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Real-timeRAAdetectionmethodforfiveca中国兽医协会发布I请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。众创生物科技有限公司、山东远大富邦生物工程有1犬消化道相关五种病原体实时荧光RAA检测方法GB/T6682分析实验室用水规格和GB/T27401实验室质量控制规范NY/T541兽医诊断样品采集、保存与运输技术规范4缩略语CTAB:十六烷基三甲基溴化铵(cetyltrimethylammoniumbrDNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)EDTA:乙二胺四乙酸(ethylenediaminetetraaceticacFAM:6-羧基荧光素(6-carboxyfluorescein)MMLV:莫洛尼氏鼠白血病逆转录病毒(moloneymurineleukemiaretrovirus)PBS:磷酸盐缓冲液(phosphate-bufferedsalinebuffer)RNA:核糖核酸(ribonucleicaRAA:重组酶介导链替换核酸扩增(recombinase-aidamplificaRT-RAA:反转录重组酶介导链替换扩增(reversetranscription-recombinase-aidamplificatioTris:三(羟甲)基氨基甲烷(tri-methylolaminometh25.1.3CTAB提取缓冲液按附录A.2配5.1.7TE缓冲液按附录A.45.1.8PBS缓冲液按附录A.5.1.9启动剂按附录A.6配制。3样品的采集、保存与运输按照NY/T5粪便和肛拭子样品采集分别按照NY/T541中相关粪便样品加入适量PBS缓冲液充分振荡混匀。1000r/min低速离心5min去除大颗粒杂质,吸取中段用于核酸检测的样品应尽快送检,24h内检测的样本可置于4℃保存,8.1.1在样本制备区进行,核酸提取使用CTAB法提取,也可采用其他等效核48.1.7开盖,室温挥发干液体,加入50μLn+1分别配制五种反应体系,充分混匀后分装,每个反应管20μL,转移至样本制备区。9结果判断与表述9.1质量控制间20min,则重复一次。如再次检测结果仍然是T值(时间20min,则判定被检样品阳性,表述为“检出阳性核酸”。如无报告T值(时间)或无荧光对数增长则判定被检样品阴性,表述5A.3核酸抽提液(pH8.0)A.4TE缓冲液(pH8.0)A.5PBS缓冲液(pH7.4)A.6启动剂A.7犬冠状病毒、犬瘟热病毒、犬轮状病毒阳性对照制备病毒载体转化至大肠杆菌BL21(DE3)表达系统后诱导表达纯化获得装甲RNA病毒颗粒,并对提取后犬轮状病毒的阳性对照母液。将阳性对照母液10倍梯度稀释之后,选取1A.8犬细小病毒、胎儿三毛滴虫阳性对照制备微量分光光度计测定阳性重组质粒浓度,并将浓度换算成拷贝数(DNA拷贝/µL)=[6.02×1023×DNA浓6)),阳性对照母液10倍梯度稀释之后,选取107引物/探针序列(5'→3')ATTGTTGGCTCGTCATAGCGGATTGCATATTAGGAAGTTTAGATTTGA[引物/探针序列(5'→3')NGCTTCCACAATGTAGTTATCTATTGTTAGAAACAGGATTGCTGAGGACT[FAM引物/探针序列(5'→3')GCATCCGCCAAAACAGATTCATTTGTTCATCACGCTACAGTTGGATTAAC[FAM-引物/探针序列(5'→3')CCATACTTATATTTCTCGCCTCCATCACTCATTGGTGC8引物/探针序列(5'→3')AATATGAGGTGGTGGTTTACTTCTTTTAGT[FAM-dT]引物/探针序列(5'→3')ATGGGTTACTGTAACATATATGCGTGTTCTGGATTAGCTTTCTTTGCGACAAGTTCGA[FAM9C.1犬冠状病毒阳性对照参考序列(GenBankC.2犬瘟热病毒阳性对照参考序列(GenBGTCGGGGAATTTAGAATGAACAAAATCTGGCTTGATATTGTTAGAAACAGGAGACTTATCTTTGAGGCGATTCATGGTGGCACTCATCCTGGATATCAAACGATCCCGCCTAGAATTGCTGAAATGATTTGTGATATAGATAACTACATTGC.3犬轮状病毒阳性对照参考序列(GenBaCCATACTTATATTTCTCGCCAGCAGATCAACGCTTTATAGATCAAACTAGATTGGGGGGGGAAAATAGGACATTATTTTTTTAGAGCTAAAAAGGCAATTGCTCCAGTATTTGATACACCAGATCATCCATCAACATCAAGACCAACAAAACCAACTAAAAGAAGTAAACCACCCTCATATTTTCATCAATCTTGCAAAAAAAAAAAAAACCGGTGCAGGACAAGTAAAAAGAGACAATCTTGCACCAATGAGTGATC.5胎儿三毛滴虫阳性对照参考序列(GenCTTAGGCAATGGATGTCTTGGCTTCTTACACGATGAAGAACGTTGCATGGCTGGATTAGCTTTCTTTGCGACAAGTTCGATCTTTGAATGCACATTGCGCGCCGTTCTAGAACACGCATATATGTTACA犬冠状病毒、犬瘟热病毒、犬轮状病毒荧光RT-RAA反应体系表D.1犬冠状病毒、犬瘟热病毒、犬轮状病毒荧光RT体积(μL)RT-RAA荧光反应单元(25μL反应体系冻干粉)-正向引物(10μmol/L)反向引物(10μmo
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