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文档简介
生物学生物技术公司生物技术实习生实习报告一、摘要
2023年7月10日至2023年9月5日,我在一家生物技术公司担任生物技术实习生。实习期间,主要参与基因编辑实验平台的优化与验证工作。通过建立标准化流程,将CRISPRCas9系统的脱靶效应检测效率提升至原有水平的1.8倍,完成32组样本的精准测序,平均耗时从72小时缩短至39小时。熟练应用分子克隆、PCR扩增和流式细胞术等技能,成功构建并验证了3种新型报告基因载体,其荧光信号强度较传统系统提高2.3倍。提炼出的自动化数据采集与质控方法,可应用于后续高通量实验,减少人为误差约15%。
二、实习内容及过程
1实习目的
我去那家公司实习,主要是想看看基因编辑这行具体是啥样,顺便把在学校学的CRISPR技术用起来,看看能不能帮上点实际忙。想学点真本事,为以后找工作探探路。
2实习单位简介
那家公司做基因治疗相关产品,主要是开发一些慢病治疗的工具包,实验室挺大的,设备新旧都有,但流程管理还算清晰。
3实习内容与过程
我跟着团队做平台优化,具体是改进CRISPRCas9的脱靶验证流程。一开始就是看他们以前的实验记录,发现每次测序都要等72小时,而且人工判读容易出错。7月15号开始,我试着把流程标准化,引入了Illumina测序仪的小型项目,把样本前处理和上机流程调整了。比如以前提取质粒要4小时,我改用磁珠法,缩短到2小时。8月2号左右,第一次跑32组样本,用了39小时出结果,比原来快了将近一半。他们以前用T7E1酶切检测,假阳性率有点高,我就建议改用二端测序法,老板同意了,后来数据准了不少。期间还参与了报告基因载体的构建,用LigationIndependentCloningKit,做了3种新设计,荧光信号比原来的强明显。
4实习成果与收获
最后那段时间,整个平台的通量确实上来了。32组样本测序缩短到39小时,效率提升1.8倍,这个数据是跟之前8次实验对比出来的。我还整理了10页的SOP文档,把磁珠法和测序流程固定下来。最大的收获是学会了怎么把理论跟实际结合,以前做实验就是按步骤来,现在知道怎么优化。比如发现酶切条件不合适,就查文献又试了几次,最后把温度从37℃调到30℃,效果就好多了。这让我明白做科研不能死板,得灵活变通。
5问题与建议
那段时间我遇到的最头疼的事是,他们老设备的日志记录不完整,有时候得跑好几次才找到问题在哪。比如8月10号有一次测序失败,花了两天才定位到是某个试剂过期了,但没人专门管这个。我觉得他们培训机制有点问题,新来的学生就扔个任务,没人手把手教怎么用那些老仪器。另外我的岗位本来是做实验的,但最后帮着写了好多文档,跟我想象的基因编辑研究员有点差别。建议他们可以搞个新人培训手册,把常用设备的使用和排错写明白,这样能省不少事。或者至少配个师兄师姐专门带,别让人瞎忙活。
三、总结与体会
1实习价值闭环
这8周就像把书里的DNA双螺旋拆开又重新组装了一遍。7月10号刚去的时候,连LigationIndependentCloningKit具体怎么选引物都搞不太清,后来跟着做那个CRISPR平台优化,从改进质粒提取到调整测序参数,每一步都得自己动手验证。记得8月15号那周,连续跑了5批实验,有3批数据不太对,最后发现是磁珠法操作细节没掌握好,得反复加样。现在回看,当初觉得难如登天的基因编辑,其实就靠这些细节堆出来的。把32组样本的测序时间从72小时砍到39小时,虽然不算惊天动地,但每节省1小时,都是实实在在的效率。这让我明白,学校里学的那些分子克隆、流式细胞术,都是基本功,真要派上用场,还得在细节上下功夫。
2职业规划联结
这段经历让我更清楚自己想干嘛了。以前觉得基因编辑研究员就是闷在实验室捣鼓试管,现在发现,优化平台流程可能更让我兴奋把一堆实验数据变成能指导后续研发的依据。比如我提的那个把T7E1检测改成二端测序的建议,虽然最后没完全采纳,但老板说会再评估,这让我觉得参与感很强。9月2号跟导师聊完,我决定下学期要报那个基因编辑工程师的认证,把SOP和GMP标准再系统学一遍。现在看招聘要求,很多公司都要求熟悉Illumina测序和生物信息分析,这8周正好补上了我的短板。之前总觉得自己会点实验技术就行,现在才懂,光会动手没用,还得懂怎么让实验更高效、结果更可靠。
3行业趋势展望
感觉基因编辑这行现在特别卷,但卷的方向还挺有意思。9月5号离职的时候,他们正在搞CART的递送系统优化,我跟着看了一小会儿,发现跟之前做的CRISPR脱靶验证异曲同工都是想办法把基因治病的药精准送到该去的地方。我注意到他们用的那个新型报告基因载体,荧光信号比传统强2.3倍,这让我想起在学校看的文献,说单细胞测序越来越火,但信号检测要是拖后腿,再好的数据也没用。所以现在特别关注那些能提升实验通量和精度的技术,比如高灵敏度的流式平台、自动化液体处理系统。感觉未来做基因编辑的,光会跑实验不行,还得懂点工程化思维,怎么把实验室技术变成能量产的东西。那家公司虽然管理上有点乱,但那种鼓励学生提建议的氛围,比学校自由,也让我看到了自己该往哪努力。
四、致谢
1
感谢那家公司给我机会实习,让我知道基因编
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