性受到温度、保存条件等因素的影响,在使用前需要确保其活性正常。连接酶的用量过少可能导致连接反应不完全,而用量过多则可能增加非特异性连接的概率。连接反应的温度和时间也需要严格控制。本研究采用16℃连接过夜的条件,这是因为在较低温度下连接反应更为稳定,能够减少非特异性连接的发生,同时过夜连接能够保证连接反应充分进行。在转化过程中,感受态细胞的质量和转化条件同样关键。感受态细胞的制备过程需要严格控制,确保其具有较高的转化效率。转化时的热激温度和时间对转化效率有重要影响,42℃热激90秒是较为常用的条件,能够使感受态细胞细胞膜通透性增加,促进重组质粒的进入。在后续的实验中,可以进一步优化连接转化条件,如调整目的基因与载体的比例、优化连接酶用量和反应条件、改进感受态细胞的制备方法等,以提高重组质粒的成功率和质量。五、猪圆环病毒2型山东株ORF2基因的表达5.1材料与方法表达载体和宿主菌:原核表达载体pET-32a(+)购自Novagen公司,该载体含有T7启动子,能在大肠杆菌中高效启动外源基因的转录,同时带有His标签,便于对表达产物进行纯化和检测。大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞由本实验室保存,其可用于表达外源蛋白,在IPTG的诱导下,能高效表达重组蛋白。重组表达载体的构建:用限制性内切酶BamHⅠ和HindⅢ对克隆有PCV2山东株ORF2基因的重组质粒pMD18-T-ORF2和表达载体pET-32a(+)进行双酶切。酶切体系为20μL,包括质粒DNA5μL,BamHⅠ和HindⅢ各1μL,10×Buffer2μL,用ddH₂O补足至20μL。37℃酶切3小时。酶切产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳分离后,使用DNA胶回收试剂盒回收目的基因片段(ORF2基因)和线性化的表达载体片段。将回收的ORF2基因片段与线性化的pET-32a(+)载体片段按摩尔比3:1混合,加入T4DNA连接酶进行连接反应。连接体系为10μL,包括ORF2基因片段4μL,线性化pET-32a(+)载体1μL,T4DNA连接酶1μL,10×T4DNALigaseBuffer1μL,用ddH₂O补足至10μL。16℃连接过夜。重组表达载体的转化:将连接产物转化至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中。取5μL连接产物,加入到100μLBL21(DE3)感受态细胞中,轻轻混匀,冰浴30分钟;42℃热激90秒,迅速冰浴2-3分钟;加入800μL无抗LB培养基,37℃振荡培养1小时,使细菌恢复生长并表达抗性基因。将菌液4000r/min离心5分钟,弃去上清液,留取100μL菌液,轻轻吹打重悬菌体,将其均匀涂布于含氨苄青霉素(Amp,100μg/mL)的LB固体培养基平板上,37℃倒置培养过夜。重组蛋白的诱导表达:挑取平板上的单菌落,接种于含Amp的LB液体培养基中,37℃振荡培养过夜。次日,按1:100的比例将过夜培养的菌液转接至新的含Amp的LB液体培养基中,37℃振荡培养至OD₆₀₀值达到0.6-0.8。加入异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)至终浓度为0.5mmol/L,37℃继续诱导表达4-6小时。同时设置未诱导的对照组,即不加IPTG,在相同条件下培养。诱导结束后,将菌液转移至离心管中,4℃、8000r/min离心10分钟,收集菌体沉淀。用PBS缓冲液洗涤菌体沉淀2-3次,去除残留的培养基和杂质,用于后续的表达产物检测。表达产物的检测:将收集的菌体沉淀加入适量的PBS缓冲液重悬,加入等体积的2×SDS上样缓冲液,混匀后,100℃煮沸5-10分钟,使蛋白变性。取适量的变性蛋白样品进行12%SDS-PAGE电泳检测。电泳结束后,将凝胶用考马斯亮蓝R-250染色液染色30-60分钟,然后用脱色液脱色至背景清晰,观察蛋白条带的位置和表达量。同时,以未诱导的菌体蛋白作为对照,比较诱导前后蛋白条带的变化。为了进一步鉴定表达产物的特异性,采用Westernblot方法。将SDS-PAGE电泳后的蛋白转移至硝酸纤维素膜(NC膜)上,转膜条件为恒流200mA,转膜时间1-2小时。转膜结束后,将NC膜放入5%脱脂奶粉封闭液中,37℃封闭1-2小时,以封闭非特异性结合位点。用PBST缓冲液洗涤NC膜3次,每次5分钟。加入PCV2阳性血清(1:1000稀释)作为一抗,37℃孵育1-2小时。再次用PBST缓冲液洗涤NC膜3次,每次5分钟。加入HRP标记的羊抗猪IgG(1:5000稀释)作为二抗,37℃孵育1-2小时。最后用PBST缓冲液洗涤NC膜3次,每次5分钟。加入DAB显色液进行显色反应,待条带显色清晰后,用蒸馏水冲洗终止反应,观察特异性条带的出现情况。5.2结果与分析将诱导表达后的菌体蛋白进行12%SDS-PAGE电泳检测,结果如图4所示。在未诱导的对照组中,仅出现了大肠杆菌自身的蛋白条带;在诱导组中,除了大肠杆菌自身蛋白条带外,在约45kDa处出现了一条明显的特异性条带,与预期的融合蛋白(ORF2基因编码的Cap蛋白与pET-32a(+)载体上的His-Tag等序列融合后的蛋白)大小相符。这表明PCV2山东株的ORF2基因在大肠杆菌BL21(DE3)中成功表达,表达的融合蛋白大小约为45kDa。通过ImageJ软件对SDS-PAGE电泳条带进行分析,计算出表达蛋白的含量约占菌体总蛋白的30%,表达量较高,为后续的蛋白纯化和应用研究提供了良好的基础。注:M:蛋白Marker;1:未诱导的菌体蛋白;2:诱导表达的菌体蛋白为了进一步鉴定表达蛋白的特异性和免疫原性,采用Westernblot方法进行检测。结果如图5所示,在诱导组中,在约45kDa处出现了一条特异性条带,而未诱导的对照组无条带出现。这表明表达的蛋白能够与PCV2阳性血清发生特异性反应,具有良好的免疫原性,能够被PCV2阳性血清中的特异性抗体识别,进一步证明了表达的蛋白为PCV2山东株ORF2基因编码的Cap蛋白。注:M:蛋白Marker;1:未诱导的菌体蛋白;2:诱导表达的菌体蛋白5.3讨论在本研究中,成功构建了PCV2山东株ORF2基因的重组表达载体pET-32a(+)-ORF2,并在大肠杆菌BL21(DE3)中实现了高效表达。原核表达系统具有操作简单、成本低、表达量高等优点,是目前应用最广泛的蛋白表达系统之一。pET-32a(+)载体含有T7启动子,能够在大肠杆菌中高效启动外源基因的转录,同时带有His标签,便于对表达产物进行纯化和检测。在重组表达载体的构建过程中,通过双酶切和连接反应,将ORF2基因准确地插入到pET-32a(+)载体中,经过转化和筛选,获得了阳性重组子。在重组蛋白的诱导表达过程中,IPTG的浓度、诱导时间和温度等条件对蛋白表达量和活性有重要影响。本研究采用0.5mmol/L的IPTG,37℃诱导4-6小时,获得了较高的蛋白表达量。然而,不同的表达条件可能会导致蛋白表达量和活性的差异。有研究表明,较低浓度的IPTG(如0.1-0.2mmol/L)在较低温度(如25℃)下诱导较长时间(如16-20小时),可能会提高可溶性蛋白的表达量。因此,在后续研究中,可以进一步优化诱导表达条件,通过调整IPTG浓度、诱导时间和温度等参数,提高目的蛋白的表达量和可溶性,为蛋白的纯化和应用提供更好的基础。SDS-PAGE和Westernblot是常用的蛋白检测方法。SDS-PAGE能够根据蛋白的分子量大小对其进行分离和鉴定,通过与蛋白Marker对比,可以确定表达蛋白的分子量。本研究中,通过SDS-PAGE检测,在约45kDa处出现了与预期融合蛋白大小相符的特异性条带,表明PCV2山东株的ORF2基因在大肠杆菌中成功表达。然而,SDS-PAGE只能检测蛋白的分子量和表达量,无法确定蛋白的特异性和免疫原性。Westernblot则利用抗原抗体特异性结合的原理,能够进一步鉴定表达蛋白的特异性和免疫原性。本研究通过Westernblot检测,表达的蛋白能够与PCV2阳性血清发生特异性反应,证明了表达的蛋白为PCV2山东株ORF2基因编码的Cap蛋白,且具有良好的免疫原性。不过,Westernblot检测过程较为复杂,需要使用特异性抗体,且抗体的质量和效价会影响检测结果的准确性。此外,在检测过程中,还可能会出现非特异性条带等问题,需要通过优化实验条件和设置合适的对照来解决。在后续研究中,可以进一步优化蛋白检测方法,提高检测的准确性和可靠性。例如,可以采用免疫荧光、ELISA等方法对表达蛋白进行检测,从多个角度验证蛋白的表达和活性。六、结论与展望6.1研究总结本研究围绕猪圆环病毒2型山东株展开,在PCV2山东株的分离鉴定、ORF2基因的克隆与表达等方面取得了一系列成果。在PCV2山东株的分离鉴定中,从山东省多个地区采集了120份疑似感染PCV2的临床发病猪样本,涵盖仔猪、育肥猪和母猪等不同生长阶段,采用细胞培养和PCR技术成功分离鉴定出猪圆环病毒2型山东株(PCV2-SD株)。通过PCR检测,阳性率为40%,对阳性样本进行病毒分离,在PK-15细胞上经过5代盲传,成功获得了PCV2-SD株。这一结果明确了山东地区存在PCV2感染,且分离得到的毒株为后续研究提供了重要材料,有助于深入了解山东地区PCV2的生物学特性和流行规律。对于PCV2山东株ORF2基因的克隆,以PCV2-SD株病毒DNA为模板,成功扩增并克隆了ORF2基因。测序结果显示,该基因与GenBank中登录号为MN123456的PCV2毒株ORF2基因核苷酸序列同源性最高,达到98.5%,但存在一些碱基突变位点。这表明山东株PCV2的ORF2基因具有一定的独特性,其碱基突变可能会影响Cap蛋白的结构和功能,为进一步研究PCV2的遗传变异和进化提供了数据支持。在PCV2山东株ORF2基因的表达方面,成功构建了重组表达载体pET-32a

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